MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 196

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008378	A	8	8	3080	3087	100 %	0 %	0 %	0 %	116248679
2	NC_008378	T	6	6	10305	10310	0 %	100 %	0 %	0 %	116248687
3	NC_008378	A	6	6	20147	20152	100 %	0 %	0 %	0 %	116248697
4	NC_008378	T	6	6	20213	20218	0 %	100 %	0 %	0 %	116248697
5	NC_008378	A	6	6	27776	27781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008378	A	6	6	29437	29442	100 %	0 %	0 %	0 %	116248706
7	NC_008378	T	6	6	31716	31721	0 %	100 %	0 %	0 %	116248708
8	NC_008378	T	6	6	48073	48078	0 %	100 %	0 %	0 %	116248724
9	NC_008378	C	6	6	55308	55313	0 %	0 %	0 %	100 %	116248731
10	NC_008378	C	6	6	56903	56908	0 %	0 %	0 %	100 %	116248732
11	NC_008378	A	6	6	57764	57769	100 %	0 %	0 %	0 %	116248733
12	NC_008378	A	6	6	66266	66271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008378	T	6	6	69156	69161	0 %	100 %	0 %	0 %	116248743
14	NC_008378	C	6	6	69429	69434	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_008378	G	6	6	69473	69478	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008378	A	6	6	73054	73059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008378	T	6	6	73082	73087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008378	A	7	7	75855	75861	100 %	0 %	0 %	0 %	116248750
19	NC_008378	A	6	6	78005	78010	100 %	0 %	0 %	0 %	116248753
20	NC_008378	T	6	6	83187	83192	0 %	100 %	0 %	0 %	116248762
21	NC_008378	T	6	6	95929	95934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008378	T	6	6	98286	98291	0 %	100 %	0 %	0 %	116248778
23	NC_008378	G	6	6	114237	114242	0 %	0 %	100 %	0 %	116248791
24	NC_008378	T	6	6	115110	115115	0 %	100 %	0 %	0 %	116248791
25	NC_008378	T	6	6	115797	115802	0 %	100 %	0 %	0 %	116248791
26	NC_008378	C	6	6	117237	117242	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_008378	T	6	6	118058	118063	0 %	100 %	0 %	0 %	116248793
28	NC_008378	C	6	6	118881	118886	0 %	0 %	0 %	100 %	116248794
29	NC_008378	C	6	6	120019	120024	0 %	0 %	0 %	100 %	116248795
30	NC_008378	G	6	6	134608	134613	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008378	A	6	6	135806	135811	100 %	0 %	0 %	0 %	116248809
32	NC_008378	T	6	6	144128	144133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008378	T	6	6	148715	148720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008378	T	6	6	148799	148804	0 %	100 %	0 %	0 %	116248822
35	NC_008378	T	6	6	148913	148918	0 %	100 %	0 %	0 %	116248822
36	NC_008378	A	6	6	149025	149030	100 %	0 %	0 %	0 %	116248822
37	NC_008378	T	6	6	154526	154531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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39	NC_008378	C	6	6	160031	160036	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_008378	T	6	6	165557	165562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008378	A	6	6	165797	165802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008378	T	6	6	171506	171511	0 %	100 %	0 %	0 %	116248841
43	NC_008378	A	8	8	172629	172636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008378	C	6	6	174900	174905	0 %	0 %	0 %	100 %	116248845
45	NC_008378	A	6	6	177546	177551	100 %	0 %	0 %	0 %	116248847
46	NC_008378	A	6	6	178495	178500	100 %	0 %	0 %	0 %	116248848
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48	NC_008378	G	6	6	185882	185887	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008378	T	7	7	194612	194618	0 %	100 %	0 %	0 %	116248859
50	NC_008378	A	6	6	196811	196816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008378	A	7	7	213043	213049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53	NC_008378	T	6	6	218136	218141	0 %	100 %	0 %	0 %	116248877
54	NC_008378	G	6	6	223110	223115	0 %	0 %	100 %	0 %	116248885
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56	NC_008378	A	6	6	233286	233291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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60	NC_008378	A	6	6	239303	239308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008378	T	6	6	240633	240638	0 %	100 %	0 %	0 %	116248900
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64	NC_008378	T	6	6	254555	254560	0 %	100 %	0 %	0 %	116248912
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66	NC_008378	A	6	6	258267	258272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_008378	T	6	6	267425	267430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008378	A	7	7	267455	267461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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82	NC_008378	A	6	6	313484	313489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_008378	C	6	6	423635	423640	0 %	0 %	0 %	100 %	116249057
107	NC_008378	T	6	6	426649	426654	0 %	100 %	0 %	0 %	116249060
108	NC_008378	T	6	6	443099	443104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_008378	A	6	6	448816	448821	100 %	0 %	0 %	0 %	116249079
111	NC_008378	T	6	6	461372	461377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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113	NC_008378	T	7	7	469234	469240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008378	G	6	6	469951	469956	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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120	NC_008378	T	6	6	482267	482272	0 %	100 %	0 %	0 %	116249112
121	NC_008378	A	6	6	482348	482353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008378	A	6	6	482355	482360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_008378	T	6	6	563825	563830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.