MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008383	GATGT	2	10	838	847	20 %	40 %	40 %	0 %	116255068
2	NC_008383	GATTG	2	10	3034	3043	20 %	40 %	40 %	0 %	116255070
3	NC_008383	TCAAA	2	10	4912	4921	60 %	20 %	0 %	20 %	116255071
4	NC_008383	GTCCA	2	10	5443	5452	20 %	20 %	20 %	40 %	116255071
5	NC_008383	CCACA	2	10	5833	5842	40 %	0 %	0 %	60 %	116255071
6	NC_008383	GCGAC	2	10	6008	6017	20 %	0 %	40 %	40 %	116255071
7	NC_008383	GAATG	2	10	6243	6252	40 %	20 %	40 %	0 %	116255071
8	NC_008383	ATTTT	2	10	6272	6281	20 %	80 %	0 %	0 %	116255071
9	NC_008383	AGGGG	2	10	12501	12510	20 %	0 %	80 %	0 %	116255076
10	NC_008383	CGGCG	2	10	14825	14834	0 %	0 %	60 %	40 %	116255079
11	NC_008383	GCCTC	2	10	15421	15430	0 %	20 %	20 %	60 %	116255080
12	NC_008383	GGAGC	2	10	15917	15926	20 %	0 %	60 %	20 %	116255080
13	NC_008383	AAGCC	2	10	19343	19352	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008383	TGATC	2	10	24853	24862	20 %	40 %	20 %	20 %	116255090
15	NC_008383	TTGCA	2	10	27054	27063	20 %	40 %	20 %	20 %	116255091
16	NC_008383	GCAGG	2	10	28141	28150	20 %	0 %	60 %	20 %	116255091
17	NC_008383	GAACG	2	10	31922	31931	40 %	0 %	40 %	20 %	116255096
18	NC_008383	AGCCG	2	10	35540	35549	20 %	0 %	40 %	40 %	116255099
19	NC_008383	CGGGC	2	10	35578	35587	0 %	0 %	60 %	40 %	116255099
20	NC_008383	ACCAA	2	10	36565	36574	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_008383	CGGGC	2	10	43749	43758	0 %	0 %	60 %	40 %	116255104
22	NC_008383	GAACC	2	10	44465	44474	40 %	0 %	20 %	40 %	116255105
23	NC_008383	TCGGC	2	10	46918	46927	0 %	20 %	40 %	40 %	116255106
24	NC_008383	TGGTA	2	10	47163	47172	20 %	40 %	40 %	0 %	116255107
25	NC_008383	CCCGA	2	10	50807	50816	20 %	0 %	20 %	60 %	116255109
26	NC_008383	GGACG	2	10	52355	52364	20 %	0 %	60 %	20 %	116255110
27	NC_008383	AATGA	2	10	53684	53693	60 %	20 %	20 %	0 %	116255111
28	NC_008383	AAAGG	2	10	57766	57775	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008383	TGCGA	2	10	57899	57908	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008383	CATAA	2	10	63820	63829	60 %	20 %	0 %	20 %	116255120
31	NC_008383	CTCCG	2	10	65637	65646	0 %	20 %	20 %	60 %	116255121
32	NC_008383	GTCCT	2	10	67360	67369	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_008383	GATGC	2	10	68300	68309	20 %	20 %	40 %	20 %	116255125
34	NC_008383	TGCCG	2	10	72285	72294	0 %	20 %	40 %	40 %	116255130
35	NC_008383	GGTCG	2	10	74489	74498	0 %	20 %	60 %	20 %	116255132
36	NC_008383	GTTCG	2	10	75437	75446	0 %	40 %	40 %	20 %	116255133
37	NC_008383	GGGGC	2	10	75879	75888	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008383	CGAAC	2	10	76683	76692	40 %	0 %	20 %	40 %	116255134
39	NC_008383	GGCGT	2	10	77620	77629	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_008383	GCGAA	2	10	78085	78094	40 %	0 %	40 %	20 %	116255135
41	NC_008383	AGTGG	2	10	78491	78500	20 %	20 %	60 %	0 %	116255135
42	NC_008383	TATCG	2	10	80942	80951	20 %	40 %	20 %	20 %	116255138
43	NC_008383	GGGCT	2	10	80999	81008	0 %	20 %	60 %	20 %	116255138
44	NC_008383	CGTGC	2	10	82039	82048	0 %	20 %	40 %	40 %	116255140
45	NC_008383	ACCGA	2	10	83638	83647	40 %	0 %	20 %	40 %	116255141
46	NC_008383	GTGCC	2	10	83700	83709	0 %	20 %	40 %	40 %	116255141
47	NC_008383	TCCCA	2	10	86685	86694	20 %	20 %	0 %	60 %	116255144
48	NC_008383	GAGGC	2	10	90626	90635	20 %	0 %	60 %	20 %	116255147
49	NC_008383	CGCTC	2	10	93331	93340	0 %	20 %	20 %	60 %	116255149
50	NC_008383	AGTTC	2	10	93568	93577	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008383	ATCCC	2	10	98066	98075	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_008383	TGCGT	2	10	98370	98379	0 %	40 %	40 %	20 %	116255154
53	NC_008383	ATGGA	2	10	100882	100891	40 %	20 %	40 %	0 %	116255156
54	NC_008383	CCATT	2	10	103841	103850	20 %	40 %	0 %	40 %	116255159
55	NC_008383	ATCTG	2	10	104321	104330	20 %	40 %	20 %	20 %	116255159
56	NC_008383	TGTCA	2	10	104335	104344	20 %	40 %	20 %	20 %	116255159
57	NC_008383	CTGGG	2	10	108220	108229	0 %	20 %	60 %	20 %	116255163
58	NC_008383	GCTTG	2	10	108508	108517	0 %	40 %	40 %	20 %	116255163
59	NC_008383	ACGGC	2	10	109122	109131	20 %	0 %	40 %	40 %	116255163
60	NC_008383	CGCCT	2	10	109289	109298	0 %	20 %	20 %	60 %	116255163
61	NC_008383	AAGGA	2	10	109886	109895	60 %	0 %	40 %	0 %	116255163
62	NC_008383	GCCGT	2	10	110627	110636	0 %	20 %	40 %	40 %	116255163
63	NC_008383	CAGCG	2	10	112502	112511	20 %	0 %	40 %	40 %	116255163
64	NC_008383	GATCC	2	10	113448	113457	20 %	20 %	20 %	40 %	116255164
65	NC_008383	GCGCG	2	10	114796	114805	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
66	NC_008383	TCCGC	2	10	115798	115807	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
67	NC_008383	TCAGC	2	10	116471	116480	20 %	20 %	20 %	40 %	116255165
68	NC_008383	GGATC	2	10	117139	117148	20 %	20 %	40 %	20 %	116255167
69	NC_008383	TCTCT	2	10	121286	121295	0 %	60 %	0 %	40 %	116255172
70	NC_008383	GCTCG	2	10	121872	121881	0 %	20 %	40 %	40 %	116255173
71	NC_008383	GCGCC	2	10	122234	122243	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_008383	GTTCG	2	10	123858	123867	0 %	40 %	40 %	20 %	116255178
73	NC_008383	AGCAG	2	10	125159	125168	40 %	0 %	40 %	20 %	116255178
74	NC_008383	CCTCC	2	10	125179	125188	0 %	20 %	0 %	80 %	116255178
75	NC_008383	GACGC	2	10	126449	126458	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_008383	CGGCG	2	10	128783	128792	0 %	0 %	60 %	40 %	116255181
77	NC_008383	CGCTG	2	10	129133	129142	0 %	20 %	40 %	40 %	116255181
78	NC_008383	ACGAT	2	10	132252	132261	40 %	20 %	20 %	20 %	116255184
79	NC_008383	AGCTT	2	10	133518	133527	20 %	40 %	20 %	20 %	116255186
80	NC_008383	TTTCG	3	15	136066	136080	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008383	TCTGG	2	10	136586	136595	0 %	40 %	40 %	20 %	116255188
82	NC_008383	CGATC	2	10	136764	136773	20 %	20 %	20 %	40 %	116255188
83	NC_008383	CGCGG	2	10	138290	138299	0 %	0 %	60 %	40 %	116255190
84	NC_008383	GTCCG	2	10	139966	139975	0 %	20 %	40 %	40 %	116255192
85	NC_008383	GTGAT	2	10	140229	140238	20 %	40 %	40 %	0 %	116255193
86	NC_008383	ATTGC	2	10	143764	143773	20 %	40 %	20 %	20 %	116255196
87	NC_008383	CCCCT	2	10	145760	145769	0 %	20 %	0 %	80 %	116255198
88	NC_008383	CCGAT	2	10	146897	146906	20 %	20 %	20 %	40 %	116255199

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.