MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008378	ATGTC	2	10	836	845	20 %	40 %	20 %	20 %	116248677
2	NC_008378	CAGGG	2	10	2738	2747	20 %	0 %	60 %	20 %	116248679
3	NC_008378	GCAAG	2	10	6219	6228	40 %	0 %	40 %	20 %	116248682
4	NC_008378	TCTCC	2	10	7181	7190	0 %	40 %	0 %	60 %	116248683
5	NC_008378	CGGCG	2	10	8557	8566	0 %	0 %	60 %	40 %	116248685
6	NC_008378	GGCAT	2	10	8651	8660	20 %	20 %	40 %	20 %	116248685
7	NC_008378	TGACC	2	10	9208	9217	20 %	20 %	20 %	40 %	116248685
8	NC_008378	ACTCA	2	10	10130	10139	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008378	CAAAC	2	10	11682	11691	60 %	0 %	0 %	40 %	116248688
10	NC_008378	CCGAT	2	10	11869	11878	20 %	20 %	20 %	40 %	116248688
11	NC_008378	GCTGC	2	10	12213	12222	0 %	20 %	40 %	40 %	116248688
12	NC_008378	CATCG	2	10	12668	12677	20 %	20 %	20 %	40 %	116248689
13	NC_008378	TTCCG	2	10	12898	12907	0 %	40 %	20 %	40 %	116248689
14	NC_008378	GAAAT	2	10	13418	13427	60 %	20 %	20 %	0 %	116248689
15	NC_008378	CGCTG	2	10	14998	15007	0 %	20 %	40 %	40 %	116248691
16	NC_008378	GGCTT	2	10	16805	16814	0 %	40 %	40 %	20 %	116248693
17	NC_008378	AGGCC	2	10	18332	18341	20 %	0 %	40 %	40 %	116248695
18	NC_008378	CGAGA	2	10	18991	19000	40 %	0 %	40 %	20 %	116248696
19	NC_008378	CCGGT	2	10	21100	21109	0 %	20 %	40 %	40 %	116248698
20	NC_008378	GCTTT	2	10	21330	21339	0 %	60 %	20 %	20 %	116248698
21	NC_008378	CTTCG	2	10	21752	21761	0 %	40 %	20 %	40 %	116248699
22	NC_008378	GGCGC	2	10	22342	22351	0 %	0 %	60 %	40 %	116248699
23	NC_008378	GCCGA	2	10	23327	23336	20 %	0 %	40 %	40 %	116248700
24	NC_008378	CGGCG	2	10	24260	24269	0 %	0 %	60 %	40 %	116248701
25	NC_008378	TGGGT	2	10	24509	24518	0 %	40 %	60 %	0 %	116248701
26	NC_008378	GGCGC	2	10	26086	26095	0 %	0 %	60 %	40 %	116248703
27	NC_008378	TCCGT	2	10	26990	26999	0 %	40 %	20 %	40 %	116248704
28	NC_008378	GGAAC	2	10	30377	30386	40 %	0 %	40 %	20 %	116248707
29	NC_008378	CAATA	2	10	30434	30443	60 %	20 %	0 %	20 %	116248707
30	NC_008378	GATCG	2	10	30968	30977	20 %	20 %	40 %	20 %	116248707
31	NC_008378	GCCGG	2	10	31654	31663	0 %	0 %	60 %	40 %	116248708
32	NC_008378	TGCGG	2	10	32540	32549	0 %	20 %	60 %	20 %	116248709
33	NC_008378	GCAGG	2	10	32781	32790	20 %	0 %	60 %	20 %	116248710
34	NC_008378	GGACG	2	10	34664	34673	20 %	0 %	60 %	20 %	116248711
35	NC_008378	CGGCT	2	10	35228	35237	0 %	20 %	40 %	40 %	116248711
36	NC_008378	TCGCG	2	10	37698	37707	0 %	20 %	40 %	40 %	116248714
37	NC_008378	CGGGC	2	10	38180	38189	0 %	0 %	60 %	40 %	116248714
38	NC_008378	CCATG	2	10	39273	39282	20 %	20 %	20 %	40 %	116248716
39	NC_008378	CGCAT	2	10	39846	39855	20 %	20 %	20 %	40 %	116248716
40	NC_008378	ATCGG	2	10	39884	39893	20 %	20 %	40 %	20 %	116248716
41	NC_008378	GAATC	2	10	40672	40681	40 %	20 %	20 %	20 %	116248717
42	NC_008378	GCCGA	2	10	41471	41480	20 %	0 %	40 %	40 %	116248718
43	NC_008378	TTGCC	2	10	41831	41840	0 %	40 %	20 %	40 %	116248718
44	NC_008378	TTTTC	2	10	43016	43025	0 %	80 %	0 %	20 %	116248719
45	NC_008378	CCGTG	2	10	43169	43178	0 %	20 %	40 %	40 %	116248719
46	NC_008378	TGTCG	2	10	43305	43314	0 %	40 %	40 %	20 %	116248719
47	NC_008378	GGCGG	2	10	44963	44972	0 %	0 %	80 %	20 %	116248720
48	NC_008378	CCAGA	2	10	45942	45951	40 %	0 %	20 %	40 %	116248722
49	NC_008378	CGCCC	2	10	46248	46257	0 %	0 %	20 %	80 %	116248722
50	NC_008378	ACGGC	2	10	46748	46757	20 %	0 %	40 %	40 %	116248722
51	NC_008378	CTGCG	2	10	48889	48898	0 %	20 %	40 %	40 %	116248724
52	NC_008378	GCGCG	2	10	51368	51377	0 %	0 %	60 %	40 %	116248728
53	NC_008378	CGGCG	2	10	53190	53199	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_008378	CCGCA	2	10	53906	53915	20 %	0 %	20 %	60 %	116248730
55	NC_008378	CGGTT	2	10	55739	55748	0 %	40 %	40 %	20 %	116248732
56	NC_008378	GATCT	2	10	55798	55807	20 %	40 %	20 %	20 %	116248732
57	NC_008378	TTCAT	2	10	56116	56125	20 %	60 %	0 %	20 %	116248732
58	NC_008378	CAAGC	2	10	58178	58187	40 %	0 %	20 %	40 %	116248734
59	NC_008378	CGGTT	2	10	58450	58459	0 %	40 %	40 %	20 %	116248734
60	NC_008378	GGGCA	2	10	60252	60261	20 %	0 %	60 %	20 %	116248736
61	NC_008378	GCTGC	2	10	63787	63796	0 %	20 %	40 %	40 %	116248740
62	NC_008378	GGCCG	2	10	65256	65265	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_008378	GGCCG	2	10	65866	65875	0 %	0 %	60 %	40 %	116248741
64	NC_008378	AGGAT	2	10	66095	66104	40 %	20 %	40 %	0 %	116248741
65	NC_008378	GACAT	2	10	67428	67437	40 %	20 %	20 %	20 %	116248743
66	NC_008378	CGACG	2	10	67646	67655	20 %	0 %	40 %	40 %	116248743
67	NC_008378	AGATC	2	10	67916	67925	40 %	20 %	20 %	20 %	116248743
68	NC_008378	GGCAG	2	10	69464	69473	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008378	AAGGC	2	10	71931	71940	40 %	0 %	40 %	20 %	116248745
70	NC_008378	AGGCG	2	10	72890	72899	20 %	0 %	60 %	20 %	116248746
71	NC_008378	GCGAC	2	10	75723	75732	20 %	0 %	40 %	40 %	116248750
72	NC_008378	CGGCA	2	10	76905	76914	20 %	0 %	40 %	40 %	116248752
73	NC_008378	GCTTT	2	10	77263	77272	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008378	ATGAC	2	10	78862	78871	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_008378	CGGCC	2	10	79044	79053	0 %	0 %	40 %	60 %	116248755
76	NC_008378	GATCG	2	10	83573	83582	20 %	20 %	40 %	20 %	116248762
77	NC_008378	GAGGG	2	10	86407	86416	20 %	0 %	80 %	0 %	116248766
78	NC_008378	TGCAG	2	10	87594	87603	20 %	20 %	40 %	20 %	116248768
79	NC_008378	CTCTG	2	10	87821	87830	0 %	40 %	20 %	40 %	116248768
80	NC_008378	CTTGC	2	10	88261	88270	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_008378	GAGCA	2	10	91135	91144	40 %	0 %	40 %	20 %	116248770
82	NC_008378	TTGGA	2	10	95668	95677	20 %	40 %	40 %	0 %	116248775
83	NC_008378	TTGCC	2	10	96716	96725	0 %	40 %	20 %	40 %	116248776
84	NC_008378	ATGAA	2	10	97212	97221	60 %	20 %	20 %	0 %	116248777
85	NC_008378	GGCGG	2	10	99344	99353	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
86	NC_008378	AAGGC	2	10	104681	104690	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_008378	CGGAC	2	10	111422	111431	20 %	0 %	40 %	40 %	116248789
88	NC_008378	ACGGC	2	10	111806	111815	20 %	0 %	40 %	40 %	116248789
89	NC_008378	CGACG	2	10	112427	112436	20 %	0 %	40 %	40 %	116248789
90	NC_008378	CAGCG	2	10	112814	112823	20 %	0 %	40 %	40 %	116248790
91	NC_008378	GGGGT	2	10	115395	115404	0 %	20 %	80 %	0 %	116248791
92	NC_008378	CTTCG	2	10	115747	115756	0 %	40 %	20 %	40 %	116248791
93	NC_008378	GAAGT	2	10	116123	116132	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008378	TGAAA	2	10	116164	116173	60 %	20 %	20 %	0 %	116248792
95	NC_008378	GGCGA	2	10	116357	116366	20 %	0 %	60 %	20 %	116248792
96	NC_008378	CCTTC	2	10	117575	117584	0 %	40 %	0 %	60 %	116248793
97	NC_008378	CCGAG	2	10	117944	117953	20 %	0 %	40 %	40 %	116248793
98	NC_008378	TTTCC	2	10	118204	118213	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_008378	TCACG	2	10	122147	122156	20 %	20 %	20 %	40 %	116248797
100	NC_008378	GTCCG	2	10	123575	123584	0 %	20 %	40 %	40 %	116248798
101	NC_008378	TGCGA	2	10	124371	124380	20 %	20 %	40 %	20 %	116248799
102	NC_008378	CCTTC	2	10	126012	126021	0 %	40 %	0 %	60 %	116248800
103	NC_008378	CGCTC	2	10	126321	126330	0 %	20 %	20 %	60 %	116248801
104	NC_008378	TGCGG	2	10	130756	130765	0 %	20 %	60 %	20 %	116248804
105	NC_008378	GATCG	2	10	131974	131983	20 %	20 %	40 %	20 %	116248805
106	NC_008378	GTTCA	2	10	135735	135744	20 %	40 %	20 %	20 %	116248809
107	NC_008378	CAAGC	2	10	137912	137921	40 %	0 %	20 %	40 %	116248810
108	NC_008378	GCACC	2	10	138254	138263	20 %	0 %	20 %	60 %	116248811
109	NC_008378	TCCGG	2	10	140505	140514	0 %	20 %	40 %	40 %	116248813
110	NC_008378	CGAGC	2	10	141543	141552	20 %	0 %	40 %	40 %	116248814
111	NC_008378	CGATC	2	10	142153	142162	20 %	20 %	20 %	40 %	116248815
112	NC_008378	TGCGG	2	10	144410	144419	0 %	20 %	60 %	20 %	116248817
113	NC_008378	GAAAC	2	10	145076	145085	60 %	0 %	20 %	20 %	116248818
114	NC_008378	TCCCG	2	10	147498	147507	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_008378	GCCCT	2	10	150746	150755	0 %	20 %	20 %	60 %	116248824
116	NC_008378	GCCGC	2	10	153063	153072	0 %	0 %	40 %	60 %	116248826
117	NC_008378	ATCGC	2	10	153095	153104	20 %	20 %	20 %	40 %	116248826
118	NC_008378	CCTGC	2	10	153446	153455	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_008378	GGCGA	2	10	157765	157774	20 %	0 %	60 %	20 %	116248830
120	NC_008378	CGGCG	2	10	158177	158186	0 %	0 %	60 %	40 %	116248831
121	NC_008378	CGAAA	2	10	162689	162698	60 %	0 %	20 %	20 %	116248834
122	NC_008378	CGTTG	2	10	162751	162760	0 %	40 %	40 %	20 %	116248834
123	NC_008378	CCGGA	2	10	163670	163679	20 %	0 %	40 %	40 %	116248835
124	NC_008378	CGAAA	2	10	163857	163866	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_008378	ACAGA	2	10	169068	169077	60 %	0 %	20 %	20 %	116248839
126	NC_008378	TGCCC	2	10	171394	171403	0 %	20 %	20 %	60 %	116248841
127	NC_008378	GCCAA	2	10	179257	179266	40 %	0 %	20 %	40 %	116248848
128	NC_008378	CGGTC	2	10	180661	180670	0 %	20 %	40 %	40 %	116248849
129	NC_008378	TGGCG	2	10	183968	183977	0 %	20 %	60 %	20 %	116248850
130	NC_008378	TGGAA	2	10	187018	187027	40 %	20 %	40 %	0 %	116248853
131	NC_008378	TCGGT	2	10	187273	187282	0 %	40 %	40 %	20 %	116248853
132	NC_008378	GGCCG	2	10	187749	187758	0 %	0 %	60 %	40 %	116248853
133	NC_008378	ACCCC	2	10	189584	189593	20 %	0 %	0 %	80 %	116248854
134	NC_008378	TCGCT	2	10	190133	190142	0 %	40 %	20 %	40 %	116248855
135	NC_008378	TCGGC	2	10	190317	190326	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_008378	GCTCG	2	10	190807	190816	0 %	20 %	40 %	40 %	116248856
137	NC_008378	AAGGC	2	10	191186	191195	40 %	0 %	40 %	20 %	116248856
138	NC_008378	GCGCG	2	10	194248	194257	0 %	0 %	60 %	40 %	116248859
139	NC_008378	CGGCG	2	10	195012	195021	0 %	0 %	60 %	40 %	116248859
140	NC_008378	CAGAT	2	10	195466	195475	40 %	20 %	20 %	20 %	116248859
141	NC_008378	CTGGA	2	10	195510	195519	20 %	20 %	40 %	20 %	116248859
142	NC_008378	CCGGC	2	10	197987	197996	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_008378	CCCGG	2	10	198897	198906	0 %	0 %	40 %	60 %	116248862
144	NC_008378	TCGCC	2	10	200703	200712	0 %	20 %	20 %	60 %	116248864
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146	NC_008378	GGCCC	2	10	210202	210211	0 %	0 %	40 %	60 %	116248871
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149	NC_008378	CCGGT	2	10	212204	212213	0 %	20 %	40 %	40 %	116248873
150	NC_008378	CTTGG	2	10	212525	212534	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
151	NC_008378	CGCTG	2	10	212849	212858	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_008378	CTGCA	2	10	213749	213758	20 %	20 %	20 %	40 %	116248874
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155	NC_008378	GCCGC	2	10	215116	215125	0 %	0 %	40 %	60 %	116248875
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157	NC_008378	GCATC	2	10	217875	217884	20 %	20 %	20 %	40 %	116248877
158	NC_008378	GCGCG	2	10	219666	219675	0 %	0 %	60 %	40 %	116248879
159	NC_008378	GCTTC	2	10	223358	223367	0 %	40 %	20 %	40 %	116248885
160	NC_008378	TTGCC	2	10	223704	223713	0 %	40 %	20 %	40 %	116248885
161	NC_008378	CATCG	2	10	223933	223942	20 %	20 %	20 %	40 %	116248885
162	NC_008378	AGCAT	2	10	224175	224184	40 %	20 %	20 %	20 %	116248886
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168	NC_008378	GGATC	2	10	229421	229430	20 %	20 %	40 %	20 %	116248891
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175	NC_008378	TCCCC	2	10	236394	236403	0 %	20 %	0 %	80 %	116248898
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189	NC_008378	GGGTC	2	10	252585	252594	0 %	20 %	60 %	20 %	116248911
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195	NC_008378	TGGAT	2	10	268977	268986	20 %	40 %	40 %	0 %	116248927
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213	NC_008378	GCAAA	2	10	289905	289914	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
214	NC_008378	CGGTT	2	10	290937	290946	0 %	40 %	40 %	20 %	116248944
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249	NC_008378	CCCAG	2	10	338278	338287	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
250	NC_008378	TTTGA	2	10	342638	342647	20 %	60 %	20 %	0 %	116248988
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