MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Granulibacter bethesdensis CGDNIH1 chromosome

Total Repeats: 642

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008343	AGGG	2	8	2660	2667	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008343	ATAG	2	8	2670	2677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008343	GATA	2	8	2758	2765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008343	GTCC	2	8	7204	7211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008343	AGCC	2	8	19257	19264	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008343	GTCT	2	8	19294	19301	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008343	GGTA	2	8	19697	19704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008343	TTCG	2	8	25608	25615	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008343	ATGG	2	8	25671	25678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008343	GGGT	2	8	27715	27722	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008343	GTTC	2	8	49416	49423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008343	GCAC	2	8	72235	72242	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008343	GGCA	2	8	81657	81664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008343	GAGG	2	8	85031	85038	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008343	ATCC	2	8	85103	85110	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008343	GGAA	2	8	85149	85156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008343	GCTT	2	8	93130	93137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008343	TTTC	2	8	96358	96365	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008343	TCAG	2	8	97208	97215	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008343	ATCA	2	8	99243	99250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008343	AACA	2	8	101086	101093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008343	GAAA	2	8	101712	101719	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008343	AAAC	2	8	102827	102834	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008343	ATTT	2	8	103077	103084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008343	GATG	2	8	104071	104078	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008343	ATTG	2	8	104226	104233	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008343	GCCA	2	8	105633	105640	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008343	TTGG	2	8	122684	122691	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008343	GGCA	2	8	122813	122820	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008343	CAGG	2	8	123830	123837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008343	CCGG	2	8	125425	125432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_008343	TCAT	2	8	130793	130800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008343	TACC	2	8	144968	144975	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008343	CTGA	2	8	152680	152687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008343	TTTC	2	8	205174	205181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008343	CCGG	2	8	205434	205441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_008343	CAGG	2	8	222071	222078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008343	CCTG	2	8	222089	222096	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008343	TGAT	2	8	223588	223595	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008343	CCCT	2	8	232009	232016	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_008343	GTCG	2	8	274683	274690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008343	AGGC	2	8	274790	274797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008343	GCAG	2	8	274820	274827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008343	GCAA	2	8	274913	274920	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008343	AATA	2	8	274978	274985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008343	AGGC	2	8	277150	277157	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008343	GCAG	2	8	277556	277563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008343	GGGC	2	8	295903	295910	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008343	GCCC	2	8	297794	297801	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
50	NC_008343	CGGG	2	8	309016	309023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008343	CTTC	2	8	309741	309748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_008343	AAAT	2	8	311809	311816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008343	CCGG	2	8	322469	322476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008343	AGCG	2	8	327768	327775	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_008343	ACTG	2	8	327903	327910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008343	TGAA	2	8	330786	330793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008343	ATGC	2	8	331546	331553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008343	CGTG	2	8	331711	331718	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008343	GGAT	2	8	331857	331864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008343	CAGA	2	8	332142	332149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008343	GAAA	2	8	332787	332794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008343	GCAG	2	8	336307	336314	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008343	AGGC	2	8	336329	336336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008343	TTCC	2	8	347348	347355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008343	GAAA	2	8	350559	350566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008343	TCTG	2	8	350959	350966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008343	CCTG	2	8	356950	356957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008343	CAGG	2	8	356970	356977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008343	CGGG	2	8	358089	358096	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008343	AGGC	2	8	358479	358486	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008343	CAGG	2	8	364812	364819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008343	AATC	2	8	372870	372877	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008343	TGAT	2	8	372884	372891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008343	GGCC	2	8	384614	384621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008343	TCTG	2	8	385507	385514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008343	GAAA	2	8	385974	385981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008343	TCCC	2	8	386144	386151	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_008343	TGGG	2	8	392308	392315	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008343	CAGG	2	8	392480	392487	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008343	GCGA	2	8	392508	392515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008343	TTAT	2	8	393283	393290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008343	GAAC	2	8	396324	396331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008343	GCCT	2	8	404856	404863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_008343	GGAC	2	8	404868	404875	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008343	TGGA	2	8	408665	408672	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008343	AGGG	2	8	408674	408681	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008343	AATC	2	8	428465	428472	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008343	CCTG	2	8	431633	431640	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008343	AGGA	2	8	433541	433548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008343	GGAC	2	8	435057	435064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008343	GCTG	2	8	435252	435259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008343	GATA	2	8	436440	436447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008343	CCTG	2	8	439094	439101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008343	ATTT	2	8	442157	442164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008343	TCCT	2	8	442791	442798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_008343	GATC	2	8	449639	449646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008343	GCCC	2	8	455563	455570	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_008343	ATTT	2	8	465201	465208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008343	AAAG	2	8	472702	472709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008343	GCCA	2	8	478072	478079	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008343	CCCA	2	8	480095	480102	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_008343	GCTG	2	8	481927	481934	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008343	CCGG	2	8	495663	495670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008343	GGCG	2	8	495818	495825	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008343	CATC	2	8	496237	496244	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008343	GGCG	2	8	496537	496544	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008343	CTGG	2	8	496562	496569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008343	CGGA	2	8	496975	496982	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008343	GTCA	2	8	497057	497064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008343	GTTT	2	8	500176	500183	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008343	GCCG	2	8	500213	500220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008343	CTTT	2	8	507696	507703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008343	AGAA	2	8	511294	511301	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008343	ATAA	2	8	511329	511336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008343	AATA	2	8	511346	511353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008343	AGGG	2	8	520914	520921	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008343	GTCT	2	8	521304	521311	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008343	GCAG	2	8	528965	528972	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008343	GGCC	2	8	531965	531972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008343	CTTC	2	8	537088	537095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008343	GAGG	2	8	537996	538003	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008343	GATC	2	8	541613	541620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008343	TCCG	2	8	543722	543729	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_008343	TGGC	2	8	543815	543822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008343	ATGT	2	8	559425	559432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008343	GGCG	2	8	560682	560689	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008343	TCGG	2	8	577671	577678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008343	TTAT	2	8	577680	577687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008343	GCGT	2	8	581423	581430	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008343	GGGT	2	8	589510	589517	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008343	GGAA	2	8	600500	600507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008343	CGGA	2	8	603607	603614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008343	CGCC	2	8	603628	603635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_008343	CCTG	2	8	606025	606032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008343	CAGC	2	8	613619	613626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008343	CAGA	2	8	613662	613669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008343	TATG	2	8	617338	617345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008343	TAAT	2	8	624950	624957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008343	ATGA	2	8	625064	625071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008343	CGCT	2	8	625273	625280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_008343	GGCT	2	8	626634	626641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008343	GGTC	2	8	626683	626690	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008343	CCGG	2	8	626785	626792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_008343	AGCC	2	8	639408	639415	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_008343	GATG	2	8	648599	648606	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008343	CAGC	2	8	648721	648728	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008343	TTCC	2	8	651100	651107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008343	GACA	2	8	651561	651568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008343	TGTT	2	8	662685	662692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008343	TTCC	2	8	669574	669581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008343	GCGA	2	8	677659	677666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_008343	CGGT	2	8	1180974	1180981	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_008343	GTTC	2	8	1229139	1229146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
289	NC_008343	TGCC	2	8	1233238	1233245	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
290	NC_008343	CTGA	2	8	1271035	1271042	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
291	NC_008343	TTTA	2	8	1271167	1271174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_008343	GCAG	2	8	1278697	1278704	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
293	NC_008343	AGCC	2	8	1281439	1281446	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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431	NC_008343	CAGA	2	8	1824639	1824646	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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434	NC_008343	CGGT	2	8	1834548	1834555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
435	NC_008343	CCGG	2	8	1834673	1834680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_008343	AAAT	2	8	2034711	2034718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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