MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008383	TTGATC	2	12	449	460	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116255068
2	NC_008383	AGTCCG	2	12	4127	4138	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255071
3	NC_008383	CCGATC	2	12	8273	8284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116255072
4	NC_008383	GGGGAG	2	12	13185	13196	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	116255076
5	NC_008383	CCAGCA	2	12	22041	22052	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116255086
6	NC_008383	GCATTC	2	12	22370	22381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116255087
7	NC_008383	CGTCAA	2	12	24171	24182	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116255089
8	NC_008383	GATCGC	2	12	26479	26490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255090
9	NC_008383	GCTGTT	2	12	29520	29531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116255093
10	NC_008383	ACGTCC	2	12	33061	33072	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116255096
11	NC_008383	ATCACG	2	12	40664	40675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116255103
12	NC_008383	CGGCGA	2	12	43099	43110	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255104
13	NC_008383	GCCGCG	2	12	47790	47801	0 %	0 %	50 %	50 %	116255107
14	NC_008383	GCGTGA	2	12	51335	51346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116255109
15	NC_008383	GCGGTC	2	12	53861	53872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255112
16	NC_008383	GATCTT	2	12	60476	60487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	116255117
17	NC_008383	GCCGGA	2	12	71059	71070	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255129
18	NC_008383	GCTATC	2	12	77253	77264	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116255134
19	NC_008383	GGCCGT	2	12	80232	80243	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255137
20	NC_008383	TGGATG	2	12	80416	80427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	116255138
21	NC_008383	GTTCAA	2	12	81222	81233	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116255138
22	NC_008383	GGCGCG	2	12	84360	84371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116255142
23	NC_008383	TCCCTT	2	12	87344	87355	0 %	50 %	0 %	50 %	116255144
24	NC_008383	TGGCGC	2	12	94914	94925	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255151
25	NC_008383	CGCCTT	2	12	96075	96086	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	116255152
26	NC_008383	ATACCT	2	12	97033	97044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116255153
27	NC_008383	CCATCT	2	12	101638	101649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	116255156
28	NC_008383	GATCCC	2	12	107807	107818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116255163
29	NC_008383	CGCAAG	2	12	108734	108745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116255163
30	NC_008383	TTGATG	2	12	108777	108788	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116255163
31	NC_008383	ATGTCG	2	12	109584	109595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116255163
32	NC_008383	CGAGAT	2	12	112228	112239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116255163
33	NC_008383	GCTTTG	2	12	116677	116688	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	116255165
34	NC_008383	GTGCCG	2	12	127764	127775	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255181
35	NC_008383	TTCGTT	2	12	130952	130963	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	116255183
36	NC_008383	GGCCGA	2	12	131428	131439	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116255183
37	NC_008383	TCAAGC	2	12	133461	133472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	116255186
38	NC_008383	AGACAA	2	12	134656	134667	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116255187
39	NC_008383	TGGACC	2	12	136526	136537	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255188
40	NC_008383	GCGCTG	2	12	138394	138405	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255190
41	NC_008383	AGCCAA	2	12	140670	140681	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116255193
42	NC_008383	CCCTGA	2	12	142668	142679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	116255195
43	NC_008383	AGCGTC	2	12	143941	143952	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255196
44	NC_008383	CCGCCT	2	12	144353	144364	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	116255196

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.