MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	AAACG	2	10	673	682	60 %	0 %	20 %	20 %	114326612
2	NC_008342	GCCTT	2	10	4145	4154	0 %	40 %	20 %	40 %	114326614
3	NC_008342	CCGCG	2	10	6006	6015	0 %	0 %	40 %	60 %	114326617
4	NC_008342	CAAGC	2	10	6130	6139	40 %	0 %	20 %	40 %	114326617
5	NC_008342	AGGCA	2	10	6345	6354	40 %	0 %	40 %	20 %	114326617
6	NC_008342	GCCGC	2	10	6686	6695	0 %	0 %	40 %	60 %	114326617
7	NC_008342	AAACA	2	10	7078	7087	80 %	0 %	0 %	20 %	114326618
8	NC_008342	CAATA	2	10	7189	7198	60 %	20 %	0 %	20 %	114326618
9	NC_008342	CAAAA	2	10	7466	7475	80 %	0 %	0 %	20 %	114326618
10	NC_008342	ATCTT	2	10	11537	11546	20 %	60 %	0 %	20 %	114326624
11	NC_008342	ACGTC	2	10	13356	13365	20 %	20 %	20 %	40 %	114326625
12	NC_008342	TGCGA	2	10	17638	17647	20 %	20 %	40 %	20 %	114326627
13	NC_008342	CGTGT	2	10	19452	19461	0 %	40 %	40 %	20 %	114326628
14	NC_008342	GCACG	2	10	20994	21003	20 %	0 %	40 %	40 %	114326628
15	NC_008342	GCGCG	2	10	24560	24569	0 %	0 %	60 %	40 %	114326630
16	NC_008342	CGGTC	2	10	25152	25161	0 %	20 %	40 %	40 %	114326631
17	NC_008342	TTGTC	2	10	29261	29270	0 %	60 %	20 %	20 %	114326636
18	NC_008342	GGGTG	2	10	39881	39890	0 %	20 %	80 %	0 %	114326647
19	NC_008342	ATGCA	2	10	40909	40918	40 %	20 %	20 %	20 %	114326648
20	NC_008342	ATCCA	2	10	46671	46680	40 %	20 %	0 %	40 %	114326653
21	NC_008342	GCGCT	2	10	50673	50682	0 %	20 %	40 %	40 %	114326658
22	NC_008342	ATCTG	2	10	50811	50820	20 %	40 %	20 %	20 %	114326658
23	NC_008342	TCATT	2	10	52430	52439	20 %	60 %	0 %	20 %	114326658
24	NC_008342	CCCAG	2	10	53489	53498	20 %	0 %	20 %	60 %	114326661
25	NC_008342	TTGTT	2	10	54484	54493	0 %	80 %	20 %	0 %	114326663

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.