MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 7227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008346	AAGA	2	8	16	23	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008346	TTCT	2	8	540	547	0 %	75 %	0 %	25 %	114565577
3	NC_008346	TATG	2	8	568	575	25 %	50 %	25 %	0 %	114565577
4	NC_008346	AATA	2	8	644	651	75 %	25 %	0 %	0 %	114565577
5	NC_008346	CGAC	2	8	778	785	25 %	0 %	25 %	50 %	114565577
6	NC_008346	GGAG	2	8	982	989	25 %	0 %	75 %	0 %	114565577
7	NC_008346	ATGC	2	8	1289	1296	25 %	25 %	25 %	25 %	114565577
8	NC_008346	GAAA	2	8	2683	2690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008346	GATA	2	8	2691	2698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008346	ACCG	2	8	3014	3021	25 %	0 %	25 %	50 %	114565579
11	NC_008346	ATTT	2	8	3129	3136	25 %	75 %	0 %	0 %	114565579
12	NC_008346	TAAT	2	8	3219	3226	50 %	50 %	0 %	0 %	114565579
13	NC_008346	CTTT	2	8	3359	3366	0 %	75 %	0 %	25 %	114565579
14	NC_008346	TTTG	2	8	3561	3568	0 %	75 %	25 %	0 %	114565579
15	NC_008346	AAGA	2	8	4795	4802	75 %	0 %	25 %	0 %	114565581
16	NC_008346	CCCT	2	8	5264	5271	0 %	25 %	0 %	75 %	114565581
17	NC_008346	GGAG	2	8	5328	5335	25 %	0 %	75 %	0 %	114565581
18	NC_008346	AAGG	2	8	5360	5367	50 %	0 %	50 %	0 %	114565581
19	NC_008346	TTAC	2	8	5584	5591	25 %	50 %	0 %	25 %	114565581
20	NC_008346	ACCA	2	8	7650	7657	50 %	0 %	0 %	50 %	114565582
21	NC_008346	AAAG	2	8	7820	7827	75 %	0 %	25 %	0 %	114565582
22	NC_008346	GGGA	2	8	8454	8461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008346	TAAT	2	8	9858	9865	50 %	50 %	0 %	0 %	114565584
24	NC_008346	GGAA	2	8	9871	9878	50 %	0 %	50 %	0 %	114565584
25	NC_008346	GAAA	2	8	11007	11014	75 %	0 %	25 %	0 %	114565585
26	NC_008346	TGAT	2	8	11641	11648	25 %	50 %	25 %	0 %	114565585
27	NC_008346	GAAT	2	8	12746	12753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008346	CATT	2	8	13321	13328	25 %	50 %	0 %	25 %	114565586
29	NC_008346	CATG	2	8	15175	15182	25 %	25 %	25 %	25 %	114565587
30	NC_008346	TTGA	2	8	15256	15263	25 %	50 %	25 %	0 %	114565587
31	NC_008346	CGGC	2	8	16046	16053	0 %	0 %	50 %	50 %	114565587
32	NC_008346	TTGC	2	8	16276	16283	0 %	50 %	25 %	25 %	114565587
33	NC_008346	TTTA	2	8	17597	17604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008346	TCTA	2	8	18498	18505	25 %	50 %	0 %	25 %	114565589
35	NC_008346	AATA	2	8	19012	19019	75 %	25 %	0 %	0 %	114565590
36	NC_008346	AAAG	2	8	19513	19520	75 %	0 %	25 %	0 %	114565590
37	NC_008346	GCCG	2	8	19917	19924	0 %	0 %	50 %	50 %	114565590
38	NC_008346	GAAT	2	8	20224	20231	50 %	25 %	25 %	0 %	114565590
39	NC_008346	CGTC	2	8	20323	20330	0 %	25 %	25 %	50 %	114565591
40	NC_008346	TCAG	2	8	21142	21149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008346	GAAA	2	8	21577	21584	75 %	0 %	25 %	0 %	114565592
42	NC_008346	AAAG	2	8	21910	21917	75 %	0 %	25 %	0 %	114565592
43	NC_008346	AATC	2	8	22380	22387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008346	TCCC	2	8	22770	22777	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_008346	ATCC	2	8	23171	23178	25 %	25 %	0 %	50 %	114565593
46	NC_008346	ACAA	2	8	23259	23266	75 %	0 %	0 %	25 %	114565593
47	NC_008346	ATTA	2	8	23363	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008346	AAAT	2	8	24053	24060	75 %	25 %	0 %	0 %	114565594
49	NC_008346	GAAG	2	8	24658	24665	50 %	0 %	50 %	0 %	114565595
50	NC_008346	TTGG	2	8	25173	25180	0 %	50 %	50 %	0 %	114565596
51	NC_008346	TGGG	2	8	25222	25229	0 %	25 %	75 %	0 %	114565596
52	NC_008346	TACA	2	8	25473	25480	50 %	25 %	0 %	25 %	114565596
53	NC_008346	GATA	2	8	25525	25532	50 %	25 %	25 %	0 %	114565597
54	NC_008346	ATGA	2	8	25586	25593	50 %	25 %	25 %	0 %	114565597
55	NC_008346	TGTT	2	8	25672	25679	0 %	75 %	25 %	0 %	114565597
56	NC_008346	ATTA	2	8	25723	25730	50 %	50 %	0 %	0 %	114565597
57	NC_008346	GAAA	2	8	26372	26379	75 %	0 %	25 %	0 %	114565597
58	NC_008346	TTTA	2	8	27096	27103	25 %	75 %	0 %	0 %	114565598
59	NC_008346	CATC	2	8	27232	27239	25 %	25 %	0 %	50 %	114565598
60	NC_008346	TCAG	2	8	27654	27661	25 %	25 %	25 %	25 %	114565598
61	NC_008346	TTTC	2	8	27880	27887	0 %	75 %	0 %	25 %	114565598
62	NC_008346	CCTT	2	8	27963	27970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008346	TTGC	2	8	28860	28867	0 %	50 %	25 %	25 %	114565599
64	NC_008346	GGTT	2	8	28997	29004	0 %	50 %	50 %	0 %	114565600
65	NC_008346	AGCA	2	8	29070	29077	50 %	0 %	25 %	25 %	114565600
66	NC_008346	AATT	2	8	29930	29937	50 %	50 %	0 %	0 %	114565600
67	NC_008346	TGCC	2	8	30543	30550	0 %	25 %	25 %	50 %	114565601
68	NC_008346	AATC	2	8	30908	30915	50 %	25 %	0 %	25 %	114565601
69	NC_008346	ACAA	2	8	30970	30977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008346	TTTG	2	8	31404	31411	0 %	75 %	25 %	0 %	114565602
71	NC_008346	CGAG	2	8	31623	31630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008346	TAAA	2	8	31672	31679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008346	CAGG	2	8	32008	32015	25 %	0 %	50 %	25 %	114565603
74	NC_008346	ATTT	2	8	32106	32113	25 %	75 %	0 %	0 %	114565603
75	NC_008346	AACT	2	8	32664	32671	50 %	25 %	0 %	25 %	114565603
76	NC_008346	AGAT	2	8	33024	33031	50 %	25 %	25 %	0 %	114565603
77	NC_008346	GCAA	2	8	33091	33098	50 %	0 %	25 %	25 %	114565603
78	NC_008346	CTTT	2	8	33235	33242	0 %	75 %	0 %	25 %	114565603
79	NC_008346	ATAA	2	8	34149	34156	75 %	25 %	0 %	0 %	114565604
80	NC_008346	CCAG	2	8	35183	35190	25 %	0 %	25 %	50 %	114565605
81	NC_008346	CCCT	2	8	35598	35605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_008346	GGAA	2	8	35923	35930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008346	TGGA	2	8	35971	35978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008346	TAAG	2	8	36873	36880	50 %	25 %	25 %	0 %	114565606
85	NC_008346	TTTA	2	8	37258	37265	25 %	75 %	0 %	0 %	114565606
86	NC_008346	CCCA	2	8	37409	37416	25 %	0 %	0 %	75 %	114565606
87	NC_008346	GCAA	2	8	37841	37848	50 %	0 %	25 %	25 %	114565607
88	NC_008346	AGAT	2	8	38434	38441	50 %	25 %	25 %	0 %	114565608
89	NC_008346	ATGG	2	8	38489	38496	25 %	25 %	50 %	0 %	114565608
90	NC_008346	TTAA	2	8	39835	39842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008346	AGGA	2	8	40170	40177	50 %	0 %	50 %	0 %	114565611
92	NC_008346	TAGA	2	8	41607	41614	50 %	25 %	25 %	0 %	114565612
93	NC_008346	TAAA	2	8	41700	41707	75 %	25 %	0 %	0 %	114565612
94	NC_008346	AACT	2	8	42251	42258	50 %	25 %	0 %	25 %	114565613
95	NC_008346	GGAA	2	8	42345	42352	50 %	0 %	50 %	0 %	114565613
96	NC_008346	TTCT	2	8	42374	42381	0 %	75 %	0 %	25 %	114565613
97	NC_008346	CTGG	2	8	42523	42530	0 %	25 %	50 %	25 %	114565614
98	NC_008346	AAAC	2	8	42591	42598	75 %	0 %	0 %	25 %	114565614
99	NC_008346	AAGG	2	8	43063	43070	50 %	0 %	50 %	0 %	114565614
100	NC_008346	TAAC	2	8	43584	43591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008346	AGTG	2	8	43783	43790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008346	TTAG	2	8	43798	43805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008346	ATGG	2	8	43945	43952	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008346	ATGG	2	8	44962	44969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008346	GGAT	2	8	45250	45257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008346	GAAA	2	8	45902	45909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008346	GGCA	2	8	48106	48113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008346	AGGT	2	8	48237	48244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008346	GCAA	2	8	48489	48496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008346	CTTT	2	8	49525	49532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008346	AATT	2	8	49687	49694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008346	AGCA	2	8	49718	49725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008346	AATT	2	8	49910	49917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008346	AGCA	2	8	49941	49948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008346	GAAG	2	8	50183	50190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008346	ACTC	2	8	50599	50606	25 %	25 %	0 %	50 %	114565615
117	NC_008346	CGCT	2	8	50820	50827	0 %	25 %	25 %	50 %	114565615
118	NC_008346	GCCT	2	8	51312	51319	0 %	25 %	25 %	50 %	114565615
119	NC_008346	CCTG	2	8	51551	51558	0 %	25 %	25 %	50 %	114565615
120	NC_008346	GAAA	2	8	52555	52562	75 %	0 %	25 %	0 %	114565616
121	NC_008346	CAAG	2	8	53350	53357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008346	CTTA	2	8	53736	53743	25 %	50 %	0 %	25 %	114565618
123	NC_008346	TGGA	2	8	54736	54743	25 %	25 %	50 %	0 %	114565619
124	NC_008346	GGGA	2	8	55049	55056	25 %	0 %	75 %	0 %	114565619
125	NC_008346	TTAC	2	8	55325	55332	25 %	50 %	0 %	25 %	114565620
126	NC_008346	ACCC	2	8	55907	55914	25 %	0 %	0 %	75 %	114565621
127	NC_008346	AAAC	2	8	56985	56992	75 %	0 %	0 %	25 %	114565622
128	NC_008346	GAAG	2	8	57157	57164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008346	CGGG	2	8	57190	57197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008346	TGCT	2	8	57290	57297	0 %	50 %	25 %	25 %	114565623
131	NC_008346	GAAA	2	8	57994	58001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008346	AGAA	2	8	58008	58015	75 %	0 %	25 %	0 %	114565624
133	NC_008346	TATT	2	8	58037	58044	25 %	75 %	0 %	0 %	114565624
134	NC_008346	GAAG	2	8	58469	58476	50 %	0 %	50 %	0 %	114565624
135	NC_008346	AATA	2	8	59259	59266	75 %	25 %	0 %	0 %	114565624
136	NC_008346	CATG	2	8	59383	59390	25 %	25 %	25 %	25 %	114565624
137	NC_008346	GATA	2	8	59528	59535	50 %	25 %	25 %	0 %	114565624
138	NC_008346	GCCC	2	8	59602	59609	0 %	0 %	25 %	75 %	114565624
139	NC_008346	GATC	2	8	59648	59655	25 %	25 %	25 %	25 %	114565624
140	NC_008346	GGAA	2	8	59992	59999	50 %	0 %	50 %	0 %	114565625
141	NC_008346	CCAG	2	8	60670	60677	25 %	0 %	25 %	50 %	114565625
142	NC_008346	GATT	2	8	60705	60712	25 %	50 %	25 %	0 %	114565625
143	NC_008346	TCGC	2	8	60889	60896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_008346	GATT	2	8	61008	61015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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