MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen chromosome

Total Repeats: 1458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008346	AAGA	2	8	16	23	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008346	GAAA	2	8	2683	2690	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008346	GATA	2	8	2691	2698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008346	GGGA	2	8	8454	8461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008346	GAAT	2	8	12746	12753	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008346	TTTA	2	8	17597	17604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008346	TCAG	2	8	21142	21149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008346	AATC	2	8	22380	22387	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008346	TCCC	2	8	22770	22777	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_008346	ATTA	2	8	23363	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008346	CCTT	2	8	27963	27970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008346	ACAA	2	8	30970	30977	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008346	CGAG	2	8	31623	31630	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008346	TAAA	2	8	31672	31679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008346	CCCT	2	8	35598	35605	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_008346	GGAA	2	8	35923	35930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008346	TGGA	2	8	35971	35978	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008346	TTAA	2	8	39835	39842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008346	TAAC	2	8	43584	43591	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008346	AGTG	2	8	43783	43790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008346	TTAG	2	8	43798	43805	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008346	ATGG	2	8	43945	43952	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008346	ATGG	2	8	44962	44969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008346	GGAT	2	8	45250	45257	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008346	GAAA	2	8	45902	45909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008346	GGCA	2	8	48106	48113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008346	AGGT	2	8	48237	48244	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008346	GCAA	2	8	48489	48496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008346	CTTT	2	8	49525	49532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008346	AATT	2	8	49687	49694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008346	AGCA	2	8	49718	49725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008346	AATT	2	8	49910	49917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008346	AGCA	2	8	49941	49948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008346	GAAG	2	8	50183	50190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008346	CAAG	2	8	53350	53357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008346	GAAG	2	8	57157	57164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008346	CGGG	2	8	57190	57197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008346	GAAA	2	8	57994	58001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008346	TCGC	2	8	60889	60896	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008346	CGCT	2	8	60946	60953	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008346	GATT	2	8	61008	61015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008346	ATTA	2	8	64810	64817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008346	TCCC	2	8	65486	65493	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44	NC_008346	AGAA	2	8	71230	71237	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008346	ATTA	2	8	74719	74726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008346	ACTT	2	8	74746	74753	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008346	TATT	2	8	74794	74801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008346	GGGT	2	8	74837	74844	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008346	AGCG	2	8	78539	78546	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008346	ATGG	2	8	78625	78632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008346	TGCC	2	8	78762	78769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008346	TGGC	2	8	83743	83750	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008346	TCTT	2	8	89723	89730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_008346	GCGG	2	8	89905	89912	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008346	CAAG	2	8	90824	90831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008346	AAAT	2	8	90929	90936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008346	AGGG	2	8	91270	91277	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008346	ATAA	2	8	97419	97426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008346	AGGA	2	8	97587	97594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008346	ATAA	2	8	103424	103431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008346	AGTA	2	8	103444	103451	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008346	AAAG	2	8	103500	103507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008346	CTTA	2	8	106217	106224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008346	TAAA	2	8	112769	112776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008346	GGCA	2	8	114425	114432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008346	ATAA	2	8	114550	114557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008346	CCAG	2	8	117335	117342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008346	TATT	2	8	117375	117382	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008346	GCTA	2	8	118408	118415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008346	TGGC	2	8	118438	118445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008346	CTAT	2	8	118579	118586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008346	GGCA	2	8	118670	118677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008346	ATTT	2	8	119306	119313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008346	GCGA	2	8	121387	121394	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008346	TATT	2	8	122383	122390	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008346	AAAG	2	8	126277	126284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008346	CGCT	2	8	143295	143302	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008346	TACA	2	8	143362	143369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008346	TAAA	2	8	143454	143461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008346	GAAA	2	8	149295	149302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008346	CTGG	2	8	149317	149324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008346	AAAT	2	8	149581	149588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008346	AGAA	2	8	154535	154542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008346	TAAT	2	8	157552	157559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008346	AAGA	2	8	161222	161229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008346	ATTA	2	8	161497	161504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008346	AAGT	2	8	161841	161848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008346	TCAG	2	8	164675	164682	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008346	TTTG	2	8	169010	169017	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008346	CAGT	2	8	169062	169069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008346	ACAA	2	8	170249	170256	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008346	AATA	2	8	172161	172168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008346	CAGG	2	8	172204	172211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008346	ACCA	2	8	173761	173768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008346	CAGC	2	8	176692	176699	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008346	GGTT	2	8	176862	176869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008346	TTTC	2	8	176911	176918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008346	TCAA	2	8	177076	177083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008346	TCAA	2	8	177102	177109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008346	ACAA	2	8	177625	177632	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008346	TATT	2	8	178440	178447	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008346	ACTT	2	8	180658	180665	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008346	GTTG	2	8	181064	181071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008346	GATG	2	8	181115	181122	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008346	TCTA	2	8	183568	183575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008346	AAAT	2	8	183586	183593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008346	GAAA	2	8	183600	183607	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008346	TTTA	2	8	184624	184631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008346	AGGG	2	8	184719	184726	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008346	TTGT	2	8	186944	186951	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008346	GTCC	2	8	187119	187126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008346	TTAA	2	8	187135	187142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008346	ATTT	2	8	193905	193912	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008346	ACAA	2	8	196627	196634	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008346	TAAA	2	8	202783	202790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008346	AGCA	2	8	203066	203073	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008346	ATTA	2	8	213702	213709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008346	CAAT	2	8	213740	213747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008346	GGCC	2	8	213818	213825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008346	CGGT	3	12	215608	215619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008346	ACAA	2	8	220678	220685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008346	TAAG	2	8	227621	227628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008346	ACGG	2	8	231542	231549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008346	ACGC	2	8	233095	233102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008346	TGGA	2	8	236737	236744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008346	CGGG	2	8	239437	239444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008346	GAGG	2	8	241037	241044	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008346	CAGC	2	8	244046	244053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008346	TTAA	2	8	249123	249130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008346	GTTA	2	8	249165	249172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008346	AAAC	2	8	252788	252795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008346	AGGA	2	8	254874	254881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008346	ATTA	2	8	260639	260646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008346	AAGG	2	8	263572	263579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008346	TTGC	2	8	268125	268132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008346	AAGG	2	8	272088	272095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008346	TGAT	2	8	280551	280558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008346	AATA	2	8	281692	281699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008346	GGCA	2	8	289305	289312	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008346	ATGG	2	8	295357	295364	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008346	AAGA	2	8	297658	297665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008346	TTTC	2	8	298163	298170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008346	CCTT	2	8	298517	298524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008346	AAAG	2	8	300365	300372	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008346	TAAT	2	8	301596	301603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008346	AAGG	2	8	302783	302790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008346	ATTT	2	8	304269	304276	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008346	AAAT	2	8	304464	304471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008346	TAGA	2	8	307648	307655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008346	ATCG	2	8	309087	309094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008346	GAAG	2	8	309115	309122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008346	CTTT	2	8	312167	312174	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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