MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL8

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008383	CG	3	6	54	59	0 %	0 %	50 %	50 %	116255068
2	NC_008383	TC	3	6	63	68	0 %	50 %	0 %	50 %	116255068
3	NC_008383	GC	3	6	71	76	0 %	0 %	50 %	50 %	116255068
4	NC_008383	CT	3	6	1076	1081	0 %	50 %	0 %	50 %	116255068
5	NC_008383	GC	3	6	1757	1762	0 %	0 %	50 %	50 %	116255069
6	NC_008383	GC	4	8	2005	2012	0 %	0 %	50 %	50 %	116255069
7	NC_008383	GC	4	8	2890	2897	0 %	0 %	50 %	50 %	116255070
8	NC_008383	CA	3	6	4044	4049	50 %	0 %	0 %	50 %	116255071
9	NC_008383	CG	3	6	4257	4262	0 %	0 %	50 %	50 %	116255071
10	NC_008383	AG	3	6	4967	4972	50 %	0 %	50 %	0 %	116255071
11	NC_008383	AT	3	6	5307	5312	50 %	50 %	0 %	0 %	116255071
12	NC_008383	TC	3	6	6063	6068	0 %	50 %	0 %	50 %	116255071
13	NC_008383	GA	3	6	7057	7062	50 %	0 %	50 %	0 %	116255072
14	NC_008383	CT	3	6	8655	8660	0 %	50 %	0 %	50 %	116255073
15	NC_008383	AG	3	6	9375	9380	50 %	0 %	50 %	0 %	116255073
16	NC_008383	CG	3	6	9500	9505	0 %	0 %	50 %	50 %	116255073
17	NC_008383	GA	3	6	11143	11148	50 %	0 %	50 %	0 %	116255075
18	NC_008383	AG	3	6	13174	13179	50 %	0 %	50 %	0 %	116255076
19	NC_008383	CG	3	6	14012	14017	0 %	0 %	50 %	50 %	116255079
20	NC_008383	CG	3	6	14040	14045	0 %	0 %	50 %	50 %	116255079
21	NC_008383	CT	3	6	14317	14322	0 %	50 %	0 %	50 %	116255079
22	NC_008383	TC	3	6	14344	14349	0 %	50 %	0 %	50 %	116255079
23	NC_008383	GA	3	6	15088	15093	50 %	0 %	50 %	0 %	116255080
24	NC_008383	TC	3	6	15491	15496	0 %	50 %	0 %	50 %	116255080
25	NC_008383	TC	3	6	15737	15742	0 %	50 %	0 %	50 %	116255080
26	NC_008383	GC	3	6	16244	16249	0 %	0 %	50 %	50 %	116255080
27	NC_008383	AG	3	6	18495	18500	50 %	0 %	50 %	0 %	116255082
28	NC_008383	GC	3	6	18521	18526	0 %	0 %	50 %	50 %	116255082
29	NC_008383	CG	3	6	18873	18878	0 %	0 %	50 %	50 %	116255082
30	NC_008383	GT	3	6	19138	19143	0 %	50 %	50 %	0 %	116255082
31	NC_008383	GC	3	6	21320	21325	0 %	0 %	50 %	50 %	116255085
32	NC_008383	CT	3	6	22509	22514	0 %	50 %	0 %	50 %	116255087
33	NC_008383	TG	3	6	22577	22582	0 %	50 %	50 %	0 %	116255087
34	NC_008383	AC	3	6	24083	24088	50 %	0 %	0 %	50 %	116255089
35	NC_008383	CG	3	6	24677	24682	0 %	0 %	50 %	50 %	116255090
36	NC_008383	CG	3	6	25236	25241	0 %	0 %	50 %	50 %	116255090
37	NC_008383	CG	3	6	26417	26422	0 %	0 %	50 %	50 %	116255090
38	NC_008383	CG	3	6	27087	27092	0 %	0 %	50 %	50 %	116255091
39	NC_008383	CG	3	6	27554	27559	0 %	0 %	50 %	50 %	116255091
40	NC_008383	CG	3	6	28691	28696	0 %	0 %	50 %	50 %	116255092
41	NC_008383	GC	3	6	29333	29338	0 %	0 %	50 %	50 %	116255093
42	NC_008383	TA	3	6	29729	29734	50 %	50 %	0 %	0 %	116255093
43	NC_008383	GC	3	6	30447	30452	0 %	0 %	50 %	50 %	116255094
44	NC_008383	GC	3	6	32543	32548	0 %	0 %	50 %	50 %	116255096
45	NC_008383	GC	3	6	32750	32755	0 %	0 %	50 %	50 %	116255096
46	NC_008383	TC	3	6	33186	33191	0 %	50 %	0 %	50 %	116255096
47	NC_008383	AG	3	6	33591	33596	50 %	0 %	50 %	0 %	116255097
48	NC_008383	GC	3	6	34799	34804	0 %	0 %	50 %	50 %	116255098
49	NC_008383	GC	3	6	35416	35421	0 %	0 %	50 %	50 %	116255099
50	NC_008383	GC	3	6	35638	35643	0 %	0 %	50 %	50 %	116255099
51	NC_008383	GC	4	8	36090	36097	0 %	0 %	50 %	50 %	116255099
52	NC_008383	TC	3	6	40541	40546	0 %	50 %	0 %	50 %	116255103
53	NC_008383	CG	4	8	40571	40578	0 %	0 %	50 %	50 %	116255103
54	NC_008383	GC	3	6	40639	40644	0 %	0 %	50 %	50 %	116255103
55	NC_008383	CT	3	6	43638	43643	0 %	50 %	0 %	50 %	116255104
56	NC_008383	CT	3	6	44162	44167	0 %	50 %	0 %	50 %	116255105
57	NC_008383	GC	3	6	45504	45509	0 %	0 %	50 %	50 %	116255106
58	NC_008383	CG	3	6	45835	45840	0 %	0 %	50 %	50 %	116255106
59	NC_008383	GC	3	6	46903	46908	0 %	0 %	50 %	50 %	116255106
60	NC_008383	GC	3	6	47153	47158	0 %	0 %	50 %	50 %	116255107
61	NC_008383	GC	3	6	47388	47393	0 %	0 %	50 %	50 %	116255107
62	NC_008383	GC	3	6	47842	47847	0 %	0 %	50 %	50 %	116255107
63	NC_008383	GC	3	6	48101	48106	0 %	0 %	50 %	50 %	116255107
64	NC_008383	GC	4	8	48694	48701	0 %	0 %	50 %	50 %	116255108
65	NC_008383	GC	3	6	50516	50521	0 %	0 %	50 %	50 %	116255108
66	NC_008383	CG	3	6	51121	51126	0 %	0 %	50 %	50 %	116255109
67	NC_008383	AG	3	6	51210	51215	50 %	0 %	50 %	0 %	116255109
68	NC_008383	AG	3	6	52170	52175	50 %	0 %	50 %	0 %	116255110
69	NC_008383	GA	3	6	52283	52288	50 %	0 %	50 %	0 %	116255110
70	NC_008383	CG	3	6	52508	52513	0 %	0 %	50 %	50 %	116255111
71	NC_008383	GC	3	6	53255	53260	0 %	0 %	50 %	50 %	116255111
72	NC_008383	CG	3	6	53733	53738	0 %	0 %	50 %	50 %	116255112
73	NC_008383	GC	3	6	54630	54635	0 %	0 %	50 %	50 %	116255113
74	NC_008383	AG	3	6	58614	58619	50 %	0 %	50 %	0 %	116255114
75	NC_008383	AT	3	6	59158	59163	50 %	50 %	0 %	0 %	116255115
76	NC_008383	CT	3	6	59440	59445	0 %	50 %	0 %	50 %	116255116
77	NC_008383	AG	3	6	61132	61137	50 %	0 %	50 %	0 %	116255118
78	NC_008383	GC	3	6	61714	61719	0 %	0 %	50 %	50 %	116255119
79	NC_008383	GC	4	8	61822	61829	0 %	0 %	50 %	50 %	116255119
80	NC_008383	GC	3	6	64074	64079	0 %	0 %	50 %	50 %	116255120
81	NC_008383	GC	3	6	64303	64308	0 %	0 %	50 %	50 %	116255120
82	NC_008383	GC	3	6	64530	64535	0 %	0 %	50 %	50 %	116255120
83	NC_008383	CT	3	6	66633	66638	0 %	50 %	0 %	50 %	116255122
84	NC_008383	TG	3	6	66737	66742	0 %	50 %	50 %	0 %	116255122
85	NC_008383	CG	3	6	66959	66964	0 %	0 %	50 %	50 %	116255123
86	NC_008383	CG	3	6	67439	67444	0 %	0 %	50 %	50 %	116255124
87	NC_008383	TC	3	6	67487	67492	0 %	50 %	0 %	50 %	116255124
88	NC_008383	CG	3	6	67601	67606	0 %	0 %	50 %	50 %	116255124
89	NC_008383	TG	3	6	68215	68220	0 %	50 %	50 %	0 %	116255124
90	NC_008383	AG	3	6	68478	68483	50 %	0 %	50 %	0 %	116255125
91	NC_008383	AT	3	6	68655	68660	50 %	50 %	0 %	0 %	116255125
92	NC_008383	GC	3	6	70730	70735	0 %	0 %	50 %	50 %	116255128
93	NC_008383	TC	3	6	71092	71097	0 %	50 %	0 %	50 %	116255129
94	NC_008383	CG	3	6	71384	71389	0 %	0 %	50 %	50 %	116255129
95	NC_008383	TC	3	6	72071	72076	0 %	50 %	0 %	50 %	116255130
96	NC_008383	GC	3	6	72548	72553	0 %	0 %	50 %	50 %	116255130
97	NC_008383	TC	3	6	73432	73437	0 %	50 %	0 %	50 %	116255131
98	NC_008383	AG	3	6	73539	73544	50 %	0 %	50 %	0 %	116255131
99	NC_008383	TC	3	6	73669	73674	0 %	50 %	0 %	50 %	116255131
100	NC_008383	GC	3	6	73931	73936	0 %	0 %	50 %	50 %	116255131
101	NC_008383	GC	3	6	76619	76624	0 %	0 %	50 %	50 %	116255134
102	NC_008383	GC	3	6	76762	76767	0 %	0 %	50 %	50 %	116255134
103	NC_008383	GC	3	6	77223	77228	0 %	0 %	50 %	50 %	116255134
104	NC_008383	GA	3	6	78267	78272	50 %	0 %	50 %	0 %	116255135
105	NC_008383	CG	3	6	79746	79751	0 %	0 %	50 %	50 %	116255137
106	NC_008383	GC	3	6	80852	80857	0 %	0 %	50 %	50 %	116255138
107	NC_008383	CG	3	6	81085	81090	0 %	0 %	50 %	50 %	116255138
108	NC_008383	GA	3	6	81330	81335	50 %	0 %	50 %	0 %	116255139
109	NC_008383	CG	3	6	84578	84583	0 %	0 %	50 %	50 %	116255142
110	NC_008383	GC	3	6	85527	85532	0 %	0 %	50 %	50 %	116255144
111	NC_008383	GC	3	6	85903	85908	0 %	0 %	50 %	50 %	116255144
112	NC_008383	GC	3	6	88268	88273	0 %	0 %	50 %	50 %	116255145
113	NC_008383	GA	3	6	89606	89611	50 %	0 %	50 %	0 %	116255146
114	NC_008383	TC	3	6	90141	90146	0 %	50 %	0 %	50 %	116255147
115	NC_008383	CT	3	6	90301	90306	0 %	50 %	0 %	50 %	116255147
116	NC_008383	GA	3	6	90713	90718	50 %	0 %	50 %	0 %	116255147
117	NC_008383	GA	3	6	91330	91335	50 %	0 %	50 %	0 %	116255147
118	NC_008383	AT	4	8	91763	91770	50 %	50 %	0 %	0 %	116255148
119	NC_008383	AT	3	6	91946	91951	50 %	50 %	0 %	0 %	116255148
120	NC_008383	TC	3	6	92379	92384	0 %	50 %	0 %	50 %	116255149
121	NC_008383	GA	3	6	92401	92406	50 %	0 %	50 %	0 %	116255149
122	NC_008383	GC	3	6	93070	93075	0 %	0 %	50 %	50 %	116255149
123	NC_008383	GC	3	6	94237	94242	0 %	0 %	50 %	50 %	116255150
124	NC_008383	GC	4	8	95726	95733	0 %	0 %	50 %	50 %	116255152
125	NC_008383	CT	3	6	96365	96370	0 %	50 %	0 %	50 %	116255152
126	NC_008383	TC	3	6	96908	96913	0 %	50 %	0 %	50 %	116255153
127	NC_008383	AT	3	6	97349	97354	50 %	50 %	0 %	0 %	116255153
128	NC_008383	GC	3	6	97816	97821	0 %	0 %	50 %	50 %	116255153
129	NC_008383	GC	3	6	98518	98523	0 %	0 %	50 %	50 %	116255154
130	NC_008383	GC	3	6	98561	98566	0 %	0 %	50 %	50 %	116255154
131	NC_008383	GC	3	6	98601	98606	0 %	0 %	50 %	50 %	116255154
132	NC_008383	GC	3	6	98870	98875	0 %	0 %	50 %	50 %	116255154
133	NC_008383	TC	3	6	98982	98987	0 %	50 %	0 %	50 %	116255154
134	NC_008383	CG	3	6	99888	99893	0 %	0 %	50 %	50 %	116255155
135	NC_008383	CG	3	6	100132	100137	0 %	0 %	50 %	50 %	116255155
136	NC_008383	GC	3	6	101073	101078	0 %	0 %	50 %	50 %	116255156
137	NC_008383	GA	3	6	101490	101495	50 %	0 %	50 %	0 %	116255156
138	NC_008383	CG	3	6	101705	101710	0 %	0 %	50 %	50 %	116255156
139	NC_008383	AG	3	6	102588	102593	50 %	0 %	50 %	0 %	116255158
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141	NC_008383	AC	3	6	103133	103138	50 %	0 %	0 %	50 %	116255158
142	NC_008383	CG	3	6	104574	104579	0 %	0 %	50 %	50 %	116255159
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.