MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 5445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008379	CGT	2	6	23	28	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249461
2	NC_008379	GAC	2	6	37	42	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
3	NC_008379	TCC	2	6	105	110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249461
4	NC_008379	GTT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249461
5	NC_008379	CGT	2	6	363	368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249461
6	NC_008379	GAC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
7	NC_008379	CAC	2	6	399	404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249461
8	NC_008379	GCA	2	6	417	422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
9	NC_008379	GAC	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
10	NC_008379	CTT	2	6	687	692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249461
11	NC_008379	GGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249461
12	NC_008379	ACG	2	6	734	739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249461
13	NC_008379	GTG	2	6	742	747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249461
14	NC_008379	TGA	2	6	1301	1306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249462
15	NC_008379	GGC	2	6	1395	1400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249462
16	NC_008379	CAT	2	6	1463	1468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249462
17	NC_008379	TGG	2	6	1592	1597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249462
18	NC_008379	GAA	2	6	1637	1642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249462
19	NC_008379	ATC	2	6	1679	1684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249462
20	NC_008379	TCG	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249462
21	NC_008379	AGC	2	6	1884	1889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249462
22	NC_008379	GGA	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249462
23	NC_008379	CGA	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249462
24	NC_008379	CTG	2	6	2023	2028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249462
25	NC_008379	CGA	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249462
26	NC_008379	CGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249462
27	NC_008379	CAA	2	6	2239	2244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116249462
28	NC_008379	GAC	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249463
29	NC_008379	GCG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249463
30	NC_008379	GCA	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249463
31	NC_008379	GAC	2	6	2616	2621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249463
32	NC_008379	GGC	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249463
33	NC_008379	GCC	2	6	2871	2876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249463
34	NC_008379	TGC	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249463
35	NC_008379	GCG	2	6	2958	2963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249463
36	NC_008379	GAA	2	6	2970	2975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249463
37	NC_008379	CTT	2	6	3021	3026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249463
38	NC_008379	CCG	2	6	3049	3054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249463
39	NC_008379	CAC	2	6	3064	3069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249463
40	NC_008379	CGA	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249463
41	NC_008379	TCC	2	6	3391	3396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249463
42	NC_008379	GGA	2	6	3429	3434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249463
43	NC_008379	GCC	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249463
44	NC_008379	GTC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249463
45	NC_008379	CGC	2	6	3545	3550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249463
46	NC_008379	CGG	2	6	3599	3604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249463
47	NC_008379	TGG	2	6	4262	4267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249464
48	NC_008379	TCA	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249464
49	NC_008379	AGC	2	6	4507	4512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
50	NC_008379	TTC	2	6	4516	4521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249464
51	NC_008379	CGT	2	6	4594	4599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
52	NC_008379	CTG	2	6	4632	4637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
53	NC_008379	CTC	2	6	4698	4703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249464
54	NC_008379	TCG	2	6	4792	4797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
55	NC_008379	GCG	2	6	5017	5022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
56	NC_008379	GCC	2	6	5046	5051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249464
57	NC_008379	GCA	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
58	NC_008379	GTG	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249464
59	NC_008379	CCG	2	6	5119	5124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249464
60	NC_008379	TTA	2	6	5143	5148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116249464
61	NC_008379	GTC	2	6	5169	5174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
62	NC_008379	GCA	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
63	NC_008379	CGA	2	6	5231	5236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
64	NC_008379	GTC	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
65	NC_008379	CGT	2	6	5325	5330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
66	NC_008379	GCA	2	6	5348	5353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249464
67	NC_008379	GCC	2	6	5363	5368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249464
68	NC_008379	CGG	2	6	5452	5457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
69	NC_008379	CGG	2	6	5667	5672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
70	NC_008379	GCG	2	6	5675	5680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
71	NC_008379	TCG	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249464
72	NC_008379	GCG	2	6	5758	5763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249464
73	NC_008379	TCC	2	6	5767	5772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249464
74	NC_008379	TGT	2	6	5783	5788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249464
75	NC_008379	AGA	2	6	5836	5841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116249464
76	NC_008379	TTC	2	6	5908	5913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249464
77	NC_008379	AGC	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249465
78	NC_008379	CGG	2	6	6580	6585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249465
79	NC_008379	CCT	2	6	6721	6726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249465
80	NC_008379	CGT	2	6	6728	6733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249465
81	NC_008379	GCG	2	6	7173	7178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249466
82	NC_008379	TCT	2	6	7203	7208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249466
83	NC_008379	CGC	2	6	7245	7250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249466
84	NC_008379	AGC	2	6	7259	7264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249466
85	NC_008379	AGC	2	6	7358	7363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249466
86	NC_008379	CGG	2	6	7446	7451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249466
87	NC_008379	CGG	2	6	7459	7464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249466
88	NC_008379	GGT	2	6	7471	7476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116249466
89	NC_008379	GGA	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249466
90	NC_008379	GCG	2	6	7529	7534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249466
91	NC_008379	GCC	3	9	7621	7629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249466
92	NC_008379	TCG	2	6	7661	7666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249466
93	NC_008379	CGG	2	6	7782	7787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249466
94	NC_008379	ATC	2	6	7868	7873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249466
95	NC_008379	GCC	2	6	7940	7945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249466
96	NC_008379	ACG	2	6	8021	8026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249466
97	NC_008379	TTC	2	6	8093	8098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249466
98	NC_008379	CTT	2	6	8163	8168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249466
99	NC_008379	TCT	2	6	9371	9376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249467
100	NC_008379	GCG	3	9	9384	9392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249467
101	NC_008379	GAT	2	6	9403	9408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249467
102	NC_008379	CGA	2	6	9459	9464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249467
103	NC_008379	CAG	2	6	9667	9672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249467
104	NC_008379	TCG	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249467
105	NC_008379	GTT	2	6	9736	9741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	116249467
106	NC_008379	CAT	2	6	9745	9750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116249467
107	NC_008379	GAT	2	6	10092	10097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249468
108	NC_008379	CCT	2	6	10114	10119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249468
109	NC_008379	CCT	2	6	10123	10128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249468
110	NC_008379	GAC	2	6	10250	10255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249468
111	NC_008379	ACG	2	6	10365	10370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249468
112	NC_008379	GCC	2	6	10388	10393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249468
113	NC_008379	CGG	2	6	10495	10500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249468
114	NC_008379	GCC	2	6	10517	10522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249468
115	NC_008379	CAC	2	6	10529	10534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116249468
116	NC_008379	GCA	2	6	10708	10713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249469
117	NC_008379	CGA	2	6	10726	10731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249469
118	NC_008379	GAC	2	6	10733	10738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249469
119	NC_008379	TCG	2	6	10870	10875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249469
120	NC_008379	ATG	2	6	10977	10982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249469
121	NC_008379	CGG	2	6	11068	11073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249469
122	NC_008379	GCC	2	6	11096	11101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249469
123	NC_008379	GAG	2	6	11108	11113	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116249469
124	NC_008379	TCT	2	6	11248	11253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116249469
125	NC_008379	CAG	2	6	11257	11262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249469
126	NC_008379	GGC	2	6	11445	11450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116249470
127	NC_008379	GTC	2	6	11460	11465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116249470
128	NC_008379	TCC	2	6	11511	11516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116249470
129	NC_008379	CAG	2	6	11520	11525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116249470
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252	NC_008379	GAT	2	6	18577	18582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249477
253	NC_008379	GCC	2	6	18640	18645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116249477
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255	NC_008379	GAT	2	6	18723	18728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249477
256	NC_008379	GAT	2	6	18772	18777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116249477
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