MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 1878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008380	ATCC	2	8	151	158	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008380	AAGA	2	8	4159	4166	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008380	GCCA	2	8	5312	5319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008380	AAAT	2	8	10733	10740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008380	ATCG	2	8	11909	11916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008380	ATTA	2	8	40159	40166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008380	AGCC	2	8	46838	46845	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008380	ACGG	2	8	51451	51458	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008380	TGAA	2	8	53907	53914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008380	TCTT	2	8	63009	63016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008380	GCGG	2	8	63156	63163	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008380	AGGC	2	8	63183	63190	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008380	CACT	2	8	63283	63290	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008380	GAAC	2	8	63668	63675	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008380	GTGA	2	8	64011	64018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008380	GATC	2	8	64170	64177	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008380	TCTT	2	8	65299	65306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008380	CTTG	2	8	65430	65437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008380	GTTT	2	8	65577	65584	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008380	ATGG	2	8	65875	65882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008380	GCCG	2	8	65887	65894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008380	AGGT	2	8	65914	65921	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008380	GTGA	2	8	66551	66558	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008380	GCGA	2	8	66693	66700	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008380	CAAG	2	8	67027	67034	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008380	CGTC	2	8	67392	67399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008380	AAAG	2	8	67515	67522	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008380	GCAA	2	8	69679	69686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008380	GCCC	2	8	69852	69859	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_008380	GGGC	2	8	74515	74522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008380	CGCC	2	8	74590	74597	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_008380	CGAC	2	8	74619	74626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008380	CAAA	2	8	76858	76865	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008380	CCTT	2	8	76867	76874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008380	AGCG	2	8	84703	84710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008380	GCCC	2	8	84792	84799	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_008380	CGCT	2	8	96997	97004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008380	ACGT	2	8	97092	97099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008380	CCCG	2	8	97315	97322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_008380	TATC	2	8	97553	97560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008380	TCCT	2	8	97633	97640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008380	AGGG	2	8	99188	99195	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008380	ATAA	2	8	99234	99241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008380	GTGA	2	8	107316	107323	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008380	TTAT	2	8	115928	115935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008380	TCCG	2	8	129961	129968	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008380	CGAA	2	8	132517	132524	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008380	TCCG	2	8	134989	134996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008380	GGTT	2	8	136880	136887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008380	ATGT	2	8	140479	140486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008380	AGGA	2	8	141287	141294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008380	ATGA	2	8	144103	144110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008380	CTTG	2	8	144117	144124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008380	CATC	2	8	144161	144168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008380	CAAT	2	8	150189	150196	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008380	GGTT	2	8	150332	150339	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008380	CATT	2	8	168734	168741	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008380	GACG	2	8	168936	168943	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008380	TTTG	2	8	175106	175113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008380	GTTG	2	8	178947	178954	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008380	GTTT	2	8	179773	179780	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008380	CCGC	2	8	179938	179945	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_008380	AAGC	2	8	183215	183222	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008380	TTGC	2	8	187956	187963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008380	AGGG	2	8	192798	192805	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008380	AGGA	2	8	196243	196250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008380	CCTT	2	8	196260	196267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008380	TGAG	2	8	196301	196308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008380	CTTC	2	8	204125	204132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008380	GTTT	2	8	206588	206595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008380	GGGC	2	8	212889	212896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008380	TGGC	2	8	219778	219785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008380	GGCA	2	8	221918	221925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_008380	GCCG	2	8	227350	227357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008380	TCGA	2	8	228783	228790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008380	CTGG	2	8	229187	229194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008380	GAAT	2	8	230413	230420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008380	CGGC	2	8	231319	231326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008380	TCCT	2	8	240623	240630	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_008380	GAAC	2	8	240722	240729	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008380	AAGG	2	8	240760	240767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008380	TTCT	2	8	241418	241425	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008380	TTTC	2	8	241434	241441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008380	CGTT	2	8	245155	245162	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008380	ACCT	2	8	262897	262904	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008380	CGGG	2	8	267080	267087	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008380	AGAA	2	8	267344	267351	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008380	TCGA	2	8	267394	267401	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008380	GGCA	2	8	270493	270500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008380	TCAT	2	8	271505	271512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008380	TCCG	2	8	276984	276991	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008380	CGAT	2	8	277499	277506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008380	TGAG	2	8	277598	277605	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008380	GGAA	2	8	283465	283472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008380	CTGG	2	8	287527	287534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008380	TTAA	2	8	288712	288719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008380	CATT	2	8	294312	294319	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008380	TCAA	2	8	295590	295597	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008380	CAGC	2	8	298812	298819	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008380	TTAT	2	8	300665	300672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008380	TCTT	2	8	303373	303380	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008380	GCCG	2	8	303393	303400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008380	CGCC	2	8	303420	303427	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_008380	CCGG	2	8	307448	307455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008380	ATCA	2	8	308564	308571	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008380	CGAT	2	8	310144	310151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008380	TCTT	2	8	311272	311279	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008380	AAGC	2	8	316963	316970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008380	TCAT	2	8	320286	320293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008380	CGAT	2	8	324740	324747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008380	AGGC	2	8	324834	324841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008380	TCGA	2	8	326767	326774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008380	CGGC	2	8	331923	331930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008380	CAAA	2	8	332575	332582	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008380	GCCG	2	8	333690	333697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008380	AACT	2	8	337103	337110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008380	GTCG	2	8	342705	342712	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008380	GGAA	2	8	342802	342809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008380	CACC	2	8	346962	346969	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_008380	AACG	2	8	362917	362924	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008380	CCGA	2	8	362963	362970	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_008380	TTGA	2	8	371286	371293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008380	CCGG	2	8	376148	376155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008380	GCGG	2	8	386160	386167	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008380	CCTT	2	8	388397	388404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_008380	GACA	2	8	389448	389455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008380	TTCG	2	8	393564	393571	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008380	AGAT	2	8	407242	407249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008380	GCCC	2	8	409033	409040	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_008380	CGAC	2	8	410081	410088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008380	GGGC	2	8	410313	410320	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008380	ACTT	2	8	416212	416219	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008380	TCCT	2	8	418095	418102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008380	AGGA	2	8	418110	418117	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008380	TTGA	2	8	420100	420107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008380	TCTT	2	8	420417	420424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008380	ATCC	2	8	423792	423799	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008380	CCGG	2	8	429835	429842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008380	GCCG	2	8	429872	429879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008380	CGGC	2	8	433292	433299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008380	GCCT	2	8	441114	441121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008380	GCCG	2	8	446698	446705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008380	GTTT	2	8	453996	454003	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008380	GATC	2	8	456292	456299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008380	CGTC	2	8	458783	458790	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008380	TCGA	2	8	460369	460376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008380	CTTG	2	8	461610	461617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008380	TGAA	2	8	465492	465499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008380	TCGA	3	12	465502	465513	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008380	CTCG	2	8	467995	468002	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008380	CTGC	2	8	478236	478243	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_008380	CTGC	2	8	484225	484232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008380	TGGC	2	8	484340	484347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_008380	TCGA	2	8	484367	484374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_008380	GACC	2	8	507054	507061	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
177	NC_008380	TCCC	2	8	507966	507973	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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179	NC_008380	CCGG	2	8	508057	508064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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249	NC_008380	GATT	2	8	710688	710695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_008380	CAAG	2	8	736779	736786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
260	NC_008380	CGCT	2	8	745692	745699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
261	NC_008380	CCGG	2	8	757859	757866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
262	NC_008380	GCTT	2	8	766346	766353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
263	NC_008380	CAAA	2	8	766605	766612	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
264	NC_008380	GCCG	2	8	767836	767843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
265	NC_008380	GCAA	2	8	767884	767891	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
266	NC_008380	TTCT	2	8	770045	770052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
267	NC_008380	GACA	2	8	777628	777635	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
268	NC_008380	CAAT	2	8	782839	782846	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
269	NC_008380	GGGC	2	8	783311	783318	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
270	NC_008380	CCCG	2	8	793444	793451	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
271	NC_008380	GGGA	2	8	795272	795279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_008380	CTGC	2	8	809769	809776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
275	NC_008380	GACC	2	8	812347	812354	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
276	NC_008380	TATT	2	8	812396	812403	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_008380	TCCT	2	8	817438	817445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
280	NC_008380	CGGA	2	8	820109	820116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
281	NC_008380	CCGG	2	8	820138	820145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
282	NC_008380	TCGC	2	8	825142	825149	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
283	NC_008380	GCAG	2	8	831526	831533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
284	NC_008380	GTTG	2	8	832418	832425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
285	NC_008380	CTGG	2	8	838579	838586	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
286	NC_008380	AACG	2	8	838589	838596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_008380	TCGA	2	8	843462	843469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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290	NC_008380	GTTA	2	8	855118	855125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008380	CGGA	2	8	861078	861085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
292	NC_008380	ATTG	2	8	861187	861194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_008380	CCAG	2	8	862574	862581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
294	NC_008380	TGTT	2	8	872700	872707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
295	NC_008380	TGCG	2	8	877629	877636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
296	NC_008380	TGAT	2	8	878840	878847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_008380	TGAT	2	8	1295509	1295516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_008380	GCAT	2	8	1353347	1353354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
492	NC_008380	AAGC	2	8	1353459	1353466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
493	NC_008380	CGGC	2	8	1353529	1353536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
494	NC_008380	TCCC	2	8	1359081	1359088	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
495	NC_008380	TTTA	2	8	1362862	1362869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
496	NC_008380	GATC	2	8	1363745	1363752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
497	NC_008380	TTGC	2	8	1363922	1363929	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_008380	AGGA	2	8	1364848	1364855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_008380	GAGC	2	8	1366909	1366916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
500	NC_008380	CGGC	2	8	1366983	1366990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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