MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008346	CTATAG	2	12	10978	10989	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008346	TTTTAA	2	12	17954	17965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008346	CGCAGG	2	12	49240	49251	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008346	GGGGGT	2	12	70108	70119	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008346	TCAGTG	2	12	89776	89787	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008346	AAATTT	2	12	91207	91218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008346	ACGGAG	2	12	119426	119437	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_008346	TATCCA	2	12	153630	153641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008346	ACCAAG	2	12	169676	169687	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008346	AAAAGA	2	12	175465	175476	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008346	CCCCGT	2	12	228939	228950	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008346	CCCCCT	2	12	230998	231009	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
13	NC_008346	ACGGGG	2	12	274923	274934	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008346	ACGGGG	2	12	274964	274975	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008346	CCCCGT	2	12	285454	285465	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_008346	GGATAA	2	12	335414	335425	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008346	ATTATA	2	12	345409	345420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008346	CGGAAC	2	12	398012	398023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008346	CGCAGG	2	12	422654	422665	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008346	CCCCGT	2	12	453029	453040	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_008346	TAAATA	2	12	495142	495153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008346	ATTCTT	2	12	511171	511182	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008346	ACGGGG	2	12	553352	553363	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008346	AAATAT	2	12	567734	567745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008346	AGAATA	2	12	589001	589012	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008346	GGAAGA	2	12	589624	589635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008346	CCTGGC	2	12	669022	669033	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008346	TTTTGA	2	12	676975	676986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008346	ATTAAT	2	12	681207	681218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008346	TGCAGG	2	12	688990	689001	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008346	ATATTT	2	12	697219	697230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008346	TCTTTT	2	12	699564	699575	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008346	CAAAAA	2	12	700639	700650	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008346	TACTAT	2	12	722678	722689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008346	ATTTTC	2	12	776415	776426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008346	CCGGGG	2	12	784164	784175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008346	GGGTAA	2	12	788955	788966	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008346	CGAGAA	2	12	792471	792482	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008346	TATGAT	2	12	806490	806501	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008346	TTTGCT	2	12	810473	810484	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008346	AGCAAA	2	12	821757	821768	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_008346	AATGAA	2	12	829457	829468	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008346	AATATT	2	12	829610	829621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008346	AGCAAA	2	12	845149	845160	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008346	TTATTT	2	12	865206	865217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008346	ACGGGG	2	12	867135	867146	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008346	ATTGAG	2	12	877897	877908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008346	CCCCGT	2	12	888336	888347	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008346	CCCCGT	2	12	888395	888406	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008346	CCCCGT	2	12	888434	888445	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_008346	GGAAGG	2	12	944115	944126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008346	CCCCGT	2	12	944178	944189	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_008346	CCCCGT	2	12	944220	944231	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_008346	CCCCGT	2	12	944259	944270	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_008346	AAGGGG	2	12	954879	954890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008346	CTGCAG	2	12	956334	956345	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008346	AAATAT	2	12	1011164	1011175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008346	CTTTAT	2	12	1025087	1025098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008346	TCTGAA	2	12	1044579	1044590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008346	CGCAGG	2	12	1058277	1058288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008346	GGGGAT	2	12	1092703	1092714	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008346	CGGATC	2	12	1128115	1128126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008346	TAAATT	2	12	1141944	1141955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008346	GAGGTT	2	12	1144627	1144638	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008346	GCTGTT	2	12	1146891	1146902	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_008346	CAAGGG	2	12	1176897	1176908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008346	TGCTTA	2	12	1180139	1180150	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008346	GCTATA	2	12	1182871	1182882	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008346	TTTGCT	2	12	1205291	1205302	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008346	TATGCT	2	12	1207874	1207885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_008346	GGTTTA	2	12	1217116	1217127	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008346	AAAATT	2	12	1222456	1222467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008346	CCTCCG	2	12	1250236	1250247	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_008346	GCGTGA	2	12	1253906	1253917	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_008346	CCCCGT	2	12	1282193	1282204	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008346	TACTTC	2	12	1363531	1363542	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008346	AGCTTC	2	12	1369621	1369632	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008346	GATAAA	2	12	1409175	1409186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008346	CCCCCT	2	12	1433957	1433968	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_008346	CCCTTG	2	12	1444885	1444896	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008346	ACGGGG	2	12	1465250	1465261	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008346	AATAGC	2	12	1478102	1478113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008346	ATTCTT	2	12	1488194	1488205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_008346	TACCAA	2	12	1492668	1492679	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008346	TACCCC	2	12	1498361	1498372	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_008346	ATATTG	2	12	1518285	1518296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008346	ATTTTT	2	12	1519927	1519938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008346	TTCCTT	2	12	1520165	1520176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008346	AGTATA	2	12	1531701	1531712	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008346	TTTGCT	2	12	1552957	1552968	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_008346	TTACCA	2	12	1561299	1561310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008346	TTATAG	2	12	1584728	1584739	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008346	ATTCAA	2	12	1593464	1593475	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008346	TTAATA	2	12	1603928	1603939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008346	CCCCGT	2	12	1644437	1644448	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_008346	GTACCT	2	12	1671115	1671126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008346	CTTGGT	2	12	1680273	1680284	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_008346	TGCCGA	2	12	1680387	1680398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_008346	TTCTGG	2	12	1710181	1710192	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008346	TATCAT	2	12	1710658	1710669	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_008346	AGCATT	2	12	1800836	1800847	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_008346	GCTTTT	2	12	1824353	1824364	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008346	AATTTT	2	12	1885076	1885087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008346	TTCGCC	2	12	1886784	1886795	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008346	CTAGTT	2	12	1894486	1894497	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008346	ACCCCC	2	12	1898112	1898123	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
107	NC_008346	TCTATA	2	12	1898287	1898298	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008346	TTCAGG	2	12	1900269	1900280	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_008346	TTAGTT	2	12	1907521	1907532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008346	ACGGGG	2	12	1915887	1915898	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008346	CAAATG	2	12	1921032	1921043	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008346	CGCTGC	2	12	1960386	1960397	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_008346	ATGCTA	2	12	1968068	1968079	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_008346	GTCATT	2	12	1981261	1981272	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008346	CGGGCT	2	12	1984389	1984400	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008346	AGCAAA	2	12	1996326	1996337	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008346	AATGAA	2	12	2002175	2002186	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008346	AGTTTA	2	12	2011791	2011802	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008346	TAGAAA	2	12	2070297	2070308	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008346	ATATAA	2	12	2092939	2092950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008346	AAATTC	2	12	2119518	2119529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_008346	TCTTTT	2	12	2123258	2123269	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008346	CAAATC	2	12	2138024	2138035	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_008346	CCTCCC	2	12	2161257	2161268	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
125	NC_008346	ATGATT	2	12	2214908	2214919	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008346	CTTAAA	2	12	2215352	2215363	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008346	CCCTTG	2	12	2256059	2256070	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008346	TACTTG	2	12	2277450	2277461	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_008346	TTTGCT	2	12	2288132	2288143	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_008346	GCCCTT	2	12	2288951	2288962	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
131	NC_008346	ATTCTT	2	12	2315399	2315410	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_008346	CATTTC	2	12	2331857	2331868	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008346	TATAAT	2	12	2332598	2332609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008346	AATCTC	2	12	2354561	2354572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_008346	AAAGAA	2	12	2356975	2356986	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008346	TTCATC	2	12	2368880	2368891	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008346	AGGAAA	2	12	2388025	2388036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008346	TAAGAA	2	12	2392337	2392348	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008346	TTTTAT	2	12	2396042	2396053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008346	AGCTTT	2	12	2414827	2414838	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_008346	CAGCTG	2	12	2414868	2414879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_008346	CCAACC	2	12	2416001	2416012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_008346	GCTCCA	2	12	2416317	2416328	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008346	TAAAAT	2	12	2426320	2426331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008346	AGCAAG	2	12	2437810	2437821	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_008346	TTTTGG	2	12	2450323	2450334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008346	ATTTTG	2	12	2464513	2464524	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008346	AGGAAG	2	12	2504177	2504188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008346	GTAGAA	2	12	2536697	2536708	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008346	AATGGC	2	12	2537258	2537269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_008346	AAATAA	2	12	2556537	2556548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008346	AATAGG	2	12	2571945	2571956	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008346	GTTTAC	2	12	2587772	2587783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_008346	TTATCA	2	12	2627944	2627955	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_008346	GATATA	2	12	2663352	2663363	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008346	TTTTTA	2	12	2666734	2666745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008346	TCATAA	2	12	2680147	2680158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_008346	CTGATC	2	12	2687272	2687283	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_008346	TTTCAT	2	12	2687829	2687840	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_008346	GCATCC	2	12	2688236	2688247	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
161	NC_008346	AAATAA	2	12	2713447	2713458	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008346	ACGGGG	2	12	2766954	2766965	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_008346	CCCCGT	2	12	2773955	2773966	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_008346	TAAAAC	2	12	2783254	2783265	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
165	NC_008346	AGCAAA	2	12	2796391	2796402	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_008346	TTTATT	2	12	2809677	2809688	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_008346	AGCAAA	2	12	2850535	2850546	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_008346	CAAATT	2	12	2852405	2852416	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_008346	AGGAGA	2	12	2858871	2858882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008346	GGCGAT	2	12	2868307	2868318	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_008346	GGCGAA	2	12	2889631	2889642	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
172	NC_008346	GCGAAA	2	12	2909176	2909187	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
173	NC_008346	CAGTAG	6	36	2934487	2934522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.