MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008382	ACCG	2	8	1316	1323	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008382	AGCC	2	8	3879	3886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008382	GCCC	2	8	5774	5781	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008382	TCGT	2	8	5786	5793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008382	TTTC	2	8	11064	11071	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008382	GTCG	2	8	17066	17073	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008382	TCGC	2	8	17219	17226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008382	GGCC	2	8	19795	19802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008382	CCCG	2	8	22688	22695	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_008382	GCCA	2	8	24571	24578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008382	CGTT	2	8	31756	31763	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008382	CTGG	2	8	32145	32152	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008382	AAGC	2	8	32671	32678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008382	TCAT	2	8	33748	33755	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008382	CTGG	2	8	33781	33788	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008382	CTGG	2	8	34321	34328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008382	GCCT	2	8	41457	41464	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008382	GCGG	2	8	41537	41544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008382	GAAT	2	8	48439	48446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008382	GGCC	2	8	48730	48737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008382	CTTT	2	8	48950	48957	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008382	GCGG	2	8	51505	51512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008382	CAGG	2	8	51884	51891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008382	GCCG	2	8	53047	53054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008382	AGCG	2	8	53542	53549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008382	TGGC	2	8	53679	53686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008382	CTTT	2	8	54586	54593	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008382	TTTC	2	8	55862	55869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008382	TGTA	2	8	56051	56058	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008382	GCGG	2	8	56161	56168	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008382	CCGT	2	8	59085	59092	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008382	GAAG	2	8	59182	59189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008382	GCTC	2	8	59527	59534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008382	TTCA	2	8	59720	59727	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008382	CGTC	2	8	59935	59942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008382	GGGC	2	8	67557	67564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008382	GTCT	2	8	69309	69316	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008382	TTCG	2	8	69531	69538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008382	CGGC	3	12	75660	75671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008382	GGCG	2	8	76545	76552	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008382	TGTT	2	8	80489	80496	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008382	TCGG	2	8	81690	81697	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008382	CTCA	2	8	81879	81886	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008382	TGGT	2	8	84895	84902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008382	TGCG	2	8	86829	86836	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008382	CGTT	2	8	93497	93504	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008382	CTTC	2	8	95112	95119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008382	GCGG	3	12	95219	95230	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008382	TCGT	2	8	96151	96158	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008382	TTTC	2	8	96375	96382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008382	GAAA	2	8	96399	96406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008382	GCAC	2	8	96481	96488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008382	TCTG	2	8	96651	96658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008382	CGTC	2	8	97355	97362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008382	TGCC	2	8	97738	97745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008382	CTGA	2	8	101574	101581	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008382	GCAA	2	8	101834	101841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008382	AGCG	2	8	101954	101961	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008382	GCGG	2	8	105142	105149	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008382	ATTG	2	8	105160	105167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008382	GCAC	2	8	107669	107676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008382	GAAA	2	8	107985	107992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008382	CGAT	2	8	108298	108305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008382	AGCC	2	8	109317	109324	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008382	GCCG	2	8	109695	109702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008382	GGAG	2	8	110094	110101	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008382	TTGT	2	8	110169	110176	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008382	GATC	3	12	117502	117513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008382	GCCT	2	8	118388	118395	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008382	GCGG	2	8	118468	118475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008382	TCCA	2	8	121722	121729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008382	CTAT	2	8	132506	132513	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008382	GGTC	2	8	132516	132523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008382	AGCG	2	8	132676	132683	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008382	CGGC	2	8	134050	134057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008382	CAGC	2	8	134253	134260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008382	GCGG	2	8	134587	134594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008382	ACCC	2	8	134641	134648	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_008382	GCCG	2	8	134722	134729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008382	CGTC	2	8	135790	135797	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008382	TGCC	2	8	136173	136180	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008382	CCCG	2	8	136559	136566	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008382	GGAC	2	8	137441	137448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008382	GGAG	2	8	139553	139560	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008382	CGAG	2	8	139753	139760	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008382	CTAT	2	8	140401	140408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008382	GGTC	2	8	140411	140418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008382	AGCG	2	8	140571	140578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008382	TGGA	2	8	141609	141616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008382	ATGG	2	8	141762	141769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008382	GTTT	2	8	142821	142828	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008382	TTGT	2	8	143028	143035	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008382	TGTT	2	8	143842	143849	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008382	ATCG	2	8	146492	146499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008382	CGGA	2	8	147000	147007	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008382	AGAA	2	8	149875	149882	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008382	GCCG	2	8	150270	150277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008382	CCGG	3	12	150747	150758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008382	CGAT	2	8	150852	150859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008382	CCCT	2	8	151203	151210	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_008382	CAGT	2	8	151501	151508	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.