MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyphomonas neptunium ATCC 15444 chromosome

Total Repeats: 3932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008358	GAG	2	6	120	125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008358	CAC	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_008358	CGC	2	6	4435	4440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008358	GAG	2	6	5082	5087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008358	GCC	2	6	7655	7660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008358	GCC	2	6	7733	7738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008358	TGA	2	6	8789	8794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008358	GCC	3	9	9627	9635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008358	GCA	2	6	10381	10386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008358	CAA	2	6	12718	12723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008358	AGG	2	6	13516	13521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008358	TCC	2	6	15483	15488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_008358	CCG	2	6	15912	15917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008358	CGC	2	6	17162	17167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_008358	CCT	2	6	18139	18144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008358	GAA	2	6	18195	18200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008358	CCG	2	6	24125	24130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_008358	CAC	2	6	24197	24202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008358	GCC	2	6	26489	26494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008358	CGG	2	6	27215	27220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008358	GCC	2	6	29642	29647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008358	CAT	2	6	29656	29661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008358	GGA	2	6	31786	31791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008358	TGC	2	6	31817	31822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008358	CGA	2	6	31924	31929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008358	GGA	2	6	31933	31938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008358	TTG	2	6	33394	33399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008358	TGC	2	6	35839	35844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008358	CAT	2	6	39036	39041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008358	GCT	2	6	39043	39048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008358	CGC	2	6	39125	39130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_008358	TGG	2	6	42660	42665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008358	CCA	2	6	42673	42678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008358	GGA	2	6	42691	42696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008358	CGC	2	6	45383	45388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_008358	GCG	2	6	45408	45413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008358	CGC	2	6	45461	45466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_008358	CAA	2	6	46064	46069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008358	GCC	2	6	46100	46105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_008358	TCC	2	6	47241	47246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008358	AGA	2	6	47254	47259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008358	GGA	2	6	47262	47267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008358	AGC	2	6	51548	51553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008358	GCG	2	6	52315	52320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008358	AGA	2	6	52767	52772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008358	GGA	2	6	52854	52859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008358	TTC	2	6	53690	53695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008358	GCC	2	6	54496	54501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008358	GGC	2	6	54880	54885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008358	ACT	2	6	55737	55742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008358	CCG	2	6	55904	55909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008358	CGG	2	6	56193	56198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008358	GCC	2	6	57609	57614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008358	TGC	2	6	64028	64033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008358	GGC	2	6	65307	65312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008358	CCA	2	6	65339	65344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008358	ATG	2	6	65373	65378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008358	GCC	2	6	65453	65458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_008358	TAT	2	6	68794	68799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008358	AAT	2	6	69453	69458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008358	TCC	2	6	69653	69658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008358	CGG	2	6	71027	71032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008358	TGA	2	6	71042	71047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008358	CAA	2	6	73822	73827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008358	CAG	2	6	75761	75766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008358	ATA	2	6	75790	75795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008358	ATC	2	6	75799	75804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008358	TCA	2	6	75840	75845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008358	AGG	2	6	75929	75934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008358	CAA	2	6	82920	82925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008358	TCC	2	6	83056	83061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008358	GGA	2	6	83159	83164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008358	TCT	2	6	85975	85980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008358	AGG	2	6	86028	86033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008358	GGA	2	6	87408	87413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008358	GCT	2	6	88892	88897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008358	CTT	2	6	98180	98185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008358	CTC	2	6	98278	98283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_008358	CGG	2	6	98597	98602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008358	GCC	2	6	98616	98621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008358	CGG	3	9	98712	98720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008358	CCG	2	6	98735	98740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_008358	CCG	2	6	104988	104993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008358	GCC	2	6	105604	105609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008358	GCC	2	6	105647	105652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008358	GCG	2	6	106921	106926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008358	TGT	2	6	106951	106956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008358	GCC	2	6	106991	106996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008358	CCA	2	6	107169	107174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_008358	TCC	2	6	107182	107187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_008358	GCG	2	6	107259	107264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008358	CGG	2	6	107270	107275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008358	GCA	2	6	107312	107317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008358	CTT	2	6	107330	107335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008358	GGA	2	6	107421	107426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008358	CGA	2	6	107471	107476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008358	CCT	2	6	108248	108253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_008358	TAA	2	6	108254	108259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008358	GAT	2	6	110375	110380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008358	GGC	2	6	111603	111608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008358	CGC	3	9	112146	112154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008358	TCC	2	6	112166	112171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008358	CGC	4	12	112211	112222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_008358	CAT	2	6	112227	112232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008358	CGC	2	6	113827	113832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008358	AGC	2	6	113857	113862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008358	GGA	2	6	113916	113921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008358	GCC	2	6	118685	118690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_008358	CTT	2	6	118725	118730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008358	ATG	2	6	119564	119569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008358	GCG	2	6	119577	119582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008358	TCC	2	6	119807	119812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008358	GCG	2	6	121804	121809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008358	TGC	2	6	122088	122093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008358	GGA	2	6	124610	124615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008358	CGC	2	6	131508	131513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008358	CAT	2	6	133266	133271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008358	GAG	2	6	135601	135606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008358	GCC	2	6	137134	137139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_008358	TGA	2	6	137764	137769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008358	TGG	2	6	139922	139927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008358	AGT	2	6	139932	139937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008358	GGA	2	6	146534	146539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008358	GCG	2	6	146546	146551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_008358	GCA	2	6	146582	146587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_008358	GGA	2	6	146685	146690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008358	GGC	2	6	149617	149622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008358	GGC	2	6	149666	149671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_008358	GCC	2	6	149678	149683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_008358	TGC	2	6	152173	152178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008358	CGC	2	6	155226	155231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_008358	TCC	2	6	156601	156606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_008358	CTC	2	6	157415	157420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_008358	CCT	2	6	158327	158332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008358	CGC	2	6	161576	161581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_008358	GCG	2	6	161597	161602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008358	CCG	2	6	162534	162539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_008358	GAA	2	6	163763	163768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008358	CTT	2	6	165548	165553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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