MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Granulibacter bethesdensis CGDNIH1 chromosome

Total Repeats: 2246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008343	CGCTG	2	10	213	222	0 %	20 %	40 %	40 %	114326665
2	NC_008343	TGGCA	2	10	441	450	20 %	20 %	40 %	20 %	114326665
3	NC_008343	GCCCG	2	10	1580	1589	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4	NC_008343	GTCCT	2	10	3180	3189	0 %	40 %	20 %	40 %	114326667
5	NC_008343	GGCAT	2	10	3808	3817	20 %	20 %	40 %	20 %	114326667
6	NC_008343	GCCAT	2	10	3887	3896	20 %	20 %	20 %	40 %	114326668
7	NC_008343	ATGGG	2	10	4828	4837	20 %	20 %	60 %	0 %	114326669
8	NC_008343	AGAAA	2	10	6804	6813	80 %	0 %	20 %	0 %	114326669
9	NC_008343	GTCAT	2	10	15344	15353	20 %	40 %	20 %	20 %	114326678
10	NC_008343	GGTGG	2	10	16074	16083	0 %	20 %	80 %	0 %	114326678
11	NC_008343	CCCCG	2	10	16372	16381	0 %	0 %	20 %	80 %	114326678
12	NC_008343	TGCCG	2	10	16776	16785	0 %	20 %	40 %	40 %	114326678
13	NC_008343	GACCA	2	10	19409	19418	40 %	0 %	20 %	40 %	114326682
14	NC_008343	CTGAG	2	10	22120	22129	20 %	20 %	40 %	20 %	114326684
15	NC_008343	TCGCC	2	10	23757	23766	0 %	20 %	20 %	60 %	114326686
16	NC_008343	GTGCG	2	10	23835	23844	0 %	20 %	60 %	20 %	114326686
17	NC_008343	CACGC	2	10	24154	24163	20 %	0 %	20 %	60 %	114326686
18	NC_008343	GATCA	2	10	24622	24631	40 %	20 %	20 %	20 %	114326686
19	NC_008343	GGTCG	2	10	25888	25897	0 %	20 %	60 %	20 %	114326687
20	NC_008343	CCGCT	2	10	26170	26179	0 %	20 %	20 %	60 %	114326687
21	NC_008343	GCCTT	2	10	28264	28273	0 %	40 %	20 %	40 %	114326689
22	NC_008343	GATCT	2	10	30384	30393	20 %	40 %	20 %	20 %	114326692
23	NC_008343	CCACG	2	10	31431	31440	20 %	0 %	20 %	60 %	114326693
24	NC_008343	TCCGC	2	10	33246	33255	0 %	20 %	20 %	60 %	114326695
25	NC_008343	ATACC	2	10	34146	34155	40 %	20 %	0 %	40 %	114326696
26	NC_008343	GCCGG	2	10	35235	35244	0 %	0 %	60 %	40 %	114326696
27	NC_008343	TCGTT	2	10	37478	37487	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_008343	GTGGC	2	10	38356	38365	0 %	20 %	60 %	20 %	114326699
29	NC_008343	CGCGG	2	10	39660	39669	0 %	0 %	60 %	40 %	114326701
30	NC_008343	AGGGC	2	10	40818	40827	20 %	0 %	60 %	20 %	114326701
31	NC_008343	TCAGG	2	10	41072	41081	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_008343	GAGGG	2	10	41659	41668	20 %	0 %	80 %	0 %	114326702
33	NC_008343	CTGGT	2	10	43006	43015	0 %	40 %	40 %	20 %	114326703
34	NC_008343	TGATG	2	10	43283	43292	20 %	40 %	40 %	0 %	114326704
35	NC_008343	CCCAA	2	10	45274	45283	40 %	0 %	0 %	60 %	114326706
36	NC_008343	GCCGT	2	10	47057	47066	0 %	20 %	40 %	40 %	114326708
37	NC_008343	CCATG	2	10	47095	47104	20 %	20 %	20 %	40 %	114326708
38	NC_008343	GTCCG	2	10	48318	48327	0 %	20 %	40 %	40 %	114326710
39	NC_008343	CTGTG	2	10	48649	48658	0 %	40 %	40 %	20 %	114326710
40	NC_008343	TGAGC	2	10	50262	50271	20 %	20 %	40 %	20 %	114326711
41	NC_008343	ATCCG	2	10	53042	53051	20 %	20 %	20 %	40 %	114326713
42	NC_008343	GAAAC	2	10	53603	53612	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_008343	GGCCA	2	10	56823	56832	20 %	0 %	40 %	40 %	114326717
44	NC_008343	GTACG	2	10	58552	58561	20 %	20 %	40 %	20 %	114326718
45	NC_008343	GGCAT	2	10	61495	61504	20 %	20 %	40 %	20 %	114326720
46	NC_008343	CCGTG	2	10	62715	62724	0 %	20 %	40 %	40 %	114326722
47	NC_008343	GCATG	2	10	63244	63253	20 %	20 %	40 %	20 %	114326722
48	NC_008343	CATGA	2	10	63417	63426	40 %	20 %	20 %	20 %	114326722
49	NC_008343	CGATG	2	10	65383	65392	20 %	20 %	40 %	20 %	114326723
50	NC_008343	GGAAC	2	10	66932	66941	40 %	0 %	40 %	20 %	114326724
51	NC_008343	ACAGT	2	10	67326	67335	40 %	20 %	20 %	20 %	114326724
52	NC_008343	CTTTG	2	10	67479	67488	0 %	60 %	20 %	20 %	114326725
53	NC_008343	CTCAA	2	10	67854	67863	40 %	20 %	0 %	40 %	114326725
54	NC_008343	TCAGG	2	10	67999	68008	20 %	20 %	40 %	20 %	114326725
55	NC_008343	GAAAT	2	10	69975	69984	60 %	20 %	20 %	0 %	114326726
56	NC_008343	AAAAT	2	10	72315	72324	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008343	TGCGT	2	10	72649	72658	0 %	40 %	40 %	20 %	114326729
58	NC_008343	TGTTC	2	10	72981	72990	0 %	60 %	20 %	20 %	114326730
59	NC_008343	AGGCG	2	10	73665	73674	20 %	0 %	60 %	20 %	114326730
60	NC_008343	GCCGC	2	10	75013	75022	0 %	0 %	40 %	60 %	114326733
61	NC_008343	CGATT	2	10	75067	75076	20 %	40 %	20 %	20 %	114326733
62	NC_008343	CTGGT	2	10	75466	75475	0 %	40 %	40 %	20 %	114326733
63	NC_008343	TGGCC	2	10	75879	75888	0 %	20 %	40 %	40 %	114326734
64	NC_008343	CCAGC	2	10	75957	75966	20 %	0 %	20 %	60 %	114326734
65	NC_008343	GCCCG	2	10	76450	76459	0 %	0 %	40 %	60 %	114326735
66	NC_008343	GGCTG	2	10	78464	78473	0 %	20 %	60 %	20 %	114326736
67	NC_008343	GCCCG	2	10	82829	82838	0 %	0 %	40 %	60 %	114326739
68	NC_008343	TCCAT	2	10	83145	83154	20 %	40 %	0 %	40 %	114326739
69	NC_008343	ACGGC	2	10	83665	83674	20 %	0 %	40 %	40 %	114326739
70	NC_008343	ACGCT	2	10	85399	85408	20 %	20 %	20 %	40 %	114326741
71	NC_008343	CGGCG	2	10	86907	86916	0 %	0 %	60 %	40 %	114326742
72	NC_008343	TCACG	2	10	87294	87303	20 %	20 %	20 %	40 %	114326742
73	NC_008343	TTCAG	2	10	88923	88932	20 %	40 %	20 %	20 %	114326744
74	NC_008343	CCGGC	2	10	92186	92195	0 %	0 %	40 %	60 %	114326746
75	NC_008343	TTCGG	2	10	92636	92645	0 %	40 %	40 %	20 %	114326746
76	NC_008343	TGGGA	2	10	93856	93865	20 %	20 %	60 %	0 %	114326748
77	NC_008343	ATGGA	2	10	94225	94234	40 %	20 %	40 %	0 %	114326749
78	NC_008343	TTCCG	2	10	95111	95120	0 %	40 %	20 %	40 %	114326750
79	NC_008343	ATCAC	2	10	95833	95842	40 %	20 %	0 %	40 %	114326750
80	NC_008343	GTTTA	2	10	96411	96420	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008343	GCTGG	2	10	96448	96457	0 %	20 %	60 %	20 %	114326751
82	NC_008343	ATATG	2	10	97313	97322	40 %	40 %	20 %	0 %	114326752
83	NC_008343	TGTGC	2	10	98056	98065	0 %	40 %	40 %	20 %	114326753
84	NC_008343	AGGAA	2	10	98855	98864	60 %	0 %	40 %	0 %	114326753
85	NC_008343	ATTGC	2	10	101405	101414	20 %	40 %	20 %	20 %	114326756
86	NC_008343	CGGAT	2	10	106019	106028	20 %	20 %	40 %	20 %	114326761
87	NC_008343	GCCGT	2	10	106262	106271	0 %	20 %	40 %	40 %	114326761
88	NC_008343	CATGC	2	10	106376	106385	20 %	20 %	20 %	40 %	114326761
89	NC_008343	CCCGT	2	10	107523	107532	0 %	20 %	20 %	60 %	114326762
90	NC_008343	GATCA	2	10	107652	107661	40 %	20 %	20 %	20 %	114326762
91	NC_008343	CGGGC	2	10	107823	107832	0 %	0 %	60 %	40 %	114326762
92	NC_008343	GGCCC	2	10	109673	109682	0 %	0 %	40 %	60 %	114326766
93	NC_008343	CTGGA	2	10	110315	110324	20 %	20 %	40 %	20 %	114326766
94	NC_008343	CCGAC	2	10	112303	112312	20 %	0 %	20 %	60 %	114326769
95	NC_008343	GGCAG	2	10	112792	112801	20 %	0 %	60 %	20 %	114326769
96	NC_008343	CATGC	2	10	113687	113696	20 %	20 %	20 %	40 %	114326770
97	NC_008343	GGCCC	2	10	113887	113896	0 %	0 %	40 %	60 %	114326771
98	NC_008343	GGGAC	2	10	115186	115195	20 %	0 %	60 %	20 %	114326772
99	NC_008343	CCCGC	2	10	115436	115445	0 %	0 %	20 %	80 %	114326772
100	NC_008343	AGCTG	2	10	115965	115974	20 %	20 %	40 %	20 %	114326772
101	NC_008343	GCATG	2	10	119296	119305	20 %	20 %	40 %	20 %	114326774
102	NC_008343	TGCTG	2	10	120121	120130	0 %	40 %	40 %	20 %	114326774
103	NC_008343	AGCCG	2	10	127386	127395	20 %	0 %	40 %	40 %	114326781
104	NC_008343	CGCGT	2	10	127587	127596	0 %	20 %	40 %	40 %	114326781
105	NC_008343	CGGGG	2	10	128366	128375	0 %	0 %	80 %	20 %	114326782
106	NC_008343	GAAAC	2	10	130218	130227	60 %	0 %	20 %	20 %	114326783
107	NC_008343	GGCCG	2	10	130415	130424	0 %	0 %	60 %	40 %	114326783
108	NC_008343	GTCAG	2	10	132695	132704	20 %	20 %	40 %	20 %	114326784
109	NC_008343	TCCCG	2	10	134015	134024	0 %	20 %	20 %	60 %	114326785
110	NC_008343	CGGGC	2	10	135327	135336	0 %	0 %	60 %	40 %	114326785
111	NC_008343	CGCGG	2	10	135667	135676	0 %	0 %	60 %	40 %	114326785
112	NC_008343	CGATC	2	10	135700	135709	20 %	20 %	20 %	40 %	114326785
113	NC_008343	GGCTG	2	10	138344	138353	0 %	20 %	60 %	20 %	114326786
114	NC_008343	GGCGT	2	10	138585	138594	0 %	20 %	60 %	20 %	114326786
115	NC_008343	GGTGG	2	10	139139	139148	0 %	20 %	80 %	0 %	114326787
116	NC_008343	TTTCG	2	10	141300	141309	0 %	60 %	20 %	20 %	114326789
117	NC_008343	GCTCG	2	10	144039	144048	0 %	20 %	40 %	40 %	114326791
118	NC_008343	TGATC	2	10	144360	144369	20 %	40 %	20 %	20 %	114326791
119	NC_008343	CGAAG	2	10	144763	144772	40 %	0 %	40 %	20 %	114326791
120	NC_008343	GCACC	2	10	144776	144785	20 %	0 %	20 %	60 %	114326791
121	NC_008343	CGGTG	2	10	146193	146202	0 %	20 %	60 %	20 %	114326793
122	NC_008343	TGCCG	2	10	146486	146495	0 %	20 %	40 %	40 %	114326794
123	NC_008343	TCAGT	2	10	147084	147093	20 %	40 %	20 %	20 %	114326794
124	NC_008343	GCCGA	2	10	150516	150525	20 %	0 %	40 %	40 %	114326796
125	NC_008343	GGCTC	2	10	150562	150571	0 %	20 %	40 %	40 %	114326796
126	NC_008343	CTGGT	2	10	150787	150796	0 %	40 %	40 %	20 %	114326796
127	NC_008343	GGGCC	2	10	151234	151243	0 %	0 %	60 %	40 %	114326797
128	NC_008343	ATGGT	2	10	152102	152111	20 %	40 %	40 %	0 %	114326798
129	NC_008343	TAAAA	2	10	152649	152658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008343	CCCGC	2	10	153311	153320	0 %	0 %	20 %	80 %	114326799
131	NC_008343	GTGCA	2	10	153407	153416	20 %	20 %	40 %	20 %	114326799
132	NC_008343	TCCTT	2	10	154528	154537	0 %	60 %	0 %	40 %	114326800
133	NC_008343	TCCCG	2	10	159329	159338	0 %	20 %	20 %	60 %	114326805
134	NC_008343	CCAGA	2	10	162995	163004	40 %	0 %	20 %	40 %	114326809
135	NC_008343	CCCGT	2	10	164124	164133	0 %	20 %	20 %	60 %	114326810
136	NC_008343	ACGTC	2	10	164284	164293	20 %	20 %	20 %	40 %	114326811
137	NC_008343	CCAGA	2	10	166009	166018	40 %	0 %	20 %	40 %	114326813
138	NC_008343	CGGAT	2	10	167596	167605	20 %	20 %	40 %	20 %	114326813
139	NC_008343	GTGGG	2	10	168782	168791	0 %	20 %	80 %	0 %	114326812
140	NC_008343	TGATC	2	10	170023	170032	20 %	40 %	20 %	20 %	114326814
141	NC_008343	TGCCC	2	10	171050	171059	0 %	20 %	20 %	60 %	114326815
142	NC_008343	GCCCA	2	10	171160	171169	20 %	0 %	20 %	60 %	114326815
143	NC_008343	CGAAC	2	10	172535	172544	40 %	0 %	20 %	40 %	114326815
144	NC_008343	CCGGC	2	10	173080	173089	0 %	0 %	40 %	60 %	114326815
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149	NC_008343	ACCTG	2	10	176566	176575	20 %	20 %	20 %	40 %	114326818
150	NC_008343	ACCAG	2	10	177493	177502	40 %	0 %	20 %	40 %	114326819
151	NC_008343	ATAGC	2	10	177798	177807	40 %	20 %	20 %	20 %	114326819
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153	NC_008343	GTGAG	2	10	179433	179442	20 %	20 %	60 %	0 %	114326821
154	NC_008343	GGCAG	2	10	179529	179538	20 %	0 %	60 %	20 %	114326821
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157	NC_008343	CCGGG	2	10	181816	181825	0 %	0 %	60 %	40 %	114326823
158	NC_008343	TTCCG	2	10	185897	185906	0 %	40 %	20 %	40 %	114326827
159	NC_008343	CACGA	2	10	188379	188388	40 %	0 %	20 %	40 %	114326828
160	NC_008343	GTTTT	2	10	189178	189187	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008343	CCAGC	2	10	189342	189351	20 %	0 %	20 %	60 %	114326830
162	NC_008343	AGAAC	2	10	189428	189437	60 %	0 %	20 %	20 %	114326830
163	NC_008343	TCCGC	2	10	192823	192832	0 %	20 %	20 %	60 %	114326834
164	NC_008343	GCAGC	2	10	193698	193707	20 %	0 %	40 %	40 %	114326834
165	NC_008343	TCCGA	2	10	193929	193938	20 %	20 %	20 %	40 %	114326835
166	NC_008343	ATCAG	2	10	193948	193957	40 %	20 %	20 %	20 %	114326835
167	NC_008343	GACGG	2	10	194055	194064	20 %	0 %	60 %	20 %	114326835
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175	NC_008343	TGGAT	2	10	209714	209723	20 %	40 %	40 %	0 %	114326848
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181	NC_008343	CCGGC	2	10	216992	217001	0 %	0 %	40 %	60 %	114326854
182	NC_008343	ATCTG	2	10	219715	219724	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_008343	GCGTG	2	10	220251	220260	0 %	20 %	60 %	20 %	114326857
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192	NC_008343	CTCGT	2	10	231932	231941	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
193	NC_008343	CGGGG	2	10	233907	233916	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
194	NC_008343	GGGCA	2	10	235631	235640	20 %	0 %	60 %	20 %	114326867
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196	NC_008343	GCCGG	2	10	240486	240495	0 %	0 %	60 %	40 %	114326871
197	NC_008343	GCCGG	2	10	241017	241026	0 %	0 %	60 %	40 %	114326871
198	NC_008343	GCCGG	2	10	241537	241546	0 %	0 %	60 %	40 %	114326872
199	NC_008343	TGTCT	2	10	241820	241829	0 %	60 %	20 %	20 %	114326872
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230	NC_008343	ATACG	2	10	289765	289774	40 %	20 %	20 %	20 %	114326910
231	NC_008343	CCCGC	2	10	291548	291557	0 %	0 %	20 %	80 %	114326911
232	NC_008343	CCTGC	2	10	293397	293406	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
233	NC_008343	GCTGC	2	10	293806	293815	0 %	20 %	40 %	40 %	114326913
234	NC_008343	CGATG	2	10	293964	293973	20 %	20 %	40 %	20 %	114326913
235	NC_008343	CTGGA	2	10	295302	295311	20 %	20 %	40 %	20 %	114326914
236	NC_008343	AAAAC	2	10	295742	295751	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
237	NC_008343	TGGTC	2	10	296136	296145	0 %	40 %	40 %	20 %	114326915
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243	NC_008343	GCTGA	2	10	308714	308723	20 %	20 %	40 %	20 %	114326927
244	NC_008343	GGCTC	2	10	309216	309225	0 %	20 %	40 %	40 %	114326928
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246	NC_008343	GGGGA	2	10	313679	313688	20 %	0 %	80 %	0 %	114326932
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250	NC_008343	GAGCC	2	10	316989	316998	20 %	0 %	40 %	40 %	114326935
251	NC_008343	CTGAT	2	10	317279	317288	20 %	40 %	20 %	20 %	114326935
252	NC_008343	TGAGC	2	10	317925	317934	20 %	20 %	40 %	20 %	114326937
253	NC_008343	TGATC	2	10	319910	319919	20 %	40 %	20 %	20 %	114326941
254	NC_008343	GACCA	2	10	320454	320463	40 %	0 %	20 %	40 %	114326942
255	NC_008343	AGCCG	2	10	322327	322336	20 %	0 %	40 %	40 %	114326943
256	NC_008343	CTCGC	2	10	322505	322514	0 %	20 %	20 %	60 %	114326944
257	NC_008343	CCGGC	2	10	324177	324186	0 %	0 %	40 %	60 %	114326945
258	NC_008343	CACCG	2	10	324397	324406	20 %	0 %	20 %	60 %	114326945
259	NC_008343	ACCGG	2	10	324548	324557	20 %	0 %	40 %	40 %	114326945
260	NC_008343	GGGCC	2	10	324846	324855	0 %	0 %	60 %	40 %	114326945
261	NC_008343	CCAGG	2	10	325117	325126	20 %	0 %	40 %	40 %	114326945
262	NC_008343	GGGCA	2	10	325618	325627	20 %	0 %	60 %	20 %	114326945
263	NC_008343	GGCCG	2	10	326938	326947	0 %	0 %	60 %	40 %	114326946
264	NC_008343	CATGC	2	10	327918	327927	20 %	20 %	20 %	40 %	114326947
265	NC_008343	ATCCG	2	10	328468	328477	20 %	20 %	20 %	40 %	114326947
266	NC_008343	GCCCG	2	10	328611	328620	0 %	0 %	40 %	60 %	114326947
267	NC_008343	TGGTC	2	10	329650	329659	0 %	40 %	40 %	20 %	114326947
268	NC_008343	ATGCG	2	10	331057	331066	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
269	NC_008343	TGGGA	2	10	331583	331592	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
270	NC_008343	ATGGC	2	10	333555	333564	20 %	20 %	40 %	20 %	114326950
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393	NC_008343	CGGCG	2	10	487155	487164	0 %	0 %	60 %	40 %	114327092
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496	NC_008343	GCGCA	2	10	612172	612181	20 %	0 %	40 %	40 %	114327198
497	NC_008343	CGGTA	2	10	613236	613245	20 %	20 %	40 %	20 %	114327199
498	NC_008343	GACCA	2	10	613253	613262	40 %	0 %	20 %	40 %	114327199
499	NC_008343	AGATG	2	10	613587	613596	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008343	CCAGC	2	10	615979	615988	20 %	0 %	20 %	60 %	114327202

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