MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 2044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008346	TTCTG	2	10	931	940	0 %	60 %	20 %	20 %	114565577
2	NC_008346	CAATA	2	10	4828	4837	60 %	20 %	0 %	20 %	114565581
3	NC_008346	TGCCC	2	10	6074	6083	0 %	20 %	20 %	60 %	114565582
4	NC_008346	AGTAA	2	10	7944	7953	60 %	20 %	20 %	0 %	114565582
5	NC_008346	GGGAT	2	10	11089	11098	20 %	20 %	60 %	0 %	114565585
6	NC_008346	TTGCA	2	10	14107	14116	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_008346	GCTCT	2	10	16664	16673	0 %	40 %	20 %	40 %	114565588
8	NC_008346	CTCGA	2	10	18639	18648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008346	GGCTT	2	10	18968	18977	0 %	40 %	40 %	20 %	114565590
10	NC_008346	GGCAG	2	10	19146	19155	20 %	0 %	60 %	20 %	114565590
11	NC_008346	CCGGA	2	10	19665	19674	20 %	0 %	40 %	40 %	114565590
12	NC_008346	GGTAT	2	10	20096	20105	20 %	40 %	40 %	0 %	114565590
13	NC_008346	GCTTT	2	10	20428	20437	0 %	60 %	20 %	20 %	114565591
14	NC_008346	GCCCG	2	10	20563	20572	0 %	0 %	40 %	60 %	114565591
15	NC_008346	TTTAG	2	10	21116	21125	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008346	ATATA	2	10	21193	21202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008346	ATATC	2	10	23515	23524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_008346	TGGGA	2	10	23653	23662	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008346	AGATC	2	10	27360	27369	40 %	20 %	20 %	20 %	114565598
20	NC_008346	CCATT	2	10	28288	28297	20 %	40 %	0 %	40 %	114565599
21	NC_008346	TGATA	2	10	30364	30373	40 %	40 %	20 %	0 %	114565600
22	NC_008346	GTTTT	2	10	35616	35625	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008346	CGTAT	2	10	41057	41066	20 %	40 %	20 %	20 %	114565612
24	NC_008346	GGTAG	2	10	43975	43984	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008346	TCGTG	2	10	44793	44802	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008346	GAAAT	2	10	45667	45676	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008346	GCAAA	2	10	45958	45967	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008346	GGGAG	2	10	46559	46568	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008346	GAGAA	2	10	47404	47413	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008346	CGCCC	2	10	52368	52377	0 %	0 %	20 %	80 %	114565616
31	NC_008346	GATAA	2	10	53309	53318	60 %	20 %	20 %	0 %	114565617
32	NC_008346	GATAA	2	10	54229	54238	60 %	20 %	20 %	0 %	114565618
33	NC_008346	TTTTC	2	10	61409	61418	0 %	80 %	0 %	20 %	114565626
34	NC_008346	CTGGG	2	10	63560	63569	0 %	20 %	60 %	20 %	114565628
35	NC_008346	TATAA	2	10	63784	63793	60 %	40 %	0 %	0 %	114565628
36	NC_008346	AGATT	2	10	64986	64995	40 %	40 %	20 %	0 %	114565630
37	NC_008346	TTTTC	2	10	65237	65246	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_008346	AAGAA	2	10	65555	65564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008346	GAAAT	2	10	66761	66770	60 %	20 %	20 %	0 %	114565632
40	NC_008346	AAAGT	2	10	69172	69181	60 %	20 %	20 %	0 %	114565635
41	NC_008346	GCCTG	2	10	74156	74165	0 %	20 %	40 %	40 %	114565641
42	NC_008346	GTGAA	2	10	74845	74854	40 %	20 %	40 %	0 %	114565642
43	NC_008346	GTTTT	2	10	75055	75064	0 %	80 %	20 %	0 %	114565642
44	NC_008346	GTGAA	2	10	76909	76918	40 %	20 %	40 %	0 %	114565643
45	NC_008346	CTCGT	2	10	78864	78873	0 %	40 %	20 %	40 %	114565646
46	NC_008346	GGAAA	2	10	79711	79720	60 %	0 %	40 %	0 %	114565647
47	NC_008346	ATATC	2	10	80407	80416	40 %	40 %	0 %	20 %	114565647
48	NC_008346	GAGCA	2	10	82013	82022	40 %	0 %	40 %	20 %	114565647
49	NC_008346	CTTCG	2	10	82608	82617	0 %	40 %	20 %	40 %	114565648
50	NC_008346	TCTTT	2	10	83076	83085	0 %	80 %	0 %	20 %	114565648
51	NC_008346	CCCAG	2	10	84438	84447	20 %	0 %	20 %	60 %	114565649
52	NC_008346	TTCCC	2	10	85298	85307	0 %	40 %	0 %	60 %	114565649
53	NC_008346	CCATA	2	10	85631	85640	40 %	20 %	0 %	40 %	114565650
54	NC_008346	GCCCC	2	10	86682	86691	0 %	0 %	20 %	80 %	114565651
55	NC_008346	CCGGA	2	10	86708	86717	20 %	0 %	40 %	40 %	114565651
56	NC_008346	AGGTC	2	10	87414	87423	20 %	20 %	40 %	20 %	114565652
57	NC_008346	TAATA	2	10	87612	87621	60 %	40 %	0 %	0 %	114565652
58	NC_008346	TGATG	2	10	88140	88149	20 %	40 %	40 %	0 %	114565652
59	NC_008346	GGATT	2	10	91017	91026	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008346	ATCCT	2	10	92994	93003	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_008346	GGAAG	2	10	93716	93725	40 %	0 %	60 %	0 %	114565656
62	NC_008346	GGAAG	2	10	94079	94088	40 %	0 %	60 %	0 %	114565657
63	NC_008346	AGCCA	2	10	94282	94291	40 %	0 %	20 %	40 %	114565658
64	NC_008346	TCCCC	2	10	96114	96123	0 %	20 %	0 %	80 %	114565663
65	NC_008346	TAACA	2	10	97406	97415	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_008346	AAAGG	2	10	97465	97474	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008346	AAGAA	2	10	99303	99312	80 %	0 %	20 %	0 %	114565667
68	NC_008346	TTAGT	2	10	99539	99548	20 %	60 %	20 %	0 %	114565667
69	NC_008346	GAAAA	2	10	100356	100365	80 %	0 %	20 %	0 %	114565667
70	NC_008346	TAAAA	2	10	100785	100794	80 %	20 %	0 %	0 %	114565667
71	NC_008346	AAAGC	2	10	103986	103995	60 %	0 %	20 %	20 %	114565669
72	NC_008346	GAAAA	2	10	104768	104777	80 %	0 %	20 %	0 %	114565669
73	NC_008346	CCGGG	2	10	106914	106923	0 %	0 %	60 %	40 %	114565671
74	NC_008346	AATAA	2	10	107194	107203	80 %	20 %	0 %	0 %	114565671
75	NC_008346	GATAA	2	10	107498	107507	60 %	20 %	20 %	0 %	114565672
76	NC_008346	TAATA	2	10	110430	110439	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008346	GAATT	2	10	111000	111009	40 %	40 %	20 %	0 %	114565676
78	NC_008346	TCAAA	2	10	111379	111388	60 %	20 %	0 %	20 %	114565677
79	NC_008346	ATGGC	2	10	113458	113467	20 %	20 %	40 %	20 %	114565679
80	NC_008346	CAAAG	2	10	114588	114597	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_008346	TAAAT	2	10	116668	116677	60 %	40 %	0 %	0 %	114565682
82	NC_008346	GGCCG	2	10	118074	118083	0 %	0 %	60 %	40 %	114565683
83	NC_008346	CGTTT	2	10	118380	118389	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_008346	TCTCG	2	10	118889	118898	0 %	40 %	20 %	40 %	114565684
85	NC_008346	CAGCG	2	10	119048	119057	20 %	0 %	40 %	40 %	114565684
86	NC_008346	TCGCG	2	10	119564	119573	0 %	20 %	40 %	40 %	114565685
87	NC_008346	TGGCA	2	10	119914	119923	20 %	20 %	40 %	20 %	114565685
88	NC_008346	AACAG	2	10	121462	121471	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_008346	GGAAG	2	10	122589	122598	40 %	0 %	60 %	0 %	114565688
90	NC_008346	GATTT	2	10	123283	123292	20 %	60 %	20 %	0 %	114565688
91	NC_008346	CTCAT	2	10	124589	124598	20 %	40 %	0 %	40 %	114565689
92	NC_008346	CTGGC	2	10	125182	125191	0 %	20 %	40 %	40 %	114565689
93	NC_008346	GCCCG	2	10	125375	125384	0 %	0 %	40 %	60 %	114565689
94	NC_008346	CGGAA	2	10	129824	129833	40 %	0 %	40 %	20 %	114565694
95	NC_008346	GGACA	2	10	131235	131244	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_008346	TTATG	2	10	134443	134452	20 %	60 %	20 %	0 %	114565697
97	NC_008346	ACCGG	2	10	134984	134993	20 %	0 %	40 %	40 %	114565697
98	NC_008346	CCTGG	2	10	135188	135197	0 %	20 %	40 %	40 %	114565698
99	NC_008346	ATATG	2	10	138091	138100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008346	TCTCC	2	10	138511	138520	0 %	40 %	0 %	60 %	114565699
101	NC_008346	CCTGG	2	10	139438	139447	0 %	20 %	40 %	40 %	114565699
102	NC_008346	AGCTT	2	10	140442	140451	20 %	40 %	20 %	20 %	114565699
103	NC_008346	AGCGG	2	10	141636	141645	20 %	0 %	60 %	20 %	114565700
104	NC_008346	CCCAA	2	10	144694	144703	40 %	0 %	0 %	60 %	114565702
105	NC_008346	CCTGG	2	10	145029	145038	0 %	20 %	40 %	40 %	114565702
106	NC_008346	ATACA	2	10	145945	145954	60 %	20 %	0 %	20 %	114565702
107	NC_008346	CTTTG	2	10	147614	147623	0 %	60 %	20 %	20 %	114565703
108	NC_008346	CCGGC	2	10	148016	148025	0 %	0 %	40 %	60 %	114565703
109	NC_008346	AGCAA	2	10	149543	149552	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_008346	CCAAT	2	10	152107	152116	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_008346	TAAAG	2	10	153149	153158	60 %	20 %	20 %	0 %	114565706
112	NC_008346	ATTGA	2	10	154030	154039	40 %	40 %	20 %	0 %	114565707
113	NC_008346	GGCAT	2	10	154307	154316	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_008346	TATCA	2	10	154559	154568	40 %	40 %	0 %	20 %	114565708
115	NC_008346	ATTTT	2	10	156022	156031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008346	CCTTT	2	10	156189	156198	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_008346	AACCA	2	10	156898	156907	60 %	0 %	0 %	40 %	114565710
118	NC_008346	ATAAA	2	10	157614	157623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008346	AGATC	2	10	158858	158867	40 %	20 %	20 %	20 %	114565711
120	NC_008346	GATAT	2	10	159204	159213	40 %	40 %	20 %	0 %	114565711
121	NC_008346	ATAAA	3	15	161458	161472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008346	CAAAT	2	10	162764	162773	60 %	20 %	0 %	20 %	114565713
123	NC_008346	AGGCC	2	10	167250	167259	20 %	0 %	40 %	40 %	114565715
124	NC_008346	TATAA	2	10	169394	169403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008346	TTTAT	2	10	170078	170087	20 %	80 %	0 %	0 %	114565716
126	NC_008346	GAAAG	2	10	172683	172692	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008346	CAAGC	2	10	173849	173858	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
128	NC_008346	GGTGC	2	10	174282	174291	0 %	20 %	60 %	20 %	114565720
129	NC_008346	TTATC	2	10	179435	179444	20 %	60 %	0 %	20 %	114565726
130	NC_008346	ACAAA	2	10	180390	180399	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_008346	AGAAA	2	10	181694	181703	80 %	0 %	20 %	0 %	114565727
132	NC_008346	GAAAA	2	10	183756	183765	80 %	0 %	20 %	0 %	114565729
133	NC_008346	CCTGG	2	10	185772	185781	0 %	20 %	40 %	40 %	114565730
134	NC_008346	AGTGG	2	10	185860	185869	20 %	20 %	60 %	0 %	114565730
135	NC_008346	CAGAA	2	10	186227	186236	60 %	0 %	20 %	20 %	114565730
136	NC_008346	GCCAT	2	10	186892	186901	20 %	20 %	20 %	40 %	114565730
137	NC_008346	GGGCC	2	10	188578	188587	0 %	0 %	60 %	40 %	114565731
138	NC_008346	TGGAA	2	10	194943	194952	40 %	20 %	40 %	0 %	114565734
139	NC_008346	TCAGC	2	10	195342	195351	20 %	20 %	20 %	40 %	114565734
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151	NC_008346	CGCTT	2	10	212165	212174	0 %	40 %	20 %	40 %	114565742
152	NC_008346	GTTGT	2	10	213757	213766	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008346	AGTAA	2	10	215476	215485	60 %	20 %	20 %	0 %	114565743
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260	NC_008346	TGTTA	2	10	374624	374633	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_008346	CAATC	2	10	375357	375366	40 %	20 %	0 %	40 %	114565871
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