MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008382	TTCAAC	2	12	994	1005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254911
2	NC_008382	GAAACA	2	12	2276	2287	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116254912
3	NC_008382	CAAAGA	2	12	4998	5009	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	116254915
4	NC_008382	AGAGGA	2	12	6746	6757	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008382	CGATGG	2	12	7005	7016	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116254917
6	NC_008382	TCTACG	2	12	8264	8275	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254917
7	NC_008382	TTCCTG	2	12	10438	10449	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	116254919
8	NC_008382	TCAACA	2	12	11015	11026	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008382	TGATCG	2	12	12358	12369	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116254921
10	NC_008382	CTCGGC	2	12	33216	33227	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	116254943
11	NC_008382	CAAACC	2	12	34435	34446	50 %	0 %	0 %	50 %	116254945
12	NC_008382	CTGGCG	2	12	35104	35115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254945
13	NC_008382	CATCGT	2	12	40527	40538	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254952
14	NC_008382	GGCAAG	2	12	44385	44396	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008382	CCTCTT	2	12	45438	45449	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008382	AGGCGG	2	12	53217	53228	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008382	AGGCGG	2	12	53231	53242	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008382	CCGGAT	2	12	59020	59031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008382	ACAGTT	2	12	60794	60805	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	116254973
20	NC_008382	GATTGT	2	12	61373	61384	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	116254974
21	NC_008382	GCCCGC	2	12	69029	69040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254983
22	NC_008382	ATCTCG	2	12	69174	69185	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116254983
23	NC_008382	TCGGCG	2	12	70257	70268	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116254984
24	NC_008382	GGCCGA	2	12	72445	72456	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	116254984
25	NC_008382	AGCGTG	2	12	73228	73239	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	116254985
26	NC_008382	GGGATG	2	12	73849	73860	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	116254986
27	NC_008382	GCGGAA	2	12	77153	77164	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116254990
28	NC_008382	GTCATC	2	12	89193	89204	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116255003
29	NC_008382	TCGGCG	2	12	92040	92051	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255006
30	NC_008382	TCGGCG	2	12	92271	92282	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255006
31	NC_008382	TCGGCG	2	12	92502	92513	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	116255006
32	NC_008382	GTCGAT	2	12	93551	93562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	116255007
33	NC_008382	TTGGCG	2	12	96063	96074	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008382	CAACCG	2	12	99907	99918	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	116255013
35	NC_008382	GCAGTG	2	12	101592	101603	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008382	GGTTTG	2	12	109201	109212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008382	ACTGCG	2	12	115226	115237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	116255030
38	NC_008382	GGCAAG	2	12	121316	121327	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008382	CGCTTA	2	12	122391	122402	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	116255036
40	NC_008382	CCAGAA	2	12	126458	126469	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	116255040
41	NC_008382	GGACAA	2	12	127776	127787	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	116255041
42	NC_008382	GGATCT	2	12	132485	132496	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008382	ATGACG	2	12	132808	132819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	116255046
44	NC_008382	AGCCCC	2	12	136588	136599	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008382	GGATCT	2	12	140380	140391	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008382	ATGACG	2	12	140703	140714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008382	TGCAAC	2	12	142783	142794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008382	CGAAGG	2	12	144339	144350	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	116255059

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.