MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 chromosome

Total Repeats: 700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008369	CAAGAT	2	12	721	732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115313982
2	NC_008369	TAAGAG	2	12	6969	6980	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115313986
3	NC_008369	TGGTTT	2	12	7401	7412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115313986
4	NC_008369	TAAAGG	2	12	8744	8755	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115313988
5	NC_008369	GTTGAT	2	12	9834	9845	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115313990
6	NC_008369	ATTAAG	2	12	14498	14509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115313994
7	NC_008369	TCTAGT	2	12	26821	26832	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314000
8	NC_008369	CTAAAA	2	12	30384	30395	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115314001
9	NC_008369	TGGTGA	2	12	32370	32381	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314003
10	NC_008369	ACCAAT	2	12	32406	32417	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	115314003
11	NC_008369	TAAATT	2	12	41532	41543	50 %	50 %	0 %	0 %	115314012
12	NC_008369	TACCAG	2	12	45287	45298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115314014
13	NC_008369	TAAAAA	2	12	56121	56132	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	115314022
14	NC_008369	TTATGT	2	12	57883	57894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314025
15	NC_008369	AAGGAT	2	12	58425	58436	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115314025
16	NC_008369	GTTATT	2	12	62920	62931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314029
17	NC_008369	ATCTTT	2	12	80338	80349	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314042
18	NC_008369	TATGAA	2	12	81453	81464	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314043
19	NC_008369	TGCAAA	2	12	86135	86146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115314048
20	NC_008369	TCAAAA	2	12	87176	87187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115314049
21	NC_008369	CAGCTT	2	12	87789	87800	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115314049
22	NC_008369	CTTTCT	2	12	90295	90306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	115314050
23	NC_008369	ATATAG	2	12	91447	91458	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314050
24	NC_008369	AATATC	2	12	95409	95420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314054
25	NC_008369	GTGATT	2	12	95645	95656	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115314054
26	NC_008369	TCCAGC	2	12	97369	97380	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115314055
27	NC_008369	GTTTTA	2	12	100301	100312	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314058
28	NC_008369	TTTTGA	2	12	102744	102755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314059
29	NC_008369	TTTATC	2	12	103216	103227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314060
30	NC_008369	TAGTAT	2	12	105095	105106	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115314061
31	NC_008369	TCATTA	2	12	105638	105649	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314062
32	NC_008369	GATAAG	2	12	107486	107497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115314064
33	NC_008369	ATTAAA	2	12	107651	107662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115314064
34	NC_008369	CATTTG	2	12	109320	109331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314064
35	NC_008369	CTATTT	2	12	110142	110153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314064
36	NC_008369	CTTTCA	2	12	112314	112325	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	115314066
37	NC_008369	TCATTA	3	18	113556	113573	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314067
38	NC_008369	TTTATA	2	12	123418	123429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115314073
39	NC_008369	GATGGT	2	12	129777	129788	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314074
40	NC_008369	ATCAAT	2	12	134293	134304	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314076
41	NC_008369	AATACC	2	12	139118	139129	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	115314077
42	NC_008369	CTGATA	2	12	139384	139395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	115314077
43	NC_008369	TTGAGA	2	12	143998	144009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314081
44	NC_008369	TTAGGC	2	12	144855	144866	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115314081
45	NC_008369	TATTTT	2	12	148093	148104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	115314085
46	NC_008369	TAAGTA	2	12	149038	149049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314087
47	NC_008369	AAATAT	2	12	155872	155883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115314091
48	NC_008369	ACAGGT	2	12	158049	158060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115314094
49	NC_008369	ACTTTT	2	12	158392	158403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314095
50	NC_008369	GTTTTA	2	12	159017	159028	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314096
51	NC_008369	GCCATT	2	12	160508	160519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115314099
52	NC_008369	ACTGTT	2	12	161911	161922	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314100
53	NC_008369	ATCAAT	2	12	165171	165182	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314102
54	NC_008369	AAACTT	2	12	165576	165587	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314103
55	NC_008369	TATCAA	2	12	172279	172290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314107
56	NC_008369	AATTAT	2	12	172543	172554	50 %	50 %	0 %	0 %	115314107
57	NC_008369	GCTTTG	2	12	176809	176820	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	115314112
58	NC_008369	TAAAAA	2	12	178655	178666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	115314116
59	NC_008369	TAGCTT	2	12	179329	179340	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314117
60	NC_008369	CCAGCT	2	12	180161	180172	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	115314117
61	NC_008369	GACAAA	2	12	180692	180703	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115314118
62	NC_008369	CAAATT	2	12	189746	189757	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314127
63	NC_008369	TTTTAT	2	12	190431	190442	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	115314128
64	NC_008369	TTAAGT	2	12	191172	191183	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115314128
65	NC_008369	ATTATA	2	12	196443	196454	50 %	50 %	0 %	0 %	115314133
66	NC_008369	CACCAA	2	12	198217	198228	50 %	0 %	0 %	50 %	115314135
67	NC_008369	ACTAGT	2	12	205605	205616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	115314144
68	NC_008369	AAGATG	2	12	210139	210150	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115314148
69	NC_008369	TACTGC	2	12	210755	210766	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	115314148
70	NC_008369	TTTAGC	2	12	210953	210964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314148
71	NC_008369	ATTAGT	2	12	211556	211567	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115314148
72	NC_008369	ATAAGT	2	12	212641	212652	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314150
73	NC_008369	TAGCTT	2	12	215566	215577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314152
74	NC_008369	CATCAC	2	12	218825	218836	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	115314155
75	NC_008369	TTTTGA	2	12	218838	218849	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314155
76	NC_008369	TTATGG	2	12	221888	221899	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115314156
77	NC_008369	ATTTTT	2	12	224179	224190	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	115314158
78	NC_008369	TGAAGC	2	12	225141	225152	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115314159
79	NC_008369	AAAGAA	2	12	226246	226257	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	115314160
80	NC_008369	AAAAGA	2	12	227729	227740	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	115314162
81	NC_008369	TGGTGT	2	12	228758	228769	0 %	50 %	50 %	0 %	115314164
82	NC_008369	GTTTTT	2	12	229458	229469	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	115314164
83	NC_008369	TGAAGT	2	12	231249	231260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314168
84	NC_008369	GCAAGA	2	12	231725	231736	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	115314169
85	NC_008369	CTGTTG	2	12	232807	232818	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	115314169
86	NC_008369	AGGTTG	2	12	233416	233427	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314169
87	NC_008369	AAGGGT	2	12	234462	234473	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	115314171
88	NC_008369	GTAAAG	2	12	238130	238141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	115314178
89	NC_008369	TGGGTG	2	12	239680	239691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	115314183
90	NC_008369	TTGGTG	2	12	240809	240820	0 %	50 %	50 %	0 %	115314185
91	NC_008369	TGATAA	2	12	262043	262054	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314201
92	NC_008369	CATTAG	2	12	263177	263188	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	115314202
93	NC_008369	CTAAAG	2	12	264006	264017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115314203
94	NC_008369	ATAACA	2	12	264578	264589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115314204
95	NC_008369	TTTATG	2	12	266308	266319	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314205
96	NC_008369	TGGTGA	2	12	268465	268476	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314207
97	NC_008369	GCTTTA	2	12	270520	270531	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314209
98	NC_008369	AAAGCC	2	12	273321	273332	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	115314211
99	NC_008369	TTGCCT	2	12	276752	276763	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	115314216
100	NC_008369	TACTAT	2	12	278466	278477	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314217
101	NC_008369	ATTTTA	2	12	278684	278695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	115314218
102	NC_008369	TCTTGT	2	12	282191	282202	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	115314221
103	NC_008369	ATCTAA	2	12	286919	286930	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	115314225
104	NC_008369	GCTAAA	2	12	287475	287486	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	115314225
105	NC_008369	TGGTAA	2	12	295973	295984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314234
106	NC_008369	GATTTT	2	12	296796	296807	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314234
107	NC_008369	ATGGTA	2	12	297953	297964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314235
108	NC_008369	TGCTGG	2	12	297993	298004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	115314235
109	NC_008369	GTTGAG	2	12	300063	300074	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314236
110	NC_008369	AGTGGT	2	12	300684	300695	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314236
111	NC_008369	CATTAT	2	12	301327	301338	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314236
112	NC_008369	TGAGAC	2	12	302523	302534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115314237
113	NC_008369	ACATCC	2	12	302763	302774	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	115314237
114	NC_008369	GTTTTA	2	12	303542	303553	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314238
115	NC_008369	TTGGTT	2	12	312453	312464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115314245
116	NC_008369	TATCTT	2	12	313155	313166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314245
117	NC_008369	CTCTAA	2	12	314553	314564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115314247
118	NC_008369	AAGCAA	2	12	318708	318719	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	115314254
119	NC_008369	GTTTTA	2	12	322907	322918	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314259
120	NC_008369	TAGCTT	2	12	327726	327737	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314263
121	NC_008369	TAGTTT	2	12	330443	330454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	115314264
122	NC_008369	TAAAAT	2	12	332535	332546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	115314265
123	NC_008369	CTTGAT	2	12	335970	335981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314270
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125	NC_008369	TTAAGA	2	12	347411	347422	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	115314280
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217	NC_008369	AGCCAT	2	12	605664	605675	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115314486
218	NC_008369	TTGAGG	2	12	617217	617228	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	115314498
219	NC_008369	TTTGCA	2	12	618058	618069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314499
220	NC_008369	TTGCTA	2	12	619440	619451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314501
221	NC_008369	AGCTAT	2	12	620326	620337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	115314502
222	NC_008369	ATACTT	3	18	626576	626593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314507
223	NC_008369	GATTTG	2	12	629449	629460	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115314511
224	NC_008369	AAAACT	2	12	629772	629783	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115314511
225	NC_008369	TTTATC	2	12	630887	630898	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314513
226	NC_008369	TTAATA	2	12	633504	633515	50 %	50 %	0 %	0 %	115314516
227	NC_008369	ATCAGC	2	12	635128	635139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115314517
228	NC_008369	TAAAAA	2	12	641128	641139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	115314523
229	NC_008369	GCTACA	2	12	645297	645308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115314527
230	NC_008369	GTAATG	2	12	647323	647334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	115314529
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232	NC_008369	AGTATT	2	12	653014	653025	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	115314534
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346	NC_008369	GGTTTT	2	12	992755	992766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	115314816
347	NC_008369	CATTAT	2	12	1005705	1005716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115314830
348	NC_008369	GGCATA	2	12	1006213	1006224	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	115314830
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350	NC_008369	TGGTAT	2	12	1010801	1010812	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	115314834
351	NC_008369	TCTATT	2	12	1017796	1017807	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	115314839
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353	NC_008369	TCCTGG	2	12	1028354	1028365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	115314848
354	NC_008369	TTAGCT	2	12	1031887	1031898	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	115314852
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444	NC_008369	CTTGCT	2	12	1249648	1249659	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	115315042
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448	NC_008369	AGCACC	2	12	1268726	1268737	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	115315051
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450	NC_008369	AATCAA	2	12	1273202	1273213	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	115315057
451	NC_008369	GTTTTT	2	12	1273772	1273783	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	115315058
452	NC_008369	AAACCT	2	12	1288585	1288596	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	115315064
453	NC_008369	GTACCA	2	12	1294165	1294176	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115315069
454	NC_008369	GGATTC	2	12	1298291	1298302	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	115315074
455	NC_008369	TTATCA	2	12	1298635	1298646	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115315075
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457	NC_008369	CTATTA	2	12	1303706	1303717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	115315080
458	NC_008369	AGCATC	2	12	1313206	1313217	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	115315085
459	NC_008369	TTTTTC	2	12	1313525	1313536	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	115315085
460	NC_008369	AACTTC	2	12	1322715	1322726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	115315092
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