MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 410

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008382	GCGG	2	8	307	314	0 %	0 %	75 %	25 %	116254911
2	NC_008382	TCGA	2	8	328	335	25 %	25 %	25 %	25 %	116254911
3	NC_008382	GGGT	2	8	450	457	0 %	25 %	75 %	0 %	116254911
4	NC_008382	CGAT	2	8	524	531	25 %	25 %	25 %	25 %	116254911
5	NC_008382	AAGG	2	8	751	758	50 %	0 %	50 %	0 %	116254911
6	NC_008382	ACCG	2	8	1316	1323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008382	GATC	2	8	1508	1515	25 %	25 %	25 %	25 %	116254912
8	NC_008382	GACG	2	8	1733	1740	25 %	0 %	50 %	25 %	116254912
9	NC_008382	GATC	2	8	2198	2205	25 %	25 %	25 %	25 %	116254912
10	NC_008382	GGCC	2	8	2785	2792	0 %	0 %	50 %	50 %	116254913
11	NC_008382	TACG	2	8	2828	2835	25 %	25 %	25 %	25 %	116254913
12	NC_008382	GAGC	2	8	3533	3540	25 %	0 %	50 %	25 %	116254913
13	NC_008382	AGCC	2	8	3879	3886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008382	TTGA	2	8	4206	4213	25 %	50 %	25 %	0 %	116254914
15	NC_008382	GGGC	2	8	4257	4264	0 %	0 %	75 %	25 %	116254914
16	NC_008382	CTCG	2	8	4454	4461	0 %	25 %	25 %	50 %	116254914
17	NC_008382	AGGT	2	8	4684	4691	25 %	25 %	50 %	0 %	116254914
18	NC_008382	CATG	2	8	5514	5521	25 %	25 %	25 %	25 %	116254915
19	NC_008382	AGCC	2	8	5531	5538	25 %	0 %	25 %	50 %	116254915
20	NC_008382	GCCC	2	8	5774	5781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_008382	TCGT	2	8	5786	5793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008382	CAGT	2	8	5984	5991	25 %	25 %	25 %	25 %	116254916
23	NC_008382	GGCA	2	8	6024	6031	25 %	0 %	50 %	25 %	116254916
24	NC_008382	CAGC	2	8	6897	6904	25 %	0 %	25 %	50 %	116254917
25	NC_008382	GGCG	2	8	6924	6931	0 %	0 %	75 %	25 %	116254917
26	NC_008382	CGGC	2	8	7043	7050	0 %	0 %	50 %	50 %	116254917
27	NC_008382	CTCG	2	8	7158	7165	0 %	25 %	25 %	50 %	116254917
28	NC_008382	TGGC	2	8	7584	7591	0 %	25 %	50 %	25 %	116254917
29	NC_008382	CCGT	2	8	7899	7906	0 %	25 %	25 %	50 %	116254917
30	NC_008382	TCGC	2	8	7928	7935	0 %	25 %	25 %	50 %	116254917
31	NC_008382	CGAG	2	8	7980	7987	25 %	0 %	50 %	25 %	116254917
32	NC_008382	CGCT	2	8	8310	8317	0 %	25 %	25 %	50 %	116254917
33	NC_008382	GATC	2	8	8361	8368	25 %	25 %	25 %	25 %	116254917
34	NC_008382	GCTC	2	8	9393	9400	0 %	25 %	25 %	50 %	116254918
35	NC_008382	GATG	2	8	10215	10222	25 %	25 %	50 %	0 %	116254919
36	NC_008382	CGGC	2	8	10224	10231	0 %	0 %	50 %	50 %	116254919
37	NC_008382	AGTC	2	8	10871	10878	25 %	25 %	25 %	25 %	116254919
38	NC_008382	TTTC	2	8	11064	11071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008382	GTCC	2	8	12606	12613	0 %	25 %	25 %	50 %	116254921
40	NC_008382	GCGT	2	8	14485	14492	0 %	25 %	50 %	25 %	116254921
41	NC_008382	ACCG	2	8	15039	15046	25 %	0 %	25 %	50 %	116254921
42	NC_008382	GTGG	2	8	15596	15603	0 %	25 %	75 %	0 %	116254921
43	NC_008382	CGTG	2	8	15659	15666	0 %	25 %	50 %	25 %	116254921
44	NC_008382	CGGC	2	8	16218	16225	0 %	0 %	50 %	50 %	116254922
45	NC_008382	ATCT	2	8	16287	16294	25 %	50 %	0 %	25 %	116254922
46	NC_008382	CCCG	2	8	16691	16698	0 %	0 %	25 %	75 %	116254922
47	NC_008382	CGGC	3	12	16735	16746	0 %	0 %	50 %	50 %	116254922
48	NC_008382	GCTG	2	8	16840	16847	0 %	25 %	50 %	25 %	116254922
49	NC_008382	ACTC	2	8	16883	16890	25 %	25 %	0 %	50 %	116254922
50	NC_008382	GTCG	2	8	17066	17073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008382	TCGC	2	8	17219	17226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008382	CCGA	2	8	17356	17363	25 %	0 %	25 %	50 %	116254923
53	NC_008382	CGGC	2	8	17879	17886	0 %	0 %	50 %	50 %	116254923
54	NC_008382	GGCA	2	8	18218	18225	25 %	0 %	50 %	25 %	116254923
55	NC_008382	CCGG	2	8	18960	18967	0 %	0 %	50 %	50 %	116254925
56	NC_008382	GCGA	2	8	19557	19564	25 %	0 %	50 %	25 %	116254926
57	NC_008382	CCTG	2	8	19761	19768	0 %	25 %	25 %	50 %	116254926
58	NC_008382	GGCC	2	8	19795	19802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008382	CCGC	2	8	19900	19907	0 %	0 %	25 %	75 %	116254927
60	NC_008382	CGCT	2	8	20149	20156	0 %	25 %	25 %	50 %	116254927
61	NC_008382	GGGA	2	8	20363	20370	25 %	0 %	75 %	0 %	116254928
62	NC_008382	GTCC	2	8	20713	20720	0 %	25 %	25 %	50 %	116254929
63	NC_008382	TCGA	2	8	21470	21477	25 %	25 %	25 %	25 %	116254930
64	NC_008382	GATT	2	8	21614	21621	25 %	50 %	25 %	0 %	116254930
65	NC_008382	GGCC	2	8	22182	22189	0 %	0 %	50 %	50 %	116254932
66	NC_008382	CGCC	2	8	22305	22312	0 %	0 %	25 %	75 %	116254932
67	NC_008382	CCCG	2	8	22688	22695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_008382	CGGC	2	8	24154	24161	0 %	0 %	50 %	50 %	116254935
69	NC_008382	TGCC	2	8	24335	24342	0 %	25 %	25 %	50 %	116254935
70	NC_008382	GCCA	2	8	24571	24578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008382	AAGA	2	8	25540	25547	75 %	0 %	25 %	0 %	116254937
72	NC_008382	GAAA	2	8	26719	26726	75 %	0 %	25 %	0 %	116254938
73	NC_008382	CAAG	2	8	26851	26858	50 %	0 %	25 %	25 %	116254938
74	NC_008382	CTCA	2	8	26976	26983	25 %	25 %	0 %	50 %	116254938
75	NC_008382	CGGA	2	8	27961	27968	25 %	0 %	50 %	25 %	116254938
76	NC_008382	CAGC	2	8	29262	29269	25 %	0 %	25 %	50 %	116254940
77	NC_008382	TTCA	2	8	29358	29365	25 %	50 %	0 %	25 %	116254940
78	NC_008382	TCGC	2	8	29741	29748	0 %	25 %	25 %	50 %	116254940
79	NC_008382	TCGC	2	8	29898	29905	0 %	25 %	25 %	50 %	116254940
80	NC_008382	CGCC	2	8	29976	29983	0 %	0 %	25 %	75 %	116254940
81	NC_008382	TGCC	2	8	30247	30254	0 %	25 %	25 %	50 %	116254941
82	NC_008382	GCCC	2	8	31241	31248	0 %	0 %	25 %	75 %	116254942
83	NC_008382	AGGC	2	8	31323	31330	25 %	0 %	50 %	25 %	116254942
84	NC_008382	CGTT	2	8	31756	31763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008382	CTGG	2	8	32145	32152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008382	AAGC	2	8	32671	32678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008382	CACC	2	8	33536	33543	25 %	0 %	0 %	75 %	116254943
88	NC_008382	TCAT	2	8	33748	33755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008382	CTGG	2	8	33781	33788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008382	GACG	2	8	34019	34026	25 %	0 %	50 %	25 %	116254944
91	NC_008382	CTGG	2	8	34321	34328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008382	TTGG	2	8	34626	34633	0 %	50 %	50 %	0 %	116254945
93	NC_008382	TTGC	2	8	34710	34717	0 %	50 %	25 %	25 %	116254945
94	NC_008382	TCGT	2	8	35329	35336	0 %	50 %	25 %	25 %	116254945
95	NC_008382	ATCC	2	8	36372	36379	25 %	25 %	0 %	50 %	116254946
96	NC_008382	GTTC	2	8	36565	36572	0 %	50 %	25 %	25 %	116254946
97	NC_008382	GCGG	2	8	36663	36670	0 %	0 %	75 %	25 %	116254946
98	NC_008382	GTGA	2	8	37296	37303	25 %	25 %	50 %	0 %	116254948
99	NC_008382	AGAT	2	8	38266	38273	50 %	25 %	25 %	0 %	116254950
100	NC_008382	GCCA	2	8	38523	38530	25 %	0 %	25 %	50 %	116254950
101	NC_008382	AGGT	2	8	39053	39060	25 %	25 %	50 %	0 %	116254951
102	NC_008382	AACC	2	8	39382	39389	50 %	0 %	0 %	50 %	116254951
103	NC_008382	GGAA	2	8	39604	39611	50 %	0 %	50 %	0 %	116254951
104	NC_008382	CGAT	2	8	39939	39946	25 %	25 %	25 %	25 %	116254952
105	NC_008382	GGGA	2	8	40034	40041	25 %	0 %	75 %	0 %	116254952
106	NC_008382	CGCT	2	8	40097	40104	0 %	25 %	25 %	50 %	116254952
107	NC_008382	GCAA	2	8	40633	40640	50 %	0 %	25 %	25 %	116254952
108	NC_008382	GCCT	2	8	41457	41464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008382	GCGG	2	8	41537	41544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008382	TGGC	2	8	42104	42111	0 %	25 %	50 %	25 %	116254954
111	NC_008382	TCTT	2	8	42312	42319	0 %	75 %	0 %	25 %	116254955
112	NC_008382	GCTT	2	8	42357	42364	0 %	50 %	25 %	25 %	116254955
113	NC_008382	GCCG	2	8	43208	43215	0 %	0 %	50 %	50 %	116254956
114	NC_008382	ACGC	2	8	43367	43374	25 %	0 %	25 %	50 %	116254956
115	NC_008382	ATGG	2	8	43410	43417	25 %	25 %	50 %	0 %	116254956
116	NC_008382	CGAG	2	8	44079	44086	25 %	0 %	50 %	25 %	116254956
117	NC_008382	ATGG	2	8	44246	44253	25 %	25 %	50 %	0 %	116254956
118	NC_008382	AATA	2	8	45218	45225	75 %	25 %	0 %	0 %	116254957
119	NC_008382	ATAA	2	8	45325	45332	75 %	25 %	0 %	0 %	116254957
120	NC_008382	GACG	2	8	45370	45377	25 %	0 %	50 %	25 %	116254957
121	NC_008382	GATG	2	8	45873	45880	25 %	25 %	50 %	0 %	116254958
122	NC_008382	CAGC	2	8	45990	45997	25 %	0 %	25 %	50 %	116254958
123	NC_008382	CTTT	2	8	46462	46469	0 %	75 %	0 %	25 %	116254959
124	NC_008382	TTTC	2	8	46471	46478	0 %	75 %	0 %	25 %	116254959
125	NC_008382	TTTG	2	8	46479	46486	0 %	75 %	25 %	0 %	116254959
126	NC_008382	AGGC	2	8	46831	46838	25 %	0 %	50 %	25 %	116254960
127	NC_008382	GACG	2	8	47215	47222	25 %	0 %	50 %	25 %	116254960
128	NC_008382	ATTG	2	8	47853	47860	25 %	50 %	25 %	0 %	116254961
129	NC_008382	TCTG	2	8	48348	48355	0 %	50 %	25 %	25 %	116254962
130	NC_008382	TTGT	2	8	48390	48397	0 %	75 %	25 %	0 %	116254962
131	NC_008382	GAAT	2	8	48439	48446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008382	GGCC	2	8	48730	48737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008382	CTTT	2	8	48950	48957	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008382	TGCC	2	8	49049	49056	0 %	25 %	25 %	50 %	116254965
135	NC_008382	CGAA	2	8	49147	49154	50 %	0 %	25 %	25 %	116254965
136	NC_008382	CGTC	2	8	50919	50926	0 %	25 %	25 %	50 %	116254966
137	NC_008382	TGCC	2	8	51302	51309	0 %	25 %	25 %	50 %	116254966
138	NC_008382	GCGG	2	8	51505	51512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008382	GATA	2	8	51784	51791	50 %	25 %	25 %	0 %	116254967
140	NC_008382	CAGG	2	8	51884	51891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008382	GCCG	2	8	53047	53054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008382	AGCG	2	8	53542	53549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008382	TGGC	2	8	53679	53686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008382	CTTT	2	8	54586	54593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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146	NC_008382	AGAA	2	8	55146	55153	75 %	0 %	25 %	0 %	116254970
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150	NC_008382	GCGG	2	8	56161	56168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_008382	CCTT	2	8	56632	56639	0 %	50 %	0 %	50 %	116254972
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163	NC_008382	CGTC	2	8	59935	59942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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263	NC_008382	CTTC	2	8	95112	95119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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272	NC_008382	TCTG	2	8	96651	96658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
273	NC_008382	CGTC	2	8	97355	97362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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281	NC_008382	AAAG	2	8	101531	101538	75 %	0 %	25 %	0 %	116255015
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283	NC_008382	GCAA	2	8	101834	101841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NC_008382	AGCG	2	8	101954	101961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
285	NC_008382	TCAT	2	8	102890	102897	25 %	50 %	0 %	25 %	116255016
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290	NC_008382	ATTG	2	8	105160	105167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008382	ATCG	2	8	105684	105691	25 %	25 %	25 %	25 %	116255020
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297	NC_008382	ATCG	2	8	108862	108869	25 %	25 %	25 %	25 %	116255023
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299	NC_008382	GCCG	2	8	109695	109702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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406	NC_008382	CCGG	3	12	150747	150758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
407	NC_008382	CGAT	2	8	150852	150859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
408	NC_008382	CCCT	2	8	151203	151210	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
409	NC_008382	TGAG	2	8	151261	151268	25 %	25 %	50 %	0 %	116255066
410	NC_008382	CAGT	2	8	151501	151508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.