MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 1213

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008344	GTAA	2	8	1550	1557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008344	GTTT	2	8	5735	5742	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008344	AGTT	2	8	6494	6501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008344	TCAA	2	8	6502	6509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008344	CCAC	2	8	6781	6788	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_008344	GCAT	2	8	11213	11220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008344	TGAC	2	8	11567	11574	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008344	CACC	2	8	12502	12509	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_008344	AAAC	2	8	15082	15089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008344	AGAC	2	8	15273	15280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008344	CTCC	2	8	17423	17430	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_008344	AGCC	2	8	17538	17545	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008344	TAAC	2	8	18456	18463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008344	TGGA	2	8	21719	21726	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008344	GACG	2	8	26163	26170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008344	ACCA	2	8	27041	27048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008344	CGAG	2	8	27078	27085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008344	AGTG	2	8	27755	27762	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008344	TTCT	2	8	31330	31337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008344	TGTA	2	8	31700	31707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008344	GTGG	2	8	32401	32408	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008344	GCTT	2	8	36627	36634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008344	GTTT	2	8	37360	37367	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008344	CAAT	2	8	37495	37502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008344	CCTT	2	8	39076	39083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008344	TTTC	2	8	39599	39606	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008344	GCAT	2	8	39770	39777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008344	ATTC	2	8	39946	39953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008344	GGTC	2	8	43966	43973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008344	GAAT	2	8	44872	44879	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008344	GCCT	2	8	46309	46316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008344	GAAG	2	8	46730	46737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008344	CAGC	2	8	46768	46775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008344	CGAG	2	8	47034	47041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008344	AAGA	2	8	47213	47220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008344	AACT	2	8	47582	47589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008344	GTTG	2	8	47607	47614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008344	TGCC	2	8	48658	48665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008344	CGAA	2	8	48951	48958	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008344	GGTA	2	8	52471	52478	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008344	TTAT	2	8	55409	55416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008344	GTAG	2	8	56196	56203	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008344	CCGT	2	8	63397	63404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008344	CGCC	2	8	66169	66176	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_008344	TAGG	2	8	71241	71248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008344	ACAA	2	8	77181	77188	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008344	TCTA	2	8	79489	79496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008344	ATTT	2	8	79711	79718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008344	GGGA	2	8	84265	84272	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008344	GGCG	2	8	92272	92279	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008344	CAAT	2	8	99603	99610	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_008344	TTAA	2	8	99657	99664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008344	TGGA	2	8	99694	99701	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008344	CGCT	2	8	99851	99858	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008344	GGTA	2	8	99986	99993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008344	GTGG	2	8	102492	102499	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008344	GGTG	2	8	102873	102880	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008344	AGAA	2	8	105725	105732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008344	TGGT	2	8	107832	107839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008344	CAGC	2	8	108775	108782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008344	GGTG	2	8	109744	109751	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008344	CCGT	2	8	112343	112350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_008344	TCCT	2	8	112591	112598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008344	CAAA	2	8	114823	114830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008344	GCGT	2	8	114867	114874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008344	CGGA	2	8	114881	114888	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008344	CAGT	2	8	116877	116884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008344	GTCG	2	8	123002	123009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008344	CATA	2	8	123513	123520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008344	TACT	2	8	123642	123649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008344	TGCC	2	8	124606	124613	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008344	TGGG	2	8	131320	131327	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008344	AGGA	2	8	143587	143594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008344	TAAT	2	8	146073	146080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008344	GATA	2	8	148535	148542	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008344	ATCT	2	8	149612	149619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008344	TGCC	2	8	170644	170651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_008344	CAGC	2	8	171834	171841	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008344	TTGG	2	8	171946	171953	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008344	TGAT	2	8	173661	173668	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008344	GCCA	2	8	173698	173705	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008344	CCCT	2	8	173728	173735	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_008344	TGTC	2	8	177723	177730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008344	ATCT	2	8	177916	177923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008344	AGTA	2	8	187942	187949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008344	ATAA	2	8	194071	194078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008344	CAGG	2	8	202262	202269	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008344	ATAG	2	8	202274	202281	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008344	TGAA	2	8	203952	203959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008344	AAAC	2	8	206756	206763	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008344	CCTC	2	8	222526	222533	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_008344	AAGC	2	8	222656	222663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008344	TTGC	2	8	222743	222750	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_008344	GAAA	2	8	222757	222764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008344	AAGC	2	8	231258	231265	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008344	TAAA	2	8	231439	231446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008344	GTGA	2	8	232105	232112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008344	GAAA	2	8	232147	232154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008344	TACC	2	8	232684	232691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008344	ACCC	2	8	233768	233775	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_008344	GCAT	2	8	234155	234162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008344	GACA	2	8	234575	234582	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008344	AAAG	2	8	234717	234724	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008344	TTTA	2	8	235037	235044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008344	AAGT	2	8	235177	235184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008344	TAAA	2	8	235222	235229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008344	AAAT	2	8	236816	236823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008344	TATT	2	8	236898	236905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008344	AATG	2	8	236939	236946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008344	CTAT	2	8	237512	237519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008344	ATCA	2	8	237532	237539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008344	CAGG	2	8	237822	237829	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008344	TATT	2	8	237955	237962	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008344	ACCA	2	8	244249	244256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008344	ATTT	2	8	245088	245095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008344	CTTG	2	8	247765	247772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008344	AGGG	2	8	247787	247794	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008344	AGTT	2	8	247848	247855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008344	TGCA	2	8	250777	250784	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008344	GATA	2	8	272346	272353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008344	CATA	2	8	272912	272919	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008344	GCAA	9	36	281865	281900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008344	TCCC	2	8	281956	281963	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_008344	TTAT	2	8	289208	289215	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008344	GATA	2	8	289281	289288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008344	ACCT	2	8	298177	298184	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_008344	TTAT	6	24	299511	299534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008344	TTTA	2	8	302737	302744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008344	CTTT	2	8	304442	304449	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008344	TGAT	2	8	304461	304468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008344	TCAG	2	8	304572	304579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008344	CAGG	2	8	305399	305406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008344	GTTT	2	8	307405	307412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008344	TCAA	2	8	309819	309826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008344	AGCT	2	8	310271	310278	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008344	CCTT	2	8	310809	310816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_008344	ATCC	2	8	310870	310877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008344	GTTA	2	8	311014	311021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008344	TCCC	2	8	311246	311253	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_008344	GTTT	2	8	312766	312773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008344	TAAG	2	8	312929	312936	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008344	TGAT	2	8	315262	315269	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008344	CCGG	2	8	321612	321619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008344	CAGC	2	8	321662	321669	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008344	TGAG	2	8	323671	323678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008344	CATT	2	8	323837	323844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008344	TGTC	2	8	324140	324147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008344	GCTG	2	8	324214	324221	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008344	GATA	2	8	326776	326783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008344	GACA	2	8	333967	333974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_008344	CTGA	2	8	335898	335905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008344	TGTT	2	8	336051	336058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008344	ATTT	2	8	336205	336212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008344	TTTG	2	8	336846	336853	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008344	GCTG	2	8	337030	337037	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_008344	GTTT	2	8	337324	337331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008344	GCGA	2	8	337455	337462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
158	NC_008344	GTTT	2	8	337827	337834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008344	TGAT	2	8	341838	341845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_008344	CCAC	2	8	349486	349493	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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163	NC_008344	TCGA	2	8	360904	360911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_008344	TCTG	2	8	362128	362135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_008344	CCTG	2	8	362161	362168	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_008344	GGGA	2	8	366524	366531	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008344	ATCA	2	8	367111	367118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
171	NC_008344	AATC	2	8	367287	367294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_008344	TCAA	2	8	367450	367457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_008344	TTGA	2	8	367776	367783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_008344	TTCA	2	8	367860	367867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_008344	TTCT	2	8	379194	379201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_008344	ATTT	2	8	379258	379265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_008344	GCCC	2	8	380582	380589	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
182	NC_008344	GGTT	2	8	383822	383829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_008344	ATCA	2	8	390946	390953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_008344	TATT	2	8	391277	391284	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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190	NC_008344	TTCA	2	8	404568	404575	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
191	NC_008344	TGAT	2	8	404743	404750	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
192	NC_008344	CTTG	2	8	406144	406151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
193	NC_008344	AACC	3	12	406876	406887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_008344	ATGA	2	8	425575	425582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_008344	AATT	2	8	425748	425755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_008344	TGAT	2	8	438905	438912	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_008344	ACGA	2	8	503687	503694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
232	NC_008344	ATGG	2	8	503761	503768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
233	NC_008344	TGTA	2	8	504957	504964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_008344	CGTT	2	8	983432	983439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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450	NC_008344	CAGT	2	8	992076	992083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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484	NC_008344	TTGC	2	8	1126616	1126623	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_008344	GATT	2	8	1130506	1130513	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_008344	AGCA	2	8	1148678	1148685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_008344	AATC	2	8	1151544	1151551	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_008344	TGTA	2	8	1155731	1155738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_008344	GCTT	2	8	1156312	1156319	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
499	NC_008344	CCAT	2	8	1160009	1160016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
500	NC_008344	TTAA	2	8	1160828	1160835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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