MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 chromosome

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008369	TATTTC	2	12	2819	2830	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008369	GTTTTA	2	12	21394	21405	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008369	AAGGTT	2	12	24368	24379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008369	ATAAGT	2	12	37586	37597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008369	TTAATT	2	12	50258	50269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008369	CTTGAG	2	12	64131	64142	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008369	CAGTTA	2	12	84843	84854	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008369	AAAAAG	2	12	97927	97938	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008369	AGCTTT	2	12	101719	101730	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008369	TTTATA	2	12	117217	117228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008369	AGAATA	2	12	125889	125900	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008369	TGAAAT	2	12	128195	128206	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008369	GTTTTA	2	12	130636	130647	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008369	TTTTAT	2	12	136753	136764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008369	TTATAA	2	12	142516	142527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008369	ATAAAT	2	12	149452	149463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008369	GATCTA	2	12	153006	153017	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008369	ACCTTA	2	12	159843	159854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008369	TAATTA	2	12	163534	163545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008369	ATTTAA	2	12	172754	172765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008369	GTTTTA	2	12	184364	184375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008369	ATTTTT	2	12	215819	215830	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008369	TTTTGT	2	12	216336	216347	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008369	GTTTTA	2	12	247929	247940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008369	ATGTAT	2	12	252161	252172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008369	GGTATG	2	12	253175	253186	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008369	AAATGC	2	12	262740	262751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008369	GCAACA	2	12	328297	328308	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008369	ATTAAT	2	12	329125	329136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008369	TTAGAT	2	12	339314	339325	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008369	ATATTT	2	12	341943	341954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008369	ATTGAT	2	12	357092	357103	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008369	GTCTTG	2	12	362132	362143	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008369	TTTAAA	2	12	379114	379125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008369	AGTAAC	2	12	411748	411759	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008369	GTTTTA	2	12	412150	412161	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008369	AGAATA	2	12	420828	420839	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008369	TGAAAT	2	12	423134	423145	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008369	TAAAAT	2	12	427855	427866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008369	ATTTTT	2	12	428434	428445	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008369	AAGTTA	2	12	449395	449406	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008369	AAAAGT	2	12	491220	491231	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008369	TAATGA	2	12	493379	493390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008369	AGTTGG	2	12	493781	493792	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008369	TAGAAG	2	12	498778	498789	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008369	GTTTTA	2	12	511193	511204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008369	TAAATT	2	12	529228	529239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008369	ATTAAG	2	12	549649	549660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008369	ACTTTA	2	12	562765	562776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008369	CCTATT	2	12	598974	598985	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008369	GTTTTA	2	12	599754	599765	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008369	TTTGTA	2	12	609697	609708	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008369	TGGATT	2	12	612266	612277	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008369	TTAATG	2	12	616369	616380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008369	TAAAAA	2	12	636708	636719	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008369	ATGTTA	2	12	645480	645491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008369	TAGAAT	2	12	749371	749382	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008369	ATTTTG	2	12	752158	752169	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008369	TTAAAA	2	12	753510	753521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008369	ACAGGT	2	12	766038	766049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_008369	TTGCAG	2	12	767817	767828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008369	TCCCAC	2	12	770201	770212	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008369	ATGAAA	2	12	770958	770969	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008369	TAGTTT	2	12	775024	775035	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008369	AACAAA	2	12	782990	783001	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008369	GATTAT	2	12	783013	783024	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008369	TAATTT	2	12	808896	808907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008369	TATAAT	2	12	826211	826222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008369	TTAGTT	2	12	827641	827652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008369	TAAATA	2	12	840529	840540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008369	TATAGT	2	12	870341	870352	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008369	AAAATA	2	12	871664	871675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008369	TAACAG	2	12	889377	889388	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_008369	ATATTT	2	12	893190	893201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008369	ATTTTT	2	12	901261	901272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008369	TTATAT	2	12	909914	909925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008369	CATTAG	2	12	910947	910958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008369	TTTACT	2	12	917549	917560	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008369	TTAGTT	2	12	932641	932652	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008369	TAACAA	2	12	933365	933376	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008369	TTTAAA	2	12	940727	940738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008369	ATTAGA	2	12	943412	943423	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008369	TAGATA	2	12	952680	952691	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008369	ATTTGA	2	12	952837	952848	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008369	AAAATA	2	12	953222	953233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008369	TATAAT	4	24	962088	962111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008369	TTTGCT	2	12	968589	968600	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008369	AAGAAA	2	12	993989	994000	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008369	TTGATT	2	12	995054	995065	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008369	ACAAAC	2	12	996418	996429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008369	CTATAA	2	12	996900	996911	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008369	AAAATT	2	12	999553	999564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008369	AGTATT	2	12	1014612	1014623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008369	CCAAAT	2	12	1015740	1015751	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008369	CAGGTT	2	12	1026143	1026154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008369	ATATAA	2	12	1037339	1037350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008369	TCCATC	2	12	1037907	1037918	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008369	TAAACT	2	12	1039105	1039116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008369	TTTGGC	2	12	1040955	1040966	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008369	TTGATA	2	12	1046357	1046368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008369	AGATAT	2	12	1046534	1046545	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008369	ATTAAT	2	12	1047145	1047156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008369	ACATTA	2	12	1047323	1047334	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008369	GTACTT	2	12	1047588	1047599	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_008369	TATTTT	2	12	1050789	1050800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008369	TTTAGA	2	12	1052423	1052434	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008369	TCAAAT	2	12	1052606	1052617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008369	ATATCA	2	12	1063551	1063562	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008369	TAAGAA	2	12	1072096	1072107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008369	GTTTTA	2	12	1099226	1099237	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008369	AGCTTT	2	12	1100644	1100655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008369	AGAATA	2	12	1124814	1124825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008369	TGAAAT	2	12	1127120	1127131	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008369	TTAGCT	2	12	1162374	1162385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008369	TATCTA	2	12	1162456	1162467	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_008369	AGATTA	2	12	1166388	1166399	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008369	CTAAAT	2	12	1168836	1168847	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_008369	ATAAAG	2	12	1170253	1170264	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008369	TAATTA	2	12	1187504	1187515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008369	AATTTA	2	12	1213818	1213829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008369	CTTATT	2	12	1214188	1214199	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008369	TATAGG	2	12	1214400	1214411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008369	ATATTA	2	12	1224724	1224735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008369	CGGTGC	2	12	1235312	1235323	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008369	TGGGCT	2	12	1236422	1236433	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008369	AATTCA	2	12	1238019	1238030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008369	CTTGAT	2	12	1239258	1239269	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_008369	AGAATC	2	12	1262720	1262731	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008369	TATAGA	2	12	1263233	1263244	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008369	TAATTT	2	12	1263496	1263507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_008369	TTTATT	2	12	1264145	1264156	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.