MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL9

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008379	A	8	8	118	125	100 %	0 %	0 %	0 %	116249461
2	NC_008379	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	116249461
3	NC_008379	T	6	6	1729	1734	0 %	100 %	0 %	0 %	116249462
4	NC_008379	A	8	8	3134	3141	100 %	0 %	0 %	0 %	116249463
5	NC_008379	G	6	6	4619	4624	0 %	0 %	100 %	0 %	116249464
6	NC_008379	G	6	6	8815	8820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008379	C	6	6	11100	11105	0 %	0 %	0 %	100 %	116249469
8	NC_008379	T	6	6	20594	20599	0 %	100 %	0 %	0 %	116249478
9	NC_008379	A	6	6	30419	30424	100 %	0 %	0 %	0 %	116249488
10	NC_008379	T	6	6	42139	42144	0 %	100 %	0 %	0 %	116249497
11	NC_008379	T	6	6	42251	42256	0 %	100 %	0 %	0 %	116249497
12	NC_008379	G	6	6	45548	45553	0 %	0 %	100 %	0 %	116249499
13	NC_008379	T	6	6	50649	50654	0 %	100 %	0 %	0 %	116249503
14	NC_008379	A	6	6	50707	50712	100 %	0 %	0 %	0 %	116249503
15	NC_008379	A	6	6	51104	51109	100 %	0 %	0 %	0 %	116249504
16	NC_008379	T	6	6	53217	53222	0 %	100 %	0 %	0 %	116249506
17	NC_008379	T	6	6	67485	67490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008379	A	7	7	70166	70172	100 %	0 %	0 %	0 %	116249524
19	NC_008379	T	6	6	72533	72538	0 %	100 %	0 %	0 %	116249527
20	NC_008379	T	6	6	92464	92469	0 %	100 %	0 %	0 %	116249545
21	NC_008379	G	7	7	93364	93370	0 %	0 %	100 %	0 %	116249546
22	NC_008379	T	6	6	97860	97865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008379	T	6	6	100446	100451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008379	G	6	6	107225	107230	0 %	0 %	100 %	0 %	116249560
25	NC_008379	G	6	6	125649	125654	0 %	0 %	100 %	0 %	116249578
26	NC_008379	C	6	6	130128	130133	0 %	0 %	0 %	100 %	116249581
27	NC_008379	C	6	6	134056	134061	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NC_008379	G	7	7	143383	143389	0 %	0 %	100 %	0 %	116249591
29	NC_008379	A	6	6	144347	144352	100 %	0 %	0 %	0 %	116249592
30	NC_008379	T	8	8	148607	148614	0 %	100 %	0 %	0 %	116249594
31	NC_008379	G	6	6	151100	151105	0 %	0 %	100 %	0 %	116249597
32	NC_008379	G	8	8	151123	151130	0 %	0 %	100 %	0 %	116249597
33	NC_008379	T	8	8	153168	153175	0 %	100 %	0 %	0 %	116249599
34	NC_008379	A	6	6	157983	157988	100 %	0 %	0 %	0 %	116249602
35	NC_008379	G	6	6	158856	158861	0 %	0 %	100 %	0 %	116249603
36	NC_008379	A	6	6	161578	161583	100 %	0 %	0 %	0 %	116249606
37	NC_008379	T	6	6	162345	162350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008379	T	6	6	165409	165414	0 %	100 %	0 %	0 %	116249609
39	NC_008379	A	6	6	166103	166108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008379	G	6	6	185724	185729	0 %	0 %	100 %	0 %	116249620
41	NC_008379	A	6	6	186759	186764	100 %	0 %	0 %	0 %	116249620
42	NC_008379	A	6	6	187368	187373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008379	C	6	6	189989	189994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_008379	A	6	6	193884	193889	100 %	0 %	0 %	0 %	116249626
45	NC_008379	A	7	7	199370	199376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008379	T	6	6	214100	214105	0 %	100 %	0 %	0 %	116249643
47	NC_008379	A	6	6	217943	217948	100 %	0 %	0 %	0 %	116249647
48	NC_008379	A	6	6	218722	218727	100 %	0 %	0 %	0 %	116249647
49	NC_008379	C	6	6	220021	220026	0 %	0 %	0 %	100 %	116249650
50	NC_008379	A	6	6	221454	221459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008379	G	6	6	229223	229228	0 %	0 %	100 %	0 %	116249658
52	NC_008379	T	7	7	240399	240405	0 %	100 %	0 %	0 %	116249670
53	NC_008379	T	7	7	274067	274073	0 %	100 %	0 %	0 %	116249700
54	NC_008379	A	6	6	279226	279231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008379	G	6	6	294479	294484	0 %	0 %	100 %	0 %	116249720
56	NC_008379	T	6	6	306763	306768	0 %	100 %	0 %	0 %	116249730
57	NC_008379	G	6	6	309988	309993	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008379	A	6	6	312365	312370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008379	A	6	6	333275	333280	100 %	0 %	0 %	0 %	116249752
60	NC_008379	C	6	6	334030	334035	0 %	0 %	0 %	100 %	116249753
61	NC_008379	A	6	6	341755	341760	100 %	0 %	0 %	0 %	116249758
62	NC_008379	A	6	6	342070	342075	100 %	0 %	0 %	0 %	116249758
63	NC_008379	C	6	6	349959	349964	0 %	0 %	0 %	100 %	116249763
64	NC_008379	A	6	6	350450	350455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.