MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 55462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008345	CAA	2	6	41	46	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561189
2	NC_008345	ATT	2	6	371	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561189
3	NC_008345	GCA	2	6	390	395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561189
4	NC_008345	AGC	2	6	457	462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561189
5	NC_008345	TGG	2	6	487	492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561189
6	NC_008345	GGC	2	6	518	523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561189
7	NC_008345	ATT	2	6	569	574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561189
8	NC_008345	AAT	2	6	578	583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561189
9	NC_008345	GTG	2	6	596	601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561189
10	NC_008345	GAA	2	6	662	667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
11	NC_008345	TTA	2	6	676	681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561189
12	NC_008345	AAG	2	6	744	749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
13	NC_008345	ATC	2	6	786	791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561189
14	NC_008345	ATT	2	6	794	799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561189
15	NC_008345	ATA	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561189
16	NC_008345	AGA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
17	NC_008345	TAC	2	6	1160	1165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561189
18	NC_008345	TGG	2	6	1291	1296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561189
19	NC_008345	GAA	2	6	1349	1354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
20	NC_008345	AGA	2	6	1369	1374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561189
21	NC_008345	TCT	2	6	1400	1405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561189
22	NC_008345	GCG	2	6	1480	1485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561190
23	NC_008345	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561190
24	NC_008345	TCA	2	6	1545	1550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561190
25	NC_008345	TGG	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561190
26	NC_008345	ACG	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561190
27	NC_008345	AAC	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561190
28	NC_008345	ATA	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561190
29	NC_008345	CCG	2	6	1762	1767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561190
30	NC_008345	ATT	2	6	1839	1844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561190
31	NC_008345	TTA	2	6	1883	1888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561190
32	NC_008345	GGT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561190
33	NC_008345	GAC	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561190
34	NC_008345	CCG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561190
35	NC_008345	CAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561190
36	NC_008345	AAT	2	6	2310	2315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561190
37	NC_008345	AAG	3	9	2323	2331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561190
38	NC_008345	AGA	2	6	2333	2338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561190
39	NC_008345	ATT	2	6	2340	2345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561190
40	NC_008345	AAC	2	6	2412	2417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561190
41	NC_008345	TGA	2	6	2426	2431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561190
42	NC_008345	AGA	3	9	2486	2494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561190
43	NC_008345	CTT	2	6	2748	2753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561191
44	NC_008345	AAT	2	6	2800	2805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561191
45	NC_008345	GAT	3	9	2806	2814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561191
46	NC_008345	CGT	2	6	2872	2877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561191
47	NC_008345	GTG	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561191
48	NC_008345	TTA	2	6	2963	2968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561191
49	NC_008345	CCG	2	6	3009	3014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114561191
50	NC_008345	CTA	2	6	3220	3225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561191
51	NC_008345	ATT	2	6	3441	3446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561191
52	NC_008345	ACA	2	6	3486	3491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561191
53	NC_008345	CGA	2	6	3519	3524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561191
54	NC_008345	AAC	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561191
55	NC_008345	TTC	2	6	3735	3740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
56	NC_008345	TGA	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
57	NC_008345	TCA	2	6	3825	3830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561192
58	NC_008345	GAA	2	6	3967	3972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561192
59	NC_008345	TTA	2	6	3995	4000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561192
60	NC_008345	TGA	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
61	NC_008345	TGG	2	6	4053	4058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
62	NC_008345	AGT	2	6	4231	4236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
63	NC_008345	TTG	2	6	4388	4393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561192
64	NC_008345	GGT	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
65	NC_008345	GTG	2	6	4574	4579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
66	NC_008345	TGA	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
67	NC_008345	TTG	2	6	4829	4834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561192
68	NC_008345	TTG	2	6	4841	4846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561192
69	NC_008345	TGC	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
70	NC_008345	GCG	2	6	4867	4872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561192
71	NC_008345	CGT	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
72	NC_008345	GGT	2	6	4918	4923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
73	NC_008345	CTG	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
74	NC_008345	TTC	2	6	5045	5050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
75	NC_008345	AAG	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561192
76	NC_008345	CAT	4	12	5193	5204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561192
77	NC_008345	CTT	3	9	5253	5261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
78	NC_008345	ACC	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561192
79	NC_008345	ATT	2	6	5494	5499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561192
80	NC_008345	TGT	2	6	5543	5548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561192
81	NC_008345	TGA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561192
82	NC_008345	TAT	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561192
83	NC_008345	CTT	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
84	NC_008345	GAA	2	6	5821	5826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561192
85	NC_008345	GGT	2	6	5827	5832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
86	NC_008345	GTG	2	6	5843	5848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561192
87	NC_008345	AAG	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561192
88	NC_008345	CTT	2	6	5871	5876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561192
89	NC_008345	CGT	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
90	NC_008345	GCT	2	6	6031	6036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
91	NC_008345	CGT	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561192
92	NC_008345	ACC	2	6	6305	6310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561193
93	NC_008345	CAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561193
94	NC_008345	AAT	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561193
95	NC_008345	CGA	2	6	6580	6585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561193
96	NC_008345	TAC	2	6	6609	6614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561193
97	NC_008345	TGT	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561193
98	NC_008345	CAA	2	6	6707	6712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561193
99	NC_008345	CAA	2	6	6734	6739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561193
100	NC_008345	TTA	2	6	6750	6755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561193
101	NC_008345	ATG	2	6	6912	6917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561193
102	NC_008345	TGG	2	6	6945	6950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114561193
103	NC_008345	AAC	2	6	6978	6983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561193
104	NC_008345	TGA	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561193
105	NC_008345	ATT	2	6	7154	7159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561193
106	NC_008345	GAA	2	6	7241	7246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561193
107	NC_008345	ATT	2	6	7421	7426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561194
108	NC_008345	GCA	2	6	7427	7432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561194
109	NC_008345	TAA	2	6	7476	7481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561194
110	NC_008345	TCA	2	6	7507	7512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561194
111	NC_008345	TTG	2	6	7584	7589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561194
112	NC_008345	CTG	2	6	7661	7666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561194
113	NC_008345	GCT	2	6	7750	7755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561194
114	NC_008345	CAG	2	6	7817	7822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561194
115	NC_008345	GAC	2	6	7832	7837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114561194
116	NC_008345	CAT	2	6	7922	7927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561194
117	NC_008345	GCG	2	6	8046	8051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561194
118	NC_008345	TTC	2	6	8196	8201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561194
119	NC_008345	GTT	3	9	8361	8369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561194
120	NC_008345	GTT	2	6	8435	8440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561194
121	NC_008345	AGA	2	6	8507	8512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114561194
122	NC_008345	ACT	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561194
123	NC_008345	TGT	2	6	8566	8571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561194
124	NC_008345	TTC	2	6	8706	8711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561194
125	NC_008345	CTT	2	6	8756	8761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561194
126	NC_008345	AGT	2	6	8764	8769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561194
127	NC_008345	ACC	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114561194
128	NC_008345	TGC	2	6	8802	8807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561194
129	NC_008345	GCT	2	6	8809	8814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561194
130	NC_008345	AAT	2	6	8891	8896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561194
131	NC_008345	AAT	2	6	8949	8954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561194
132	NC_008345	TAA	2	6	9003	9008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114561194
133	NC_008345	TGT	2	6	9047	9052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561194
134	NC_008345	TGC	2	6	9234	9239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561194
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253	NC_008345	CAA	2	6	18715	18720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561201
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255	NC_008345	GGC	2	6	18788	18793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114561201
256	NC_008345	TTG	2	6	19349	19354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114561202
257	NC_008345	ATG	2	6	19426	19431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561202
258	NC_008345	ATC	2	6	19612	19617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561202
259	NC_008345	ATG	2	6	19708	19713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114561202
260	NC_008345	TCG	2	6	19960	19965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561202
261	NC_008345	ATT	2	6	19989	19994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561202
262	NC_008345	CTG	2	6	20092	20097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561202
263	NC_008345	TGC	2	6	20216	20221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114561202
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276	NC_008345	ATT	2	6	21193	21198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114561204
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286	NC_008345	CTT	2	6	21715	21720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114561204
287	NC_008345	TAC	2	6	21724	21729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114561204
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375	NC_008345	CAA	2	6	27498	27503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114561210
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