MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008383	AATC	2	8	11959	11966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008383	AGCG	2	8	18184	18191	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_008383	CGAT	2	8	20768	20775	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008383	TCCT	2	8	31544	31551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008383	CCGA	2	8	36857	36864	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008383	TGGA	2	8	36971	36978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008383	ATTT	2	8	37043	37050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008383	GATC	2	8	37147	37154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008383	TTTA	2	8	37924	37931	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008383	ATAA	2	8	39831	39838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008383	AGCG	2	8	41279	41286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008383	TCGA	2	8	41582	41589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008383	ACCG	2	8	41639	41646	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008383	TCCA	2	8	41657	41664	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008383	GATC	2	8	41824	41831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008383	CATG	2	8	41875	41882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008383	ATCG	2	8	42858	42865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008383	CATG	2	8	43928	43935	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008383	GCCG	2	8	48529	48536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008383	ACCG	2	8	48550	48557	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008383	TCAA	2	8	48633	48640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008383	TGGC	2	8	55621	55628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008383	CAAG	2	8	55780	55787	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008383	GCCG	2	8	56416	56423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008383	CGGC	2	8	57226	57233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008383	GTCC	2	8	57298	57305	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008383	TGGT	2	8	57408	57415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008383	GCGG	2	8	57953	57960	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008383	GGTT	2	8	58206	58213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008383	TCAA	2	8	59303	59310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008383	TGAC	2	8	60153	60160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008383	GCCG	2	8	60167	60174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008383	CATA	2	8	60937	60944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008383	TCCT	2	8	62749	62756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008383	CGAG	2	8	63535	63542	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008383	AGCG	2	8	64828	64835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008383	TCAA	2	8	69302	69309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008383	CGAT	2	8	75758	75765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008383	GTGG	2	8	76150	76157	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008383	TTCC	2	8	77528	77535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008383	GCGG	2	8	81529	81536	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008383	AAGA	2	8	87625	87632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008383	GCGG	2	8	93852	93859	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008383	GGTG	2	8	94463	94470	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008383	CGCT	2	8	101876	101883	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008383	GCGA	2	8	107656	107663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008383	GAAA	2	8	113780	113787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008383	CCGG	2	8	113851	113858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008383	CGAT	2	8	114039	114046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008383	GAAG	2	8	114547	114554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008383	GCCG	2	8	114709	114716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008383	GCGG	2	8	115184	115191	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008383	CAAA	2	8	115847	115854	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008383	GCCC	2	8	118474	118481	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
55	NC_008383	CTCG	2	8	120119	120126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008383	ACCC	2	8	120169	120176	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_008383	CCCG	2	8	120679	120686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_008383	GGGA	3	12	120767	120778	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008383	AACG	2	8	126494	126501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008383	TGTC	2	8	133292	133299	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008383	TTCC	2	8	135989	135996	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008383	AGTG	2	8	136162	136169	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008383	AGAC	2	8	147130	147137	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.