MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008344	GTGAGT	2	12	6830	6841	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008344	AACGGC	2	12	10629	10640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008344	TAAGCA	2	12	12553	12564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008344	CACGCA	2	12	32295	32306	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008344	AGCTTA	2	12	35549	35560	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008344	ATCGAA	2	12	37408	37419	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008344	GCACCG	2	12	112446	112457	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_008344	GTTGAT	2	12	131949	131960	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008344	ATAAAT	2	12	233291	233302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008344	TAAAAA	2	12	233529	233540	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008344	TTGAAT	2	12	237001	237012	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008344	CCCTTT	2	12	289220	289231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008344	TCTTTT	2	12	312145	312156	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008344	GGTGCG	2	12	321215	321226	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008344	ATTACT	2	12	336785	336796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008344	GATAGA	2	12	362238	362249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008344	ACTGGC	2	12	380493	380504	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008344	ATCCTT	2	12	392639	392650	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008344	CAGATT	4	24	392720	392743	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_008344	TGAATA	2	12	404446	404457	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008344	TTTTTG	2	12	416515	416526	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008344	CAATAT	2	12	434492	434503	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_008344	TATGAA	2	12	471533	471544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008344	TCAGGA	2	12	480783	480794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008344	GTGTTA	2	12	488902	488913	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008344	TTCATT	2	12	548831	548842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_008344	CCTGTT	2	12	574633	574644	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008344	CTTTGA	2	12	586810	586821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008344	TGTATG	2	12	624071	624082	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008344	GAGACA	2	12	630698	630709	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008344	GTCAGG	2	12	642233	642244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008344	ACATAG	2	12	647830	647841	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_008344	AGATCA	2	12	659250	659261	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008344	CAAACA	2	12	687379	687390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008344	TTTGGG	3	18	697977	697994	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008344	ATTTGA	2	12	702968	702979	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008344	CGAATT	2	12	759101	759112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008344	CGTTCA	2	12	836554	836565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008344	AGTATT	2	12	837480	837491	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008344	CTGGGA	2	12	902402	902413	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008344	TGAATT	2	12	909779	909790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008344	GATTCA	2	12	974739	974750	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_008344	GCAATC	2	12	987130	987141	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008344	TAAAAC	2	12	1009874	1009885	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008344	TCTTTT	2	12	1014642	1014653	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008344	GAAAAG	2	12	1016332	1016343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008344	TTTTTA	2	12	1016346	1016357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008344	ACAGAT	2	12	1027087	1027098	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008344	CCAGCA	2	12	1038503	1038514	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008344	AAAATC	2	12	1051020	1051031	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_008344	TTGCCC	2	12	1064309	1064320	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008344	CATCTC	2	12	1093634	1093645	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_008344	AAAAGA	2	12	1100772	1100783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008344	AAGTTA	2	12	1135510	1135521	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008344	GCTTGA	2	12	1139712	1139723	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008344	GTATTT	2	12	1231457	1231468	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008344	TGAATG	2	12	1246815	1246826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008344	GTCCTG	2	12	1272411	1272422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008344	ATGCTC	2	12	1279931	1279942	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008344	CGGTCA	2	12	1282480	1282491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008344	AATTCC	2	12	1301558	1301569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008344	ACAGAT	2	12	1333077	1333088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008344	AAATCA	2	12	1336483	1336494	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008344	GATTAC	2	12	1340859	1340870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_008344	AATTTG	2	12	1341093	1341104	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008344	TCATTA	2	12	1343388	1343399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_008344	AGTGGT	2	12	1366391	1366402	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008344	TAAGCT	2	12	1370083	1370094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_008344	TCTTTT	2	12	1385839	1385850	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008344	GCGACA	2	12	1457976	1457987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008344	CCTCTC	2	12	1457989	1458000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_008344	GCCAAA	2	12	1462187	1462198	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008344	TACACA	2	12	1478152	1478163	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008344	CTTTTC	2	12	1485547	1485558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008344	TAAATT	2	12	1562415	1562426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008344	TACTGC	2	12	1591166	1591177	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008344	GGTTCT	2	12	1603629	1603640	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008344	CAGTTT	2	12	1655247	1655258	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008344	CTCTCC	2	12	1662708	1662719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_008344	ACACGG	2	12	1679609	1679620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008344	AACAGG	2	12	1681235	1681246	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008344	GTTTTA	3	18	1697684	1697701	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008344	CAGTAC	2	12	1711549	1711560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008344	ATGACG	2	12	1750324	1750335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008344	TCATAA	2	12	1750853	1750864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008344	GGAAAT	2	12	1751115	1751126	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008344	GATGCC	2	12	1760781	1760792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008344	ATAAAA	2	12	1794019	1794030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008344	TACCGA	2	12	1820486	1820497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_008344	TTTTTA	2	12	1847673	1847684	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008344	ATCCTG	2	12	1894708	1894719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008344	GGAAAT	2	12	1903575	1903586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008344	AGAACA	2	12	1913184	1913195	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008344	ATCCTG	2	12	1935033	1935044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008344	ACTAAC	2	12	1971284	1971295	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008344	GATGAA	2	12	1993252	1993263	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008344	ATTTGT	2	12	2016610	2016621	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008344	TCACCG	2	12	2041888	2041899	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008344	ACTAAA	2	12	2073759	2073770	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_008344	TTTTTA	2	12	2111839	2111850	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008344	TATTGA	2	12	2112061	2112072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008344	ATGTAC	2	12	2117369	2117380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_008344	CATACA	2	12	2190292	2190303	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008344	CGATGC	2	12	2254226	2254237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008344	ATGTCA	2	12	2303670	2303681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_008344	TTTAAT	2	12	2315240	2315251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008344	AAAAGA	2	12	2325401	2325412	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008344	CTGCAA	2	12	2331348	2331359	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008344	ACTGGA	2	12	2332703	2332714	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_008344	AGGTCA	2	12	2338751	2338762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008344	GATTCT	2	12	2426686	2426697	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_008344	TTGCTT	2	12	2474720	2474731	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_008344	AATTAT	2	12	2478593	2478604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008344	CAACTG	2	12	2491040	2491051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008344	ATTTGT	2	12	2501063	2501074	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008344	TGGTCA	2	12	2631110	2631121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_008344	AAAAAG	2	12	2649685	2649696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.