MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 8650

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008380	GAG	3	9	9	17	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008380	CTT	2	6	76	81	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008380	CCG	2	6	160	165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008380	AGG	2	6	198	203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008380	CGT	2	6	336	341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008380	CGC	2	6	421	426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008380	GCC	2	6	4685	4690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008380	ATC	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008380	CGG	2	6	5376	5381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008380	GAA	2	6	8221	8226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008380	ACA	2	6	8262	8267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008380	GCA	2	6	11820	11825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008380	TCG	2	6	11826	11831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008380	ATC	2	6	12920	12925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008380	AAT	2	6	12979	12984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008380	GAG	2	6	13018	13023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008380	ATG	2	6	13914	13919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008380	TGC	2	6	13970	13975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008380	CAA	2	6	13977	13982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008380	ATG	2	6	15953	15958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008380	GCT	2	6	22526	22531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008380	TGC	2	6	34347	34352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008380	CCG	2	6	35862	35867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008380	AAG	2	6	35905	35910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008380	GCA	2	6	36677	36682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008380	CTG	2	6	39131	39136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008380	TCA	2	6	39953	39958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008380	GGA	2	6	40017	40022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008380	GCG	2	6	40139	40144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008380	TTC	2	6	40192	40197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008380	TTG	2	6	41941	41946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008380	CGC	2	6	41987	41992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008380	GTC	2	6	45925	45930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008380	CCG	2	6	46684	46689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008380	GAT	2	6	46707	46712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008380	ATG	2	6	46768	46773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008380	CAT	2	6	46802	46807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008380	GGC	2	6	46823	46828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008380	GCC	2	6	48061	48066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008380	GCA	2	6	51308	51313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008380	ATT	2	6	53888	53893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008380	GCA	2	6	53929	53934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008380	GCC	2	6	56153	56158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008380	CGG	2	6	56172	56177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008380	ATT	2	6	56198	56203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008380	CAA	2	6	57038	57043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008380	CCG	2	6	63001	63006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_008380	GCG	3	9	63299	63307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008380	CTG	2	6	63308	63313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008380	CGA	2	6	63315	63320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008380	CGA	2	6	63401	63406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008380	GTC	2	6	63416	63421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008380	GAA	2	6	63446	63451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008380	GCG	2	6	63464	63469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008380	TCG	2	6	63601	63606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008380	GGC	2	6	63679	63684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008380	TGG	2	6	63860	63865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008380	CGA	2	6	63884	63889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008380	GAT	2	6	63909	63914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008380	GCA	2	6	63958	63963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008380	GAA	2	6	64076	64081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008380	CAG	2	6	64101	64106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008380	GTT	2	6	64132	64137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008380	GGA	2	6	64292	64297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008380	GGC	2	6	64312	64317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008380	TGC	2	6	64630	64635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008380	GTC	2	6	64642	64647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008380	TGG	2	6	64821	64826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008380	AGG	2	6	65033	65038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008380	CCT	2	6	65115	65120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_008380	CGC	2	6	65245	65250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008380	ACG	2	6	65264	65269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008380	TGC	2	6	65359	65364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008380	GAC	2	6	65382	65387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008380	CCA	2	6	65533	65538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008380	CCA	2	6	65702	65707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_008380	GAA	2	6	65742	65747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008380	TGG	2	6	65899	65904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008380	GTT	2	6	65976	65981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008380	GCT	2	6	66087	66092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008380	CAT	2	6	66136	66141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008380	TGG	2	6	66275	66280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008380	GTC	2	6	66505	66510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008380	AAG	2	6	66618	66623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008380	AGT	2	6	66686	66691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008380	TTG	2	6	67090	67095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008380	GGA	2	6	67157	67162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008380	TAC	2	6	67361	67366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008380	CAA	2	6	67410	67415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008380	AAC	2	6	67478	67483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008380	AGC	2	6	67501	67506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008380	CAT	2	6	67507	67512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008380	TGA	2	6	67641	67646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008380	TGG	2	6	67840	67845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008380	GTT	2	6	67864	67869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008380	GGT	2	6	67950	67955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008380	GAA	2	6	68027	68032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008380	TAT	2	6	68055	68060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008380	GAC	2	6	68125	68130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008380	CGG	2	6	68207	68212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008380	GGT	2	6	68425	68430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008380	ACC	2	6	68478	68483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008380	TGG	2	6	68538	68543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008380	TGG	2	6	68593	68598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008380	GTC	2	6	68620	68625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008380	GGT	2	6	68701	68706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008380	TGA	2	6	68762	68767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008380	GTT	2	6	68792	68797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008380	CGT	2	6	68896	68901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008380	TGG	2	6	68989	68994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008380	TGT	2	6	68998	69003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008380	GAC	2	6	69111	69116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008380	TGG	2	6	69437	69442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008380	TCT	2	6	69577	69582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008380	AGC	2	6	69774	69779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008380	AAG	2	6	69921	69926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008380	ACA	2	6	69953	69958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008380	AAG	2	6	70035	70040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008380	GAG	2	6	70044	70049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008380	CGC	2	6	74467	74472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_008380	CCA	2	6	74680	74685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_008380	GCC	2	6	74703	74708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_008380	GAT	2	6	74720	74725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008380	GAC	2	6	76224	76229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008380	GCA	2	6	76382	76387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008380	GAC	2	6	76438	76443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_008380	GGC	2	6	76453	76458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008380	CGG	2	6	76553	76558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008380	CTC	2	6	76725	76730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008380	CTA	2	6	76822	76827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008380	CCT	3	9	84623	84631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008380	TGC	2	6	84644	84649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008380	TCT	2	6	84834	84839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008380	GAA	2	6	87543	87548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008380	GAT	2	6	89317	89322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008380	ATG	2	6	89392	89397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008380	TGC	2	6	89437	89442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008380	CCT	2	6	90027	90032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_008380	AAC	2	6	90063	90068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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