MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008358	ATGGCT	2	12	13567	13578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008358	GGGCCG	2	12	18183	18194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008358	TCGCGG	2	12	82969	82980	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008358	GGGCGC	2	12	82995	83006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008358	GCGGGG	2	12	120984	120995	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008358	GGATGT	2	12	122094	122105	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008358	GCCCGC	2	12	128136	128147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_008358	GTTTTT	2	12	191409	191420	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008358	AGAGGG	2	12	192205	192216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008358	TTCTGC	2	12	242430	242441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008358	GGAAGC	2	12	270941	270952	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_008358	AGCCAA	2	12	276932	276943	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008358	CGGCAC	2	12	304015	304026	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008358	GTGAAA	2	12	352241	352252	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008358	GCCCTT	2	12	381729	381740	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008358	GGCGGG	2	12	388270	388281	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_008358	CGCAGG	2	12	456598	456609	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008358	AGGGGC	2	12	459546	459557	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008358	GATCGC	2	12	466085	466096	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008358	CCGGAC	2	12	471385	471396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008358	TTCCGT	2	12	471419	471430	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008358	CAAGGC	2	12	527128	527139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008358	CATGAT	2	12	546173	546184	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008358	CGGTCC	2	12	558514	558525	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008358	TGACGT	2	12	671519	671530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008358	TTTCTT	2	12	672169	672180	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008358	GGGGTA	2	12	703519	703530	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008358	AGGCAG	2	12	715047	715058	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008358	CAAGCG	2	12	731958	731969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008358	CGCCCG	2	12	734472	734483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_008358	CTCGCC	2	12	740866	740877	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008358	GCGAAG	2	12	852969	852980	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008358	GCGCCC	2	12	862757	862768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008358	GCCCGC	2	12	866561	866572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_008358	GGGCAG	2	12	913090	913101	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008358	GCAGGG	2	12	950170	950181	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_008358	GGGCAG	2	12	954334	954345	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008358	GAAATC	2	12	1036191	1036202	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008358	ACCCTC	2	12	1110163	1110174	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008358	CACCCC	2	12	1189466	1189477	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
41	NC_008358	AGGGGC	2	12	1326401	1326412	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008358	AGAGGG	2	12	1331428	1331439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008358	GAGCTG	2	12	1334128	1334139	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008358	AAACAT	2	12	1347779	1347790	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008358	TATCTG	2	12	1362784	1362795	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008358	AGCCAG	2	12	1390444	1390455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008358	GGCGCG	2	12	1473520	1473531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008358	GAGGCT	2	12	1478058	1478069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008358	GAACGA	2	12	1509323	1509334	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_008358	CAATCC	2	12	1510952	1510963	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008358	CTGCGC	2	12	1632308	1632319	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008358	GAAAGT	2	12	1635894	1635905	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008358	CAAACA	2	12	1662931	1662942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008358	GAGGGC	2	12	1720391	1720402	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008358	TTCGCC	2	12	1763113	1763124	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008358	GCGCCG	2	12	1829322	1829333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008358	GGAAGG	2	12	1856812	1856823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008358	CGGCAC	2	12	1867035	1867046	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008358	ACGCCA	2	12	1868423	1868434	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008358	CCTCGG	2	12	2001173	2001184	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008358	GGCTCC	2	12	2001373	2001384	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008358	GCACAA	2	12	2113746	2113757	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008358	CGGATG	2	12	2152435	2152446	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008358	ACGTAA	2	12	2169574	2169585	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008358	CCCGCA	2	12	2306482	2306493	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008358	AGATCC	2	12	2311568	2311579	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008358	GGCCCG	2	12	2314388	2314399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008358	GCGCAA	2	12	2331692	2331703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008358	GCGCCC	2	12	2341599	2341610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008358	TTGCGC	2	12	2528532	2528543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008358	CGTTAT	2	12	2555084	2555095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008358	TCCATT	2	12	2612526	2612537	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008358	GCCGGA	2	12	2635333	2635344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008358	TTCCAG	2	12	2654422	2654433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008358	ATTTGC	2	12	2666084	2666095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008358	AGTTTC	2	12	2683630	2683641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008358	AAGCGC	2	12	2711971	2711982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008358	CATTGC	2	12	2719976	2719987	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008358	CCCGCT	2	12	2765400	2765411	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008358	GGCGCT	2	12	2788409	2788420	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008358	TGAAGA	2	12	2844791	2844802	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008358	AGGCGG	2	12	2871713	2871724	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008358	GCCGGG	2	12	2871788	2871799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008358	GATGGG	2	12	2879895	2879906	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008358	CAGCCT	2	12	2937785	2937796	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_008358	GTTCCT	2	12	2937926	2937937	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008358	TTGACG	2	12	2984770	2984781	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_008358	TCCTGC	2	12	3037046	3037057	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008358	TAAAGA	2	12	3044883	3044894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008358	TCAAAC	2	12	3088239	3088250	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008358	TCCCTC	2	12	3119690	3119701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_008358	TGGAGC	2	12	3212357	3212368	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008358	CGCGTT	2	12	3256337	3256348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008358	CGTTAT	2	12	3258809	3258820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008358	GTACAA	2	12	3309425	3309436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008358	TGCCCC	2	12	3312203	3312214	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_008358	TTTCAG	2	12	3314108	3314119	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008358	GAAAAG	2	12	3314976	3314987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008358	CTCGCC	2	12	3359913	3359924	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008358	TTTCAG	2	12	3572903	3572914	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008358	ATTTCG	2	12	3577401	3577412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008358	GCCCTG	2	12	3590630	3590641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008358	TTTGCG	2	12	3675842	3675853	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.