MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL10

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008381	A	6	6	2259	2264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008381	G	6	6	3339	3344	0 %	0 %	100 %	0 %	116254470
3	NC_008381	T	7	7	4130	4136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008381	G	6	6	12428	12433	0 %	0 %	100 %	0 %	116254483
5	NC_008381	G	6	6	13514	13519	0 %	0 %	100 %	0 %	116254485
6	NC_008381	T	7	7	17787	17793	0 %	100 %	0 %	0 %	116254488
7	NC_008381	C	6	6	25904	25909	0 %	0 %	0 %	100 %	116254495
8	NC_008381	G	6	6	26248	26253	0 %	0 %	100 %	0 %	116254495
9	NC_008381	C	6	6	27741	27746	0 %	0 %	0 %	100 %	116254496
10	NC_008381	C	7	7	29942	29948	0 %	0 %	0 %	100 %	116254496
11	NC_008381	T	6	6	30081	30086	0 %	100 %	0 %	0 %	116254496
12	NC_008381	G	6	6	30429	30434	0 %	0 %	100 %	0 %	116254496
13	NC_008381	A	6	6	35659	35664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008381	G	6	6	35695	35700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008381	C	6	6	36259	36264	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_008381	G	6	6	38694	38699	0 %	0 %	100 %	0 %	116254499
17	NC_008381	T	6	6	42996	43001	0 %	100 %	0 %	0 %	116254503
18	NC_008381	A	6	6	43910	43915	100 %	0 %	0 %	0 %	116254504
19	NC_008381	T	7	7	44807	44813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008381	T	6	6	47689	47694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008381	C	6	6	51679	51684	0 %	0 %	0 %	100 %	116254507
22	NC_008381	T	6	6	55367	55372	0 %	100 %	0 %	0 %	116254511
23	NC_008381	A	6	6	57692	57697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008381	A	7	7	64113	64119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008381	A	6	6	65161	65166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008381	G	6	6	65531	65536	0 %	0 %	100 %	0 %	116254522
27	NC_008381	C	7	7	65970	65976	0 %	0 %	0 %	100 %	116254522
28	NC_008381	T	8	8	67320	67327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008381	T	7	7	70914	70920	0 %	100 %	0 %	0 %	116254528
30	NC_008381	T	6	6	71608	71613	0 %	100 %	0 %	0 %	116254528
31	NC_008381	T	6	6	75256	75261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008381	A	7	7	75326	75332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008381	A	6	6	75350	75355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008381	A	7	7	76680	76686	100 %	0 %	0 %	0 %	116254534
35	NC_008381	A	6	6	77289	77294	100 %	0 %	0 %	0 %	116254535
36	NC_008381	A	7	7	78452	78458	100 %	0 %	0 %	0 %	116254536
37	NC_008381	T	7	7	80164	80170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008381	A	6	6	80406	80411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008381	A	6	6	80544	80549	100 %	0 %	0 %	0 %	116254538
40	NC_008381	A	6	6	83300	83305	100 %	0 %	0 %	0 %	116254540
41	NC_008381	T	6	6	91395	91400	0 %	100 %	0 %	0 %	116254548
42	NC_008381	C	6	6	93119	93124	0 %	0 %	0 %	100 %	116254549
43	NC_008381	A	7	7	95654	95660	100 %	0 %	0 %	0 %	116254550
44	NC_008381	G	6	6	95818	95823	0 %	0 %	100 %	0 %	116254550
45	NC_008381	A	6	6	97221	97226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008381	A	6	6	97719	97724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008381	A	6	6	105350	105355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008381	G	6	6	105612	105617	0 %	0 %	100 %	0 %	116254558
49	NC_008381	T	6	6	106026	106031	0 %	100 %	0 %	0 %	116254558
50	NC_008381	A	6	6	107207	107212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008381	G	6	6	107458	107463	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008381	A	6	6	107579	107584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008381	A	6	6	110622	110627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008381	G	6	6	110655	110660	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008381	C	6	6	125758	125763	0 %	0 %	0 %	100 %	116254576
56	NC_008381	A	8	8	129396	129403	100 %	0 %	0 %	0 %	116254580
57	NC_008381	G	6	6	129701	129706	0 %	0 %	100 %	0 %	116254580
58	NC_008381	A	6	6	130063	130068	100 %	0 %	0 %	0 %	116254580
59	NC_008381	A	7	7	134682	134688	100 %	0 %	0 %	0 %	116254584
60	NC_008381	A	6	6	134783	134788	100 %	0 %	0 %	0 %	116254584
61	NC_008381	T	7	7	138905	138911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008381	A	6	6	139147	139152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008381	A	6	6	144148	144153	100 %	0 %	0 %	0 %	116254589
64	NC_008381	A	6	6	155989	155994	100 %	0 %	0 %	0 %	116254600
65	NC_008381	T	6	6	161107	161112	0 %	100 %	0 %	0 %	116254603
66	NC_008381	C	6	6	164930	164935	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_008381	C	6	6	165939	165944	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
68	NC_008381	G	6	6	168924	168929	0 %	0 %	100 %	0 %	116254610
69	NC_008381	T	6	6	170165	170170	0 %	100 %	0 %	0 %	116254612
70	NC_008381	G	7	7	171787	171793	0 %	0 %	100 %	0 %	116254614
71	NC_008381	C	6	6	171859	171864	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
72	NC_008381	A	6	6	175651	175656	100 %	0 %	0 %	0 %	116254618
73	NC_008381	T	6	6	179591	179596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008381	G	6	6	185263	185268	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008381	A	6	6	186400	186405	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008381	T	8	8	186622	186629	0 %	100 %	0 %	0 %	116254627
77	NC_008381	T	6	6	187288	187293	0 %	100 %	0 %	0 %	116254628
78	NC_008381	A	6	6	190233	190238	100 %	0 %	0 %	0 %	116254631
79	NC_008381	T	6	6	191273	191278	0 %	100 %	0 %	0 %	116254632
80	NC_008381	A	6	6	193547	193552	100 %	0 %	0 %	0 %	116254635
81	NC_008381	T	7	7	194673	194679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008381	T	6	6	194938	194943	0 %	100 %	0 %	0 %	116254637
83	NC_008381	T	6	6	200968	200973	0 %	100 %	0 %	0 %	116254641
84	NC_008381	C	6	6	201220	201225	0 %	0 %	0 %	100 %	116254642
85	NC_008381	C	6	6	201512	201517	0 %	0 %	0 %	100 %	116254642
86	NC_008381	G	6	6	203014	203019	0 %	0 %	100 %	0 %	116254643
87	NC_008381	G	6	6	214805	214810	0 %	0 %	100 %	0 %	116254654
88	NC_008381	T	8	8	216692	216699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008381	T	6	6	216737	216742	0 %	100 %	0 %	0 %	116254657
90	NC_008381	T	7	7	217567	217573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008381	T	6	6	226092	226097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008381	T	7	7	228812	228818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008381	A	6	6	229919	229924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008381	T	6	6	234012	234017	0 %	100 %	0 %	0 %	116254671
95	NC_008381	T	7	7	238689	238695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008381	T	6	6	239179	239184	0 %	100 %	0 %	0 %	116254676
97	NC_008381	C	6	6	246895	246900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
98	NC_008381	G	6	6	250002	250007	0 %	0 %	100 %	0 %	116254689
99	NC_008381	G	7	7	253755	253761	0 %	0 %	100 %	0 %	116254693
100	NC_008381	A	6	6	261865	261870	100 %	0 %	0 %	0 %	116254701
101	NC_008381	A	6	6	262286	262291	100 %	0 %	0 %	0 %	116254701
102	NC_008381	C	6	6	263270	263275	0 %	0 %	0 %	100 %	116254702
103	NC_008381	A	7	7	268355	268361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008381	A	6	6	268424	268429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008381	T	7	7	270169	270175	0 %	100 %	0 %	0 %	116254707
106	NC_008381	T	6	6	279614	279619	0 %	100 %	0 %	0 %	116254715
107	NC_008381	C	7	7	289696	289702	0 %	0 %	0 %	100 %	116254723
108	NC_008381	G	6	6	295788	295793	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008381	G	6	6	307890	307895	0 %	0 %	100 %	0 %	116254736
110	NC_008381	T	6	6	310537	310542	0 %	100 %	0 %	0 %	116254738
111	NC_008381	A	6	6	316131	316136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008381	A	6	6	320152	320157	100 %	0 %	0 %	0 %	116254748
113	NC_008381	A	6	6	321055	321060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008381	C	8	8	324322	324329	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_008381	C	6	6	327012	327017	0 %	0 %	0 %	100 %	116254752
116	NC_008381	T	6	6	332816	332821	0 %	100 %	0 %	0 %	116254764
117	NC_008381	G	6	6	333001	333006	0 %	0 %	100 %	0 %	116254764
118	NC_008381	C	6	6	336446	336451	0 %	0 %	0 %	100 %	116254766
119	NC_008381	A	7	7	347175	347181	100 %	0 %	0 %	0 %	116254776
120	NC_008381	T	6	6	352447	352452	0 %	100 %	0 %	0 %	116254781
121	NC_008381	T	7	7	354639	354645	0 %	100 %	0 %	0 %	116254784
122	NC_008381	A	6	6	358759	358764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008381	T	6	6	361945	361950	0 %	100 %	0 %	0 %	116254790
124	NC_008381	A	6	6	380326	380331	100 %	0 %	0 %	0 %	116254809
125	NC_008381	T	6	6	383556	383561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008381	G	6	6	386135	386140	0 %	0 %	100 %	0 %	116254814
127	NC_008381	G	6	6	390167	390172	0 %	0 %	100 %	0 %	116254817
128	NC_008381	A	6	6	398020	398025	100 %	0 %	0 %	0 %	116254823
129	NC_008381	T	6	6	400308	400313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008381	C	6	6	401520	401525	0 %	0 %	0 %	100 %	116254826
131	NC_008381	T	7	7	419779	419785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008381	C	6	6	424401	424406	0 %	0 %	0 %	100 %	116254846
133	NC_008381	A	6	6	426821	426826	100 %	0 %	0 %	0 %	116254849
134	NC_008381	A	7	7	431977	431983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008381	C	6	6	452233	452238	0 %	0 %	0 %	100 %	116254876
136	NC_008381	A	6	6	454869	454874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008381	G	6	6	467602	467607	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008381	C	6	6	468679	468684	0 %	0 %	0 %	100 %	116254893
139	NC_008381	A	6	6	470218	470223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008381	A	6	6	471504	471509	100 %	0 %	0 %	0 %	116254894
141	NC_008381	A	6	6	480043	480048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008381	T	6	6	482398	482403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008381	A	7	7	483618	483624	100 %	0 %	0 %	0 %	116254906
144	NC_008381	C	6	6	486462	486467	0 %	0 %	0 %	100 %	116254908
145	NC_008381	T	6	6	488022	488027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.