MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 2285

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008378	ACGG	2	8	236	243	25 %	0 %	50 %	25 %	116248677
2	NC_008378	GTCG	2	8	882	889	0 %	25 %	50 %	25 %	116248677
3	NC_008378	ATAG	2	8	1191	1198	50 %	25 %	25 %	0 %	116248677
4	NC_008378	CTTC	2	8	1440	1447	0 %	50 %	0 %	50 %	116248678
5	NC_008378	CGAT	2	8	1453	1460	25 %	25 %	25 %	25 %	116248678
6	NC_008378	CGAT	2	8	1464	1471	25 %	25 %	25 %	25 %	116248678
7	NC_008378	CCGC	2	8	1537	1544	0 %	0 %	25 %	75 %	116248678
8	NC_008378	GGCC	2	8	2681	2688	0 %	0 %	50 %	50 %	116248679
9	NC_008378	ACGA	2	8	3226	3233	50 %	0 %	25 %	25 %	116248679
10	NC_008378	GGCC	2	8	4042	4049	0 %	0 %	50 %	50 %	116248680
11	NC_008378	GTGA	2	8	4109	4116	25 %	25 %	50 %	0 %	116248680
12	NC_008378	CGGC	2	8	4234	4241	0 %	0 %	50 %	50 %	116248680
13	NC_008378	GAAG	2	8	4955	4962	50 %	0 %	50 %	0 %	116248681
14	NC_008378	TCAG	2	8	5185	5192	25 %	25 %	25 %	25 %	116248681
15	NC_008378	ATCA	2	8	5307	5314	50 %	25 %	0 %	25 %	116248681
16	NC_008378	GGCT	2	8	5740	5747	0 %	25 %	50 %	25 %	116248682
17	NC_008378	GACC	2	8	5784	5791	25 %	0 %	25 %	50 %	116248682
18	NC_008378	CGAT	2	8	6122	6129	25 %	25 %	25 %	25 %	116248682
19	NC_008378	GTCC	2	8	6486	6493	0 %	25 %	25 %	50 %	116248682
20	NC_008378	AGGA	2	8	6773	6780	50 %	0 %	50 %	0 %	116248683
21	NC_008378	ATCT	2	8	7515	7522	25 %	50 %	0 %	25 %	116248683
22	NC_008378	GCCG	2	8	7930	7937	0 %	0 %	50 %	50 %	116248684
23	NC_008378	TCCT	2	8	8012	8019	0 %	50 %	0 %	50 %	116248684
24	NC_008378	TTCG	2	8	8350	8357	0 %	50 %	25 %	25 %	116248684
25	NC_008378	CGAA	2	8	8737	8744	50 %	0 %	25 %	25 %	116248685
26	NC_008378	GCCG	2	8	9085	9092	0 %	0 %	50 %	50 %	116248685
27	NC_008378	GCTG	2	8	9301	9308	0 %	25 %	50 %	25 %	116248685
28	NC_008378	CACC	2	8	9399	9406	25 %	0 %	0 %	75 %	116248685
29	NC_008378	CCAA	2	8	9619	9626	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008378	ATCG	2	8	10119	10126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008378	CGGC	2	8	11111	11118	0 %	0 %	50 %	50 %	116248687
32	NC_008378	TGGG	2	8	11525	11532	0 %	25 %	75 %	0 %	116248687
33	NC_008378	GAAG	2	8	11544	11551	50 %	0 %	50 %	0 %	116248687
34	NC_008378	CGCT	2	8	12234	12241	0 %	25 %	25 %	50 %	116248688
35	NC_008378	TTCT	2	8	13071	13078	0 %	75 %	0 %	25 %	116248689
36	NC_008378	CGAC	2	8	13243	13250	25 %	0 %	25 %	50 %	116248689
37	NC_008378	CTGT	2	8	13495	13502	0 %	50 %	25 %	25 %	116248690
38	NC_008378	GCCG	2	8	13612	13619	0 %	0 %	50 %	50 %	116248690
39	NC_008378	TCGT	2	8	13868	13875	0 %	50 %	25 %	25 %	116248690
40	NC_008378	GCCG	2	8	13878	13885	0 %	0 %	50 %	50 %	116248690
41	NC_008378	CCTT	2	8	13886	13893	0 %	50 %	0 %	50 %	116248690
42	NC_008378	ATCG	2	8	14717	14724	25 %	25 %	25 %	25 %	116248691
43	NC_008378	GCGG	2	8	14956	14963	0 %	0 %	75 %	25 %	116248691
44	NC_008378	GATC	2	8	15022	15029	25 %	25 %	25 %	25 %	116248691
45	NC_008378	CCAT	2	8	15108	15115	25 %	25 %	0 %	50 %	116248691
46	NC_008378	CGTG	2	8	15943	15950	0 %	25 %	50 %	25 %	116248692
47	NC_008378	TCGT	2	8	16262	16269	0 %	50 %	25 %	25 %	116248693
48	NC_008378	GGGA	2	8	16945	16952	25 %	0 %	75 %	0 %	116248694
49	NC_008378	AGGT	2	8	17266	17273	25 %	25 %	50 %	0 %	116248694
50	NC_008378	TTCG	2	8	17997	18004	0 %	50 %	25 %	25 %	116248695
51	NC_008378	CGAC	2	8	18392	18399	25 %	0 %	25 %	50 %	116248695
52	NC_008378	GCCA	2	8	18758	18765	25 %	0 %	25 %	50 %	116248696
53	NC_008378	TTCG	2	8	18880	18887	0 %	50 %	25 %	25 %	116248696
54	NC_008378	GCTG	2	8	19059	19066	0 %	25 %	50 %	25 %	116248696
55	NC_008378	TGAA	2	8	19895	19902	50 %	25 %	25 %	0 %	116248696
56	NC_008378	ATTG	2	8	20160	20167	25 %	50 %	25 %	0 %	116248697
57	NC_008378	AGGG	2	8	20386	20393	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008378	CGCC	2	8	21841	21848	0 %	0 %	25 %	75 %	116248699
59	NC_008378	GGTC	2	8	21994	22001	0 %	25 %	50 %	25 %	116248699
60	NC_008378	GTCC	2	8	22042	22049	0 %	25 %	25 %	50 %	116248699
61	NC_008378	GCGA	2	8	23636	23643	25 %	0 %	50 %	25 %	116248700
62	NC_008378	TCCT	2	8	24432	24439	0 %	50 %	0 %	50 %	116248701
63	NC_008378	GATC	2	8	25127	25134	25 %	25 %	25 %	25 %	116248702
64	NC_008378	GTGC	2	8	25594	25601	0 %	25 %	50 %	25 %	116248702
65	NC_008378	GAAA	2	8	25800	25807	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008378	TTTG	2	8	25823	25830	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008378	GGGC	2	8	26010	26017	0 %	0 %	75 %	25 %	116248703
68	NC_008378	TCAT	2	8	26651	26658	25 %	50 %	0 %	25 %	116248703
69	NC_008378	CGGC	2	8	26783	26790	0 %	0 %	50 %	50 %	116248704
70	NC_008378	GGCT	2	8	26874	26881	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
71	NC_008378	GGCT	2	8	26887	26894	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
72	NC_008378	CGGT	2	8	27197	27204	0 %	25 %	50 %	25 %	116248704
73	NC_008378	CGAC	2	8	27209	27216	25 %	0 %	25 %	50 %	116248704
74	NC_008378	GGAA	2	8	27263	27270	50 %	0 %	50 %	0 %	116248704
75	NC_008378	ATGG	2	8	27591	27598	25 %	25 %	50 %	0 %	116248704
76	NC_008378	GCGG	2	8	27651	27658	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008378	GCGG	2	8	28734	28741	0 %	0 %	75 %	25 %	116248705
78	NC_008378	TCGA	2	8	28913	28920	25 %	25 %	25 %	25 %	116248705
79	NC_008378	ATCG	2	8	29065	29072	25 %	25 %	25 %	25 %	116248705
80	NC_008378	CCAG	2	8	29169	29176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008378	GCAC	2	8	29749	29756	25 %	0 %	25 %	50 %	116248706
82	NC_008378	GAGC	2	8	29937	29944	25 %	0 %	50 %	25 %	116248706
83	NC_008378	TCCG	2	8	30261	30268	0 %	25 %	25 %	50 %	116248706
84	NC_008378	GCTG	2	8	30317	30324	0 %	25 %	50 %	25 %	116248706
85	NC_008378	ATCC	2	8	30566	30573	25 %	25 %	0 %	50 %	116248707
86	NC_008378	GGCC	2	8	30592	30599	0 %	0 %	50 %	50 %	116248707
87	NC_008378	GGCG	2	8	31242	31249	0 %	0 %	75 %	25 %	116248708
88	NC_008378	GCCT	2	8	31548	31555	0 %	25 %	25 %	50 %	116248708
89	NC_008378	GACC	2	8	31788	31795	25 %	0 %	25 %	50 %	116248708
90	NC_008378	GTCG	2	8	33210	33217	0 %	25 %	50 %	25 %	116248710
91	NC_008378	CGAT	2	8	33665	33672	25 %	25 %	25 %	25 %	116248710
92	NC_008378	TGCG	2	8	33698	33705	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008378	CTGG	2	8	35503	35510	0 %	25 %	50 %	25 %	116248712
94	NC_008378	CTTC	2	8	36618	36625	0 %	50 %	0 %	50 %	116248713
95	NC_008378	CGGG	2	8	36649	36656	0 %	0 %	75 %	25 %	116248713
96	NC_008378	CGGG	2	8	37925	37932	0 %	0 %	75 %	25 %	116248714
97	NC_008378	GCCA	2	8	38152	38159	25 %	0 %	25 %	50 %	116248714
98	NC_008378	GAGC	2	8	38194	38201	25 %	0 %	50 %	25 %	116248714
99	NC_008378	GGCG	2	8	38649	38656	0 %	0 %	75 %	25 %	116248715
100	NC_008378	CCTT	2	8	39082	39089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008378	ACTT	2	8	39375	39382	25 %	50 %	0 %	25 %	116248716
102	NC_008378	GGAC	2	8	39639	39646	25 %	0 %	50 %	25 %	116248716
103	NC_008378	GCTG	2	8	39689	39696	0 %	25 %	50 %	25 %	116248716
104	NC_008378	CGGC	2	8	40244	40251	0 %	0 %	50 %	50 %	116248716
105	NC_008378	TGCG	2	8	40567	40574	0 %	25 %	50 %	25 %	116248717
106	NC_008378	TGGG	2	8	40581	40588	0 %	25 %	75 %	0 %	116248717
107	NC_008378	ATCG	2	8	41308	41315	25 %	25 %	25 %	25 %	116248718
108	NC_008378	CGGC	2	8	41625	41632	0 %	0 %	50 %	50 %	116248718
109	NC_008378	CGGC	2	8	42244	42251	0 %	0 %	50 %	50 %	116248719
110	NC_008378	GCCC	2	8	43373	43380	0 %	0 %	25 %	75 %	116248719
111	NC_008378	GGCG	2	8	43672	43679	0 %	0 %	75 %	25 %	116248720
112	NC_008378	GCCG	2	8	43852	43859	0 %	0 %	50 %	50 %	116248720
113	NC_008378	TCCG	2	8	44290	44297	0 %	25 %	25 %	50 %	116248720
114	NC_008378	GAAG	2	8	45143	45150	50 %	0 %	50 %	0 %	116248721
115	NC_008378	CGAC	2	8	45307	45314	25 %	0 %	25 %	50 %	116248721
116	NC_008378	TGCG	2	8	45442	45449	0 %	25 %	50 %	25 %	116248721
117	NC_008378	GGCC	2	8	45517	45524	0 %	0 %	50 %	50 %	116248721
118	NC_008378	CTTT	2	8	45612	45619	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008378	AGAA	2	8	45620	45627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008378	GATC	2	8	45999	46006	25 %	25 %	25 %	25 %	116248722
121	NC_008378	GGCT	2	8	46066	46073	0 %	25 %	50 %	25 %	116248722
122	NC_008378	TTCA	2	8	46104	46111	25 %	50 %	0 %	25 %	116248722
123	NC_008378	TGGC	2	8	46156	46163	0 %	25 %	50 %	25 %	116248722
124	NC_008378	GCAG	2	8	46466	46473	25 %	0 %	50 %	25 %	116248722
125	NC_008378	GGCC	2	8	46824	46831	0 %	0 %	50 %	50 %	116248722
126	NC_008378	GCCG	2	8	46980	46987	0 %	0 %	50 %	50 %	116248722
127	NC_008378	GCCG	2	8	47453	47460	0 %	0 %	50 %	50 %	116248723
128	NC_008378	GGCC	2	8	48337	48344	0 %	0 %	50 %	50 %	116248724
129	NC_008378	GGCG	2	8	49342	49349	0 %	0 %	75 %	25 %	116248725
130	NC_008378	GCTG	2	8	49698	49705	0 %	25 %	50 %	25 %	116248725
131	NC_008378	CACG	2	8	49906	49913	25 %	0 %	25 %	50 %	116248726
132	NC_008378	GGAT	2	8	50398	50405	25 %	25 %	50 %	0 %	116248726
133	NC_008378	GCCG	3	12	50441	50452	0 %	0 %	50 %	50 %	116248727
134	NC_008378	GCCG	2	8	50859	50866	0 %	0 %	50 %	50 %	116248727
135	NC_008378	GCCG	2	8	51255	51262	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
136	NC_008378	GCCG	2	8	51401	51408	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
137	NC_008378	CGGC	2	8	51757	51764	0 %	0 %	50 %	50 %	116248728
138	NC_008378	CTCG	2	8	51899	51906	0 %	25 %	25 %	50 %	116248728
139	NC_008378	TTGC	2	8	52071	52078	0 %	50 %	25 %	25 %	116248728
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141	NC_008378	CGGA	2	8	54250	54257	25 %	0 %	50 %	25 %	116248730
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