MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 chromosome

Total Repeats: 29775

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008344	CAG	2	6	98	103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330037
2	NC_008344	CGA	2	6	226	231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330037
3	NC_008344	CAA	2	6	306	311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330037
4	NC_008344	ACC	2	6	349	354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330037
5	NC_008344	CAC	2	6	373	378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330037
6	NC_008344	GTC	2	6	638	643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330037
7	NC_008344	TGG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330037
8	NC_008344	ATG	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330037
9	NC_008344	GAA	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330037
10	NC_008344	GGA	2	6	844	849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330037
11	NC_008344	TAC	2	6	1166	1171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330037
12	NC_008344	ACA	2	6	1757	1762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330038
13	NC_008344	ACT	2	6	1954	1959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330038
14	NC_008344	ACA	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330038
15	NC_008344	GCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330038
16	NC_008344	TTA	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330038
17	NC_008344	ATT	2	6	2107	2112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330038
18	NC_008344	ACA	2	6	2124	2129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330038
19	NC_008344	CTT	2	6	2172	2177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330038
20	NC_008344	TCC	2	6	2421	2426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330038
21	NC_008344	ATT	2	6	2447	2452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330038
22	NC_008344	AGT	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330038
23	NC_008344	GAA	2	6	2537	2542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330038
24	NC_008344	GAA	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330038
25	NC_008344	AAC	2	6	2624	2629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330038
26	NC_008344	GAT	3	9	2696	2704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330038
27	NC_008344	AGT	2	6	2736	2741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330038
28	NC_008344	CCA	2	6	2820	2825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330039
29	NC_008344	CAT	2	6	2948	2953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330039
30	NC_008344	CGA	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330039
31	NC_008344	TGA	2	6	3007	3012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330039
32	NC_008344	GAT	2	6	3092	3097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330039
33	NC_008344	CTG	3	9	3111	3119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330039
34	NC_008344	TGA	2	6	3157	3162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330039
35	NC_008344	GTG	2	6	3209	3214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330039
36	NC_008344	TCA	2	6	3265	3270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330039
37	NC_008344	TCG	2	6	3516	3521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330039
38	NC_008344	GAT	2	6	3584	3589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330039
39	NC_008344	TAA	2	6	3652	3657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330039
40	NC_008344	TGG	2	6	3673	3678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330039
41	NC_008344	TGA	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330039
42	NC_008344	GGT	2	6	3883	3888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330039
43	NC_008344	GTT	2	6	3896	3901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330039
44	NC_008344	CAA	2	6	3958	3963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330039
45	NC_008344	ATT	2	6	3965	3970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330039
46	NC_008344	TGG	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330039
47	NC_008344	CGG	2	6	4126	4131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330039
48	NC_008344	TCC	2	6	4229	4234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330039
49	NC_008344	ATC	2	6	4322	4327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330039
50	NC_008344	CTG	3	9	4367	4375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330039
51	NC_008344	ACC	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330039
52	NC_008344	GAT	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330039
53	NC_008344	GAT	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330039
54	NC_008344	GTG	2	6	4863	4868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330039
55	NC_008344	AAG	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330039
56	NC_008344	ACG	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330039
57	NC_008344	CCT	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330039
58	NC_008344	TAA	2	6	5262	5267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330040
59	NC_008344	CAA	2	6	5402	5407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330040
60	NC_008344	GGC	2	6	5424	5429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330040
61	NC_008344	ATT	2	6	5497	5502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330040
62	NC_008344	TTC	2	6	5598	5603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330040
63	NC_008344	TTG	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330041
64	NC_008344	TTC	2	6	6046	6051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330041
65	NC_008344	CGG	2	6	6353	6358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330041
66	NC_008344	GGC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330042
67	NC_008344	CGA	2	6	7198	7203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330042
68	NC_008344	TGC	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330042
69	NC_008344	AGC	2	6	7389	7394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330042
70	NC_008344	GCG	2	6	7395	7400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330042
71	NC_008344	GTT	2	6	7441	7446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330042
72	NC_008344	CGT	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330042
73	NC_008344	GCC	2	6	7522	7527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330042
74	NC_008344	GCC	2	6	7529	7534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330042
75	NC_008344	TTC	2	6	7545	7550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330042
76	NC_008344	ACG	2	6	7607	7612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330042
77	NC_008344	TTA	2	6	7628	7633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330042
78	NC_008344	ATT	2	6	7709	7714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330042
79	NC_008344	GGT	2	6	7723	7728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330042
80	NC_008344	CTG	2	6	7832	7837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330042
81	NC_008344	AAG	2	6	8012	8017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114330042
82	NC_008344	CGC	2	6	8096	8101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330042
83	NC_008344	ATG	2	6	8105	8110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330042
84	NC_008344	GGC	2	6	8155	8160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330042
85	NC_008344	CAA	2	6	8209	8214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330042
86	NC_008344	ACC	2	6	8335	8340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330042
87	NC_008344	GCT	2	6	8509	8514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330042
88	NC_008344	TGC	2	6	8715	8720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330042
89	NC_008344	ACG	2	6	8865	8870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330043
90	NC_008344	GAG	2	6	8887	8892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114330043
91	NC_008344	ACG	2	6	8896	8901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330043
92	NC_008344	TCG	2	6	8945	8950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330043
93	NC_008344	TCG	2	6	8980	8985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330043
94	NC_008344	GCT	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330043
95	NC_008344	ACC	2	6	9729	9734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330044
96	NC_008344	TCG	2	6	9804	9809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330044
97	NC_008344	CTT	2	6	9874	9879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330044
98	NC_008344	TCA	2	6	9885	9890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330044
99	NC_008344	GCC	2	6	9927	9932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330044
100	NC_008344	TAA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330044
101	NC_008344	CAC	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330044
102	NC_008344	CAA	2	6	10103	10108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330044
103	NC_008344	GCA	2	6	10123	10128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330044
104	NC_008344	CAG	2	6	10301	10306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330044
105	NC_008344	TGT	2	6	10381	10386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114330044
106	NC_008344	CAC	3	9	10788	10796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330045
107	NC_008344	GCA	2	6	10840	10845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330045
108	NC_008344	ATT	2	6	10951	10956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330045
109	NC_008344	GAT	2	6	11641	11646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330046
110	NC_008344	ACG	2	6	11655	11660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330046
111	NC_008344	TGG	2	6	11940	11945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330046
112	NC_008344	GGT	2	6	12046	12051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330046
113	NC_008344	CCA	2	6	12162	12167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330046
114	NC_008344	CTA	2	6	12182	12187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330046
115	NC_008344	CCA	2	6	12198	12203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330046
116	NC_008344	CCA	2	6	12261	12266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330046
117	NC_008344	GCC	2	6	12289	12294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330046
118	NC_008344	TAA	2	6	12784	12789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114330047
119	NC_008344	TCA	2	6	12838	12843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330047
120	NC_008344	CTG	2	6	12943	12948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330047
121	NC_008344	CCA	2	6	12949	12954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330047
122	NC_008344	CTG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330047
123	NC_008344	GCA	2	6	13087	13092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330047
124	NC_008344	CAA	2	6	13121	13126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330047
125	NC_008344	GCT	2	6	13344	13349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330047
126	NC_008344	GCA	2	6	13369	13374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330047
127	NC_008344	CTG	3	9	13387	13395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330047
128	NC_008344	AAC	2	6	13506	13511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114330047
129	NC_008344	TCC	2	6	13527	13532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330047
130	NC_008344	GCG	2	6	13555	13560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330047
131	NC_008344	CTC	2	6	13604	13609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330047
132	NC_008344	GGC	2	6	13875	13880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330048
133	NC_008344	GCT	2	6	13923	13928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114330048
134	NC_008344	GGC	2	6	14079	14084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330048
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143	NC_008344	TCC	2	6	14942	14947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330049
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146	NC_008344	CGC	2	6	15872	15877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330050
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152	NC_008344	CAT	2	6	16299	16304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330050
153	NC_008344	CCA	2	6	16388	16393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330050
154	NC_008344	CAT	2	6	16552	16557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330050
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158	NC_008344	ACC	2	6	16591	16596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114330050
159	NC_008344	CAT	2	6	16597	16602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330050
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162	NC_008344	CAT	2	6	16722	16727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330050
163	NC_008344	CGC	2	6	16731	16736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330050
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240	NC_008344	ATG	2	6	26497	26502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330057
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252	NC_008344	CCT	2	6	27674	27679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330058
253	NC_008344	TGA	2	6	27803	27808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114330059
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257	NC_008344	GCA	2	6	28242	28247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330059
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370	NC_008344	CTT	2	6	41631	41636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114330072
371	NC_008344	TAT	2	6	41902	41907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114330073
372	NC_008344	TCA	2	6	42186	42191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330073
373	NC_008344	TCC	2	6	42198	42203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114330073
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375	NC_008344	ACT	2	6	42815	42820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114330074
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497	NC_008344	CAG	2	6	54017	54022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114330084
498	NC_008344	GTG	2	6	54076	54081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114330084
499	NC_008344	GCC	2	6	54123	54128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114330084
500	NC_008344	CGG	2	6	54169	54174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114330084

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