MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 11394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008380	GAAC	2	8	484	491	50 %	0 %	25 %	25 %	116249767
2	NC_008380	CGAT	2	8	643	650	25 %	25 %	25 %	25 %	116249767
3	NC_008380	ATCT	2	8	777	784	25 %	50 %	0 %	25 %	116249767
4	NC_008380	ATCT	2	8	963	970	25 %	50 %	0 %	25 %	116249767
5	NC_008380	CGAT	2	8	1915	1922	25 %	25 %	25 %	25 %	116249768
6	NC_008380	TTCA	2	8	2080	2087	25 %	50 %	0 %	25 %	116249769
7	NC_008380	CCGG	2	8	2461	2468	0 %	0 %	50 %	50 %	116249769
8	NC_008380	GCTC	2	8	2981	2988	0 %	25 %	25 %	50 %	116249770
9	NC_008380	TGCC	2	8	4769	4776	0 %	25 %	25 %	50 %	116249773
10	NC_008380	CGCC	2	8	4927	4934	0 %	0 %	25 %	75 %	116249773
11	NC_008380	GCCG	2	8	5033	5040	0 %	0 %	50 %	50 %	116249773
12	NC_008380	TGCG	2	8	5659	5666	0 %	25 %	50 %	25 %	116249774
13	NC_008380	GCCA	2	8	5937	5944	25 %	0 %	25 %	50 %	116249774
14	NC_008380	GATC	2	8	6474	6481	25 %	25 %	25 %	25 %	116249775
15	NC_008380	GGCC	2	8	6720	6727	0 %	0 %	50 %	50 %	116249775
16	NC_008380	GATC	2	8	6771	6778	25 %	25 %	25 %	25 %	116249775
17	NC_008380	CTGG	2	8	6810	6817	0 %	25 %	50 %	25 %	116249775
18	NC_008380	GCAG	2	8	6900	6907	25 %	0 %	50 %	25 %	116249775
19	NC_008380	TCGC	2	8	6945	6952	0 %	25 %	25 %	50 %	116249775
20	NC_008380	GCCG	2	8	7031	7038	0 %	0 %	50 %	50 %	116249775
21	NC_008380	CGCC	2	8	7369	7376	0 %	0 %	25 %	75 %	116249776
22	NC_008380	CGGC	2	8	8092	8099	0 %	0 %	50 %	50 %	116249777
23	NC_008380	GTAT	2	8	8385	8392	25 %	50 %	25 %	0 %	116249778
24	NC_008380	CCAT	2	8	9045	9052	25 %	25 %	0 %	50 %	116249778
25	NC_008380	GTCC	2	8	9353	9360	0 %	25 %	25 %	50 %	116249778
26	NC_008380	GACG	2	8	9808	9815	25 %	0 %	50 %	25 %	116249778
27	NC_008380	TGCG	2	8	10086	10093	0 %	25 %	50 %	25 %	116249778
28	NC_008380	GCTC	2	8	10584	10591	0 %	25 %	25 %	50 %	116249778
29	NC_008380	GCTG	2	8	10878	10885	0 %	25 %	50 %	25 %	116249779
30	NC_008380	GCCT	2	8	10988	10995	0 %	25 %	25 %	50 %	116249779
31	NC_008380	GATC	2	8	11385	11392	25 %	25 %	25 %	25 %	116249779
32	NC_008380	GGGT	2	8	11987	11994	0 %	25 %	75 %	0 %	116249781
33	NC_008380	CAGC	2	8	12073	12080	25 %	0 %	25 %	50 %	116249781
34	NC_008380	GCCG	2	8	12081	12088	0 %	0 %	50 %	50 %	116249781
35	NC_008380	CCGG	2	8	12307	12314	0 %	0 %	50 %	50 %	116249781
36	NC_008380	CGAT	2	8	12424	12431	25 %	25 %	25 %	25 %	116249781
37	NC_008380	TGCC	2	8	12566	12573	0 %	25 %	25 %	50 %	116249781
38	NC_008380	TCGA	2	8	12816	12823	25 %	25 %	25 %	25 %	116249781
39	NC_008380	GTCC	2	8	14300	14307	0 %	25 %	25 %	50 %	116249783
40	NC_008380	GCTG	2	8	14627	14634	0 %	25 %	50 %	25 %	116249783
41	NC_008380	GCAT	2	8	15193	15200	25 %	25 %	25 %	25 %	116249783
42	NC_008380	CCGC	2	8	15705	15712	0 %	0 %	25 %	75 %	116249784
43	NC_008380	GCTG	2	8	16267	16274	0 %	25 %	50 %	25 %	116249785
44	NC_008380	AAGA	2	8	16473	16480	75 %	0 %	25 %	0 %	116249785
45	NC_008380	TTCC	2	8	17663	17670	0 %	50 %	0 %	50 %	116249787
46	NC_008380	GGCA	2	8	18155	18162	25 %	0 %	50 %	25 %	116249787
47	NC_008380	ACCT	2	8	18525	18532	25 %	25 %	0 %	50 %	116249787
48	NC_008380	AAGG	2	8	18558	18565	50 %	0 %	50 %	0 %	116249787
49	NC_008380	CGCA	2	8	18869	18876	25 %	0 %	25 %	50 %	116249788
50	NC_008380	CTCG	2	8	18962	18969	0 %	25 %	25 %	50 %	116249788
51	NC_008380	AGGC	2	8	18991	18998	25 %	0 %	50 %	25 %	116249788
52	NC_008380	GGCC	2	8	19064	19071	0 %	0 %	50 %	50 %	116249788
53	NC_008380	GATG	2	8	19268	19275	25 %	25 %	50 %	0 %	116249788
54	NC_008380	GGTC	2	8	20959	20966	0 %	25 %	50 %	25 %	116249790
55	NC_008380	CGGC	2	8	21563	21570	0 %	0 %	50 %	50 %	116249790
56	NC_008380	CGGT	2	8	21859	21866	0 %	25 %	50 %	25 %	116249790
57	NC_008380	ATCA	2	8	22198	22205	50 %	25 %	0 %	25 %	116249791
58	NC_008380	CCGA	2	8	22252	22259	25 %	0 %	25 %	50 %	116249791
59	NC_008380	GCCT	2	8	23099	23106	0 %	25 %	25 %	50 %	116249792
60	NC_008380	CGAT	2	8	23296	23303	25 %	25 %	25 %	25 %	116249792
61	NC_008380	CACG	2	8	23450	23457	25 %	0 %	25 %	50 %	116249792
62	NC_008380	CGGC	2	8	24431	24438	0 %	0 %	50 %	50 %	116249792
63	NC_008380	GGAA	2	8	24755	24762	50 %	0 %	50 %	0 %	116249792
64	NC_008380	GCGA	2	8	24844	24851	25 %	0 %	50 %	25 %	116249792
65	NC_008380	GCTG	2	8	25004	25011	0 %	25 %	50 %	25 %	116249792
66	NC_008380	CCCG	2	8	25274	25281	0 %	0 %	25 %	75 %	116249792
67	NC_008380	TCGA	2	8	26303	26310	25 %	25 %	25 %	25 %	116249793
68	NC_008380	GCCG	2	8	26967	26974	0 %	0 %	50 %	50 %	116249793
69	NC_008380	CGAT	2	8	27059	27066	25 %	25 %	25 %	25 %	116249793
70	NC_008380	CCGT	2	8	27512	27519	0 %	25 %	25 %	50 %	116249793
71	NC_008380	TTCG	2	8	27562	27569	0 %	50 %	25 %	25 %	116249793
72	NC_008380	GAGC	2	8	27831	27838	25 %	0 %	50 %	25 %	116249793
73	NC_008380	CGAG	2	8	28112	28119	25 %	0 %	50 %	25 %	116249793
74	NC_008380	CGGC	2	8	28275	28282	0 %	0 %	50 %	50 %	116249793
75	NC_008380	GCGA	2	8	28876	28883	25 %	0 %	50 %	25 %	116249793
76	NC_008380	GATC	2	8	29031	29038	25 %	25 %	25 %	25 %	116249793
77	NC_008380	GCGA	2	8	29198	29205	25 %	0 %	50 %	25 %	116249793
78	NC_008380	TTCG	2	8	29667	29674	0 %	50 %	25 %	25 %	116249794
79	NC_008380	TCCG	2	8	30579	30586	0 %	25 %	25 %	50 %	116249795
80	NC_008380	CAGG	2	8	30752	30759	25 %	0 %	50 %	25 %	116249795
81	NC_008380	GCAC	2	8	32348	32355	25 %	0 %	25 %	50 %	116249796
82	NC_008380	CCGG	2	8	32517	32524	0 %	0 %	50 %	50 %	116249796
83	NC_008380	CTTC	2	8	32871	32878	0 %	50 %	0 %	50 %	116249796
84	NC_008380	ATCG	2	8	33130	33137	25 %	25 %	25 %	25 %	116249796
85	NC_008380	GCCG	2	8	33142	33149	0 %	0 %	50 %	50 %	116249796
86	NC_008380	CGCC	2	8	33518	33525	0 %	0 %	25 %	75 %	116249796
87	NC_008380	GCCG	2	8	33989	33996	0 %	0 %	50 %	50 %	116249796
88	NC_008380	GCCG	2	8	34018	34025	0 %	0 %	50 %	50 %	116249796
89	NC_008380	GCGG	2	8	34116	34123	0 %	0 %	75 %	25 %	116249796
90	NC_008380	CAGG	2	8	34155	34162	25 %	0 %	50 %	25 %	116249796
91	NC_008380	TCAG	2	8	34462	34469	25 %	25 %	25 %	25 %	116249797
92	NC_008380	TGGT	2	8	34591	34598	0 %	50 %	50 %	0 %	116249797
93	NC_008380	CCAG	2	8	35253	35260	25 %	0 %	25 %	50 %	116249797
94	NC_008380	CAGC	2	8	36590	36597	25 %	0 %	25 %	50 %	116249799
95	NC_008380	CCGG	2	8	37396	37403	0 %	0 %	50 %	50 %	116249801
96	NC_008380	GACG	2	8	38062	38069	25 %	0 %	50 %	25 %	116249801
97	NC_008380	GATC	2	8	38617	38624	25 %	25 %	25 %	25 %	116249801
98	NC_008380	GGCC	2	8	38668	38675	0 %	0 %	50 %	50 %	116249801
99	NC_008380	CGAC	2	8	38722	38729	25 %	0 %	25 %	50 %	116249801
100	NC_008380	AGCG	2	8	39502	39509	25 %	0 %	50 %	25 %	116249802
101	NC_008380	CAGC	2	8	40337	40344	25 %	0 %	25 %	50 %	116249803
102	NC_008380	CTGA	2	8	41224	41231	25 %	25 %	25 %	25 %	116249803
103	NC_008380	GGCA	2	8	41412	41419	25 %	0 %	50 %	25 %	116249803
104	NC_008380	GTTC	2	8	42058	42065	0 %	50 %	25 %	25 %	116249804
105	NC_008380	GGCG	2	8	42067	42074	0 %	0 %	75 %	25 %	116249804
106	NC_008380	GCCT	2	8	42747	42754	0 %	25 %	25 %	50 %	116249805
107	NC_008380	ATCC	2	8	42975	42982	25 %	25 %	0 %	50 %	116249805
108	NC_008380	AGAT	2	8	43846	43853	50 %	25 %	25 %	0 %	116249806
109	NC_008380	TGCG	2	8	44765	44772	0 %	25 %	50 %	25 %	116249808
110	NC_008380	TCGA	2	8	44786	44793	25 %	25 %	25 %	25 %	116249808
111	NC_008380	GCCG	2	8	45046	45053	0 %	0 %	50 %	50 %	116249808
112	NC_008380	GGTC	2	8	46236	46243	0 %	25 %	50 %	25 %	116249810
113	NC_008380	CGGC	2	8	46292	46299	0 %	0 %	50 %	50 %	116249810
114	NC_008380	CTTT	2	8	46498	46505	0 %	75 %	0 %	25 %	116249811
115	NC_008380	GACC	2	8	47807	47814	25 %	0 %	25 %	50 %	116249813
116	NC_008380	GATC	2	8	48129	48136	25 %	25 %	25 %	25 %	116249814
117	NC_008380	CGGC	2	8	48334	48341	0 %	0 %	50 %	50 %	116249814
118	NC_008380	GATC	2	8	48387	48394	25 %	25 %	25 %	25 %	116249814
119	NC_008380	GGCG	2	8	48891	48898	0 %	0 %	75 %	25 %	116249815
120	NC_008380	GGCA	2	8	49657	49664	25 %	0 %	50 %	25 %	116249816
121	NC_008380	AAGC	2	8	50888	50895	50 %	0 %	25 %	25 %	116249817
122	NC_008380	CGAT	2	8	51101	51108	25 %	25 %	25 %	25 %	116249817
123	NC_008380	GCCT	2	8	51523	51530	0 %	25 %	25 %	50 %	116249818
124	NC_008380	GCCG	2	8	51547	51554	0 %	0 %	50 %	50 %	116249818
125	NC_008380	GGTG	2	8	51970	51977	0 %	25 %	75 %	0 %	116249818
126	NC_008380	TCGC	2	8	52175	52182	0 %	25 %	25 %	50 %	116249818
127	NC_008380	TCGA	2	8	52208	52215	25 %	25 %	25 %	25 %	116249818
128	NC_008380	AGGC	2	8	52887	52894	25 %	0 %	50 %	25 %	116249819
129	NC_008380	GGCC	2	8	53215	53222	0 %	0 %	50 %	50 %	116249819
130	NC_008380	CCAT	2	8	53471	53478	25 %	25 %	0 %	50 %	116249819
131	NC_008380	TCCT	2	8	54205	54212	0 %	50 %	0 %	50 %	116249820
132	NC_008380	CCTG	2	8	54231	54238	0 %	25 %	25 %	50 %	116249820
133	NC_008380	GCTC	2	8	54365	54372	0 %	25 %	25 %	50 %	116249820
134	NC_008380	GATC	2	8	54566	54573	25 %	25 %	25 %	25 %	116249820
135	NC_008380	GACG	2	8	54594	54601	25 %	0 %	50 %	25 %	116249820
136	NC_008380	CTGG	2	8	54741	54748	0 %	25 %	50 %	25 %	116249820
137	NC_008380	CCGG	2	8	55097	55104	0 %	0 %	50 %	50 %	116249820
138	NC_008380	ATGT	2	8	55129	55136	25 %	50 %	25 %	0 %	116249820
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140	NC_008380	CGGA	2	8	56243	56250	25 %	0 %	50 %	25 %	116249821
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