MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 3109

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008358	GGGAG	2	10	3661	3670	20 %	0 %	80 %	0 %	114798147
2	NC_008358	GACCT	2	10	3999	4008	20 %	20 %	20 %	40 %	114798742
3	NC_008358	TGGGG	2	10	4275	4284	0 %	20 %	80 %	0 %	114798742
4	NC_008358	TGCGC	2	10	4774	4783	0 %	20 %	40 %	40 %	114799709
5	NC_008358	GCGAC	2	10	4836	4845	20 %	0 %	40 %	40 %	114799709
6	NC_008358	CGGCA	2	10	5392	5401	20 %	0 %	40 %	40 %	114797762
7	NC_008358	AGGGC	2	10	6744	6753	20 %	0 %	60 %	20 %	114798383
8	NC_008358	ATCCC	2	10	6825	6834	20 %	20 %	0 %	60 %	114798383
9	NC_008358	TGCCG	2	10	8207	8216	0 %	20 %	40 %	40 %	114799986
10	NC_008358	ACGTG	2	10	8489	8498	20 %	20 %	40 %	20 %	114799986
11	NC_008358	CGGGG	2	10	8653	8662	0 %	0 %	80 %	20 %	114799986
12	NC_008358	GCGCC	2	10	9610	9619	0 %	0 %	40 %	60 %	114798262
13	NC_008358	TCCGG	2	10	10469	10478	0 %	20 %	40 %	40 %	114797544
14	NC_008358	ATGCC	2	10	11187	11196	20 %	20 %	20 %	40 %	114798033
15	NC_008358	GGCAG	2	10	12757	12766	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_008358	GCGGT	2	10	13438	13447	0 %	20 %	60 %	20 %	114799979
17	NC_008358	TTTCC	2	10	13702	13711	0 %	60 %	0 %	40 %	114800170
18	NC_008358	CTTCC	2	10	18234	18243	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_008358	GAAGA	2	10	18672	18681	60 %	0 %	40 %	0 %	114798480
20	NC_008358	GCAGC	2	10	19742	19751	20 %	0 %	40 %	40 %	114797893
21	NC_008358	GCGTC	2	10	20764	20773	0 %	20 %	40 %	40 %	114800480
22	NC_008358	GGCCA	2	10	21130	21139	20 %	0 %	40 %	40 %	114798109
23	NC_008358	GTGGG	2	10	21149	21158	0 %	20 %	80 %	0 %	114798109
24	NC_008358	GGCCC	2	10	21442	21451	0 %	0 %	40 %	60 %	114798109
25	NC_008358	GTCAG	2	10	22114	22123	20 %	20 %	40 %	20 %	114797148
26	NC_008358	AGCCG	2	10	23205	23214	20 %	0 %	40 %	40 %	114800103
27	NC_008358	GACGA	2	10	24570	24579	40 %	0 %	40 %	20 %	114799975
28	NC_008358	GGCGC	2	10	28070	28079	0 %	0 %	60 %	40 %	114799508
29	NC_008358	TAAAA	2	10	31260	31269	80 %	20 %	0 %	0 %	114798513
30	NC_008358	CGGGC	2	10	34201	34210	0 %	0 %	60 %	40 %	114798164
31	NC_008358	CATTC	2	10	35005	35014	20 %	40 %	0 %	40 %	114797767
32	NC_008358	CATCC	2	10	35155	35164	20 %	20 %	0 %	60 %	114797767
33	NC_008358	GGCAG	2	10	40466	40475	20 %	0 %	60 %	20 %	114800168
34	NC_008358	AGGCC	2	10	41398	41407	20 %	0 %	40 %	40 %	114800485
35	NC_008358	CGGCG	2	10	43684	43693	0 %	0 %	60 %	40 %	114798233
36	NC_008358	GGGCA	2	10	46997	47006	20 %	0 %	60 %	20 %	114800090
37	NC_008358	CCCGC	2	10	50459	50468	0 %	0 %	20 %	80 %	114797625
38	NC_008358	AATGG	2	10	51747	51756	40 %	20 %	40 %	0 %	114798190
39	NC_008358	AGGCG	2	10	52706	52715	20 %	0 %	60 %	20 %	114797533
40	NC_008358	CTCGC	2	10	53783	53792	0 %	20 %	20 %	60 %	114797557
41	NC_008358	CGTCC	2	10	53950	53959	0 %	20 %	20 %	60 %	114797557
42	NC_008358	GGGCG	2	10	54922	54931	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008358	GACGT	2	10	57465	57474	20 %	20 %	40 %	20 %	114798251
44	NC_008358	TGCGG	2	10	59567	59576	0 %	20 %	60 %	20 %	114799970
45	NC_008358	GGGCA	2	10	60265	60274	20 %	0 %	60 %	20 %	114799436
46	NC_008358	CCGCG	2	10	61933	61942	0 %	0 %	40 %	60 %	114798620
47	NC_008358	GCATG	2	10	62842	62851	20 %	20 %	40 %	20 %	114797338
48	NC_008358	ACTTC	2	10	63099	63108	20 %	40 %	0 %	40 %	114798208
49	NC_008358	GGGGC	2	10	65784	65793	0 %	0 %	80 %	20 %	114800012
50	NC_008358	GGCAT	2	10	66898	66907	20 %	20 %	40 %	20 %	114797725
51	NC_008358	CGCGG	2	10	66954	66963	0 %	0 %	60 %	40 %	114797725
52	NC_008358	AACAA	2	10	69807	69816	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_008358	CGGAT	2	10	71436	71445	20 %	20 %	40 %	20 %	114800318
54	NC_008358	CGGCG	2	10	73009	73018	0 %	0 %	60 %	40 %	114800318
55	NC_008358	GAGCT	2	10	73570	73579	20 %	20 %	40 %	20 %	114797879
56	NC_008358	ATCGG	2	10	76318	76327	20 %	20 %	40 %	20 %	114800319
57	NC_008358	GCGCG	2	10	77295	77304	0 %	0 %	60 %	40 %	114800319
58	NC_008358	CCCGC	2	10	77869	77878	0 %	0 %	20 %	80 %	114798288
59	NC_008358	GCTCG	2	10	78917	78926	0 %	20 %	40 %	40 %	114798288
60	NC_008358	ACTGA	2	10	80349	80358	40 %	20 %	20 %	20 %	114798288
61	NC_008358	TGGCG	2	10	80534	80543	0 %	20 %	60 %	20 %	114798288
62	NC_008358	GGCGA	2	10	81768	81777	20 %	0 %	60 %	20 %	114798288
63	NC_008358	GCCCG	2	10	87002	87011	0 %	0 %	40 %	60 %	114799139
64	NC_008358	ATCAC	2	10	87277	87286	40 %	20 %	0 %	40 %	114799139
65	NC_008358	CGAGG	2	10	88854	88863	20 %	0 %	60 %	20 %	114797267
66	NC_008358	GATCA	2	10	88925	88934	40 %	20 %	20 %	20 %	114797977
67	NC_008358	GCCCG	2	10	91166	91175	0 %	0 %	40 %	60 %	114798776
68	NC_008358	CGCGC	2	10	92576	92585	0 %	0 %	40 %	60 %	114799640
69	NC_008358	CTTTG	2	10	95451	95460	0 %	60 %	20 %	20 %	114800455
70	NC_008358	TTTCA	2	10	95491	95500	20 %	60 %	0 %	20 %	114800455
71	NC_008358	TGTCA	2	10	97037	97046	20 %	40 %	20 %	20 %	114799525
72	NC_008358	TTTCG	2	10	98624	98633	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_008358	ATGAG	2	10	99206	99215	40 %	20 %	40 %	0 %	114800120
74	NC_008358	GCGCG	2	10	100157	100166	0 %	0 %	60 %	40 %	114799070
75	NC_008358	GGCAT	2	10	101665	101674	20 %	20 %	40 %	20 %	114798650
76	NC_008358	ATGGA	2	10	102063	102072	40 %	20 %	40 %	0 %	114797688
77	NC_008358	TCCCT	2	10	105635	105644	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
78	NC_008358	ATTTT	2	10	107436	107445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008358	TGGCC	2	10	111867	111876	0 %	20 %	40 %	40 %	114800450
80	NC_008358	TCTGG	2	10	114607	114616	0 %	40 %	40 %	20 %	114797244
81	NC_008358	TCCTC	2	10	114858	114867	0 %	40 %	0 %	60 %	114797244
82	NC_008358	GGGCA	2	10	116195	116204	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_008358	GGCGC	2	10	116326	116335	0 %	0 %	60 %	40 %	114798229
84	NC_008358	CGATG	2	10	116695	116704	20 %	20 %	40 %	20 %	114798229
85	NC_008358	CCGTC	2	10	118182	118191	0 %	20 %	20 %	60 %	114800131
86	NC_008358	CGCGC	2	10	119892	119901	0 %	0 %	40 %	60 %	114797789
87	NC_008358	GGCCG	2	10	119959	119968	0 %	0 %	60 %	40 %	114797789
88	NC_008358	GGGGC	2	10	120062	120071	0 %	0 %	80 %	20 %	114797789
89	NC_008358	GGTCA	2	10	120777	120786	20 %	20 %	40 %	20 %	114797789
90	NC_008358	GCCGG	2	10	121299	121308	0 %	0 %	60 %	40 %	114798778
91	NC_008358	CGGCG	2	10	121460	121469	0 %	0 %	60 %	40 %	114798778
92	NC_008358	GCGGG	2	10	121832	121841	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
93	NC_008358	GGCGG	2	10	122639	122648	0 %	0 %	80 %	20 %	114799309
94	NC_008358	TCGAG	2	10	124359	124368	20 %	20 %	40 %	20 %	114800355
95	NC_008358	CAGGG	2	10	129313	129322	20 %	0 %	60 %	20 %	114799962
96	NC_008358	TGGGA	2	10	131546	131555	20 %	20 %	60 %	0 %	114797615
97	NC_008358	TTTTC	2	10	131820	131829	0 %	80 %	0 %	20 %	114797615
98	NC_008358	GGGCG	2	10	134164	134173	0 %	0 %	80 %	20 %	114799599
99	NC_008358	CCGGC	2	10	138255	138264	0 %	0 %	40 %	60 %	114800143
100	NC_008358	GCGCC	2	10	139082	139091	0 %	0 %	40 %	60 %	114799417
101	NC_008358	AGGGG	2	10	139287	139296	20 %	0 %	80 %	0 %	114799417
102	NC_008358	CGGGA	2	10	144992	145001	20 %	0 %	60 %	20 %	114798254
103	NC_008358	GACGA	2	10	146466	146475	40 %	0 %	40 %	20 %	114797399
104	NC_008358	GATCC	2	10	148940	148949	20 %	20 %	20 %	40 %	114799790
105	NC_008358	ATGGG	2	10	152019	152028	20 %	20 %	60 %	0 %	114798938
106	NC_008358	TCATG	2	10	152918	152927	20 %	40 %	20 %	20 %	114798639
107	NC_008358	CGGTG	2	10	155773	155782	0 %	20 %	60 %	20 %	114800209
108	NC_008358	GGCGC	2	10	155970	155979	0 %	0 %	60 %	40 %	114800209
109	NC_008358	CGGTC	2	10	156020	156029	0 %	20 %	40 %	40 %	114800209
110	NC_008358	AGCGC	2	10	159804	159813	20 %	0 %	40 %	40 %	114797610
111	NC_008358	CGGGT	2	10	160717	160726	0 %	20 %	60 %	20 %	114797610
112	NC_008358	GGGTT	2	10	161627	161636	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008358	AGGGC	2	10	161860	161869	20 %	0 %	60 %	20 %	114800389
114	NC_008358	AAGGA	2	10	165527	165536	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008358	GCTGC	2	10	166109	166118	0 %	20 %	40 %	40 %	114798930
116	NC_008358	GGTTG	2	10	166126	166135	0 %	40 %	60 %	0 %	114798930
117	NC_008358	CTGCA	2	10	167611	167620	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_008358	TCGGT	2	10	167832	167841	0 %	40 %	40 %	20 %	114800245
119	NC_008358	GAACA	2	10	168353	168362	60 %	0 %	20 %	20 %	114800245
120	NC_008358	GGCAG	2	10	169519	169528	20 %	0 %	60 %	20 %	114798354
121	NC_008358	TTGGC	2	10	170301	170310	0 %	40 %	40 %	20 %	114798689
122	NC_008358	AAATC	2	10	172864	172873	60 %	20 %	0 %	20 %	114798529
123	NC_008358	TGAAT	2	10	176102	176111	40 %	40 %	20 %	0 %	114798003
124	NC_008358	TGGCG	2	10	176375	176384	0 %	20 %	60 %	20 %	114798003
125	NC_008358	CGCGC	2	10	178174	178183	0 %	0 %	40 %	60 %	114797862
126	NC_008358	CGATC	2	10	179337	179346	20 %	20 %	20 %	40 %	114797862
127	NC_008358	TCAAG	2	10	180386	180395	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_008358	TCAAG	2	10	180402	180411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008358	CGCGC	2	10	180583	180592	0 %	0 %	40 %	60 %	114799497
130	NC_008358	GGGGC	2	10	182390	182399	0 %	0 %	80 %	20 %	114800272
131	NC_008358	GCATG	2	10	183614	183623	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_008358	AACCG	2	10	184414	184423	40 %	0 %	20 %	40 %	114799624
133	NC_008358	GCAGG	2	10	184598	184607	20 %	0 %	60 %	20 %	114799624
134	NC_008358	GATCA	2	10	184739	184748	40 %	20 %	20 %	20 %	114799624
135	NC_008358	TGACC	2	10	188181	188190	20 %	20 %	20 %	40 %	114799884
136	NC_008358	GGGCG	2	10	190072	190081	0 %	0 %	80 %	20 %	114800351
137	NC_008358	TGGCG	2	10	191032	191041	0 %	20 %	60 %	20 %	114800351
138	NC_008358	GGCTG	2	10	192091	192100	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_008358	ATTTT	2	10	192103	192112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008358	CGGCG	2	10	192272	192281	0 %	0 %	60 %	40 %	114799341
141	NC_008358	CGCGG	2	10	193364	193373	0 %	0 %	60 %	40 %	114798081
142	NC_008358	CGAGC	2	10	193937	193946	20 %	0 %	40 %	40 %	114798081
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145	NC_008358	ACGGC	2	10	198320	198329	20 %	0 %	40 %	40 %	114797281
146	NC_008358	CAGGG	2	10	198870	198879	20 %	0 %	60 %	20 %	114797281
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149	NC_008358	TCGGC	2	10	200714	200723	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
150	NC_008358	CGGGG	2	10	202438	202447	0 %	0 %	80 %	20 %	114799296
151	NC_008358	GCCGG	2	10	202489	202498	0 %	0 %	60 %	40 %	114799296
152	NC_008358	GCGCC	2	10	203251	203260	0 %	0 %	40 %	60 %	114800314
153	NC_008358	GCTGA	2	10	204689	204698	20 %	20 %	40 %	20 %	114800314
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157	NC_008358	TCGCT	2	10	208587	208596	0 %	40 %	20 %	40 %	114797785
158	NC_008358	CCGGC	2	10	209187	209196	0 %	0 %	40 %	60 %	114800332
159	NC_008358	GCGCG	2	10	210408	210417	0 %	0 %	60 %	40 %	114799872
160	NC_008358	GCTGG	2	10	211707	211716	0 %	20 %	60 %	20 %	114799872
161	NC_008358	CGGGA	2	10	216309	216318	20 %	0 %	60 %	20 %	114798541
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163	NC_008358	GGCGA	2	10	219221	219230	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_008358	TGCCG	2	10	219721	219730	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
165	NC_008358	ATCAC	2	10	220954	220963	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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168	NC_008358	CGCTG	2	10	222270	222279	0 %	20 %	40 %	40 %	114797940
169	NC_008358	TCGCT	2	10	224115	224124	0 %	40 %	20 %	40 %	114797106
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188	NC_008358	CAGGG	2	10	250169	250178	20 %	0 %	60 %	20 %	114799132
189	NC_008358	TGGGC	2	10	250825	250834	0 %	20 %	60 %	20 %	114799132
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201	NC_008358	GCGAT	2	10	266336	266345	20 %	20 %	40 %	20 %	114797349
202	NC_008358	GGGAA	2	10	267143	267152	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
203	NC_008358	GGCTG	2	10	267573	267582	0 %	20 %	60 %	20 %	114799169
204	NC_008358	ACACT	2	10	270648	270657	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
205	NC_008358	GCTTG	2	10	273231	273240	0 %	40 %	40 %	20 %	114798348
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241	NC_008358	CATCG	2	10	326469	326478	20 %	20 %	20 %	40 %	114798141
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243	NC_008358	GAAGG	2	10	328913	328922	40 %	0 %	60 %	0 %	114800146
244	NC_008358	GGGAA	2	10	331281	331290	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
245	NC_008358	CCCGG	2	10	331681	331690	0 %	0 %	40 %	60 %	114797790
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252	NC_008358	TCCGC	2	10	335278	335287	0 %	20 %	20 %	60 %	114800527
253	NC_008358	GCCGC	2	10	335613	335622	0 %	0 %	40 %	60 %	114800527
254	NC_008358	GGCGC	2	10	335797	335806	0 %	0 %	60 %	40 %	114800527
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263	NC_008358	CTCGC	2	10	341895	341904	0 %	20 %	20 %	60 %	114797849
264	NC_008358	CGTGC	2	10	342745	342754	0 %	20 %	40 %	40 %	114798887
265	NC_008358	GGCCT	2	10	345317	345326	0 %	20 %	40 %	40 %	114797363
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396	NC_008358	CGGCG	2	10	496321	496330	0 %	0 %	60 %	40 %	114798720
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