MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 1280

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008381	TCGA	2	8	52	59	25 %	25 %	25 %	25 %	116254468
2	NC_008381	GCCG	2	8	341	348	0 %	0 %	50 %	50 %	116254468
3	NC_008381	GCAG	2	8	918	925	25 %	0 %	50 %	25 %	116254468
4	NC_008381	TCCA	2	8	1503	1510	25 %	25 %	0 %	50 %	116254469
5	NC_008381	GCGG	2	8	1598	1605	0 %	0 %	75 %	25 %	116254469
6	NC_008381	GACA	2	8	1787	1794	50 %	0 %	25 %	25 %	116254469
7	NC_008381	GGCC	2	8	1861	1868	0 %	0 %	50 %	50 %	116254469
8	NC_008381	GCTG	2	8	1888	1895	0 %	25 %	50 %	25 %	116254469
9	NC_008381	GTCG	2	8	2502	2509	0 %	25 %	50 %	25 %	116254470
10	NC_008381	AGGC	2	8	2729	2736	25 %	0 %	50 %	25 %	116254470
11	NC_008381	TCGA	2	8	3477	3484	25 %	25 %	25 %	25 %	116254470
12	NC_008381	GCAT	2	8	3559	3566	25 %	25 %	25 %	25 %	116254470
13	NC_008381	GCCG	2	8	3687	3694	0 %	0 %	50 %	50 %	116254470
14	NC_008381	GCGG	2	8	3726	3733	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008381	GATA	2	8	3738	3745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008381	ATCG	2	8	4201	4208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008381	GCCT	2	8	4523	4530	0 %	25 %	25 %	50 %	116254471
18	NC_008381	TTCT	2	8	5042	5049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008381	CCGA	2	8	5271	5278	25 %	0 %	25 %	50 %	116254473
20	NC_008381	CGAT	2	8	5390	5397	25 %	25 %	25 %	25 %	116254473
21	NC_008381	CCGG	3	12	5460	5471	0 %	0 %	50 %	50 %	116254473
22	NC_008381	CTGG	2	8	5491	5498	0 %	25 %	50 %	25 %	116254473
23	NC_008381	GATG	2	8	5523	5530	25 %	25 %	50 %	0 %	116254473
24	NC_008381	GCGA	2	8	5531	5538	25 %	0 %	50 %	25 %	116254473
25	NC_008381	GTCG	2	8	5683	5690	0 %	25 %	50 %	25 %	116254473
26	NC_008381	CGGC	2	8	5940	5947	0 %	0 %	50 %	50 %	116254473
27	NC_008381	GGTC	2	8	6162	6169	0 %	25 %	50 %	25 %	116254473
28	NC_008381	GCCT	2	8	6335	6342	0 %	25 %	25 %	50 %	116254474
29	NC_008381	CGCT	2	8	6933	6940	0 %	25 %	25 %	50 %	116254475
30	NC_008381	CGGC	2	8	7507	7514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008381	CTCG	2	8	7796	7803	0 %	25 %	25 %	50 %	116254477
32	NC_008381	GACC	2	8	8009	8016	25 %	0 %	25 %	50 %	116254478
33	NC_008381	ATCG	2	8	8392	8399	25 %	25 %	25 %	25 %	116254479
34	NC_008381	CTTC	2	8	9218	9225	0 %	50 %	0 %	50 %	116254480
35	NC_008381	GCTG	2	8	9525	9532	0 %	25 %	50 %	25 %	116254480
36	NC_008381	GGGC	2	8	9575	9582	0 %	0 %	75 %	25 %	116254480
37	NC_008381	GTGC	2	8	9589	9596	0 %	25 %	50 %	25 %	116254480
38	NC_008381	TCGT	2	8	9789	9796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008381	AGCC	2	8	10025	10032	25 %	0 %	25 %	50 %	116254481
40	NC_008381	CGCC	2	8	10602	10609	0 %	0 %	25 %	75 %	116254481
41	NC_008381	GTCG	2	8	11090	11097	0 %	25 %	50 %	25 %	116254482
42	NC_008381	CTTT	2	8	11378	11385	0 %	75 %	0 %	25 %	116254482
43	NC_008381	ATCG	2	8	11967	11974	25 %	25 %	25 %	25 %	116254483
44	NC_008381	ACGA	2	8	12412	12419	50 %	0 %	25 %	25 %	116254483
45	NC_008381	CAGC	2	8	12460	12467	25 %	0 %	25 %	50 %	116254483
46	NC_008381	CGGC	2	8	12552	12559	0 %	0 %	50 %	50 %	116254483
47	NC_008381	CCAT	2	8	13190	13197	25 %	25 %	0 %	50 %	116254484
48	NC_008381	CAAC	2	8	13280	13287	50 %	0 %	0 %	50 %	116254484
49	NC_008381	TTGA	2	8	13673	13680	25 %	50 %	25 %	0 %	116254485
50	NC_008381	CGGA	2	8	14119	14126	25 %	0 %	50 %	25 %	116254485
51	NC_008381	GCGG	2	8	14369	14376	0 %	0 %	75 %	25 %	116254485
52	NC_008381	TCGG	2	8	14559	14566	0 %	25 %	50 %	25 %	116254485
53	NC_008381	GGAC	2	8	15623	15630	25 %	0 %	50 %	25 %	116254486
54	NC_008381	GAAG	2	8	17218	17225	50 %	0 %	50 %	0 %	116254487
55	NC_008381	TGCT	2	8	17484	17491	0 %	50 %	25 %	25 %	116254488
56	NC_008381	TCTA	2	8	17763	17770	25 %	50 %	0 %	25 %	116254488
57	NC_008381	TACT	2	8	17952	17959	25 %	50 %	0 %	25 %	116254488
58	NC_008381	ATTT	2	8	17997	18004	25 %	75 %	0 %	0 %	116254488
59	NC_008381	TGAA	2	8	18265	18272	50 %	25 %	25 %	0 %	116254488
60	NC_008381	GCCT	2	8	18989	18996	0 %	25 %	25 %	50 %	116254489
61	NC_008381	GGCC	2	8	19293	19300	0 %	0 %	50 %	50 %	116254489
62	NC_008381	GCGA	2	8	19714	19721	25 %	0 %	50 %	25 %	116254490
63	NC_008381	TTTA	2	8	19750	19757	25 %	75 %	0 %	0 %	116254490
64	NC_008381	GAAG	2	8	20117	20124	50 %	0 %	50 %	0 %	116254490
65	NC_008381	GTCG	2	8	21175	21182	0 %	25 %	50 %	25 %	116254491
66	NC_008381	ATCT	2	8	21206	21213	25 %	50 %	0 %	25 %	116254491
67	NC_008381	TGCG	2	8	21563	21570	0 %	25 %	50 %	25 %	116254492
68	NC_008381	CCGC	2	8	22073	22080	0 %	0 %	25 %	75 %	116254492
69	NC_008381	ACGA	2	8	22382	22389	50 %	0 %	25 %	25 %	116254493
70	NC_008381	AGGA	2	8	22881	22888	50 %	0 %	50 %	0 %	116254493
71	NC_008381	GGGC	2	8	22998	23005	0 %	0 %	75 %	25 %	116254493
72	NC_008381	CCGC	2	8	23322	23329	0 %	0 %	25 %	75 %	116254493
73	NC_008381	AGCC	2	8	24431	24438	25 %	0 %	25 %	50 %	116254494
74	NC_008381	ATCC	2	8	24509	24516	25 %	25 %	0 %	50 %	116254494
75	NC_008381	ATGC	2	8	24781	24788	25 %	25 %	25 %	25 %	116254495
76	NC_008381	TCAA	2	8	25195	25202	50 %	25 %	0 %	25 %	116254495
77	NC_008381	CCCA	2	8	25206	25213	25 %	0 %	0 %	75 %	116254495
78	NC_008381	TGCC	2	8	25400	25407	0 %	25 %	25 %	50 %	116254495
79	NC_008381	GCAC	2	8	26775	26782	25 %	0 %	25 %	50 %	116254495
80	NC_008381	TGGT	2	8	26855	26862	0 %	50 %	50 %	0 %	116254495
81	NC_008381	TCCA	2	8	26892	26899	25 %	25 %	0 %	50 %	116254496
82	NC_008381	CTCG	2	8	26901	26908	0 %	25 %	25 %	50 %	116254496
83	NC_008381	ATCC	2	8	27019	27026	25 %	25 %	0 %	50 %	116254496
84	NC_008381	TCGA	2	8	27273	27280	25 %	25 %	25 %	25 %	116254496
85	NC_008381	GGAC	2	8	28275	28282	25 %	0 %	50 %	25 %	116254496
86	NC_008381	TGGG	2	8	28601	28608	0 %	25 %	75 %	0 %	116254496
87	NC_008381	TAAA	2	8	28794	28801	75 %	25 %	0 %	0 %	116254496
88	NC_008381	CCAC	2	8	29125	29132	25 %	0 %	0 %	75 %	116254496
89	NC_008381	GGCA	2	8	29961	29968	25 %	0 %	50 %	25 %	116254496
90	NC_008381	GGCG	2	8	30277	30284	0 %	0 %	75 %	25 %	116254496
91	NC_008381	TGGT	2	8	31294	31301	0 %	50 %	50 %	0 %	116254497
92	NC_008381	ACGG	2	8	31708	31715	25 %	0 %	50 %	25 %	116254497
93	NC_008381	GCGA	2	8	32622	32629	25 %	0 %	50 %	25 %	116254497
94	NC_008381	AGTG	2	8	32816	32823	25 %	25 %	50 %	0 %	116254497
95	NC_008381	AATC	2	8	33166	33173	50 %	25 %	0 %	25 %	116254497
96	NC_008381	CGGT	2	8	33533	33540	0 %	25 %	50 %	25 %	116254497
97	NC_008381	GTCC	2	8	33606	33613	0 %	25 %	25 %	50 %	116254497
98	NC_008381	TCGG	2	8	33633	33640	0 %	25 %	50 %	25 %	116254497
99	NC_008381	GCCC	2	8	35651	35658	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_008381	GAAC	2	8	35706	35713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008381	GCTG	2	8	35750	35757	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008381	ACAT	2	8	35980	35987	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008381	ACAA	2	8	36168	36175	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008381	GAAT	2	8	37057	37064	50 %	25 %	25 %	0 %	116254499
105	NC_008381	CCGG	2	8	37345	37352	0 %	0 %	50 %	50 %	116254499
106	NC_008381	ATGC	2	8	37886	37893	25 %	25 %	25 %	25 %	116254499
107	NC_008381	GCCG	2	8	37899	37906	0 %	0 %	50 %	50 %	116254499
108	NC_008381	GAGC	2	8	38138	38145	25 %	0 %	50 %	25 %	116254499
109	NC_008381	CGGC	2	8	38364	38371	0 %	0 %	50 %	50 %	116254499
110	NC_008381	GTTT	2	8	38513	38520	0 %	75 %	25 %	0 %	116254499
111	NC_008381	GCGA	2	8	38647	38654	25 %	0 %	50 %	25 %	116254499
112	NC_008381	CTGA	2	8	38931	38938	25 %	25 %	25 %	25 %	116254500
113	NC_008381	TGCG	2	8	39611	39618	0 %	25 %	50 %	25 %	116254500
114	NC_008381	GAGC	2	8	39668	39675	25 %	0 %	50 %	25 %	116254500
115	NC_008381	AAAT	2	8	39891	39898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008381	ACTC	2	8	39911	39918	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008381	TGAT	2	8	40033	40040	25 %	50 %	25 %	0 %	116254501
118	NC_008381	CTTT	2	8	40594	40601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008381	GTCG	2	8	40908	40915	0 %	25 %	50 %	25 %	116254502
120	NC_008381	AGGC	2	8	40987	40994	25 %	0 %	50 %	25 %	116254502
121	NC_008381	AAGC	2	8	41035	41042	50 %	0 %	25 %	25 %	116254502
122	NC_008381	CAAC	2	8	41069	41076	50 %	0 %	0 %	50 %	116254502
123	NC_008381	GGTC	2	8	41485	41492	0 %	25 %	50 %	25 %	116254502
124	NC_008381	GCGG	2	8	41726	41733	0 %	0 %	75 %	25 %	116254502
125	NC_008381	GCGG	2	8	41759	41766	0 %	0 %	75 %	25 %	116254502
126	NC_008381	GAAG	2	8	42386	42393	50 %	0 %	50 %	0 %	116254502
127	NC_008381	GAAG	2	8	42902	42909	50 %	0 %	50 %	0 %	116254503
128	NC_008381	TCGC	2	8	43075	43082	0 %	25 %	25 %	50 %	116254503
129	NC_008381	GCCG	2	8	43113	43120	0 %	0 %	50 %	50 %	116254503
130	NC_008381	CGCC	2	8	43962	43969	0 %	0 %	25 %	75 %	116254504
131	NC_008381	GCTG	2	8	43979	43986	0 %	25 %	50 %	25 %	116254504
132	NC_008381	AGGC	2	8	44110	44117	25 %	0 %	50 %	25 %	116254504
133	NC_008381	GTCC	2	8	44158	44165	0 %	25 %	25 %	50 %	116254504
134	NC_008381	TGGC	2	8	45460	45467	0 %	25 %	50 %	25 %	116254506
135	NC_008381	CCGG	2	8	45752	45759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008381	GGTC	2	8	46175	46182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008381	TCGA	2	8	46929	46936	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008381	TCCT	2	8	47072	47079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008381	GACG	2	8	47359	47366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008381	CGAT	2	8	48081	48088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008381	CCGG	2	8	49348	49355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008381	GACC	2	8	49405	49412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008381	GCTG	2	8	49873	49880	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008381	GCAC	2	8	50549	50556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008381	GACC	2	8	50565	50572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008381	TGTC	2	8	51614	51621	0 %	50 %	25 %	25 %	116254507
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155	NC_008381	GAAC	2	8	57099	57106	50 %	0 %	25 %	25 %	116254513
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158	NC_008381	CGCC	2	8	57510	57517	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
159	NC_008381	ATTT	2	8	58686	58693	25 %	75 %	0 %	0 %	116254515
160	NC_008381	TGTC	2	8	59405	59412	0 %	50 %	25 %	25 %	116254516
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175	NC_008381	AAAG	2	8	64862	64869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_008381	CGTG	2	8	65105	65112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_008381	CGGC	2	8	65541	65548	0 %	0 %	50 %	50 %	116254522
178	NC_008381	ATGG	3	12	65759	65770	25 %	25 %	50 %	0 %	116254522
179	NC_008381	CCAG	2	8	65780	65787	25 %	0 %	25 %	50 %	116254522
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181	NC_008381	ACCA	2	8	66075	66082	50 %	0 %	0 %	50 %	116254522
182	NC_008381	CTTG	2	8	66279	66286	0 %	50 %	25 %	25 %	116254522
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184	NC_008381	CGCA	2	8	67336	67343	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
185	NC_008381	TTCC	2	8	67420	67427	0 %	50 %	0 %	50 %	116254524
186	NC_008381	ATGA	2	8	67665	67672	50 %	25 %	25 %	0 %	116254524
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201	NC_008381	TCGG	2	8	76361	76368	0 %	25 %	50 %	25 %	116254533
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244	NC_008381	GATG	2	8	92042	92049	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
245	NC_008381	GTCG	2	8	92489	92496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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258	NC_008381	ATCG	2	8	96456	96463	25 %	25 %	25 %	25 %	116254551
259	NC_008381	CGTG	2	8	96637	96644	0 %	25 %	50 %	25 %	116254551
260	NC_008381	GCCG	2	8	97029	97036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
261	NC_008381	TGTC	2	8	97282	97289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
262	NC_008381	CGAT	2	8	97690	97697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
263	NC_008381	TCGC	2	8	97984	97991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
264	NC_008381	GGCT	2	8	98863	98870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
265	NC_008381	CAGG	2	8	98936	98943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
266	NC_008381	TCAA	2	8	99379	99386	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_008381	GCAG	2	8	101800	101807	25 %	0 %	50 %	25 %	116254553
275	NC_008381	TGGA	2	8	101990	101997	25 %	25 %	50 %	0 %	116254553
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282	NC_008381	CGAA	2	8	103883	103890	50 %	0 %	25 %	25 %	116254555
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