MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008379	GAATC	2	10	5920	5929	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_008379	CGCGG	2	10	6044	6053	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_008379	TCCTG	2	10	24094	24103	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008379	CAGCC	2	10	34519	34528	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_008379	TCTGC	2	10	40190	40199	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008379	CTTTT	2	10	40218	40227	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008379	GGCCG	2	10	40708	40717	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_008379	CGATG	2	10	42704	42713	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_008379	CGATC	2	10	49764	49773	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_008379	TGAAG	2	10	51807	51816	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008379	GCGTG	2	10	52713	52722	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008379	GCGGG	2	10	53783	53792	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_008379	ACGAA	2	10	59239	59248	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008379	ATGCG	2	10	70044	70053	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_008379	GCAGA	2	10	94625	94634	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008379	ACGGA	2	10	100483	100492	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008379	CTTCG	2	10	130804	130813	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_008379	TCGCG	2	10	148462	148471	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008379	GATGC	2	10	155383	155392	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_008379	CGGCC	2	10	183670	183679	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008379	TTGCA	2	10	191728	191737	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_008379	GCATC	2	10	194614	194623	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008379	CTCCC	2	10	217746	217755	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_008379	TTTTG	2	10	236151	236160	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008379	ATTGA	2	10	240433	240442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008379	CTGAT	3	15	252870	252884	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008379	GGCGC	2	10	296091	296100	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008379	AGCGA	2	10	322386	322395	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008379	GGCCG	2	10	328709	328718	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008379	TGCCA	2	10	335127	335136	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_008379	AACCA	2	10	341211	341220	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_008379	CTTCG	2	10	342314	342323	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_008379	GATCG	2	10	348276	348285	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008379	GATTC	2	10	348654	348663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008379	GTGCG	2	10	351148	351157	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008379	ACGGC	2	10	351877	351886	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_008379	CATCG	2	10	352136	352145	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_008379	GCCCA	2	10	352218	352227	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_008379	CCTTC	2	10	352629	352638	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.