MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008381	GCGCG	2	10	35237	35246	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_008381	CCTAT	2	10	40351	40360	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008381	CGGCA	2	10	46421	46430	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008381	AGCGG	2	10	52807	52816	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_008381	ATCGC	2	10	53215	53224	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008381	AAAGG	2	10	58508	58517	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008381	GGTCC	2	10	64383	64392	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008381	GGTCC	2	10	84823	84832	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008381	CAAAA	2	10	89742	89751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_008381	GAAAC	2	10	90695	90704	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008381	TGACA	2	10	99266	99275	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008381	CACGA	2	10	99648	99657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_008381	CACGC	2	10	107464	107473	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_008381	ATCCG	2	10	109274	109283	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008381	CGAAG	2	10	112042	112051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008381	AGCCG	2	10	134332	134341	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_008381	GGAAA	2	10	138971	138980	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008381	ACAGA	2	10	139606	139615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_008381	TCGTG	2	10	140460	140469	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008381	GCGGA	2	10	140850	140859	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_008381	AGTCG	2	10	141166	141175	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008381	AGCAA	2	10	143563	143572	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008381	CGATG	2	10	144031	144040	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008381	CCATC	2	10	144098	144107	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_008381	GCGTG	2	10	145504	145513	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008381	CGCTA	2	10	148866	148875	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_008381	CTCGC	2	10	150926	150935	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_008381	CCGCT	2	10	153879	153888	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_008381	CGGAA	2	10	154952	154961	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_008381	AACCC	2	10	161647	161656	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_008381	ACCAG	2	10	162943	162952	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008381	GCTGG	2	10	173953	173962	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008381	AGCTG	2	10	185246	185255	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008381	TCCAT	2	10	186300	186309	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_008381	TGTCG	2	10	202002	202011	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008381	TAGAA	2	10	205230	205239	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008381	CTGCG	2	10	218887	218896	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008381	AGCGA	2	10	222694	222703	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008381	AGCCT	2	10	226395	226404	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_008381	GGATC	2	10	228900	228909	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_008381	CGAAA	2	10	275769	275778	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_008381	AGGAT	2	10	279456	279465	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008381	TCCGC	2	10	295510	295519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_008381	GCTTT	2	10	302423	302432	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_008381	CCGGT	2	10	302576	302585	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_008381	AAACC	2	10	322253	322262	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_008381	TGAGC	2	10	330099	330108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008381	GCGAT	2	10	331426	331435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008381	TGCAC	2	10	354342	354351	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_008381	TGCAT	2	10	358787	358796	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_008381	ACGGC	2	10	382133	382142	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008381	GACTA	2	10	405340	405349	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008381	GGAGA	2	10	415356	415365	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008381	CAGTT	2	10	416999	417008	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_008381	CAGGA	2	10	460277	460286	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_008381	GATCG	2	10	463061	463070	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_008381	ATGGC	2	10	466540	466549	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008381	GGCGT	2	10	467673	467682	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_008381	CCCGC	2	10	471707	471716	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_008381	GATTC	2	10	485157	485166	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.