MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL7

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008382	AC	3	6	725	730	50 %	0 %	0 %	50 %	116254911
2	NC_008382	CG	3	6	731	736	0 %	0 %	50 %	50 %	116254911
3	NC_008382	GC	3	6	1682	1687	0 %	0 %	50 %	50 %	116254912
4	NC_008382	GC	3	6	1806	1811	0 %	0 %	50 %	50 %	116254912
5	NC_008382	TC	3	6	1883	1888	0 %	50 %	0 %	50 %	116254912
6	NC_008382	CG	3	6	2897	2902	0 %	0 %	50 %	50 %	116254913
7	NC_008382	GC	3	6	2941	2946	0 %	0 %	50 %	50 %	116254913
8	NC_008382	GC	3	6	4119	4124	0 %	0 %	50 %	50 %	116254914
9	NC_008382	CG	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	116254914
10	NC_008382	CG	3	6	4553	4558	0 %	0 %	50 %	50 %	116254914
11	NC_008382	GA	3	6	4708	4713	50 %	0 %	50 %	0 %	116254914
12	NC_008382	GC	3	6	6246	6251	0 %	0 %	50 %	50 %	116254916
13	NC_008382	GA	3	6	6791	6796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008382	GC	3	6	7261	7266	0 %	0 %	50 %	50 %	116254917
15	NC_008382	CT	3	6	9613	9618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008382	TC	4	8	9849	9856	0 %	50 %	0 %	50 %	116254919
17	NC_008382	GC	3	6	9963	9968	0 %	0 %	50 %	50 %	116254919
18	NC_008382	CG	3	6	10013	10018	0 %	0 %	50 %	50 %	116254919
19	NC_008382	GC	3	6	10239	10244	0 %	0 %	50 %	50 %	116254919
20	NC_008382	CG	3	6	10745	10750	0 %	0 %	50 %	50 %	116254919
21	NC_008382	CG	4	8	10761	10768	0 %	0 %	50 %	50 %	116254919
22	NC_008382	GC	3	6	10909	10914	0 %	0 %	50 %	50 %	116254919
23	NC_008382	GC	3	6	11129	11134	0 %	0 %	50 %	50 %	116254920
24	NC_008382	CG	3	6	11182	11187	0 %	0 %	50 %	50 %	116254920
25	NC_008382	CG	3	6	11721	11726	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
26	NC_008382	CG	3	6	12468	12473	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
27	NC_008382	CT	3	6	12504	12509	0 %	50 %	0 %	50 %	116254921
28	NC_008382	GC	3	6	12521	12526	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
29	NC_008382	TC	3	6	12851	12856	0 %	50 %	0 %	50 %	116254921
30	NC_008382	CG	3	6	13276	13281	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
31	NC_008382	GC	3	6	14519	14524	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
32	NC_008382	TC	3	6	14627	14632	0 %	50 %	0 %	50 %	116254921
33	NC_008382	GC	3	6	15076	15081	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
34	NC_008382	CG	4	8	15166	15173	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
35	NC_008382	CG	3	6	15259	15264	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
36	NC_008382	CG	3	6	15845	15850	0 %	0 %	50 %	50 %	116254921
37	NC_008382	CG	3	6	16030	16035	0 %	0 %	50 %	50 %	116254922
38	NC_008382	GC	3	6	16516	16521	0 %	0 %	50 %	50 %	116254922
39	NC_008382	GC	3	6	17996	18001	0 %	0 %	50 %	50 %	116254923
40	NC_008382	AT	3	6	18259	18264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008382	GC	3	6	18544	18549	0 %	0 %	50 %	50 %	116254924
42	NC_008382	GC	3	6	18947	18952	0 %	0 %	50 %	50 %	116254925
43	NC_008382	CG	3	6	21142	21147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008382	CG	3	6	21327	21332	0 %	0 %	50 %	50 %	116254930
45	NC_008382	CG	3	6	21383	21388	0 %	0 %	50 %	50 %	116254930
46	NC_008382	TC	4	8	21857	21864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008382	GC	3	6	22615	22620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008382	GC	3	6	23395	23400	0 %	0 %	50 %	50 %	116254934
49	NC_008382	GC	3	6	23680	23685	0 %	0 %	50 %	50 %	116254935
50	NC_008382	TA	3	6	25598	25603	50 %	50 %	0 %	0 %	116254937
51	NC_008382	CA	3	6	25678	25683	50 %	0 %	0 %	50 %	116254937
52	NC_008382	GT	3	6	26147	26152	0 %	50 %	50 %	0 %	116254937
53	NC_008382	AT	3	6	26371	26376	50 %	50 %	0 %	0 %	116254937
54	NC_008382	AG	3	6	26414	26419	50 %	0 %	50 %	0 %	116254937
55	NC_008382	CG	3	6	26565	26570	0 %	0 %	50 %	50 %	116254937
56	NC_008382	GC	3	6	26820	26825	0 %	0 %	50 %	50 %	116254938
57	NC_008382	CT	3	6	27122	27127	0 %	50 %	0 %	50 %	116254938
58	NC_008382	GA	3	6	27441	27446	50 %	0 %	50 %	0 %	116254938
59	NC_008382	TC	3	6	27477	27482	0 %	50 %	0 %	50 %	116254938
60	NC_008382	AG	3	6	27969	27974	50 %	0 %	50 %	0 %	116254938
61	NC_008382	CA	3	6	28192	28197	50 %	0 %	0 %	50 %	116254938
62	NC_008382	GC	3	6	28361	28366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008382	GC	4	8	28638	28645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008382	TC	3	6	28870	28875	0 %	50 %	0 %	50 %	116254939
65	NC_008382	GC	3	6	33300	33305	0 %	0 %	50 %	50 %	116254943
66	NC_008382	GC	3	6	33635	33640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008382	GC	3	6	33682	33687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008382	GA	3	6	34271	34276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008382	GA	3	6	34409	34414	50 %	0 %	50 %	0 %	116254945
70	NC_008382	CG	3	6	34580	34585	0 %	0 %	50 %	50 %	116254945
71	NC_008382	TC	3	6	35000	35005	0 %	50 %	0 %	50 %	116254945
72	NC_008382	CG	3	6	36021	36026	0 %	0 %	50 %	50 %	116254946
73	NC_008382	CG	3	6	36711	36716	0 %	0 %	50 %	50 %	116254946
74	NC_008382	CG	3	6	37175	37180	0 %	0 %	50 %	50 %	116254948
75	NC_008382	TG	3	6	37425	37430	0 %	50 %	50 %	0 %	116254948
76	NC_008382	GC	3	6	38318	38323	0 %	0 %	50 %	50 %	116254950
77	NC_008382	GA	3	6	38396	38401	50 %	0 %	50 %	0 %	116254950
78	NC_008382	AT	3	6	38442	38447	50 %	50 %	0 %	0 %	116254950
79	NC_008382	CG	3	6	38468	38473	0 %	0 %	50 %	50 %	116254950
80	NC_008382	AC	3	6	38569	38574	50 %	0 %	0 %	50 %	116254950
81	NC_008382	GT	3	6	38871	38876	0 %	50 %	50 %	0 %	116254950
82	NC_008382	TG	3	6	39133	39138	0 %	50 %	50 %	0 %	116254951
83	NC_008382	CA	3	6	40245	40250	50 %	0 %	0 %	50 %	116254952
84	NC_008382	GC	3	6	40306	40311	0 %	0 %	50 %	50 %	116254952
85	NC_008382	GC	3	6	40549	40554	0 %	0 %	50 %	50 %	116254952
86	NC_008382	AG	3	6	42426	42431	50 %	0 %	50 %	0 %	116254955
87	NC_008382	CA	3	6	43265	43270	50 %	0 %	0 %	50 %	116254956
88	NC_008382	GT	3	6	43641	43646	0 %	50 %	50 %	0 %	116254956
89	NC_008382	CT	3	6	43943	43948	0 %	50 %	0 %	50 %	116254956
90	NC_008382	AT	3	6	44860	44865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008382	GT	3	6	44946	44951	0 %	50 %	50 %	0 %	116254957
92	NC_008382	AG	3	6	44996	45001	50 %	0 %	50 %	0 %	116254957
93	NC_008382	TA	4	8	45048	45055	50 %	50 %	0 %	0 %	116254957
94	NC_008382	TC	3	6	45555	45560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008382	GA	3	6	45726	45731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008382	TA	3	6	46183	46188	50 %	50 %	0 %	0 %	116254958
97	NC_008382	TG	3	6	46206	46211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008382	TA	3	6	46237	46242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008382	CT	3	6	46251	46256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008382	AT	3	6	46445	46450	50 %	50 %	0 %	0 %	116254959
101	NC_008382	CG	3	6	46678	46683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008382	GC	3	6	47489	47494	0 %	0 %	50 %	50 %	116254960
103	NC_008382	CG	3	6	47552	47557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008382	AT	3	6	47702	47707	50 %	50 %	0 %	0 %	116254961
105	NC_008382	AT	3	6	47911	47916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008382	AG	4	8	48309	48316	50 %	0 %	50 %	0 %	116254962
107	NC_008382	AG	3	6	48488	48493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008382	TA	3	6	48536	48541	50 %	50 %	0 %	0 %	116254963
109	NC_008382	GA	3	6	48546	48551	50 %	0 %	50 %	0 %	116254963
110	NC_008382	TG	3	6	48637	48642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008382	TC	3	6	48686	48691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008382	AG	3	6	48879	48884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008382	AT	3	6	48933	48938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008382	CG	3	6	50018	50023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008382	TC	3	6	50063	50068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008382	GC	3	6	50583	50588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008382	GC	3	6	50647	50652	0 %	0 %	50 %	50 %	116254966
118	NC_008382	CG	3	6	51553	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008382	AT	3	6	53247	53252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008382	AG	3	6	53376	53381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008382	AT	3	6	53466	53471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008382	TA	3	6	54322	54327	50 %	50 %	0 %	0 %	116254968
123	NC_008382	AT	3	6	54569	54574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008382	GC	3	6	55226	55231	0 %	0 %	50 %	50 %	116254970
125	NC_008382	GC	3	6	56880	56885	0 %	0 %	50 %	50 %	116254972
126	NC_008382	CG	3	6	57037	57042	0 %	0 %	50 %	50 %	116254972
127	NC_008382	CG	3	6	57139	57144	0 %	0 %	50 %	50 %	116254972
128	NC_008382	GC	3	6	58081	58086	0 %	0 %	50 %	50 %	116254972
129	NC_008382	GA	3	6	58713	58718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008382	CG	3	6	58815	58820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008382	CG	3	6	58914	58919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_008382	AT	3	6	59680	59685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008382	AT	3	6	59750	59755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008382	AG	3	6	59866	59871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008382	CG	3	6	60221	60226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008382	AG	3	6	60632	60637	50 %	0 %	50 %	0 %	116254973
137	NC_008382	CG	3	6	60701	60706	0 %	0 %	50 %	50 %	116254973
138	NC_008382	GA	4	8	60721	60728	50 %	0 %	50 %	0 %	116254973
139	NC_008382	GC	3	6	60833	60838	0 %	0 %	50 %	50 %	116254973
140	NC_008382	AG	3	6	61724	61729	50 %	0 %	50 %	0 %	116254974
141	NC_008382	GA	4	8	62061	62068	50 %	0 %	50 %	0 %	116254974
142	NC_008382	TC	3	6	62426	62431	0 %	50 %	0 %	50 %	116254975
143	NC_008382	GC	3	6	63532	63537	0 %	0 %	50 %	50 %	116254976
144	NC_008382	CG	3	6	63900	63905	0 %	0 %	50 %	50 %	116254976
145	NC_008382	TG	3	6	65492	65497	0 %	50 %	50 %	0 %	116254977
146	NC_008382	GC	3	6	66416	66421	0 %	0 %	50 %	50 %	116254979
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148	NC_008382	CT	3	6	66810	66815	0 %	50 %	0 %	50 %	116254979
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.