MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 32

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008382	AAAAG	2	10	2309	2318	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008382	CATCA	2	10	8971	8980	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008382	GCCAC	2	10	19098	19107	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_008382	CGCGT	2	10	19157	19166	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_008382	GCCTG	2	10	21098	21107	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008382	TGAGC	2	10	26638	26647	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008382	ATCCG	2	10	30439	30448	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008382	TAGAT	2	10	47946	47955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008382	ACAAT	2	10	47988	47997	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008382	AGGGA	2	10	48427	48436	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008382	GATCT	2	10	50071	50080	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008382	AAAAC	2	10	53562	53571	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008382	ATATA	2	10	53657	53666	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008382	ATTGA	2	10	53689	53698	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008382	TGGCT	5	25	54537	54561	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008382	CGTCG	2	10	55849	55858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008382	CTAGT	2	10	63189	63198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008382	AGCGG	2	10	67648	67657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008382	CTTTG	2	10	81564	81573	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008382	TCGAG	2	10	81575	81584	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008382	CGCAG	2	10	85052	85061	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008382	CCTTT	2	10	95444	95453	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008382	ATTGC	2	10	95979	95988	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008382	GCCTT	2	10	107334	107343	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_008382	GATGG	2	10	107710	107719	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008382	GATGC	2	10	109721	109730	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008382	CAATG	2	10	110077	110086	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008382	GCTGA	2	10	117459	117468	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008382	CCGAC	2	10	121656	121665	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_008382	CCTCC	2	10	123394	123403	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
31	NC_008382	CTCAG	2	10	141847	141856	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008382	TTCTG	2	10	151095	151104	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.