MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella frigidimarina NCIMB 400 chromosome

Total Repeats: 5397

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008345	AG	3	6	937	942	50 %	0 %	50 %	0 %	114561189
2	NC_008345	GC	3	6	2037	2042	0 %	0 %	50 %	50 %	114561190
3	NC_008345	GA	3	6	3704	3709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008345	AT	4	8	4975	4982	50 %	50 %	0 %	0 %	114561192
5	NC_008345	CA	3	6	5228	5233	50 %	0 %	0 %	50 %	114561192
6	NC_008345	GT	3	6	6637	6642	0 %	50 %	50 %	0 %	114561193
7	NC_008345	GC	3	6	7046	7051	0 %	0 %	50 %	50 %	114561193
8	NC_008345	AT	3	6	7724	7729	50 %	50 %	0 %	0 %	114561194
9	NC_008345	GT	3	6	8483	8488	0 %	50 %	50 %	0 %	114561194
10	NC_008345	TG	3	6	9018	9023	0 %	50 %	50 %	0 %	114561194
11	NC_008345	GC	3	6	9094	9099	0 %	0 %	50 %	50 %	114561194
12	NC_008345	GT	3	6	11704	11709	0 %	50 %	50 %	0 %	114561197
13	NC_008345	TA	3	6	12883	12888	50 %	50 %	0 %	0 %	114561197
14	NC_008345	AT	3	6	12951	12956	50 %	50 %	0 %	0 %	114561197
15	NC_008345	TA	3	6	13525	13530	50 %	50 %	0 %	0 %	114561197
16	NC_008345	TA	3	6	14027	14032	50 %	50 %	0 %	0 %	114561197
17	NC_008345	TA	3	6	14047	14052	50 %	50 %	0 %	0 %	114561197
18	NC_008345	TG	3	6	14739	14744	0 %	50 %	50 %	0 %	114561198
19	NC_008345	CG	3	6	15856	15861	0 %	0 %	50 %	50 %	114561200
20	NC_008345	CA	3	6	16567	16572	50 %	0 %	0 %	50 %	114561200
21	NC_008345	CG	3	6	17815	17820	0 %	0 %	50 %	50 %	114561201
22	NC_008345	AG	3	6	18798	18803	50 %	0 %	50 %	0 %	114561201
23	NC_008345	AC	3	6	20040	20045	50 %	0 %	0 %	50 %	114561202
24	NC_008345	TA	3	6	20049	20054	50 %	50 %	0 %	0 %	114561202
25	NC_008345	GA	3	6	20444	20449	50 %	0 %	50 %	0 %	114561202
26	NC_008345	TA	3	6	21237	21242	50 %	50 %	0 %	0 %	114561204
27	NC_008345	GT	3	6	22382	22387	0 %	50 %	50 %	0 %	114561204
28	NC_008345	AT	3	6	22917	22922	50 %	50 %	0 %	0 %	114561205
29	NC_008345	TA	3	6	23577	23582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008345	AT	3	6	23670	23675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008345	GA	3	6	25799	25804	50 %	0 %	50 %	0 %	114561208
32	NC_008345	AT	3	6	26127	26132	50 %	50 %	0 %	0 %	114561209
33	NC_008345	CG	3	6	26428	26433	0 %	0 %	50 %	50 %	114561209
34	NC_008345	CG	3	6	26634	26639	0 %	0 %	50 %	50 %	114561209
35	NC_008345	GC	3	6	27296	27301	0 %	0 %	50 %	50 %	114561210
36	NC_008345	AC	3	6	28386	28391	50 %	0 %	0 %	50 %	114561210
37	NC_008345	AC	4	8	28584	28591	50 %	0 %	0 %	50 %	114561211
38	NC_008345	AT	3	6	30039	30044	50 %	50 %	0 %	0 %	114561212
39	NC_008345	AT	3	6	30777	30782	50 %	50 %	0 %	0 %	114561213
40	NC_008345	CT	3	6	31510	31515	0 %	50 %	0 %	50 %	114561214
41	NC_008345	AG	3	6	32537	32542	50 %	0 %	50 %	0 %	114561215
42	NC_008345	CA	3	6	35969	35974	50 %	0 %	0 %	50 %	114561220
43	NC_008345	TG	3	6	37068	37073	0 %	50 %	50 %	0 %	114561221
44	NC_008345	TG	3	6	38535	38540	0 %	50 %	50 %	0 %	114561222
45	NC_008345	GT	3	6	39310	39315	0 %	50 %	50 %	0 %	114561223
46	NC_008345	TA	3	6	40791	40796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008345	CG	3	6	41324	41329	0 %	0 %	50 %	50 %	114561225
48	NC_008345	TG	3	6	41821	41826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008345	GT	3	6	42419	42424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008345	AC	3	6	43241	43246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008345	AC	3	6	43410	43415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008345	CA	3	6	43608	43613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008345	AC	3	6	43648	43653	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008345	TG	3	6	43740	43745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008345	GA	3	6	45362	45367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008345	GA	3	6	45602	45607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008345	CT	3	6	46753	46758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008345	GT	3	6	46795	46800	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008345	TG	3	6	47230	47235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008345	AT	3	6	47495	47500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008345	GT	3	6	47713	47718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008345	AT	3	6	47826	47831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008345	TG	3	6	48534	48539	0 %	50 %	50 %	0 %	114561226
64	NC_008345	AT	3	6	49689	49694	50 %	50 %	0 %	0 %	114561226
65	NC_008345	TG	3	6	50994	50999	0 %	50 %	50 %	0 %	114561227
66	NC_008345	TA	3	6	51089	51094	50 %	50 %	0 %	0 %	114561227
67	NC_008345	AT	3	6	52370	52375	50 %	50 %	0 %	0 %	114561228
68	NC_008345	CG	3	6	54692	54697	0 %	0 %	50 %	50 %	114561230
69	NC_008345	GC	3	6	55124	55129	0 %	0 %	50 %	50 %	114561230
70	NC_008345	AT	3	6	56315	56320	50 %	50 %	0 %	0 %	114561231
71	NC_008345	CA	3	6	59094	59099	50 %	0 %	0 %	50 %	114561233
72	NC_008345	AT	3	6	59525	59530	50 %	50 %	0 %	0 %	114561234
73	NC_008345	TA	3	6	59769	59774	50 %	50 %	0 %	0 %	114561234
74	NC_008345	AT	3	6	61029	61034	50 %	50 %	0 %	0 %	114561235
75	NC_008345	GC	3	6	61947	61952	0 %	0 %	50 %	50 %	114561235
76	NC_008345	GT	3	6	63239	63244	0 %	50 %	50 %	0 %	114561236
77	NC_008345	AT	3	6	63395	63400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008345	TC	3	6	63497	63502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008345	AT	3	6	64514	64519	50 %	50 %	0 %	0 %	114561238
80	NC_008345	AC	3	6	66192	66197	50 %	0 %	0 %	50 %	114561240
81	NC_008345	TG	3	6	66405	66410	0 %	50 %	50 %	0 %	114561240
82	NC_008345	CG	3	6	67606	67611	0 %	0 %	50 %	50 %	114561242
83	NC_008345	CA	3	6	68417	68422	50 %	0 %	0 %	50 %	114561242
84	NC_008345	GT	3	6	68764	68769	0 %	50 %	50 %	0 %	114561242
85	NC_008345	TG	3	6	69072	69077	0 %	50 %	50 %	0 %	114561242
86	NC_008345	AT	4	8	69202	69209	50 %	50 %	0 %	0 %	114561243
87	NC_008345	GT	3	6	70076	70081	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008345	GT	3	6	70333	70338	0 %	50 %	50 %	0 %	114561245
89	NC_008345	TG	3	6	71342	71347	0 %	50 %	50 %	0 %	114561245
90	NC_008345	GT	3	6	71452	71457	0 %	50 %	50 %	0 %	114561245
91	NC_008345	TG	3	6	72977	72982	0 %	50 %	50 %	0 %	114561246
92	NC_008345	TG	3	6	73412	73417	0 %	50 %	50 %	0 %	114561246
93	NC_008345	GC	3	6	73758	73763	0 %	0 %	50 %	50 %	114561247
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95	NC_008345	CG	3	6	74402	74407	0 %	0 %	50 %	50 %	114561247
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97	NC_008345	AT	3	6	75222	75227	50 %	50 %	0 %	0 %	114561248
98	NC_008345	AC	3	6	75763	75768	50 %	0 %	0 %	50 %	114561249
99	NC_008345	GA	3	6	75774	75779	50 %	0 %	50 %	0 %	114561249
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101	NC_008345	TA	3	6	77191	77196	50 %	50 %	0 %	0 %	114561250
102	NC_008345	AT	3	6	77300	77305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008345	CA	3	6	77815	77820	50 %	0 %	0 %	50 %	114561251
104	NC_008345	TG	3	6	80020	80025	0 %	50 %	50 %	0 %	114561253
105	NC_008345	CG	3	6	80221	80226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008345	AG	3	6	80264	80269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008345	CA	3	6	80762	80767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008345	TG	3	6	81308	81313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008345	AT	3	6	81481	81486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008345	AG	3	6	82420	82425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008345	AC	3	6	82668	82673	50 %	0 %	0 %	50 %	114561257
112	NC_008345	TG	3	6	84287	84292	0 %	50 %	50 %	0 %	114561258
113	NC_008345	TG	3	6	85243	85248	0 %	50 %	50 %	0 %	114561259
114	NC_008345	TC	3	6	86834	86839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008345	GT	3	6	87948	87953	0 %	50 %	50 %	0 %	114561261
116	NC_008345	TA	3	6	88217	88222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008345	GC	3	6	88522	88527	0 %	0 %	50 %	50 %	114561262
118	NC_008345	TG	3	6	89766	89771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008345	GC	3	6	91320	91325	0 %	0 %	50 %	50 %	114561264
120	NC_008345	AG	3	6	93090	93095	50 %	0 %	50 %	0 %	114561266
121	NC_008345	AT	3	6	93537	93542	50 %	50 %	0 %	0 %	114561267
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123	NC_008345	CA	3	6	98109	98114	50 %	0 %	0 %	50 %	114561270
124	NC_008345	AC	3	6	98468	98473	50 %	0 %	0 %	50 %	114561270
125	NC_008345	GA	3	6	99527	99532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008345	CA	3	6	101809	101814	50 %	0 %	0 %	50 %	114561275
127	NC_008345	TA	3	6	103278	103283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008345	AC	3	6	103504	103509	50 %	0 %	0 %	50 %	114561277
129	NC_008345	AT	3	6	108363	108368	50 %	50 %	0 %	0 %	114561283
130	NC_008345	GT	3	6	109344	109349	0 %	50 %	50 %	0 %	114561285
131	NC_008345	TA	3	6	111999	112004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008345	AT	3	6	113147	113152	50 %	50 %	0 %	0 %	114561288
133	NC_008345	AT	3	6	113166	113171	50 %	50 %	0 %	0 %	114561288
134	NC_008345	AT	3	6	113532	113537	50 %	50 %	0 %	0 %	114561288
135	NC_008345	GA	3	6	116184	116189	50 %	0 %	50 %	0 %	114561290
136	NC_008345	TG	3	6	117214	117219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008345	TG	3	6	117326	117331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008345	AT	3	6	117352	117357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008345	GT	3	6	119548	119553	0 %	50 %	50 %	0 %	114561293
140	NC_008345	AC	3	6	120671	120676	50 %	0 %	0 %	50 %	114561294
141	NC_008345	CG	3	6	122121	122126	0 %	0 %	50 %	50 %	114561295
142	NC_008345	CG	3	6	122461	122466	0 %	0 %	50 %	50 %	114561295
143	NC_008345	GC	3	6	122973	122978	0 %	0 %	50 %	50 %	114561295
144	NC_008345	AT	3	6	123348	123353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008345	AG	3	6	124210	124215	50 %	0 %	50 %	0 %	114561297
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