MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Maricaulis maris MCS10 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008347	ATGCGA	2	12	4811	4822	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008347	CAAAAA	2	12	26772	26783	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008347	GTTTGC	2	12	29090	29101	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008347	TGCAGA	2	12	52175	52186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008347	CGAATG	2	12	52236	52247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008347	AAAACG	2	12	115252	115263	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008347	CGCTGA	2	12	332911	332922	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008347	TCCCTC	2	12	406341	406352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_008347	TGTTCG	2	12	471403	471414	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008347	TCGAAG	2	12	472871	472882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008347	TGCGGC	2	12	606725	606736	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008347	TTGACG	2	12	627680	627691	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_008347	TCCCTC	2	12	666566	666577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_008347	CCTGGT	2	12	690117	690128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008347	GAAGCG	2	12	694563	694574	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008347	GGGAAA	2	12	699572	699583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008347	TGCCGA	2	12	761472	761483	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008347	ATTCCA	2	12	771723	771734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008347	TGGGTT	2	12	797953	797964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008347	CAAGCC	2	12	924196	924207	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_008347	AGCGGC	2	12	1103462	1103473	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008347	TGGCGC	2	12	1127097	1127108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008347	GGTGTT	2	12	1140527	1140538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008347	CAGTGT	2	12	1169993	1170004	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008347	GAACCG	2	12	1185825	1185836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008347	TCTTGA	2	12	1188272	1188283	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008347	CCCGAA	2	12	1198509	1198520	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008347	AGCCTG	2	12	1233627	1233638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008347	TTTCGG	2	12	1248429	1248440	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_008347	GCGGGC	2	12	1254305	1254316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008347	CTGTGC	2	12	1305596	1305607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_008347	ATTGCG	2	12	1398527	1398538	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008347	GAAAGC	2	12	1467710	1467721	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008347	CGTTTG	2	12	1479250	1479261	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008347	TTGGCG	2	12	1485014	1485025	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008347	GGAAAA	2	12	1513066	1513077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008347	ACCCCC	2	12	1574812	1574823	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
38	NC_008347	AGGGCA	2	12	1575878	1575889	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008347	GGGCTT	2	12	1599459	1599470	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008347	AAGACC	2	12	1645280	1645291	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008347	GTGAAA	2	12	1649382	1649393	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008347	CACCTT	2	12	1650635	1650646	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008347	AAAACG	2	12	1666099	1666110	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_008347	GTCCCC	2	12	1741391	1741402	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_008347	CGCCAG	2	12	1744638	1744649	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008347	GATCGG	2	12	1752455	1752466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008347	GCGATT	2	12	1815407	1815418	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_008347	TCCCGG	2	12	1844185	1844196	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008347	TTAAGG	2	12	1865738	1865749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008347	GCAGGC	2	12	1867393	1867404	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008347	TGCCGG	2	12	1877732	1877743	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008347	TCAACG	2	12	1877746	1877757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008347	CGGTGG	2	12	1888070	1888081	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008347	CGGTGT	2	12	1888082	1888093	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008347	TGGCGG	2	12	1888103	1888114	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008347	CCTGAC	2	12	1988129	1988140	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008347	GCCCGC	2	12	1988145	1988156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_008347	TCAAGA	2	12	1993165	1993176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008347	CGGTTC	2	12	1995612	1995623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008347	GGAATG	2	12	2047070	2047081	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008347	GAAACG	2	12	2141270	2141281	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008347	GCAGGC	2	12	2148637	2148648	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008347	AGAAAC	2	12	2159647	2159658	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008347	TGTTTC	2	12	2159659	2159670	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008347	GGGCAA	2	12	2215041	2215052	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008347	AAGGAA	2	12	2275107	2275118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008347	CGCTCA	2	12	2275227	2275238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008347	GGCGAC	2	12	2276380	2276391	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008347	ATACGC	2	12	2280710	2280721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008347	TTGGCG	2	12	2291361	2291372	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008347	TCGCCC	2	12	2366325	2366336	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008347	CGCACC	2	12	2404374	2404385	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008347	TGCCTG	2	12	2407165	2407176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008347	CCCGGT	2	12	2436946	2436957	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008347	CGTTTT	2	12	2501545	2501556	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008347	ACCAGA	2	12	2508047	2508058	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008347	CGGCAG	2	12	2554042	2554053	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008347	AATGAG	2	12	2571182	2571193	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008347	CATTCT	2	12	2666604	2666615	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008347	CTGCGC	2	12	2732533	2732544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008347	GGGCTT	2	12	2789053	2789064	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008347	CGCAGG	2	12	2810025	2810036	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008347	TCCCTC	2	12	2902770	2902781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_008347	CCGGCA	2	12	3042511	3042522	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008347	CAGGAT	2	12	3073121	3073132	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008347	GCGCCG	2	12	3095884	3095895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008347	TGAACC	2	12	3125744	3125755	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008347	GGATCG	2	12	3132144	3132155	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_008347	GCCAGG	2	12	3144701	3144712	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008347	CGAGGG	2	12	3180835	3180846	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008347	CTTGCG	2	12	3359391	3359402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008347	TGGCGA	2	12	3359405	3359416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008347	GAGCTT	2	12	3359547	3359558	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.