MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 1051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008358	CGAA	2	8	11760	11767	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008358	ACCA	2	8	17028	17035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008358	CGGG	2	8	17176	17183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008358	GAAG	2	8	17197	17204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008358	GCAG	3	12	22228	22239	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008358	TCGC	2	8	23455	23462	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008358	CAGA	2	8	23493	23500	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008358	CTTT	2	8	26477	26484	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008358	TTGT	2	8	35747	35754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008358	CGGG	2	8	35806	35813	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008358	CCCT	2	8	39059	39066	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_008358	CAAT	2	8	44871	44878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008358	CAAC	2	8	48475	48482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008358	CCTG	2	8	49822	49829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008358	AGCC	2	8	51566	51573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008358	GCAA	2	8	65414	65421	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008358	CTGC	2	8	65438	65445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_008358	CGTT	2	8	69692	69699	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008358	ATTG	2	8	82953	82960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008358	GGCA	2	8	83035	83042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008358	CGCA	2	8	83146	83153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008358	GCGG	2	8	86396	86403	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008358	CGGT	2	8	98228	98235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008358	GACA	2	8	98650	98657	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008358	GGCG	2	8	104848	104855	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008358	GGCC	2	8	105672	105679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008358	CGCC	2	8	106976	106983	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_008358	GGTG	2	8	107455	107462	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008358	GATC	2	8	108229	108236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008358	CTGT	2	8	110350	110357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008358	CGGG	2	8	110781	110788	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008358	CCAG	2	8	121813	121820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008358	GCCG	2	8	121986	121993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008358	GGCG	2	8	122673	122680	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008358	GGCG	2	8	124542	124549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008358	ACGC	2	8	142625	142632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008358	CAAT	2	8	146638	146645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008358	GAAA	2	8	149655	149662	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008358	GCGG	2	8	159662	159669	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008358	GGCA	2	8	161608	161615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008358	CGGG	2	8	167440	167447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008358	AGGC	2	8	179607	179614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008358	CAGA	2	8	183744	183751	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008358	CCGG	2	8	183843	183850	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_008358	GGGA	2	8	184331	184338	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008358	CGCC	2	8	191640	191647	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_008358	GGCG	2	8	194642	194649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008358	GTCA	2	8	200628	200635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008358	TTCC	2	8	207815	207822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008358	ATAC	2	8	209761	209768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008358	ATTT	2	8	209811	209818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008358	AGGC	2	8	230325	230332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008358	CAAC	2	8	251456	251463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008358	TGAG	2	8	252274	252281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008358	GATA	2	8	252378	252385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008358	AAAC	2	8	256817	256824	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008358	AGAT	2	8	268525	268532	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008358	GCAG	2	8	268621	268628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008358	CGTC	2	8	268745	268752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008358	GCAA	2	8	269122	269129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008358	GGTA	2	8	269235	269242	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008358	CGGC	2	8	269388	269395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008358	GAGC	2	8	270808	270815	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008358	GCAA	2	8	270902	270909	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008358	GCCG	2	8	271065	271072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008358	AAGT	2	8	275753	275760	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008358	CGGC	2	8	275943	275950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008358	TTTG	2	8	284754	284761	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008358	TTCC	2	8	296617	296624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_008358	ACAG	2	8	297469	297476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008358	CTCG	2	8	297729	297736	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008358	CAGG	2	8	302649	302656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008358	CGCC	2	8	302667	302674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_008358	GGCA	2	8	304028	304035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008358	GGGC	2	8	306222	306229	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008358	CGTC	2	8	306269	306276	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008358	CAAG	2	8	311665	311672	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008358	CCGG	2	8	311695	311702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008358	CTTG	2	8	323182	323189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008358	AGGC	2	8	325536	325543	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008358	CCGG	2	8	325571	325578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008358	GCCC	2	8	329817	329824	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008358	CCCG	2	8	329876	329883	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
84	NC_008358	GAAA	2	8	345269	345276	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008358	GCGG	2	8	347679	347686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008358	TTTC	2	8	350528	350535	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008358	GGCC	2	8	353577	353584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008358	CCTC	2	8	356872	356879	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_008358	GCGG	2	8	356930	356937	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008358	GCGT	2	8	359300	359307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008358	ACCC	2	8	359419	359426	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_008358	GCCC	2	8	365834	365841	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
93	NC_008358	GCTT	2	8	372464	372471	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008358	GAGG	2	8	374397	374404	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008358	GGGT	2	8	383448	383455	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008358	GCGG	2	8	388256	388263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008358	CAAT	2	8	390557	390564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008358	ATCT	2	8	390602	390609	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008358	AAGC	2	8	391785	391792	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008358	GCCA	2	8	392915	392922	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008358	CATT	2	8	393719	393726	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008358	GATT	2	8	415695	415702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008358	AGGA	2	8	437670	437677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008358	GTCC	2	8	437735	437742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008358	CCCG	2	8	440854	440861	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_008358	GAGG	2	8	443186	443193	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008358	AGGC	2	8	450345	450352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008358	CCAT	2	8	454191	454198	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008358	CCAG	2	8	454237	454244	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008358	CCAG	2	8	454303	454310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008358	GCTT	2	8	457369	457376	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008358	GGGC	2	8	459485	459492	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008358	AGAA	2	8	460546	460553	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008358	ACCC	2	8	460673	460680	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_008358	GCCC	2	8	461978	461985	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_008358	ACGC	2	8	466018	466025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008358	ATCC	2	8	466071	466078	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_008358	TCGA	2	8	471326	471333	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008358	GGGT	2	8	471889	471896	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008358	GGCC	2	8	472097	472104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008358	AATG	2	8	472144	472151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008358	GCAG	2	8	472155	472162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008358	AGGC	2	8	472203	472210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008358	CGGA	2	8	476233	476240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008358	GGGA	2	8	482328	482335	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008358	AGAA	2	8	482634	482641	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008358	AAAT	2	8	482681	482688	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008358	AAGC	2	8	491375	491382	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008358	TCGC	2	8	504389	504396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008358	TGCT	2	8	516135	516142	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008358	GGGC	2	8	517333	517340	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008358	AAGG	2	8	518072	518079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008358	AGGC	2	8	520675	520682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008358	GGCG	2	8	523937	523944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008358	CAGG	2	8	529028	529035	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008358	TGCA	2	8	529038	529045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008358	GCAG	2	8	531924	531931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008358	ATGA	2	8	531963	531970	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008358	GGAG	2	8	531974	531981	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008358	GCTT	2	8	532940	532947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008358	TTGG	2	8	532976	532983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008358	AACT	2	8	535135	535142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008358	ACCC	2	8	535281	535288	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_008358	GTGC	2	8	537308	537315	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008358	TTCC	2	8	537368	537375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_008358	GCTG	2	8	541988	541995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008358	AGGC	2	8	546260	546267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008358	CCGG	2	8	547379	547386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_008358	GGCT	2	8	554942	554949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008358	AAGG	2	8	554995	555002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008358	GGCG	2	8	555639	555646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_008358	AGGC	2	8	1140434	1140441	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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472	NC_008358	TCGC	2	8	1608585	1608592	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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482	NC_008358	AGTA	2	8	1640225	1640232	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
483	NC_008358	GGGC	2	8	1640862	1640869	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_008358	GCCG	2	8	1654636	1654643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
486	NC_008358	CCCT	2	8	1655437	1655444	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
487	NC_008358	GCCC	2	8	1662883	1662890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
488	NC_008358	GCAA	2	8	1663812	1663819	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
489	NC_008358	AGGC	2	8	1663839	1663846	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
490	NC_008358	AGGT	2	8	1665198	1665205	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
491	NC_008358	GGCC	2	8	1666015	1666022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
492	NC_008358	ATTT	2	8	1669465	1669472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_008358	ACAG	2	8	1694507	1694514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_008358	GGCG	2	8	1697342	1697349	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
495	NC_008358	GGGC	2	8	1706153	1706160	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
496	NC_008358	CCAG	2	8	1706364	1706371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
497	NC_008358	GCAG	2	8	1706379	1706386	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
498	NC_008358	AGGC	2	8	1707462	1707469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
499	NC_008358	TGCC	2	8	1712548	1712555	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_008358	AAAT	2	8	1729198	1729205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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