MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Francisella tularensis subsp. holarctica OSU18 chromosome

Total Repeats: 504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008369	ATTAT	2	10	6832	6841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008369	AGCTA	2	10	19221	19230	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_008369	TTAAT	2	10	20462	20471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008369	TGATT	2	10	20649	20658	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008369	CAAGG	2	10	21232	21241	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_008369	AAAGA	2	10	21429	21438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008369	CAAAG	2	10	25283	25292	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_008369	ATATT	2	10	25659	25668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008369	ATTTT	2	10	26064	26073	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008369	CTGTA	2	10	36444	36453	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008369	TTATC	2	10	36731	36740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_008369	AGAAA	2	10	42580	42589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008369	TCACT	2	10	49067	49076	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_008369	AGTTT	2	10	51762	51771	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008369	GATAA	2	10	52879	52888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008369	TAAAC	2	10	53733	53742	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_008369	TATTT	2	10	55660	55669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008369	ATTAT	2	10	55690	55699	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008369	AATTT	2	10	56694	56703	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008369	GATAA	2	10	61246	61255	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008369	TAGTA	2	10	61349	61358	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008369	ATTTT	2	10	64115	64124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008369	CTAAA	2	10	65765	65774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_008369	AAAGT	2	10	71406	71415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008369	GCCCT	2	10	75535	75544	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_008369	AGAAA	2	10	75746	75755	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008369	CATCT	2	10	76854	76863	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008369	TTCTT	2	10	76926	76935	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_008369	CCTTG	2	10	77124	77133	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008369	TTTGG	2	10	77403	77412	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008369	ACTTT	2	10	77444	77453	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008369	ATTTT	2	10	84637	84646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008369	AGTTA	2	10	84761	84770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008369	TAAAA	2	10	92504	92513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008369	TTCTA	2	10	116979	116988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008369	TATAA	2	10	117290	117299	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008369	GAATA	2	10	125960	125969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008369	CAAGG	2	10	130474	130483	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_008369	AAAGA	2	10	130671	130680	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008369	GATTT	2	10	133588	133597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008369	TTTTA	2	10	136606	136615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008369	TATAG	2	10	139592	139601	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008369	AAAAT	2	10	141117	141126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008369	ATAAA	2	10	141695	141704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008369	AATAA	2	10	141845	141854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008369	ATTTT	2	10	158344	158353	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008369	AAAGC	2	10	166224	166233	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_008369	TAAAC	2	10	166605	166614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_008369	AAATA	2	10	172795	172804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008369	TATAG	2	10	173410	173419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008369	CTAGC	2	10	176452	176461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_008369	CTTGA	2	10	177348	177357	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008369	CAAGG	2	10	184201	184210	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_008369	AAAGA	2	10	184399	184408	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008369	TTAAG	2	10	190318	190327	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008369	AGATT	2	10	190412	190421	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008369	AAAAC	2	10	196969	196978	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_008369	TTGTT	5	25	213622	213646	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008369	ATATT	2	10	213890	213899	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008369	AAAAT	2	10	215745	215754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008369	AGAAA	2	10	220448	220457	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008369	TAATA	2	10	234092	234101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008369	ATTTT	2	10	238766	238775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008369	ATTTC	2	10	247482	247491	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_008369	CAAGG	2	10	247767	247776	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008369	AAAGA	2	10	247964	247973	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008369	AGAAA	2	10	248547	248556	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008369	TCAAT	2	10	249181	249190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_008369	AGAAA	2	10	252368	252377	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008369	CTTTT	2	10	253373	253382	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_008369	CATCT	2	10	254046	254055	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_008369	TTCTT	2	10	254118	254127	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008369	CCTTG	2	10	254316	254325	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_008369	CATCT	2	10	255979	255988	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_008369	TTCTT	2	10	256051	256060	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_008369	CCTTG	2	10	256249	256258	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_008369	TAATT	2	10	258151	258160	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008369	TTTCT	2	10	258917	258926	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_008369	AGTTT	2	10	259129	259138	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008369	TACAA	2	10	259766	259775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008369	TTTGA	2	10	267624	267633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008369	ACATC	2	10	289775	289784	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_008369	TTTCT	2	10	290581	290590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008369	TGATC	2	10	309500	309509	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_008369	TAATT	2	10	310214	310223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008369	TATTT	2	10	310714	310723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008369	ATTTA	2	10	316304	316313	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008369	AATCT	2	10	320705	320714	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008369	ATATA	2	10	323893	323902	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008369	AAGCA	2	10	324824	324833	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_008369	AAATG	2	10	328155	328164	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008369	GATTT	2	10	328414	328423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008369	ATTTT	2	10	328643	328652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008369	GCGAT	2	10	329571	329580	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_008369	TATCT	2	10	341960	341969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008369	TTTCT	2	10	342845	342854	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_008369	AGATA	2	10	344052	344061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008369	AATCT	2	10	352613	352622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_008369	ATTTA	2	10	358512	358521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008369	AATAA	2	10	362609	362618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008369	TAGTT	2	10	364448	364457	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008369	TTAGA	2	10	364677	364686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008369	GATTT	2	10	366526	366535	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008369	AGAAA	2	10	372694	372703	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008369	TTTAG	2	10	375763	375772	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008369	AGTTA	2	10	379612	379621	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008369	TTTCT	2	10	387055	387064	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_008369	CATCT	2	10	387565	387574	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_008369	TTCTT	2	10	387637	387646	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008369	CCTTG	2	10	387835	387844	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008369	CTGTC	2	10	388315	388324	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008369	TTTAT	2	10	390862	390871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008369	AATAA	2	10	397072	397081	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008369	CAAGG	2	10	411988	411997	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008369	AAAGA	2	10	412185	412194	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008369	TTTCT	2	10	413366	413375	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_008369	TGTTA	2	10	418807	418816	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008369	TTTTA	2	10	418821	418830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008369	TAAAT	2	10	418867	418876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008369	GAATA	2	10	420899	420908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008369	TAATT	2	10	425498	425507	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008369	TGAAA	2	10	439236	439245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008369	TAATT	2	10	443999	444008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008369	AGAAA	2	10	446534	446543	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008369	TTTTA	2	10	453931	453940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008369	AGTTA	2	10	453950	453959	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008369	TTAAC	2	10	481268	481277	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008369	ATTTT	2	10	483533	483542	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008369	TTTAA	2	10	488353	488362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008369	CATCT	2	10	492743	492752	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_008369	TTCTT	2	10	492815	492824	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008369	CCTTG	2	10	492985	492994	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_008369	GTTTG	2	10	506007	506016	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008369	CAATT	2	10	506018	506027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_008369	AATGA	2	10	508731	508740	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008369	TAGAT	2	10	508743	508752	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008369	ACTAT	2	10	510652	510661	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008369	AAATT	2	10	510697	510706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008369	CAAGG	2	10	511031	511040	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_008369	AAAGA	2	10	511228	511237	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008369	GATAA	2	10	516287	516296	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008369	GATAA	2	10	517466	517475	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008369	TTCTT	2	10	523780	523789	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_008369	ATTTA	2	10	543476	543485	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008369	TAATG	2	10	549323	549332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008369	AACTT	2	10	550626	550635	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_008369	ATTTT	2	10	550757	550766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008369	AGAAA	2	10	551177	551186	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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