MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008379	TC	3	6	4141	4146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008379	GC	3	6	5979	5984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008379	CA	3	6	7043	7048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008379	TG	3	6	8315	8320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008379	GC	4	8	10014	10021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008379	CG	3	6	22662	22667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008379	GC	3	6	22672	22677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008379	GC	3	6	23266	23271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008379	GC	3	6	23337	23342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008379	AC	3	6	27114	27119	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_008379	GC	3	6	28078	28083	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008379	CG	3	6	37128	37133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008379	GC	3	6	37724	37729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008379	AG	3	6	39660	39665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008379	GC	3	6	39706	39711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008379	GC	3	6	43258	43263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008379	GC	3	6	43590	43595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008379	TC	3	6	43805	43810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_008379	GC	3	6	48973	48978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008379	CG	3	6	48987	48992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008379	GC	3	6	52501	52506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008379	GA	4	8	52543	52550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008379	TC	3	6	52622	52627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008379	GA	3	6	52754	52759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008379	GA	3	6	57451	57456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008379	GA	4	8	61498	61505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008379	GC	3	6	65819	65824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008379	AG	3	6	67532	67537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008379	TC	3	6	81793	81798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008379	TC	3	6	86963	86968	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008379	TC	3	6	88043	88048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008379	GT	3	6	97933	97938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008379	CG	3	6	97997	98002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008379	TA	3	6	100403	100408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008379	GA	3	6	100472	100477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008379	CG	3	6	102215	102220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008379	CG	3	6	108075	108080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008379	AG	3	6	108111	108116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008379	GA	3	6	112768	112773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008379	CG	3	6	116225	116230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008379	GA	3	6	117034	117039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008379	TG	3	6	133429	133434	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008379	CG	3	6	141751	141756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008379	TA	3	6	141858	141863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008379	CT	3	6	148923	148928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008379	CG	3	6	155168	155173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008379	GC	3	6	155341	155346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008379	GC	3	6	156333	156338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008379	GC	3	6	165991	165996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008379	GA	3	6	166289	166294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008379	GA	3	6	179652	179657	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008379	GA	3	6	185006	185011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008379	CT	3	6	197960	197965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008379	CT	3	6	198072	198077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008379	CG	3	6	198165	198170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008379	AG	3	6	198399	198404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008379	GC	3	6	237172	237177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008379	CG	3	6	239626	239631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008379	AC	3	6	252851	252856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008379	AG	4	8	256064	256071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008379	CG	3	6	260946	260951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008379	TG	3	6	266380	266385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008379	CT	3	6	279130	279135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008379	TG	3	6	279155	279160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008379	CG	3	6	284985	284990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008379	TA	3	6	328745	328750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008379	GC	3	6	336141	336146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008379	CG	3	6	342275	342280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_008379	GC	3	6	345302	345307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008379	CG	3	6	348598	348603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008379	CG	3	6	351305	351310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008379	CG	3	6	351946	351951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_008379	CG	3	6	352072	352077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008379	GC	4	8	352245	352252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008379	GC	3	6	352461	352466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008379	AG	4	8	352528	352535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008379	AG	3	6	352640	352645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.