MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Granulibacter bethesdensis CGDNIH1 chromosome

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008343	ATTGCA	2	12	122709	122720	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_008343	TATTTT	2	12	219678	219689	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008343	TCTCAG	2	12	222126	222137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008343	GCTCCG	2	12	353166	353177	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008343	TTCCCG	2	12	365230	365241	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008343	CCAGCG	2	12	496081	496092	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008343	TCTGGC	2	12	544211	544222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008343	AAGCGT	2	12	563250	563261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008343	AAAAGC	2	12	619165	619176	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_008343	GGCTTA	2	12	636835	636846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008343	TCCGGT	2	12	653141	653152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008343	CCTGTT	2	12	670761	670772	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008343	AGGGCG	2	12	685189	685200	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_008343	ACGGAA	2	12	730730	730741	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008343	TAAAAT	2	12	735476	735487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008343	TCCGGC	2	12	810560	810571	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008343	TTTTTG	2	12	830535	830546	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008343	GCGATA	2	12	833371	833382	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008343	TAAAAA	2	12	871981	871992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008343	TGGCAT	2	12	911583	911594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_008343	GATGCC	2	12	995495	995506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008343	CAGCGG	2	12	1089051	1089062	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008343	TGCTGG	2	12	1089174	1089185	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_008343	CGGTTG	2	12	1098666	1098677	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_008343	ATTAAA	2	12	1110109	1110120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008343	ACTGGC	2	12	1143828	1143839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008343	AATCGG	2	12	1148895	1148906	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_008343	CGTGGT	2	12	1200338	1200349	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008343	CCAAGA	2	12	1200631	1200642	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008343	CTTTGC	2	12	1203061	1203072	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008343	ATGTGA	2	12	1207026	1207037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008343	TGAATA	2	12	1427333	1427344	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008343	CCGTAC	2	12	1454362	1454373	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008343	GCGCTG	2	12	1523996	1524007	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008343	ACTTTA	2	12	1567574	1567585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008343	GCCCGT	2	12	1593782	1593793	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008343	TAAATA	2	12	1652057	1652068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008343	TCAATA	2	12	1652225	1652236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_008343	AAAATT	2	12	1652380	1652391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008343	TCTTGC	2	12	1668579	1668590	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008343	ATCTCC	2	12	1706596	1706607	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008343	AAATAA	2	12	1710186	1710197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008343	CTTCCT	2	12	1728780	1728791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008343	AGGGAG	2	12	1762069	1762080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008343	TTTTCT	2	12	1762757	1762768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008343	TTCAGC	2	12	1764541	1764552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008343	ATATTA	2	12	1800530	1800541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008343	CATCCG	2	12	1867673	1867684	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_008343	GCCCGA	2	12	1919402	1919413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008343	TATTTT	2	12	1946121	1946132	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008343	GCGTCG	2	12	2023634	2023645	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008343	CAGCGA	2	12	2038668	2038679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008343	TTCTCC	2	12	2054206	2054217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008343	AGCCGA	2	12	2147955	2147966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008343	CCTTCG	2	12	2203265	2203276	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008343	CTGTTT	2	12	2208607	2208618	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008343	CCGGAG	2	12	2321027	2321038	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008343	CATGGC	2	12	2364977	2364988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008343	GAAGCT	2	12	2382377	2382388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_008343	CCATCG	2	12	2507137	2507148	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008343	GCAGGG	2	12	2558287	2558298	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008343	CCATGG	2	12	2561791	2561802	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.