MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	CAAGCA	2	12	283	294	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008342	TACACG	2	12	6984	6995	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114326618
3	NC_008342	CGAATA	2	12	9463	9474	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	114326621
4	NC_008342	CTTGAT	2	12	15342	15353	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114326626
5	NC_008342	CGATCC	2	12	19393	19404	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114326628
6	NC_008342	TTTATC	2	12	28984	28995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	114326636
7	NC_008342	AATAAA	2	12	29714	29725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	114326636
8	NC_008342	AAAAGC	2	12	31317	31328	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_008342	GCCATT	2	12	38941	38952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114326646
10	NC_008342	GCTGTT	2	12	40272	40283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	114326648
11	NC_008342	TTCCTT	2	12	42153	42164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326650
12	NC_008342	TAACCT	2	12	43514	43525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326650
13	NC_008342	AAAATA	2	12	46203	46214	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	114326653
14	NC_008342	TTCATA	2	12	46829	46840	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	114326654
15	NC_008342	ACCGCG	2	12	47292	47303	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114326654
16	NC_008342	TGATTG	2	12	49387	49398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	114326657
17	NC_008342	AGCCTG	2	12	49603	49614	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114326657
18	NC_008342	CTCTTT	2	12	52401	52412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326658

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.