MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 chromosome

Total Repeats: 914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008369	CAAGAT	2	12	721	732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115313982
2	NC_008369	TATTTC	2	12	2819	2830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008369	TAAGAG	2	12	6969	6980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115313986
4	NC_008369	TGGTTT	2	12	7401	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115313986
5	NC_008369	TAAAGG	2	12	8744	8755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115313988
6	NC_008369	GTTGAT	2	12	9834	9845	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115313990
7	NC_008369	ATTAAG	2	12	14498	14509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115313994
8	NC_008369	GTTTTA	2	12	21394	21405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008369	AAGGTT	2	12	24368	24379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008369	TCTAGT	2	12	26821	26832	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314000
11	NC_008369	CTAAAA	2	12	30384	30395	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115314001
12	NC_008369	TGGTGA	2	12	32370	32381	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314003
13	NC_008369	ACCAAT	2	12	32406	32417	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	115314003
14	NC_008369	ATAAGT	2	12	37586	37597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008369	TAAATT	2	12	41532	41543	50 %	50 %	0 %	0 %	115314012
16	NC_008369	TACCAG	2	12	45287	45298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115314014
17	NC_008369	TTAATT	2	12	50258	50269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008369	TAAAAA	2	12	56121	56132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	115314022
19	NC_008369	TTATGT	2	12	57883	57894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314025
20	NC_008369	AAGGAT	2	12	58425	58436	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115314025
21	NC_008369	GTTATT	2	12	62920	62931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314029
22	NC_008369	CTTGAG	2	12	64131	64142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008369	ATCTTT	2	12	80338	80349	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314042
24	NC_008369	TATGAA	2	12	81453	81464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314043
25	NC_008369	CAGTTA	2	12	84843	84854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008369	TGCAAA	2	12	86135	86146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115314048
27	NC_008369	TCAAAA	2	12	87176	87187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115314049
28	NC_008369	CAGCTT	2	12	87789	87800	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115314049
29	NC_008369	CTTTCT	2	12	90295	90306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115314050
30	NC_008369	ATATAG	2	12	91447	91458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314050
31	NC_008369	AATATC	2	12	95409	95420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314054
32	NC_008369	GTGATT	2	12	95645	95656	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115314054
33	NC_008369	TCCAGC	2	12	97369	97380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115314055
34	NC_008369	AAAAAG	2	12	97927	97938	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008369	GTTTTA	2	12	100301	100312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314058
36	NC_008369	AGCTTT	2	12	101719	101730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008369	TTTTGA	2	12	102744	102755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314059
38	NC_008369	TTTATC	2	12	103216	103227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314060
39	NC_008369	TAGTAT	2	12	105095	105106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115314061
40	NC_008369	TCATTA	2	12	105638	105649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314062
41	NC_008369	GATAAG	2	12	107486	107497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115314064
42	NC_008369	ATTAAA	2	12	107651	107662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115314064
43	NC_008369	CATTTG	2	12	109320	109331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314064
44	NC_008369	CTATTT	2	12	110142	110153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314064
45	NC_008369	CTTTCA	2	12	112314	112325	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	115314066
46	NC_008369	TCATTA	3	18	113556	113573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314067
47	NC_008369	TTTATA	2	12	117217	117228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008369	TTTATA	2	12	123418	123429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115314073
49	NC_008369	AGAATA	2	12	125889	125900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008369	TGAAAT	2	12	128195	128206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008369	GATGGT	2	12	129777	129788	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314074
52	NC_008369	GTTTTA	2	12	130636	130647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008369	ATCAAT	2	12	134293	134304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314076
54	NC_008369	TTTTAT	2	12	136753	136764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008369	AATACC	2	12	139118	139129	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	115314077
56	NC_008369	CTGATA	2	12	139384	139395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	115314077
57	NC_008369	TTATAA	2	12	142516	142527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008369	TTGAGA	2	12	143998	144009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314081
59	NC_008369	TTAGGC	2	12	144855	144866	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115314081
60	NC_008369	TATTTT	2	12	148093	148104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	115314085
61	NC_008369	TAAGTA	2	12	149038	149049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314087
62	NC_008369	ATAAAT	2	12	149452	149463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008369	GATCTA	2	12	153006	153017	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008369	AAATAT	2	12	155872	155883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115314091
65	NC_008369	ACAGGT	2	12	158049	158060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115314094
66	NC_008369	ACTTTT	2	12	158392	158403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314095
67	NC_008369	GTTTTA	2	12	159017	159028	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314096
68	NC_008369	ACCTTA	2	12	159843	159854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008369	GCCATT	2	12	160508	160519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115314099
70	NC_008369	ACTGTT	2	12	161911	161922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314100
71	NC_008369	TAATTA	2	12	163534	163545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008369	ATCAAT	2	12	165171	165182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314102
73	NC_008369	AAACTT	2	12	165576	165587	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314103
74	NC_008369	TATCAA	2	12	172279	172290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314107
75	NC_008369	AATTAT	2	12	172543	172554	50 %	50 %	0 %	0 %	115314107
76	NC_008369	ATTTAA	2	12	172754	172765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008369	GCTTTG	2	12	176809	176820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	115314112
78	NC_008369	TAAAAA	2	12	178655	178666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	115314116
79	NC_008369	TAGCTT	2	12	179329	179340	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314117
80	NC_008369	CCAGCT	2	12	180161	180172	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115314117
81	NC_008369	GACAAA	2	12	180692	180703	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115314118
82	NC_008369	GTTTTA	2	12	184364	184375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008369	CAAATT	2	12	189746	189757	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314127
84	NC_008369	TTTTAT	2	12	190431	190442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	115314128
85	NC_008369	TTAAGT	2	12	191172	191183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115314128
86	NC_008369	ATTATA	2	12	196443	196454	50 %	50 %	0 %	0 %	115314133
87	NC_008369	CACCAA	2	12	198217	198228	50 %	0 %	0 %	50 %	115314135
88	NC_008369	ACTAGT	2	12	205605	205616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	115314144
89	NC_008369	AAGATG	2	12	210139	210150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115314148
90	NC_008369	TACTGC	2	12	210755	210766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115314148
91	NC_008369	TTTAGC	2	12	210953	210964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314148
92	NC_008369	ATTAGT	2	12	211556	211567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115314148
93	NC_008369	ATAAGT	2	12	212641	212652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314150
94	NC_008369	TAGCTT	2	12	215566	215577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314152
95	NC_008369	ATTTTT	2	12	215819	215830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008369	TTTTGT	2	12	216336	216347	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008369	CATCAC	2	12	218825	218836	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	115314155
98	NC_008369	TTTTGA	2	12	218838	218849	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314155
99	NC_008369	TTATGG	2	12	221888	221899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115314156
100	NC_008369	ATTTTT	2	12	224179	224190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	115314158
101	NC_008369	TGAAGC	2	12	225141	225152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115314159
102	NC_008369	AAAGAA	2	12	226246	226257	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	115314160
103	NC_008369	AAAAGA	2	12	227729	227740	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	115314162
104	NC_008369	TGGTGT	2	12	228758	228769	0 %	50 %	50 %	0 %	115314164
105	NC_008369	GTTTTT	2	12	229458	229469	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	115314164
106	NC_008369	TGAAGT	2	12	231249	231260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314168
107	NC_008369	GCAAGA	2	12	231725	231736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	115314169
108	NC_008369	CTGTTG	2	12	232807	232818	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	115314169
109	NC_008369	AGGTTG	2	12	233416	233427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314169
110	NC_008369	AAGGGT	2	12	234462	234473	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	115314171
111	NC_008369	GTAAAG	2	12	238130	238141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115314178
112	NC_008369	TGGGTG	2	12	239680	239691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115314183
113	NC_008369	TTGGTG	2	12	240809	240820	0 %	50 %	50 %	0 %	115314185
114	NC_008369	GTTTTA	2	12	247929	247940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008369	ATGTAT	2	12	252161	252172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008369	GGTATG	2	12	253175	253186	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008369	TGATAA	2	12	262043	262054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314201
118	NC_008369	AAATGC	2	12	262740	262751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008369	CATTAG	2	12	263177	263188	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	115314202
120	NC_008369	CTAAAG	2	12	264006	264017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115314203
121	NC_008369	ATAACA	2	12	264578	264589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115314204
122	NC_008369	TTTATG	2	12	266308	266319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314205
123	NC_008369	TGGTGA	2	12	268465	268476	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314207
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129	NC_008369	TCTTGT	2	12	282191	282202	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	115314221
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149	NC_008369	ATTAAT	2	12	329125	329136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008369	TAGTTT	2	12	330443	330454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314264
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163	NC_008369	GTCTTG	2	12	362132	362143	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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170	NC_008369	TAGTGA	2	12	380452	380463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314312
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227	NC_008369	AAAAGT	2	12	491220	491231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
228	NC_008369	TAATGA	2	12	493379	493390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
229	NC_008369	AGTTGG	2	12	493781	493792	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
230	NC_008369	CATATT	2	12	495719	495730	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314397
231	NC_008369	TAGAAG	2	12	498778	498789	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
232	NC_008369	ATTATG	2	12	502429	502440	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115314406
233	NC_008369	GGCTCT	2	12	503719	503730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115314408
234	NC_008369	TTGAGG	2	12	510283	510294	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314416
235	NC_008369	GTTTTA	2	12	511193	511204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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237	NC_008369	ATAAAA	2	12	514043	514054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	115314419
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242	NC_008369	ATTTTG	2	12	532790	532801	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314435
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462	NC_008369	ACATTA	2	12	1047323	1047334	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
463	NC_008369	GTACTT	2	12	1047588	1047599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
464	NC_008369	TATTTT	2	12	1050789	1050800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_008369	TTTAGA	2	12	1052423	1052434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_008369	ATCAGT	2	12	1053158	1053169	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	115314868
468	NC_008369	TTTAAA	2	12	1055205	1055216	50 %	50 %	0 %	0 %	115314869
469	NC_008369	ATATCA	2	12	1063551	1063562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
470	NC_008369	GCAGGT	2	12	1064749	1064760	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	115314876
471	NC_008369	TTTTGA	2	12	1065219	1065230	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314876
472	NC_008369	AGTTGA	2	12	1066852	1066863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314877
473	NC_008369	CAAAAT	2	12	1070906	1070917	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115314882
474	NC_008369	TAAGAA	2	12	1072096	1072107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_008369	AGCTTT	2	12	1100644	1100655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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500	NC_008369	TTTATA	2	12	1116142	1116153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115314920

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