MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 9605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008345	TCCG	2	8	99	106	0 %	25 %	25 %	50 %	114561189
2	NC_008345	ATGG	2	8	119	126	25 %	25 %	50 %	0 %	114561189
3	NC_008345	TATT	2	8	699	706	25 %	75 %	0 %	0 %	114561189
4	NC_008345	TTGG	2	8	861	868	0 %	50 %	50 %	0 %	114561189
5	NC_008345	ACCT	2	8	951	958	25 %	25 %	0 %	50 %	114561189
6	NC_008345	ACGT	2	8	999	1006	25 %	25 %	25 %	25 %	114561189
7	NC_008345	GTTA	2	8	2388	2395	25 %	50 %	25 %	0 %	114561190
8	NC_008345	TTGA	2	8	2469	2476	25 %	50 %	25 %	0 %	114561190
9	NC_008345	TATG	2	8	2498	2505	25 %	50 %	25 %	0 %	114561190
10	NC_008345	CGTT	2	8	2764	2771	0 %	50 %	25 %	25 %	114561191
11	NC_008345	AATC	2	8	3115	3122	50 %	25 %	0 %	25 %	114561191
12	NC_008345	CGAT	2	8	3608	3615	25 %	25 %	25 %	25 %	114561191
13	NC_008345	GCAA	2	8	3618	3625	50 %	0 %	25 %	25 %	114561191
14	NC_008345	CATT	2	8	3903	3910	25 %	50 %	0 %	25 %	114561192
15	NC_008345	AACA	2	8	4766	4773	75 %	0 %	0 %	25 %	114561192
16	NC_008345	ACTA	2	8	5734	5741	50 %	25 %	0 %	25 %	114561192
17	NC_008345	TACA	2	8	5920	5927	50 %	25 %	0 %	25 %	114561192
18	NC_008345	TCCA	2	8	6433	6440	25 %	25 %	0 %	50 %	114561193
19	NC_008345	GTTT	2	8	8006	8013	0 %	75 %	25 %	0 %	114561194
20	NC_008345	GGCG	2	8	8237	8244	0 %	0 %	75 %	25 %	114561194
21	NC_008345	ATGC	2	8	8247	8254	25 %	25 %	25 %	25 %	114561194
22	NC_008345	TGCT	2	8	9192	9199	0 %	50 %	25 %	25 %	114561194
23	NC_008345	ATTC	2	8	9501	9508	25 %	50 %	0 %	25 %	114561194
24	NC_008345	AAGT	2	8	9645	9652	50 %	25 %	25 %	0 %	114561195
25	NC_008345	TGCA	2	8	9724	9731	25 %	25 %	25 %	25 %	114561195
26	NC_008345	TAAA	2	8	10122	10129	75 %	25 %	0 %	0 %	114561195
27	NC_008345	ATCA	2	8	11303	11310	50 %	25 %	0 %	25 %	114561197
28	NC_008345	ACAT	2	8	11610	11617	50 %	25 %	0 %	25 %	114561197
29	NC_008345	TTGC	2	8	12591	12598	0 %	50 %	25 %	25 %	114561197
30	NC_008345	AGTT	2	8	12845	12852	25 %	50 %	25 %	0 %	114561197
31	NC_008345	TCAA	2	8	13617	13624	50 %	25 %	0 %	25 %	114561197
32	NC_008345	AGTT	2	8	13799	13806	25 %	50 %	25 %	0 %	114561197
33	NC_008345	CATT	2	8	13978	13985	25 %	50 %	0 %	25 %	114561197
34	NC_008345	GGCT	2	8	15018	15025	0 %	25 %	50 %	25 %	114561198
35	NC_008345	GTGG	2	8	15708	15715	0 %	25 %	75 %	0 %	114561200
36	NC_008345	AGCG	2	8	17023	17030	25 %	0 %	50 %	25 %	114561201
37	NC_008345	TCTT	2	8	17106	17113	0 %	75 %	0 %	25 %	114561201
38	NC_008345	GTTT	2	8	17176	17183	0 %	75 %	25 %	0 %	114561201
39	NC_008345	AAGT	2	8	17291	17298	50 %	25 %	25 %	0 %	114561201
40	NC_008345	TTGA	2	8	17613	17620	25 %	50 %	25 %	0 %	114561201
41	NC_008345	GCTG	2	8	17871	17878	0 %	25 %	50 %	25 %	114561201
42	NC_008345	CTTT	2	8	17998	18005	0 %	75 %	0 %	25 %	114561201
43	NC_008345	AGTC	2	8	18538	18545	25 %	25 %	25 %	25 %	114561201
44	NC_008345	TTTG	2	8	18769	18776	0 %	75 %	25 %	0 %	114561201
45	NC_008345	ATTT	2	8	18823	18830	25 %	75 %	0 %	0 %	114561201
46	NC_008345	TTGC	2	8	18913	18920	0 %	50 %	25 %	25 %	114561201
47	NC_008345	TACT	2	8	19922	19929	25 %	50 %	0 %	25 %	114561202
48	NC_008345	TGAT	2	8	20065	20072	25 %	50 %	25 %	0 %	114561202
49	NC_008345	AGTT	2	8	20101	20108	25 %	50 %	25 %	0 %	114561202
50	NC_008345	CTTA	2	8	20312	20319	25 %	50 %	0 %	25 %	114561202
51	NC_008345	AAGC	2	8	20340	20347	50 %	0 %	25 %	25 %	114561202
52	NC_008345	TTGA	2	8	20461	20468	25 %	50 %	25 %	0 %	114561202
53	NC_008345	ATTT	2	8	21409	21416	25 %	75 %	0 %	0 %	114561204
54	NC_008345	CATT	2	8	21785	21792	25 %	50 %	0 %	25 %	114561204
55	NC_008345	ACTG	2	8	23083	23090	25 %	25 %	25 %	25 %	114561205
56	NC_008345	CGTG	2	8	23975	23982	0 %	25 %	50 %	25 %	114561207
57	NC_008345	AATA	2	8	24072	24079	75 %	25 %	0 %	0 %	114561207
58	NC_008345	CAGT	2	8	24441	24448	25 %	25 %	25 %	25 %	114561208
59	NC_008345	AACA	2	8	25087	25094	75 %	0 %	0 %	25 %	114561208
60	NC_008345	ATGC	2	8	25237	25244	25 %	25 %	25 %	25 %	114561208
61	NC_008345	AAAT	2	8	25297	25304	75 %	25 %	0 %	0 %	114561208
62	NC_008345	TAAT	2	8	25556	25563	50 %	50 %	0 %	0 %	114561208
63	NC_008345	TAAA	2	8	25707	25714	75 %	25 %	0 %	0 %	114561208
64	NC_008345	TTTG	2	8	25827	25834	0 %	75 %	25 %	0 %	114561208
65	NC_008345	GGCC	2	8	26648	26655	0 %	0 %	50 %	50 %	114561209
66	NC_008345	TGTA	2	8	26828	26835	25 %	50 %	25 %	0 %	114561209
67	NC_008345	CAAG	2	8	27616	27623	50 %	0 %	25 %	25 %	114561210
68	NC_008345	CTTG	2	8	28709	28716	0 %	50 %	25 %	25 %	114561211
69	NC_008345	ATAA	2	8	29599	29606	75 %	25 %	0 %	0 %	114561212
70	NC_008345	CAAT	2	8	29863	29870	50 %	25 %	0 %	25 %	114561212
71	NC_008345	TTAA	2	8	30521	30528	50 %	50 %	0 %	0 %	114561213
72	NC_008345	AAGC	2	8	31955	31962	50 %	0 %	25 %	25 %	114561214
73	NC_008345	TTAA	2	8	32071	32078	50 %	50 %	0 %	0 %	114561214
74	NC_008345	GGGT	2	8	32323	32330	0 %	25 %	75 %	0 %	114561214
75	NC_008345	TATT	2	8	32394	32401	25 %	75 %	0 %	0 %	114561215
76	NC_008345	CATT	2	8	32574	32581	25 %	50 %	0 %	25 %	114561215
77	NC_008345	TCAA	2	8	33750	33757	50 %	25 %	0 %	25 %	114561217
78	NC_008345	GGTA	2	8	34711	34718	25 %	25 %	50 %	0 %	114561218
79	NC_008345	TTGG	2	8	34993	35000	0 %	50 %	50 %	0 %	114561218
80	NC_008345	GCGA	2	8	35262	35269	25 %	0 %	50 %	25 %	114561219
81	NC_008345	CAAT	2	8	35705	35712	50 %	25 %	0 %	25 %	114561220
82	NC_008345	TTGG	2	8	36779	36786	0 %	50 %	50 %	0 %	114561220
83	NC_008345	TATT	2	8	36914	36921	25 %	75 %	0 %	0 %	114561220
84	NC_008345	TCGG	2	8	37047	37054	0 %	25 %	50 %	25 %	114561221
85	NC_008345	ATGA	2	8	37260	37267	50 %	25 %	25 %	0 %	114561221
86	NC_008345	ATTA	2	8	37703	37710	50 %	50 %	0 %	0 %	114561221
87	NC_008345	TTAA	2	8	37743	37750	50 %	50 %	0 %	0 %	114561221
88	NC_008345	GCAA	2	8	37826	37833	50 %	0 %	25 %	25 %	114561221
89	NC_008345	CGGT	2	8	38092	38099	0 %	25 %	50 %	25 %	114561221
90	NC_008345	AAGT	2	8	38362	38369	50 %	25 %	25 %	0 %	114561222
91	NC_008345	AATT	2	8	38907	38914	50 %	50 %	0 %	0 %	114561222
92	NC_008345	GTTG	2	8	39043	39050	0 %	50 %	50 %	0 %	114561222
93	NC_008345	CAAG	2	8	39282	39289	50 %	0 %	25 %	25 %	114561223
94	NC_008345	ATTT	2	8	40179	40186	25 %	75 %	0 %	0 %	114561224
95	NC_008345	TGTA	2	8	40432	40439	25 %	50 %	25 %	0 %	114561224
96	NC_008345	ATAA	2	8	41039	41046	75 %	25 %	0 %	0 %	114561225
97	NC_008345	ACCA	2	8	41376	41383	50 %	0 %	0 %	50 %	114561225
98	NC_008345	ATTT	2	8	48002	48009	25 %	75 %	0 %	0 %	114561226
99	NC_008345	ATTT	2	8	48334	48341	25 %	75 %	0 %	0 %	114561226
100	NC_008345	TGTT	2	8	48701	48708	0 %	75 %	25 %	0 %	114561226
101	NC_008345	TCTG	2	8	48766	48773	0 %	50 %	25 %	25 %	114561226
102	NC_008345	ATTA	2	8	49149	49156	50 %	50 %	0 %	0 %	114561226
103	NC_008345	AGCA	2	8	49481	49488	50 %	0 %	25 %	25 %	114561226
104	NC_008345	AGCT	2	8	50081	50088	25 %	25 %	25 %	25 %	114561226
105	NC_008345	AATT	2	8	50294	50301	50 %	50 %	0 %	0 %	114561226
106	NC_008345	AGTC	2	8	50645	50652	25 %	25 %	25 %	25 %	114561227
107	NC_008345	TGAG	2	8	50876	50883	25 %	25 %	50 %	0 %	114561227
108	NC_008345	CTTG	2	8	51347	51354	0 %	50 %	25 %	25 %	114561228
109	NC_008345	TGCA	2	8	51649	51656	25 %	25 %	25 %	25 %	114561228
110	NC_008345	TGTT	2	8	52621	52628	0 %	75 %	25 %	0 %	114561228
111	NC_008345	TATC	2	8	53031	53038	25 %	50 %	0 %	25 %	114561228
112	NC_008345	GTGA	2	8	53050	53057	25 %	25 %	50 %	0 %	114561228
113	NC_008345	GATA	2	8	53364	53371	50 %	25 %	25 %	0 %	114561229
114	NC_008345	GCAA	2	8	53985	53992	50 %	0 %	25 %	25 %	114561229
115	NC_008345	ATTG	2	8	54174	54181	25 %	50 %	25 %	0 %	114561229
116	NC_008345	CAAG	2	8	54841	54848	50 %	0 %	25 %	25 %	114561230
117	NC_008345	CGTT	2	8	55186	55193	0 %	50 %	25 %	25 %	114561230
118	NC_008345	AAAT	2	8	55234	55241	75 %	25 %	0 %	0 %	114561230
119	NC_008345	TAAT	2	8	55417	55424	50 %	50 %	0 %	0 %	114561230
120	NC_008345	TTTG	2	8	56264	56271	0 %	75 %	25 %	0 %	114561231
121	NC_008345	TTAG	2	8	56554	56561	25 %	50 %	25 %	0 %	114561231
122	NC_008345	AATA	2	8	56739	56746	75 %	25 %	0 %	0 %	114561231
123	NC_008345	AAAT	2	8	57261	57268	75 %	25 %	0 %	0 %	114561232
124	NC_008345	GATG	2	8	57299	57306	25 %	25 %	50 %	0 %	114561232
125	NC_008345	CTTG	2	8	57783	57790	0 %	50 %	25 %	25 %	114561232
126	NC_008345	CCGT	2	8	58088	58095	0 %	25 %	25 %	50 %	114561232
127	NC_008345	ACAA	2	8	58211	58218	75 %	0 %	0 %	25 %	114561232
128	NC_008345	ATGA	2	8	58261	58268	50 %	25 %	25 %	0 %	114561232
129	NC_008345	TAGA	2	8	58387	58394	50 %	25 %	25 %	0 %	114561232
130	NC_008345	AAAT	2	8	58408	58415	75 %	25 %	0 %	0 %	114561232
131	NC_008345	TTAA	2	8	58695	58702	50 %	50 %	0 %	0 %	114561233
132	NC_008345	GCGG	2	8	58935	58942	0 %	0 %	75 %	25 %	114561233
133	NC_008345	TGGA	2	8	59272	59279	25 %	25 %	50 %	0 %	114561233
134	NC_008345	TCAG	2	8	59579	59586	25 %	25 %	25 %	25 %	114561234
135	NC_008345	TTAA	2	8	59637	59644	50 %	50 %	0 %	0 %	114561234
136	NC_008345	TTGC	2	8	59882	59889	0 %	50 %	25 %	25 %	114561235
137	NC_008345	TAAT	2	8	59949	59956	50 %	50 %	0 %	0 %	114561235
138	NC_008345	TTAA	2	8	59978	59985	50 %	50 %	0 %	0 %	114561235
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