MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 7695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008381	TTG	2	6	20	25	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254468
2	NC_008381	CGA	2	6	80	85	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254468
3	NC_008381	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254468
4	NC_008381	GTT	2	6	120	125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254468
5	NC_008381	CGG	2	6	151	156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254468
6	NC_008381	CAG	2	6	159	164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254468
7	NC_008381	GCT	2	6	180	185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254468
8	NC_008381	CGC	2	6	216	221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254468
9	NC_008381	CGG	2	6	251	256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254468
10	NC_008381	CCA	2	6	300	305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254468
11	NC_008381	CCT	2	6	323	328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254468
12	NC_008381	GGC	2	6	388	393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254468
13	NC_008381	GAC	3	9	402	410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254468
14	NC_008381	CGC	2	6	571	576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254468
15	NC_008381	CGA	2	6	693	698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254468
16	NC_008381	TTC	2	6	709	714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254468
17	NC_008381	GTC	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254468
18	NC_008381	ATC	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254468
19	NC_008381	CCG	2	6	778	783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254468
20	NC_008381	TCA	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254468
21	NC_008381	CTG	2	6	901	906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254468
22	NC_008381	CGT	2	6	909	914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254468
23	NC_008381	ATG	2	6	980	985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254468
24	NC_008381	TCG	2	6	1001	1006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254468
25	NC_008381	GAT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254468
26	NC_008381	AGC	2	6	1361	1366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254469
27	NC_008381	CGC	2	6	1367	1372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254469
28	NC_008381	CAG	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254469
29	NC_008381	GCC	2	6	1575	1580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254469
30	NC_008381	CGT	2	6	1634	1639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254469
31	NC_008381	GAA	2	6	1656	1661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254469
32	NC_008381	CGC	2	6	1734	1739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254469
33	NC_008381	CCG	2	6	1957	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254469
34	NC_008381	GGA	2	6	2015	2020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254469
35	NC_008381	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254469
36	NC_008381	CGG	2	6	2125	2130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254469
37	NC_008381	CGC	2	6	2168	2173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254469
38	NC_008381	GAC	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254470
39	NC_008381	GCG	2	6	2436	2441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254470
40	NC_008381	GCT	2	6	2550	2555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254470
41	NC_008381	GAA	2	6	2610	2615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254470
42	NC_008381	GCG	2	6	2703	2708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254470
43	NC_008381	CGC	2	6	2715	2720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254470
44	NC_008381	TCG	2	6	2723	2728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254470
45	NC_008381	CGA	2	6	2802	2807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254470
46	NC_008381	GCT	2	6	2832	2837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254470
47	NC_008381	GAG	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254470
48	NC_008381	GCC	2	6	2927	2932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254470
49	NC_008381	GAA	2	6	2965	2970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254470
50	NC_008381	CGA	2	6	3041	3046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254470
51	NC_008381	CGA	2	6	3069	3074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254470
52	NC_008381	GGA	2	6	3315	3320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116254470
53	NC_008381	TGG	2	6	3354	3359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116254470
54	NC_008381	GCC	2	6	3517	3522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254470
55	NC_008381	CGC	2	6	3543	3548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254470
56	NC_008381	GGC	2	6	3577	3582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254470
57	NC_008381	GCT	2	6	3771	3776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008381	ACG	2	6	3792	3797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008381	TGC	2	6	3828	3833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008381	GCC	2	6	3997	4002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008381	CGC	2	6	4153	4158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008381	TCT	2	6	4222	4227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008381	AAG	2	6	4234	4239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008381	CCA	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_008381	CAA	2	6	4283	4288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008381	CGC	2	6	4384	4389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254471
67	NC_008381	CAG	2	6	4426	4431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254471
68	NC_008381	GAC	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254471
69	NC_008381	GAT	3	9	4564	4572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254471
70	NC_008381	GAA	2	6	4585	4590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254471
71	NC_008381	ACC	2	6	4634	4639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254471
72	NC_008381	GAT	2	6	4693	4698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254471
73	NC_008381	CGC	2	6	4711	4716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254471
74	NC_008381	GAT	2	6	4759	4764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254471
75	NC_008381	TCG	2	6	4783	4788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254472
76	NC_008381	GCG	2	6	4834	4839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254472
77	NC_008381	CTC	2	6	4860	4865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254472
78	NC_008381	TCT	2	6	5066	5071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008381	AAT	2	6	5090	5095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008381	AGC	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254473
81	NC_008381	CGC	2	6	5159	5164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254473
82	NC_008381	GTT	2	6	5170	5175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254473
83	NC_008381	TAG	2	6	5177	5182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254473
84	NC_008381	CTG	2	6	5191	5196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254473
85	NC_008381	GCT	2	6	5315	5320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254473
86	NC_008381	CGC	2	6	5327	5332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254473
87	NC_008381	GCC	2	6	5413	5418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254473
88	NC_008381	GAC	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254473
89	NC_008381	GTC	2	6	5551	5556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254473
90	NC_008381	CGA	3	9	5618	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254473
91	NC_008381	CCG	2	6	5627	5632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254473
92	NC_008381	CAG	2	6	5701	5706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254473
93	NC_008381	CGC	2	6	5750	5755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254473
94	NC_008381	GAT	2	6	5991	5996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116254473
95	NC_008381	AGC	3	9	6011	6019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254473
96	NC_008381	CCG	2	6	6024	6029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254473
97	NC_008381	CGC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254473
98	NC_008381	CGG	2	6	6191	6196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254473
99	NC_008381	GCA	2	6	6204	6209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254473
100	NC_008381	CGT	2	6	6290	6295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254474
101	NC_008381	GCA	2	6	6346	6351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254474
102	NC_008381	CAT	2	6	6362	6367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254474
103	NC_008381	GAA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254474
104	NC_008381	CTG	2	6	6400	6405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254474
105	NC_008381	GAA	2	6	6472	6477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116254474
106	NC_008381	GTC	2	6	6500	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254474
107	NC_008381	CTC	2	6	6552	6557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254474
108	NC_008381	CCG	2	6	6566	6571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254474
109	NC_008381	ATC	3	9	6592	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254474
110	NC_008381	CCT	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116254475
111	NC_008381	GCA	2	6	6628	6633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254475
112	NC_008381	GCG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254475
113	NC_008381	GCC	2	6	6738	6743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254475
114	NC_008381	TTG	2	6	6846	6851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254475
115	NC_008381	CCA	2	6	6950	6955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254475
116	NC_008381	ACC	2	6	7012	7017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116254476
117	NC_008381	CAT	2	6	7032	7037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116254476
118	NC_008381	GCC	2	6	7061	7066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254476
119	NC_008381	TCG	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254476
120	NC_008381	GTC	2	6	7093	7098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254476
121	NC_008381	GCA	2	6	7116	7121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254476
122	NC_008381	GCC	2	6	7138	7143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254476
123	NC_008381	TTC	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116254476
124	NC_008381	GCT	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254477
125	NC_008381	TCG	2	6	7737	7742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254477
126	NC_008381	CCG	2	6	7747	7752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116254477
127	NC_008381	CGG	2	6	7808	7813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254477
128	NC_008381	GTC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116254477
129	NC_008381	CGG	2	6	7829	7834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116254477
130	NC_008381	CTG	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008381	ATC	2	6	7919	7924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_008381	GCA	2	6	15322	15327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116254486
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264	NC_008381	GCC	2	6	15834	15839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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289	NC_008381	TAC	2	6	17348	17353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_008381	TGT	2	6	17470	17475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116254488
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