MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 9033

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008345	TGC	2	6	2559	2564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008345	CTT	2	6	2572	2577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008345	CTA	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008345	TAA	2	6	10507	10512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008345	TTA	2	6	11100	11105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008345	ACA	2	6	14510	14515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008345	TAT	3	9	15427	15435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008345	AGA	2	6	15483	15488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008345	CAG	2	6	18984	18989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008345	ACA	2	6	19045	19050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008345	ATC	2	6	19079	19084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008345	GCA	2	6	21123	21128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008345	GTT	2	6	23208	23213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008345	TGT	2	6	23224	23229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008345	AGT	2	6	23238	23243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008345	CAT	2	6	23640	23645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008345	AAT	2	6	23748	23753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008345	TCA	2	6	24343	24348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008345	TAA	2	6	30148	30153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008345	GTT	2	6	31300	31305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008345	CAA	2	6	31339	31344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008345	AGG	2	6	32855	32860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008345	CCT	2	6	32866	32871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_008345	TTA	2	6	35481	35486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008345	ATT	2	6	35540	35545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008345	ATC	2	6	40636	40641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008345	GTA	2	6	40657	40662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008345	AAT	2	6	40749	40754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008345	ATA	2	6	40761	40766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008345	ATT	2	6	40842	40847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008345	TAT	2	6	40848	40853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008345	GTG	2	6	41588	41593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008345	TCT	2	6	41859	41864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008345	TTC	2	6	41866	41871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008345	ATT	2	6	41939	41944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008345	TTC	2	6	41949	41954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008345	GGC	2	6	42053	42058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008345	GCG	2	6	42117	42122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008345	AGG	2	6	42212	42217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008345	CGA	2	6	42292	42297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008345	GAT	2	6	42317	42322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008345	GCA	2	6	42366	42371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008345	GAA	2	6	42425	42430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008345	GGA	2	6	42461	42466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008345	TAA	2	6	42479	42484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008345	AGA	2	6	42508	42513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008345	CAG	2	6	42534	42539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008345	GGA	2	6	42725	42730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008345	GGC	2	6	42745	42750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008345	GAA	2	6	42988	42993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008345	AGA	2	6	43017	43022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008345	TGC	2	6	43064	43069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008345	GTC	2	6	43076	43081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008345	TGG	2	6	43154	43159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008345	GGA	2	6	43190	43195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008345	GAC	2	6	43203	43208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_008345	TCA	2	6	43215	43220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008345	CGT	2	6	43309	43314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008345	AAG	2	6	43446	43451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008345	CAC	2	6	43480	43485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008345	CCT	2	6	43551	43556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008345	CTT	2	6	43627	43632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008345	GTT	2	6	43670	43675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008345	ATG	2	6	43721	43726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008345	TAA	2	6	44009	44014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008345	TAA	2	6	44040	44045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008345	GGA	2	6	44159	44164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008345	TAG	2	6	44188	44193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008345	TCC	2	6	44355	44360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008345	GGA	2	6	44665	44670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008345	TAC	2	6	44869	44874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008345	AAC	2	6	44919	44924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008345	AGC	2	6	45009	45014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008345	CAT	2	6	45015	45020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008345	ACC	2	6	45087	45092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_008345	GCG	2	6	45387	45392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008345	GGT	2	6	45411	45416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008345	TGA	2	6	45473	45478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008345	TGA	2	6	45492	45497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008345	AGT	2	6	45498	45503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008345	TCT	2	6	45526	45531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008345	GGT	2	6	45572	45577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008345	GCT	2	6	45660	45665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008345	CGG	2	6	45853	45858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_008345	ATG	2	6	45929	45934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008345	ACC	2	6	46124	46129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_008345	TGG	2	6	46184	46189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008345	TCC	2	6	46210	46215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008345	GGA	2	6	46227	46232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008345	GGT	2	6	46347	46352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008345	CGG	2	6	46434	46439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008345	TCA	2	6	46462	46467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008345	CGT	2	6	46542	46547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008345	GAT	2	6	46582	46587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008345	GCT	2	6	46596	46601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008345	ACT	2	6	46774	46779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008345	ATT	3	9	46956	46964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008345	GAA	2	6	46976	46981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008345	CAC	2	6	47029	47034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_008345	TTG	2	6	47191	47196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008345	CTC	2	6	47257	47262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_008345	TGA	2	6	47332	47337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008345	TGA	2	6	47356	47361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008345	TCA	2	6	47413	47418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008345	CGA	2	6	47612	47617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_008345	TAA	2	6	47737	47742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008345	TTA	2	6	51277	51282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008345	CAT	2	6	53303	53308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008345	GCT	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008345	TCC	2	6	55817	55822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_008345	AAT	2	6	55941	55946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008345	GCA	2	6	55958	55963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008345	ATT	2	6	55985	55990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008345	CAT	2	6	56785	56790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008345	TAA	2	6	56795	56800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008345	TCA	2	6	58550	58555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008345	TGA	2	6	58582	58587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008345	TAT	2	6	58600	58605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008345	AAC	2	6	58607	58612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008345	TAA	2	6	58623	58628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008345	GCA	2	6	59350	59355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008345	TGC	2	6	59378	59383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008345	ATT	2	6	59500	59505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008345	AGT	2	6	63410	63415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008345	TGA	2	6	65911	65916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008345	ATT	3	9	65925	65933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008345	AAC	2	6	65946	65951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008345	AGG	2	6	66054	66059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008345	TGA	2	6	72938	72943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008345	TTG	2	6	74670	74675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008345	TGC	2	6	74700	74705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008345	TAA	2	6	74714	74719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008345	GAT	2	6	74759	74764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008345	ATT	2	6	74812	74817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008345	TTG	2	6	75293	75298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008345	CAT	2	6	76227	76232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_008345	CAG	2	6	76234	76239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_008345	ATT	2	6	76427	76432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008345	AAC	2	6	76439	76444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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