MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 55356

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008358	GAG	2	6	120	125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008358	CGC	2	6	344	349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797376
3	NC_008358	ATT	2	6	388	393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114797376
4	NC_008358	GCC	2	6	568	573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797376
5	NC_008358	ACA	2	6	608	613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114797376
6	NC_008358	ATT	2	6	628	633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114797376
7	NC_008358	ATG	2	6	670	675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797376
8	NC_008358	TTC	2	6	715	720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797376
9	NC_008358	TGG	2	6	856	861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114797376
10	NC_008358	CCG	2	6	899	904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797376
11	NC_008358	GAA	2	6	954	959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797376
12	NC_008358	CGC	2	6	1032	1037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797376
13	NC_008358	AGA	2	6	1043	1048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797376
14	NC_008358	TGC	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797376
15	NC_008358	GCC	2	6	1134	1139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798603
16	NC_008358	GCC	3	9	1151	1159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798603
17	NC_008358	CAA	2	6	1225	1230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114798603
18	NC_008358	CGG	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798603
19	NC_008358	CGA	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798603
20	NC_008358	CTG	2	6	1359	1364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798603
21	NC_008358	AGA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798603
22	NC_008358	ATT	2	6	1617	1622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114798603
23	NC_008358	GCT	2	6	1642	1647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798603
24	NC_008358	TCT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799600
25	NC_008358	GGA	2	6	2045	2050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114799600
26	NC_008358	AGA	2	6	2154	2159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114799600
27	NC_008358	CTG	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799600
28	NC_008358	TCG	2	6	2237	2242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799600
29	NC_008358	CCG	2	6	2294	2299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799600
30	NC_008358	TCT	2	6	2306	2311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799600
31	NC_008358	CAT	2	6	2495	2500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799600
32	NC_008358	ATC	2	6	2502	2507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799600
33	NC_008358	ATG	2	6	2584	2589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797191
34	NC_008358	GGC	2	6	2622	2627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797191
35	NC_008358	CGA	2	6	2714	2719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797191
36	NC_008358	CTG	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797191
37	NC_008358	GGC	2	6	2853	2858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797191
38	NC_008358	GTT	2	6	2883	2888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114797191
39	NC_008358	TGA	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797191
40	NC_008358	ATC	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798147
41	NC_008358	GAT	2	6	3199	3204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798147
42	NC_008358	GAC	2	6	3296	3301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798147
43	NC_008358	ATT	2	6	3338	3343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114798147
44	NC_008358	CAT	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798147
45	NC_008358	CAT	2	6	3445	3450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798147
46	NC_008358	GCT	2	6	3577	3582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798147
47	NC_008358	GCT	2	6	3616	3621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798147
48	NC_008358	GGT	2	6	3623	3628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114798147
49	NC_008358	TTG	2	6	3756	3761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114798147
50	NC_008358	CGC	2	6	3818	3823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798742
51	NC_008358	GCC	2	6	3915	3920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798742
52	NC_008358	GAT	2	6	3939	3944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798742
53	NC_008358	CAG	2	6	3984	3989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798742
54	NC_008358	CGG	2	6	4188	4193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798742
55	NC_008358	GCT	2	6	4265	4270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798742
56	NC_008358	CGG	2	6	4289	4294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798742
57	NC_008358	CAC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008358	CGC	2	6	4435	4440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008358	GGC	2	6	4477	4482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799709
60	NC_008358	GCG	2	6	4530	4535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799709
61	NC_008358	GAA	2	6	4703	4708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114799709
62	NC_008358	GCG	2	6	4716	4721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799709
63	NC_008358	GCT	2	6	4786	4791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799709
64	NC_008358	GCA	2	6	4911	4916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799709
65	NC_008358	TCC	2	6	5009	5014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114799709
66	NC_008358	GCT	2	6	5029	5034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114799709
67	NC_008358	CGA	2	6	5035	5040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799709
68	NC_008358	GCC	2	6	5051	5056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799709
69	NC_008358	GAG	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008358	TGC	2	6	5122	5127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797762
71	NC_008358	GCG	2	6	5180	5185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797762
72	NC_008358	CGA	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797762
73	NC_008358	CGC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797762
74	NC_008358	CGC	2	6	5348	5353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797762
75	NC_008358	CGC	2	6	5364	5369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797762
76	NC_008358	CGC	2	6	5431	5436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797762
77	NC_008358	ATC	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797762
78	NC_008358	CGC	2	6	5555	5560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797762
79	NC_008358	CAC	2	6	5653	5658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797762
80	NC_008358	GGC	2	6	5696	5701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797762
81	NC_008358	TTC	2	6	5735	5740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797762
82	NC_008358	GAA	2	6	5924	5929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114797762
83	NC_008358	TCT	2	6	5964	5969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797762
84	NC_008358	CCT	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797762
85	NC_008358	CCT	2	6	6133	6138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114797762
86	NC_008358	CGG	2	6	6154	6159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797762
87	NC_008358	CGC	2	6	6316	6321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797762
88	NC_008358	CGC	2	6	6405	6410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798383
89	NC_008358	GGC	2	6	6459	6464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798383
90	NC_008358	GAA	2	6	6507	6512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798383
91	NC_008358	TCC	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114798383
92	NC_008358	GCG	2	6	6581	6586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798383
93	NC_008358	CAG	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798383
94	NC_008358	TCA	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114798383
95	NC_008358	GGC	2	6	6841	6846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798383
96	NC_008358	GCG	2	6	6848	6853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798383
97	NC_008358	CTT	2	6	6980	6985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114798843
98	NC_008358	CGC	2	6	7054	7059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798843
99	NC_008358	GCG	2	6	7062	7067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798843
100	NC_008358	GCG	3	9	7085	7093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798843
101	NC_008358	TTG	2	6	7206	7211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114798843
102	NC_008358	TCG	2	6	7213	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114798843
103	NC_008358	TGA	2	6	7240	7245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798843
104	NC_008358	GGT	2	6	7267	7272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114798843
105	NC_008358	GGC	2	6	7309	7314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798843
106	NC_008358	TTC	2	6	7406	7411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114798843
107	NC_008358	CCG	2	6	7443	7448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798843
108	NC_008358	CGC	2	6	7462	7467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798843
109	NC_008358	GAG	2	6	7568	7573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114798843
110	NC_008358	CGG	2	6	7579	7584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798843
111	NC_008358	GCC	2	6	7655	7660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008358	GCC	2	6	7733	7738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008358	GCC	2	6	7781	7786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799986
114	NC_008358	CCG	2	6	7894	7899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799986
115	NC_008358	TCA	2	6	7966	7971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799986
116	NC_008358	CCA	2	6	7996	8001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114799986
117	NC_008358	TGA	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114799986
118	NC_008358	TTC	2	6	8058	8063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799986
119	NC_008358	CGC	2	6	8074	8079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799986
120	NC_008358	CCA	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114799986
121	NC_008358	GCC	2	6	8105	8110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114799986
122	NC_008358	TTC	2	6	8195	8200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114799986
123	NC_008358	TGG	2	6	8275	8280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114799986
124	NC_008358	TCA	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114799986
125	NC_008358	GGC	2	6	8369	8374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799986
126	NC_008358	GCA	2	6	8404	8409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114799986
127	NC_008358	ACC	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114799986
128	NC_008358	GGC	2	6	8702	8707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799986
129	NC_008358	TTG	2	6	8713	8718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114799986
130	NC_008358	TGA	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008358	ATG	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798553
132	NC_008358	GCC	2	6	8939	8944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798553
133	NC_008358	CGC	2	6	8983	8988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798553
134	NC_008358	TGG	2	6	9001	9006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114798553
135	NC_008358	CGG	2	6	9130	9135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798262
136	NC_008358	GAA	2	6	9179	9184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114798262
137	NC_008358	GAC	2	6	9277	9282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798262
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141	NC_008358	GGC	2	6	9556	9561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114798262
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143	NC_008358	TGA	2	6	9600	9605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114798262
144	NC_008358	GCC	3	9	9627	9635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_008358	CAG	2	6	9768	9773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800535
146	NC_008358	CGG	2	6	9805	9810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800535
147	NC_008358	CAG	2	6	9837	9842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114800535
148	NC_008358	GCC	3	9	9913	9921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114800535
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152	NC_008358	GCA	2	6	10381	10386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_008358	CAT	2	6	10536	10541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797544
154	NC_008358	CGC	2	6	10590	10595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797544
155	NC_008358	GTG	2	6	10612	10617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114797544
156	NC_008358	GCC	2	6	10638	10643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797544
157	NC_008358	CCG	2	6	10676	10681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797544
158	NC_008358	ATC	2	6	10717	10722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114797544
159	NC_008358	TGG	2	6	10737	10742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114797544
160	NC_008358	TCG	2	6	10799	10804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797544
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172	NC_008358	ATA	2	6	11844	11849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114799488
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241	NC_008358	CGG	2	6	15994	15999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799580
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252	NC_008358	GCC	4	12	16624	16635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797696
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256	NC_008358	GCC	3	9	16822	16830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797696
257	NC_008358	TTC	2	6	16839	16844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797696
258	NC_008358	TGA	2	6	16858	16863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797696
259	NC_008358	CGC	3	9	16887	16895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797696
260	NC_008358	CGT	2	6	16911	16916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114797696
261	NC_008358	GCC	2	6	16951	16956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114797696
262	NC_008358	CGC	2	6	17162	17167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_008358	GGC	2	6	17326	17331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114800461
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279	NC_008358	CCT	2	6	18139	18144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
280	NC_008358	GAA	2	6	18195	18200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_008358	CGA	2	6	18413	18418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114798480
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288	NC_008358	CTT	2	6	19021	19026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114797893
289	NC_008358	GCA	2	6	19101	19106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114797893
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297	NC_008358	CCA	2	6	19457	19462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114797893
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303	NC_008358	CAT	2	6	20031	20036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114800480
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333	NC_008358	GCG	2	6	21855	21860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114797148
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362	NC_008358	ATG	2	6	24006	24011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114797256
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364	NC_008358	CCG	2	6	24125	24130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
365	NC_008358	CAC	2	6	24197	24202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
366	NC_008358	GGC	2	6	24278	24283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114799975
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499	NC_008358	GCC	2	6	31560	31565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114798513
500	NC_008358	GGA	2	6	31786	31791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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