MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 9994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008358	CGCT	2	8	661	668	0 %	25 %	25 %	50 %	114797376
2	NC_008358	CCTG	2	8	815	822	0 %	25 %	25 %	50 %	114797376
3	NC_008358	GCTG	2	8	1258	1265	0 %	25 %	50 %	25 %	114798603
4	NC_008358	ATGG	2	8	1754	1761	25 %	25 %	50 %	0 %	114799600
5	NC_008358	CCAG	2	8	1844	1851	25 %	0 %	25 %	50 %	114799600
6	NC_008358	GATG	2	8	1969	1976	25 %	25 %	50 %	0 %	114799600
7	NC_008358	GAAG	2	8	2349	2356	50 %	0 %	50 %	0 %	114799600
8	NC_008358	GGAA	2	8	2741	2748	50 %	0 %	50 %	0 %	114797191
9	NC_008358	CCGG	2	8	2927	2934	0 %	0 %	50 %	50 %	114797191
10	NC_008358	AGCG	2	8	2992	2999	25 %	0 %	50 %	25 %	114797191
11	NC_008358	GCTT	2	8	3709	3716	0 %	50 %	25 %	25 %	114798147
12	NC_008358	GTTC	2	8	4492	4499	0 %	50 %	25 %	25 %	114799709
13	NC_008358	GCCG	2	8	4648	4655	0 %	0 %	50 %	50 %	114799709
14	NC_008358	CCGC	2	8	5236	5243	0 %	0 %	25 %	75 %	114797762
15	NC_008358	GCCT	2	8	5413	5420	0 %	25 %	25 %	50 %	114797762
16	NC_008358	GGAA	2	8	5506	5513	50 %	0 %	50 %	0 %	114797762
17	NC_008358	TGGA	2	8	5903	5910	25 %	25 %	50 %	0 %	114797762
18	NC_008358	ATTT	2	8	6188	6195	25 %	75 %	0 %	0 %	114797762
19	NC_008358	GCCC	2	8	6513	6520	0 %	0 %	25 %	75 %	114798383
20	NC_008358	CTTC	2	8	8113	8120	0 %	50 %	0 %	50 %	114799986
21	NC_008358	TGGC	2	8	8433	8440	0 %	25 %	50 %	25 %	114799986
22	NC_008358	CCGC	2	8	8448	8455	0 %	0 %	25 %	75 %	114799986
23	NC_008358	CTTA	2	8	9248	9255	25 %	50 %	0 %	25 %	114798262
24	NC_008358	CCGT	2	8	9324	9331	0 %	25 %	25 %	50 %	114798262
25	NC_008358	CCTT	2	8	9718	9725	0 %	50 %	0 %	50 %	114800535
26	NC_008358	GCCA	2	8	10151	10158	25 %	0 %	25 %	50 %	114800535
27	NC_008358	GGGC	2	8	10242	10249	0 %	0 %	75 %	25 %	114800535
28	NC_008358	TCGG	2	8	10258	10265	0 %	25 %	50 %	25 %	114800535
29	NC_008358	CTCA	2	8	10761	10768	25 %	25 %	0 %	50 %	114797544
30	NC_008358	GCGG	2	8	11425	11432	0 %	0 %	75 %	25 %	114798033
31	NC_008358	ATCG	2	8	11450	11457	25 %	25 %	25 %	25 %	114798033
32	NC_008358	CGAA	2	8	11760	11767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008358	GCCA	2	8	11958	11965	25 %	0 %	25 %	50 %	114799488
34	NC_008358	CATC	2	8	12296	12303	25 %	25 %	0 %	50 %	114799488
35	NC_008358	CGCC	2	8	12482	12489	0 %	0 %	25 %	75 %	114799488
36	NC_008358	GCGG	2	8	12940	12947	0 %	0 %	75 %	25 %	114799979
37	NC_008358	CTGT	2	8	13219	13226	0 %	50 %	25 %	25 %	114799979
38	NC_008358	GAAG	2	8	13884	13891	50 %	0 %	50 %	0 %	114800170
39	NC_008358	AAGC	2	8	14083	14090	50 %	0 %	25 %	25 %	114799370
40	NC_008358	ACCC	2	8	14106	14113	25 %	0 %	0 %	75 %	114799370
41	NC_008358	CAGC	2	8	14433	14440	25 %	0 %	25 %	50 %	114800166
42	NC_008358	CCTT	2	8	14461	14468	0 %	50 %	0 %	50 %	114800166
43	NC_008358	TACA	2	8	14475	14482	50 %	25 %	0 %	25 %	114800166
44	NC_008358	GCCC	2	8	14571	14578	0 %	0 %	25 %	75 %	114800166
45	NC_008358	GGAT	2	8	14623	14630	25 %	25 %	50 %	0 %	114800166
46	NC_008358	TGAT	2	8	15923	15930	25 %	50 %	25 %	0 %	114799580
47	NC_008358	GCCC	2	8	16170	16177	0 %	0 %	25 %	75 %	114799580
48	NC_008358	GATG	2	8	16344	16351	25 %	25 %	50 %	0 %	114799580
49	NC_008358	ACCA	2	8	17028	17035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008358	CGGG	2	8	17176	17183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008358	GAAG	2	8	17197	17204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008358	TCGC	2	8	17386	17393	0 %	25 %	25 %	50 %	114800461
53	NC_008358	AGGC	2	8	17490	17497	25 %	0 %	50 %	25 %	114800461
54	NC_008358	GGCG	2	8	18048	18055	0 %	0 %	75 %	25 %	114800461
55	NC_008358	GAAG	2	8	18482	18489	50 %	0 %	50 %	0 %	114798480
56	NC_008358	CCGC	2	8	19142	19149	0 %	0 %	25 %	75 %	114797893
57	NC_008358	TCAG	2	8	19226	19233	25 %	25 %	25 %	25 %	114797893
58	NC_008358	TGAA	2	8	19803	19810	50 %	25 %	25 %	0 %	114797893
59	NC_008358	GGCG	2	8	20001	20008	0 %	0 %	75 %	25 %	114800480
60	NC_008358	CAGG	2	8	21497	21504	25 %	0 %	50 %	25 %	114797148
61	NC_008358	CGTT	2	8	21937	21944	0 %	50 %	25 %	25 %	114797148
62	NC_008358	GCCA	2	8	21997	22004	25 %	0 %	25 %	50 %	114797148
63	NC_008358	GCAG	3	12	22228	22239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008358	AGGC	2	8	22862	22869	25 %	0 %	50 %	25 %	114800103
65	NC_008358	TCGC	2	8	23455	23462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008358	CAGA	2	8	23493	23500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008358	GCCT	2	8	24114	24121	0 %	25 %	25 %	50 %	114797256
68	NC_008358	GCCT	2	8	24632	24639	0 %	25 %	25 %	50 %	114799975
69	NC_008358	CTGC	2	8	24710	24717	0 %	25 %	25 %	50 %	114799975
70	NC_008358	CGGG	2	8	24727	24734	0 %	0 %	75 %	25 %	114799975
71	NC_008358	GCTC	2	8	24910	24917	0 %	25 %	25 %	50 %	114799975
72	NC_008358	GCTC	2	8	25540	25547	0 %	25 %	25 %	50 %	114799975
73	NC_008358	GGCC	2	8	25865	25872	0 %	0 %	50 %	50 %	114799975
74	NC_008358	TCGC	2	8	25930	25937	0 %	25 %	25 %	50 %	114799975
75	NC_008358	GGCG	2	8	26087	26094	0 %	0 %	75 %	25 %	114799975
76	NC_008358	ATGG	2	8	26310	26317	25 %	25 %	50 %	0 %	114799975
77	NC_008358	CTTT	2	8	26477	26484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008358	CTCG	2	8	26857	26864	0 %	25 %	25 %	50 %	114799210
79	NC_008358	CTCG	2	8	27700	27707	0 %	25 %	25 %	50 %	114799508
80	NC_008358	CGCC	2	8	27814	27821	0 %	0 %	25 %	75 %	114799508
81	NC_008358	GCCG	2	8	28172	28179	0 %	0 %	50 %	50 %	114799508
82	NC_008358	CGGC	2	8	28509	28516	0 %	0 %	50 %	50 %	114799508
83	NC_008358	GCCG	2	8	30330	30337	0 %	0 %	50 %	50 %	114798513
84	NC_008358	AGGC	2	8	30831	30838	25 %	0 %	50 %	25 %	114798513
85	NC_008358	CGGA	2	8	30917	30924	25 %	0 %	50 %	25 %	114798513
86	NC_008358	CAAT	2	8	31502	31509	50 %	25 %	0 %	25 %	114798513
87	NC_008358	GCCC	2	8	32060	32067	0 %	0 %	25 %	75 %	114797587
88	NC_008358	CCTT	2	8	32372	32379	0 %	50 %	0 %	50 %	114797587
89	NC_008358	CCCG	2	8	32622	32629	0 %	0 %	25 %	75 %	114797587
90	NC_008358	GATG	2	8	32953	32960	25 %	25 %	50 %	0 %	114798866
91	NC_008358	GAAG	2	8	33043	33050	50 %	0 %	50 %	0 %	114798866
92	NC_008358	CTGC	2	8	33070	33077	0 %	25 %	25 %	50 %	114798866
93	NC_008358	CGGA	2	8	34290	34297	25 %	0 %	50 %	25 %	114798164
94	NC_008358	GGCG	2	8	34445	34452	0 %	0 %	75 %	25 %	114798164
95	NC_008358	GGCC	2	8	34508	34515	0 %	0 %	50 %	50 %	114798164
96	NC_008358	TGGC	2	8	34582	34589	0 %	25 %	50 %	25 %	114798164
97	NC_008358	GGCC	2	8	34727	34734	0 %	0 %	50 %	50 %	114798164
98	NC_008358	CGGG	2	8	34771	34778	0 %	0 %	75 %	25 %	114798164
99	NC_008358	GCGG	2	8	35125	35132	0 %	0 %	75 %	25 %	114797767
100	NC_008358	GGAT	2	8	35673	35680	25 %	25 %	50 %	0 %	114797767
101	NC_008358	TTGT	2	8	35747	35754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008358	CGGG	2	8	35806	35813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008358	TGGG	2	8	36218	36225	0 %	25 %	75 %	0 %	114799732
104	NC_008358	CAGC	2	8	37153	37160	25 %	0 %	25 %	50 %	114799732
105	NC_008358	GCCG	2	8	37604	37611	0 %	0 %	50 %	50 %	114799732
106	NC_008358	GGTG	2	8	37688	37695	0 %	25 %	75 %	0 %	114799732
107	NC_008358	ACGG	2	8	37696	37703	25 %	0 %	50 %	25 %	114799732
108	NC_008358	GGCC	2	8	37901	37908	0 %	0 %	50 %	50 %	114797793
109	NC_008358	GGCG	2	8	38165	38172	0 %	0 %	75 %	25 %	114797793
110	NC_008358	AAGG	2	8	38578	38585	50 %	0 %	50 %	0 %	114797917
111	NC_008358	TCGA	2	8	38728	38735	25 %	25 %	25 %	25 %	114797917
112	NC_008358	CCCT	2	8	39059	39066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_008358	TCAT	2	8	39245	39252	25 %	50 %	0 %	25 %	114800168
114	NC_008358	GGCG	2	8	39375	39382	0 %	0 %	75 %	25 %	114800168
115	NC_008358	GAAA	2	8	42036	42043	75 %	0 %	25 %	0 %	114799333
116	NC_008358	CCAG	2	8	42110	42117	25 %	0 %	25 %	50 %	114799333
117	NC_008358	ATGG	2	8	43262	43269	25 %	25 %	50 %	0 %	114798524
118	NC_008358	GGCG	2	8	43434	43441	0 %	0 %	75 %	25 %	114798233
119	NC_008358	AATG	2	8	44146	44153	50 %	25 %	25 %	0 %	114798233
120	NC_008358	CCGG	2	8	44702	44709	0 %	0 %	50 %	50 %	114799969
121	NC_008358	CAAT	2	8	44871	44878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008358	GCTT	2	8	45041	45048	0 %	50 %	25 %	25 %	114798050
123	NC_008358	GACG	2	8	45485	45492	25 %	0 %	50 %	25 %	114798012
124	NC_008358	GACG	2	8	45857	45864	25 %	0 %	50 %	25 %	114797061
125	NC_008358	ACCC	2	8	46619	46626	25 %	0 %	0 %	75 %	114800090
126	NC_008358	TCAT	2	8	47298	47305	25 %	50 %	0 %	25 %	114799080
127	NC_008358	GCCA	2	8	47567	47574	25 %	0 %	25 %	50 %	114799080
128	NC_008358	GGCT	2	8	47760	47767	0 %	25 %	50 %	25 %	114799080
129	NC_008358	CAAC	2	8	48475	48482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008358	GCTG	2	8	48655	48662	0 %	25 %	50 %	25 %	114800136
131	NC_008358	GGAA	2	8	48871	48878	50 %	0 %	50 %	0 %	114800136
132	NC_008358	TGGC	2	8	49018	49025	0 %	25 %	50 %	25 %	114799115
133	NC_008358	ACCC	2	8	49094	49101	25 %	0 %	0 %	75 %	114799115
134	NC_008358	CCTG	2	8	49822	49829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008358	GGCG	2	8	50170	50177	0 %	0 %	75 %	25 %	114797625
136	NC_008358	CCAT	2	8	50334	50341	25 %	25 %	0 %	50 %	114797625
137	NC_008358	GTCT	2	8	50383	50390	0 %	50 %	25 %	25 %	114797625
138	NC_008358	CGCC	2	8	51140	51147	0 %	0 %	25 %	75 %	114798905
139	NC_008358	AGCC	2	8	51566	51573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008358	GCCC	2	8	51622	51629	0 %	0 %	25 %	75 %	114798190
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142	NC_008358	TGGG	2	8	51709	51716	0 %	25 %	75 %	0 %	114798190
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